Doublet Group distance statistics: 51485

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.013, 0.031, 0.050, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.031 std_dev=0.019
C2	A	0, 0.013, 0.033, 0.053, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.033 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.015, 0.036, 0.057, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.036 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.013, 0.035, 0.056, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.035 std_dev=0.022
C4	A	0, 0.018, 0.043, 0.069, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.043 std_dev=0.025
O6	A	0, 0.019, 0.046, 0.072, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.046 std_dev=0.027
N3	A	0, 0.020, 0.047, 0.075, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.047 std_dev=0.028
N9	A	0, 0.020, 0.051, 0.082, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.051 std_dev=0.031
N7	A	0, 0.023, 0.057, 0.091, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.057 std_dev=0.034
N2	A	0, 0.028, 0.066, 0.104, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.066 std_dev=0.038
C8	A	0, 0.028, 0.070, 0.111, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.070 std_dev=0.041
C2'	A	0, 0.045, 0.117, 0.188, 0.193 max_d=0.193 avg_d=0.117 std_dev=0.071
O4'	A	0, 0.042, 0.133, 0.224, 0.244 max_d=0.244 avg_d=0.133 std_dev=0.091
C3'	A	0, 0.051, 0.171, 0.291, 0.339 max_d=0.339 avg_d=0.171 std_dev=0.120
O2'	A	0, 0.082, 0.208, 0.334, 0.340 max_d=0.340 avg_d=0.208 std_dev=0.126
C4'	A	0, 0.058, 0.212, 0.367, 0.426 max_d=0.426 avg_d=0.212 std_dev=0.154
O3'	A	0, 0.103, 0.314, 0.526, 0.592 max_d=0.592 avg_d=0.314 std_dev=0.212
OP2	B	0, 0.116, 0.339, 0.562, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.339 std_dev=0.223
C5'	A	0, 0.113, 0.387, 0.660, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.387 std_dev=0.273
O5'	A	0, 0.141, 0.437, 0.733, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.437 std_dev=0.296
P	B	0, 0.153, 0.508, 0.864, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.508 std_dev=0.355
P	A	0, 0.283, 0.717, 1.151, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.717 std_dev=0.434
OP2	A	0, 0.336, 0.816, 1.296, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.816 std_dev=0.480
OP1	A	0, 0.345, 0.850, 1.355, 1.326 max_d=1.326 avg_d=0.850 std_dev=0.505
OP1	B	0, 0.466, 1.106, 1.746, 1.514 max_d=1.514 avg_d=1.106 std_dev=0.640
O5'	B	0, 0.596, 1.413, 2.231, 1.953 max_d=1.953 avg_d=1.413 std_dev=0.818
C5'	B	0, 0.730, 1.736, 2.742, 2.433 max_d=2.433 avg_d=1.736 std_dev=1.006
C4'	B	0, 1.207, 2.875, 4.544, 4.071 max_d=4.071 avg_d=2.875 std_dev=1.668
C3'	B	0, 1.405, 3.362, 5.318, 4.839 max_d=4.839 avg_d=3.362 std_dev=1.956
O3'	B	0, 1.434, 3.453, 5.473, 5.061 max_d=5.061 avg_d=3.453 std_dev=2.019
O4'	B	0, 1.561, 3.700, 5.839, 5.092 max_d=5.092 avg_d=3.700 std_dev=2.139
C2'	B	0, 1.904, 4.529, 7.154, 6.381 max_d=6.381 avg_d=4.529 std_dev=2.625
C2	B	0, 1.922, 4.563, 7.204, 6.348 max_d=6.348 avg_d=4.563 std_dev=2.641
C1'	B	0, 1.937, 4.595, 7.253, 6.363 max_d=6.363 avg_d=4.595 std_dev=2.658
N3	B	0, 1.976, 4.682, 7.388, 6.422 max_d=6.422 avg_d=4.682 std_dev=2.706
N1	B	0, 2.021, 4.785, 7.549, 6.522 max_d=6.522 avg_d=4.785 std_dev=2.764
O2	B	0, 2.021, 4.815, 7.610, 6.815 max_d=6.815 avg_d=4.815 std_dev=2.795
O2'	B	0, 2.278, 5.415, 8.553, 7.602 max_d=7.602 avg_d=5.415 std_dev=3.137
C4	B	0, 2.319, 5.488, 8.657, 7.353 max_d=7.353 avg_d=5.488 std_dev=3.169
C6	B	0, 2.413, 5.710, 9.008, 7.713 max_d=7.713 avg_d=5.710 std_dev=3.297
O4	B	0, 2.471, 5.847, 9.224, 7.856 max_d=7.856 avg_d=5.847 std_dev=3.376
C5	B	0, 2.635, 6.237, 9.840, 8.460 max_d=8.460 avg_d=6.237 std_dev=3.602

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.09	0.06
C2	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.02	0.04	0.13	0.01	0.13	0.17	0.14
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.07	0.06	0.04
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.04	0.08	0.02	0.01	0.01	0.08	0.03	0.00	0.00	0.01	0.03	0.05	0.09	0.05	0.04
C4	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.12	0.01	0.12	0.15	0.13
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.06	0.03	0.02	0.03	0.06	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.04	0.06	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.14	0.01	0.16	0.19	0.16
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.08	0.00	0.10	0.00	0.10	0.10	0.09	0.07	0.07	0.11	0.06	0.02	0.01	0.01	0.00	0.10	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.03	0.15	0.00	0.17	0.20	0.17
C8	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.01	0.13	0.01	0.13	0.14	0.13
N1	0.02	0.00	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.04	0.14	0.01	0.15	0.19	0.16
N2	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.04	0.05	0.12	0.01	0.12	0.17	0.13
N3	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.02	0.04	0.11	0.01	0.11	0.15	0.12
N7	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.10	0.01	0.15	0.01	0.17	0.19	0.17
N9	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.09	0.12	0.10
O2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.03	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.06	0.09	0.07	0.02	0.00	0.00	0.02	0.03	0.02	0.04	0.09	0.04	0.02
O3'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.05	0.10	0.02	0.04	0.02	0.10	0.03	0.02	0.00	0.00	0.04	0.06	0.14	0.08	0.07
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.10	0.07
O5'	0.04	0.13	0.03	0.03	0.12	0.01	0.14	0.00	0.15	0.13	0.14	0.12	0.11	0.15	0.10	0.02	0.04	0.01	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.02	0.15	0.00	0.19	0.22	0.19
OP1	0.04	0.13	0.07	0.09	0.12	0.06	0.16	0.05	0.17	0.13	0.15	0.12	0.11	0.17	0.09	0.09	0.14	0.00	0.01	0.19	0.00	0.00	0.00
OP2	0.09	0.17	0.06	0.05	0.15	0.04	0.19	0.01	0.20	0.14	0.19	0.17	0.15	0.19	0.12	0.04	0.08	0.10	0.01	0.22	0.00	0.00	0.00
P	0.06	0.14	0.04	0.04	0.13	0.02	0.16	0.01	0.17	0.13	0.16	0.13	0.12	0.17	0.10	0.02	0.07	0.07	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.41	0.29	0.40	0.33	0.84	0.21	1.03	0.11	0.85	0.53	0.43	0.05	0.41	0.37	0.98	0.23	0.10	0.08	0.06	0.08
C2	0.21	0.15	0.21	0.18	0.58	0.09	0.94	0.02	0.78	0.33	0.15	0.53	0.20	0.23	0.63	0.10	0.02	0.05	0.07	0.08
C2'	0.56	0.51	0.55	0.43	1.04	0.29	1.17	0.14	0.99	0.70	0.67	0.21	0.58	0.46	1.22	0.33	0.11	0.14	0.09	0.11
C3'	0.59	0.54	0.56	0.42	1.08	0.31	1.22	0.16	1.03	0.73	0.70	0.24	0.58	0.44	1.25	0.37	0.13	0.15	0.09	0.10
C4	0.33	0.17	0.28	0.23	0.82	0.16	1.13	0.08	0.92	0.48	0.32	0.28	0.28	0.25	0.94	0.19	0.07	0.08	0.06	0.06
C4'	0.46	0.38	0.44	0.35	0.87	0.24	1.03	0.13	0.87	0.58	0.52	0.10	0.46	0.39	1.01	0.27	0.10	0.10	0.06	0.08
C5	0.33	0.16	0.24	0.19	0.86	0.16	1.21	0.10	0.99	0.50	0.33	0.34	0.23	0.18	0.98	0.23	0.10	0.11	0.06	0.06
C5'	0.47	0.38	0.43	0.34	0.89	0.26	1.07	0.16	0.91	0.60	0.52	0.09	0.44	0.37	1.03	0.30	0.14	0.07	0.05	0.04
C6	0.29	0.14	0.20	0.16	0.78	0.15	1.17	0.11	0.96	0.45	0.25	0.47	0.19	0.14	0.87	0.21	0.12	0.12	0.07	0.08
C8	0.41	0.27	0.32	0.24	0.96	0.21	1.23	0.12	1.01	0.58	0.45	0.16	0.32	0.24	1.11	0.28	0.11	0.11	0.06	0.05
N1	0.23	0.17	0.19	0.15	0.64	0.12	1.04	0.07	0.86	0.37	0.17	0.57	0.18	0.16	0.70	0.15	0.07	0.08	0.06	0.06
N2	0.13	0.28	0.18	0.16	0.34	0.04	0.69	0.06	0.58	0.20	0.19	0.68	0.18	0.25	0.35	0.10	0.09	0.05	0.09	0.12
N3	0.27	0.11	0.27	0.23	0.68	0.12	0.98	0.04	0.80	0.39	0.21	0.35	0.27	0.28	0.75	0.11	0.04	0.07	0.07	0.09
N7	0.38	0.22	0.27	0.20	0.94	0.19	1.27	0.13	1.04	0.56	0.41	0.25	0.26	0.18	1.09	0.28	0.12	0.13	0.07	0.07
N9	0.39	0.25	0.34	0.27	0.89	0.20	1.14	0.10	0.94	0.54	0.41	0.15	0.34	0.29	1.03	0.23	0.09	0.09	0.06	0.06
O2'	0.54	0.52	0.59	0.46	0.91	0.28	0.98	0.11	0.85	0.65	0.64	0.30	0.62	0.51	1.05	0.29	0.09	0.13	0.10	0.14
O3'	0.66	0.65	0.64	0.47	1.12	0.34	1.22	0.16	1.05	0.80	0.81	0.39	0.68	0.48	1.29	0.42	0.12	0.19	0.12	0.13
O4'	0.37	0.26	0.36	0.30	0.76	0.20	0.95	0.11	0.79	0.48	0.38	0.07	0.36	0.35	0.89	0.20	0.09	0.06	0.04	0.06
O5'	0.53	0.42	0.45	0.36	1.01	0.31	1.23	0.22	1.04	0.67	0.58	0.09	0.45	0.37	1.16	0.38	0.20	0.06	0.08	0.06
O6	0.28	0.15	0.18	0.16	0.78	0.17	1.18	0.15	0.98	0.45	0.25	0.51	0.17	0.15	0.87	0.24	0.16	0.15	0.09	0.12
OP1	0.56	0.45	0.46	0.37	1.02	0.34	1.25	0.25	1.07	0.70	0.61	0.12	0.46	0.37	1.16	0.42	0.23	0.05	0.09	0.09
OP2	0.58	0.43	0.45	0.38	1.08	0.38	1.37	0.31	1.17	0.73	0.60	0.11	0.44	0.35	1.23	0.47	0.30	0.11	0.17	0.18
P	0.53	0.40	0.43	0.36	1.01	0.33	1.25	0.26	1.07	0.68	0.57	0.08	0.43	0.36	1.15	0.40	0.24	0.06	0.11	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.04	0.08	0.09	0.05
C2	0.01	0.00	0.01	0.09	0.01	0.16	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.06	0.01	0.17	0.25	0.24	0.27	0.29
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.02	0.04	0.00	0.01	0.04	0.00	0.01	0.10	0.08	0.05
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.14	0.00	0.26	0.00	0.27	0.08	0.03	0.27	0.02	0.01	0.14	0.01	0.02	0.11	0.08	0.05
C4	0.02	0.01	0.04	0.14	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.15	0.00	0.03	0.23	0.26	0.36	0.26
C4'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.08	0.00	0.23	0.00	0.25	0.04	0.09	0.35	0.07	0.02	0.08	0.01	0.01	0.07	0.05	0.03
C5	0.02	0.00	0.04	0.26	0.00	0.23	0.00	0.39	0.00	0.01	0.01	0.00	0.14	0.24	0.01	0.13	0.56	0.61	0.76	0.64
C5'	0.01	0.22	0.01	0.00	0.14	0.00	0.39	0.00	0.41	0.08	0.13	0.52	0.07	0.01	0.15	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.27	0.01	0.25	0.00	0.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.23	0.02	0.17	0.57	0.57	0.69	0.61
N1	0.01	0.00	0.02	0.08	0.02	0.04	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.07	0.02	0.01	0.13	0.15	0.18	0.13
N3	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.09	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.01	0.12	0.13	0.12	0.14	0.16
O2	0.01	0.00	0.04	0.27	0.01	0.35	0.00	0.52	0.00	0.00	0.01	0.00	0.18	0.21	0.02	0.29	0.65	0.64	0.74	0.72
O2'	0.00	0.07	0.00	0.02	0.07	0.07	0.14	0.07	0.15	0.04	0.03	0.18	0.00	0.02	0.07	0.07	0.04	0.13	0.08	0.07
O3'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.15	0.02	0.24	0.01	0.23	0.07	0.04	0.21	0.02	0.00	0.16	0.02	0.05	0.15	0.10	0.08
O4	0.03	0.01	0.04	0.14	0.00	0.08	0.01	0.15	0.02	0.02	0.01	0.02	0.07	0.16	0.00	0.03	0.23	0.27	0.38	0.27
O4'	0.00	0.17	0.00	0.01	0.03	0.01	0.13	0.01	0.17	0.01	0.12	0.29	0.07	0.02	0.03	0.00	0.05	0.07	0.07	0.05
O5'	0.04	0.25	0.01	0.02	0.23	0.01	0.56	0.00	0.57	0.13	0.13	0.65	0.04	0.05	0.23	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.08	0.24	0.10	0.11	0.26	0.07	0.61	0.04	0.57	0.15	0.12	0.64	0.13	0.15	0.27	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.27	0.08	0.08	0.36	0.05	0.76	0.01	0.69	0.18	0.14	0.74	0.08	0.10	0.38	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.29	0.05	0.05	0.26	0.03	0.64	0.01	0.61	0.13	0.16	0.72	0.07	0.08	0.27	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00