Doublet Group distance statistics: 51489

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.001, 0.006, 0.011, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.001, 0.013, 0.024, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.013 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.005, 0.016, 0.028, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N1	A	0, -0.001, 0.016, 0.033, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.016 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.008, 0.027, 0.045, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.027 std_dev=0.019
O6	A	0, 0.009, 0.031, 0.053, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.031 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.007, 0.029, 0.051, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.029 std_dev=0.022
C4	A	0, 0.002, 0.027, 0.052, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.027 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.010, 0.037, 0.064, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.037 std_dev=0.027
N3	A	0, -0.001, 0.027, 0.054, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N2	A	0, 0.004, 0.040, 0.075, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.040 std_dev=0.035
C2'	A	0, -0.018, 0.242, 0.502, 0.603 max_d=0.603 avg_d=0.242 std_dev=0.260
O4'	A	0, -0.017, 0.254, 0.526, 0.631 max_d=0.631 avg_d=0.254 std_dev=0.271
O2'	A	0, 0.023, 0.299, 0.576, 0.667 max_d=0.667 avg_d=0.299 std_dev=0.276
OP2	B	0, 0.040, 0.378, 0.716, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.378 std_dev=0.338
P	B	0, 0.122, 0.489, 0.857, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.489 std_dev=0.368
C4'	A	0, 0.014, 0.427, 0.840, 0.986 max_d=0.986 avg_d=0.427 std_dev=0.413
C3'	A	0, -0.075, 0.378, 0.831, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.378 std_dev=0.453
OP1	B	0, 0.053, 0.592, 1.131, 1.303 max_d=1.303 avg_d=0.592 std_dev=0.539
O3'	A	0, 0.014, 0.560, 1.107, 1.301 max_d=1.301 avg_d=0.560 std_dev=0.546
O5'	A	0, 0.126, 0.757, 1.387, 1.544 max_d=1.544 avg_d=0.757 std_dev=0.631
C5'	A	0, 0.077, 0.724, 1.370, 1.570 max_d=1.570 avg_d=0.724 std_dev=0.647
O5'	B	0, -0.013, 0.767, 1.546, 1.835 max_d=1.835 avg_d=0.767 std_dev=0.779
P	A	0, 0.306, 1.102, 1.898, 1.850 max_d=1.850 avg_d=1.102 std_dev=0.796
C5'	B	0, -0.033, 0.811, 1.655, 1.975 max_d=1.975 avg_d=0.811 std_dev=0.844
OP2	A	0, 0.340, 1.189, 2.038, 1.925 max_d=1.925 avg_d=1.189 std_dev=0.849
OP1	A	0, 0.376, 1.307, 2.238, 2.098 max_d=2.098 avg_d=1.307 std_dev=0.931
C4'	B	0, 0.059, 1.233, 2.407, 2.812 max_d=2.812 avg_d=1.233 std_dev=1.174
C3'	B	0, 0.238, 1.484, 2.730, 3.048 max_d=3.048 avg_d=1.484 std_dev=1.246
C6	B	0, 0.505, 1.751, 2.997, 2.797 max_d=2.797 avg_d=1.751 std_dev=1.246
O4'	B	0, 0.226, 1.512, 2.798, 3.143 max_d=3.143 avg_d=1.512 std_dev=1.286
C5	B	0, 0.520, 1.854, 3.189, 3.085 max_d=3.085 avg_d=1.854 std_dev=1.335
N1	B	0, 0.438, 1.817, 3.196, 3.339 max_d=3.339 avg_d=1.817 std_dev=1.379
C4	B	0, 0.560, 1.968, 3.376, 3.216 max_d=3.216 avg_d=1.968 std_dev=1.408
O3'	B	0, 0.225, 1.660, 3.094, 3.499 max_d=3.499 avg_d=1.660 std_dev=1.434
C1'	B	0, 0.353, 1.838, 3.322, 3.636 max_d=3.636 avg_d=1.838 std_dev=1.485
O4	B	0, 0.626, 2.156, 3.685, 3.386 max_d=3.386 avg_d=2.156 std_dev=1.529
C2'	B	0, 0.363, 1.902, 3.441, 3.769 max_d=3.769 avg_d=1.902 std_dev=1.539
N3	B	0, 0.367, 1.981, 3.595, 3.953 max_d=3.953 avg_d=1.981 std_dev=1.614
C2	B	0, 0.238, 1.936, 3.634, 4.134 max_d=4.134 avg_d=1.936 std_dev=1.698
O2'	B	0, 0.368, 2.235, 4.102, 4.569 max_d=4.569 avg_d=2.235 std_dev=1.867
O2	B	0, -0.093, 2.053, 4.199, 5.015 max_d=5.015 avg_d=2.053 std_dev=2.146

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.09	0.01	0.05	0.14	0.12
C2	0.00	0.00	0.20	0.16	0.00	0.01	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.24	0.22	0.11	0.19	0.01	0.21	0.37	0.32
C2'	0.00	0.20	0.00	0.01	0.11	0.01	0.07	0.02	0.12	0.08	0.18	0.24	0.19	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.11	0.05	0.05	0.05
C3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.08	0.00	0.05	0.02	0.09	0.08	0.14	0.18	0.13	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.08	0.09	0.04	0.03
C4	0.00	0.00	0.11	0.08	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.10	0.06	0.18	0.01	0.20	0.33	0.28
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.05	0.02	0.01	0.00	0.05	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.05	0.02	0.00
C5	0.00	0.00	0.07	0.05	0.00	0.03	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.07	0.04	0.22	0.00	0.29	0.42	0.35
C5'	0.03	0.11	0.02	0.02	0.10	0.00	0.13	0.00	0.14	0.12	0.13	0.11	0.09	0.14	0.08	0.03	0.01	0.01	0.01	0.16	0.03	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.12	0.09	0.00	0.03	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.13	0.06	0.23	0.00	0.32	0.46	0.38
C8	0.00	0.01	0.08	0.08	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.10	0.07	0.20	0.01	0.26	0.32	0.28
N1	0.01	0.00	0.18	0.14	0.00	0.02	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.20	0.09	0.22	0.01	0.28	0.43	0.36
N2	0.00	0.00	0.24	0.18	0.01	0.01	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.28	0.26	0.13	0.19	0.01	0.19	0.37	0.31
N3	0.01	0.00	0.19	0.13	0.00	0.00	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.18	0.10	0.17	0.01	0.16	0.32	0.27
N7	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.03	0.22	0.00	0.33	0.43	0.36
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.16	0.01	0.17	0.26	0.23
O2'	0.00	0.24	0.00	0.03	0.12	0.03	0.09	0.03	0.14	0.06	0.20	0.28	0.21	0.01	0.02	0.00	0.06	0.02	0.05	0.13	0.09	0.03	0.04
O3'	0.01	0.22	0.02	0.01	0.10	0.01	0.07	0.01	0.13	0.10	0.20	0.26	0.18	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.12	0.19	0.16	0.12
O4'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.07	0.09	0.13	0.10	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.06	0.02	0.08	0.08
O5'	0.09	0.19	0.06	0.02	0.18	0.01	0.22	0.01	0.23	0.20	0.22	0.19	0.17	0.22	0.16	0.05	0.04	0.04	0.00	0.24	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.11	0.08	0.01	0.04	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.12	0.06	0.24	0.00	0.38	0.50	0.42
OP1	0.05	0.21	0.05	0.09	0.20	0.05	0.29	0.03	0.32	0.26	0.28	0.19	0.16	0.33	0.17	0.09	0.19	0.02	0.01	0.38	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.37	0.05	0.04	0.33	0.02	0.42	0.01	0.46	0.32	0.43	0.37	0.32	0.43	0.26	0.03	0.16	0.08	0.01	0.50	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.32	0.05	0.03	0.28	0.00	0.35	0.01	0.38	0.28	0.36	0.31	0.27	0.36	0.23	0.04	0.12	0.08	0.00	0.42	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.21	0.02	0.04	0.17	0.13	0.16	0.18	0.19	0.06	0.30	0.30	0.02	0.16	0.30	0.27	0.19	0.21	0.22	0.27
C2	0.12	0.22	0.08	0.06	0.47	0.17	0.28	0.20	0.08	0.08	0.38	0.20	0.07	0.06	0.63	0.28	0.21	0.20	0.21	0.24
C2'	0.10	0.20	0.07	0.07	0.15	0.23	0.19	0.34	0.22	0.04	0.30	0.31	0.07	0.16	0.29	0.36	0.35	0.45	0.43	0.50
C3'	0.07	0.22	0.08	0.06	0.20	0.21	0.14	0.32	0.17	0.02	0.33	0.33	0.08	0.15	0.33	0.33	0.32	0.45	0.41	0.48
C4	0.09	0.41	0.05	0.02	0.60	0.09	0.31	0.14	0.13	0.20	0.58	0.43	0.05	0.08	0.83	0.17	0.15	0.23	0.23	0.24
C4'	0.13	0.10	0.01	0.04	0.03	0.16	0.24	0.21	0.25	0.10	0.16	0.21	0.01	0.17	0.09	0.33	0.22	0.23	0.22	0.29
C5	0.20	0.57	0.10	0.04	0.86	0.08	0.58	0.11	0.34	0.37	0.79	0.57	0.10	0.03	1.12	0.12	0.12	0.28	0.24	0.21
C5'	0.06	0.18	0.04	0.08	0.12	0.08	0.12	0.11	0.15	0.03	0.24	0.27	0.03	0.20	0.21	0.23	0.11	0.13	0.11	0.17
C6	0.21	0.59	0.10	0.06	0.94	0.09	0.74	0.11	0.44	0.41	0.81	0.55	0.10	0.07	1.18	0.13	0.12	0.29	0.24	0.19
C8	0.20	0.57	0.12	0.05	0.74	0.07	0.40	0.11	0.23	0.33	0.76	0.62	0.13	0.07	0.99	0.12	0.12	0.27	0.24	0.22
N1	0.11	0.42	0.07	0.07	0.76	0.11	0.62	0.14	0.33	0.28	0.63	0.37	0.07	0.06	0.96	0.14	0.14	0.26	0.23	0.21
N2	0.32	0.06	0.19	0.13	0.15	0.30	0.03	0.29	0.21	0.20	0.08	0.07	0.18	0.08	0.28	0.49	0.31	0.14	0.15	0.26
N3	0.12	0.20	0.04	0.02	0.35	0.16	0.11	0.19	0.11	0.06	0.35	0.23	0.04	0.11	0.53	0.29	0.20	0.19	0.20	0.25
N7	0.26	0.66	0.14	0.06	0.91	0.09	0.60	0.10	0.37	0.43	0.88	0.68	0.15	0.03	1.19	0.15	0.11	0.29	0.24	0.20
N9	0.09	0.40	0.06	0.04	0.51	0.08	0.20	0.14	0.09	0.18	0.56	0.46	0.07	0.11	0.73	0.17	0.15	0.23	0.23	0.24
O2'	0.27	0.07	0.09	0.11	0.28	0.34	0.52	0.43	0.47	0.27	0.07	0.10	0.09	0.17	0.27	0.53	0.44	0.47	0.46	0.56
O3'	0.10	0.18	0.10	0.07	0.15	0.27	0.23	0.41	0.24	0.07	0.26	0.29	0.11	0.16	0.25	0.40	0.41	0.57	0.50	0.60
O4'	0.11	0.14	0.01	0.06	0.10	0.10	0.23	0.12	0.23	0.09	0.20	0.24	0.01	0.19	0.18	0.26	0.13	0.13	0.13	0.17
O5'	0.13	0.41	0.17	0.18	0.44	0.06	0.19	0.03	0.10	0.21	0.52	0.48	0.17	0.27	0.58	0.05	0.01	0.08	0.04	0.08
O6	0.29	0.68	0.13	0.09	1.05	0.11	0.87	0.11	0.57	0.51	0.91	0.63	0.13	0.12	1.30	0.20	0.12	0.33	0.22	0.15
OP1	0.11	0.36	0.15	0.17	0.39	0.05	0.17	0.03	0.09	0.19	0.46	0.43	0.15	0.27	0.51	0.06	0.02	0.07	0.03	0.06
OP2	0.39	0.68	0.37	0.36	0.80	0.29	0.58	0.25	0.45	0.50	0.82	0.71	0.37	0.42	0.98	0.23	0.25	0.13	0.18	0.17
P	0.23	0.49	0.25	0.27	0.55	0.17	0.32	0.14	0.23	0.31	0.60	0.55	0.25	0.36	0.69	0.08	0.15	0.08	0.12	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.08	0.06	0.03
C2	0.01	0.00	0.14	0.18	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.18	0.00	0.10	0.17	0.19	0.24	0.15
C2'	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.01	0.12	0.01	0.10	0.24	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.02	0.01
C3'	0.02	0.18	0.01	0.00	0.17	0.00	0.14	0.00	0.11	0.12	0.19	0.19	0.02	0.01	0.18	0.01	0.04	0.12	0.03	0.03
C4	0.01	0.00	0.01	0.17	0.00	0.15	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.18	0.00	0.04	0.39	0.45	0.52	0.42
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.15	0.00	0.22	0.00	0.21	0.09	0.07	0.07	0.07	0.02	0.16	0.00	0.02	0.06	0.01	0.01
C5	0.01	0.00	0.09	0.14	0.00	0.22	0.00	0.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.14	0.00	0.12	0.49	0.54	0.56	0.53
C5'	0.02	0.07	0.01	0.00	0.27	0.00	0.38	0.00	0.35	0.14	0.15	0.10	0.06	0.02	0.29	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00
C6	0.01	0.00	0.12	0.11	0.00	0.21	0.00	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.11	0.00	0.15	0.42	0.44	0.39	0.41
N1	0.00	0.00	0.01	0.12	0.00	0.09	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.10	0.00	0.02	0.21	0.23	0.22	0.18
N3	0.01	0.00	0.10	0.19	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.20	0.00	0.07	0.27	0.29	0.37	0.26
O2	0.01	0.00	0.24	0.19	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.20	0.01	0.19	0.10	0.12	0.16	0.11
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.08	0.07	0.13	0.06	0.12	0.04	0.06	0.16	0.00	0.03	0.09	0.09	0.03	0.14	0.04	0.05
O3'	0.02	0.18	0.01	0.01	0.18	0.02	0.14	0.02	0.11	0.10	0.20	0.20	0.03	0.00	0.19	0.02	0.09	0.17	0.10	0.09
O4	0.00	0.00	0.01	0.18	0.00	0.16	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.19	0.00	0.04	0.42	0.50	0.60	0.48
O4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.04	0.00	0.12	0.02	0.15	0.02	0.07	0.19	0.09	0.02	0.04	0.00	0.07	0.05	0.09	0.08
O5'	0.06	0.17	0.01	0.04	0.39	0.02	0.49	0.01	0.42	0.21	0.27	0.10	0.03	0.09	0.42	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.08	0.19	0.10	0.12	0.45	0.06	0.54	0.04	0.44	0.23	0.29	0.12	0.14	0.17	0.50	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.06	0.24	0.02	0.03	0.52	0.01	0.56	0.01	0.39	0.22	0.37	0.16	0.04	0.10	0.60	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.15	0.01	0.03	0.42	0.01	0.53	0.00	0.41	0.18	0.26	0.11	0.05	0.09	0.48	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00