Doublet Group distance statistics: 51492

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.009, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.000, 0.017, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C5	A	0, 0.000, 0.023, 0.047, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C2	A	0, 0.000, 0.028, 0.055, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.028 std_dev=0.028
C4	A	0, 0.000, 0.029, 0.057, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.029 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.000, 0.031, 0.063, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.031 std_dev=0.031
N7	A	0, 0.000, 0.032, 0.063, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.032 std_dev=0.032
N3	A	0, 0.000, 0.032, 0.064, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.032 std_dev=0.032
C1'	A	0, 0.000, 0.033, 0.066, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.033 std_dev=0.033
O6	A	0, 0.000, 0.039, 0.077, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.039 std_dev=0.039
N9	A	0, 0.000, 0.043, 0.086, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.043 std_dev=0.043
N2	A	0, 0.000, 0.092, 0.185, 0.185 max_d=0.185 avg_d=0.092 std_dev=0.092
O4'	A	0, 0.000, 0.173, 0.347, 0.347 max_d=0.347 avg_d=0.173 std_dev=0.173
P	B	0, 0.000, 0.187, 0.374, 0.374 max_d=0.374 avg_d=0.187 std_dev=0.187
O5'	B	0, 0.000, 0.256, 0.513, 0.513 max_d=0.513 avg_d=0.256 std_dev=0.256
C2'	A	0, 0.000, 0.308, 0.616, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.308 std_dev=0.308
C4'	A	0, 0.000, 0.358, 0.717, 0.717 max_d=0.717 avg_d=0.358 std_dev=0.358
C3'	A	0, 0.000, 0.507, 1.013, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.507 std_dev=0.507
O2'	A	0, 0.000, 0.528, 1.057, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.528 std_dev=0.528
OP2	A	0, 0.000, 0.543, 1.087, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.543 std_dev=0.543
C5'	A	0, 0.000, 0.602, 1.204, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.602 std_dev=0.602
P	A	0, 0.000, 0.621, 1.241, 1.241 max_d=1.241 avg_d=0.621 std_dev=0.621
OP1	A	0, 0.000, 0.644, 1.289, 1.289 max_d=1.289 avg_d=0.644 std_dev=0.644
O5'	A	0, 0.000, 0.678, 1.356, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.678 std_dev=0.678
OP1	B	0, 0.000, 0.750, 1.500, 1.500 max_d=1.500 avg_d=0.750 std_dev=0.750
OP2	B	0, 0.000, 0.790, 1.581, 1.581 max_d=1.581 avg_d=0.790 std_dev=0.790
O3'	A	0, 0.000, 0.811, 1.622, 1.622 max_d=1.622 avg_d=0.811 std_dev=0.811
C5'	B	0, 0.000, 1.460, 2.919, 2.919 max_d=2.919 avg_d=1.460 std_dev=1.460
C4'	B	0, 0.000, 2.276, 4.553, 4.553 max_d=4.553 avg_d=2.276 std_dev=2.276
O4'	B	0, 0.000, 2.998, 5.995, 5.995 max_d=5.995 avg_d=2.998 std_dev=2.998
C3'	B	0, 0.000, 3.196, 6.393, 6.393 max_d=6.393 avg_d=3.196 std_dev=3.196
O3'	B	0, 0.000, 3.441, 6.882, 6.882 max_d=6.882 avg_d=3.441 std_dev=3.441
C6	B	0, 0.000, 4.108, 8.217, 8.217 max_d=8.217 avg_d=4.108 std_dev=4.108
C1'	B	0, 0.000, 4.156, 8.312, 8.312 max_d=8.312 avg_d=4.156 std_dev=4.156
C2'	B	0, 0.000, 4.185, 8.370, 8.370 max_d=8.370 avg_d=4.185 std_dev=4.185
O2'	B	0, 0.000, 4.613, 9.227, 9.227 max_d=9.227 avg_d=4.613 std_dev=4.613
N1	B	0, 0.000, 4.764, 9.529, 9.529 max_d=9.529 avg_d=4.764 std_dev=4.764
C5	B	0, 0.000, 4.800, 9.601, 9.601 max_d=9.601 avg_d=4.800 std_dev=4.800
C2	B	0, 0.000, 6.119, 12.237, 12.237 max_d=12.237 avg_d=6.119 std_dev=6.119
C4	B	0, 0.000, 6.213, 12.426, 12.426 max_d=12.426 avg_d=6.213 std_dev=6.213
N3	B	0, 0.000, 6.746, 13.492, 13.492 max_d=13.492 avg_d=6.746 std_dev=6.746
O2	B	0, 0.000, 6.771, 13.542, 13.542 max_d=13.542 avg_d=6.771 std_dev=6.771
O4	B	0, 0.000, 7.030, 14.060, 14.060 max_d=14.060 avg_d=7.030 std_dev=7.030

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.03	0.03
C2	0.04	0.00	0.13	0.05	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.24	0.10	0.00	0.07	0.00	0.11	0.17	0.09
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.10	0.08	0.19	0.13	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.16	0.06
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.10	0.21	0.02	0.13	0.07	0.20	0.08	0.00	0.00	0.00	0.02	0.15	0.19	0.23	0.13
C4	0.02	0.00	0.05	0.04	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.02	0.00	0.09	0.00	0.11	0.14	0.08
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.07	0.12	0.02	0.09	0.04	0.12	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.10	0.07	0.07	0.01
C5	0.00	0.01	0.01	0.12	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.13	0.01	0.17	0.01	0.19	0.22	0.17
C5'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.14	0.16	0.09	0.03	0.00	0.18	0.06	0.03	0.00	0.01	0.00	0.19	0.02	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.02	0.10	0.00	0.07	0.00	0.14	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.11	0.11	0.02	0.19	0.00	0.22	0.27	0.21
C8	0.01	0.01	0.10	0.21	0.00	0.12	0.01	0.16	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.23	0.00	0.17	0.03	0.16	0.15	0.12
N1	0.03	0.00	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.18	0.00	0.01	0.14	0.00	0.17	0.23	0.16
N2	0.07	0.00	0.19	0.13	0.01	0.09	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.33	0.20	0.03	0.03	0.01	0.07	0.15	0.06
N3	0.04	0.00	0.13	0.07	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.22	0.11	0.01	0.04	0.01	0.07	0.12	0.04
N7	0.01	0.01	0.07	0.20	0.00	0.12	0.01	0.18	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.24	0.01	0.22	0.03	0.22	0.23	0.20
N9	0.00	0.01	0.01	0.08	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.00	0.07	0.01	0.09	0.09	0.04
O2'	0.01	0.24	0.00	0.00	0.11	0.04	0.06	0.03	0.11	0.06	0.18	0.33	0.22	0.02	0.02	0.00	0.02	0.04	0.02	0.08	0.17	0.17	0.08
O3'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.02	0.01	0.13	0.00	0.11	0.23	0.00	0.20	0.11	0.24	0.07	0.02	0.00	0.01	0.05	0.17	0.30	0.35	0.22
O4'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.05	0.03	0.04	0.08	0.11
O5'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.09	0.01	0.17	0.00	0.19	0.17	0.14	0.03	0.04	0.22	0.07	0.02	0.05	0.05	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01
O6	0.00	0.00	0.01	0.15	0.00	0.10	0.01	0.19	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.08	0.17	0.03	0.24	0.00	0.28	0.33	0.27
OP1	0.04	0.11	0.14	0.19	0.11	0.07	0.19	0.02	0.22	0.16	0.17	0.07	0.07	0.22	0.09	0.17	0.30	0.04	0.01	0.28	0.00	0.00	0.01
OP2	0.03	0.17	0.16	0.23	0.14	0.07	0.22	0.02	0.27	0.15	0.23	0.15	0.12	0.23	0.09	0.17	0.35	0.08	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.09	0.06	0.13	0.08	0.01	0.17	0.01	0.21	0.12	0.16	0.06	0.04	0.20	0.04	0.08	0.22	0.11	0.01	0.27	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	1.33	2.52	1.43	1.25	3.26	0.60	2.61	0.51	1.98	1.95	3.13	2.46	1.41	1.13	3.85	0.78	0.05	0.28	0.42	0.11
C2	1.20	2.13	1.19	1.08	2.78	0.58	2.42	0.53	1.89	1.77	2.59	1.97	1.18	0.93	3.10	0.78	0.01	0.39	0.45	0.06
C2'	1.48	2.76	1.50	1.25	3.51	0.61	2.77	0.40	2.11	2.12	3.41	2.73	1.49	1.13	4.18	0.87	0.14	0.21	0.44	0.19
C3'	1.43	2.65	1.45	1.22	3.41	0.60	2.70	0.41	2.05	2.04	3.29	2.62	1.44	1.11	4.09	0.84	0.07	0.28	0.34	0.10
C4	1.07	2.07	1.12	1.01	2.83	0.46	2.36	0.44	1.76	1.64	2.61	1.94	1.10	0.87	3.31	0.61	0.04	0.27	0.39	0.09
C4'	1.33	2.52	1.42	1.23	3.25	0.59	2.59	0.48	1.95	1.94	3.14	2.49	1.40	1.13	3.89	0.76	0.04	0.30	0.37	0.09
C5	0.70	1.53	0.74	0.70	2.29	0.22	1.95	0.28	1.38	1.20	2.02	1.37	0.73	0.56	2.73	0.32	0.07	0.16	0.32	0.11
C5'	1.20	2.31	1.31	1.17	3.04	0.54	2.42	0.49	1.82	1.78	2.90	2.27	1.29	1.07	3.65	0.68	0.02	0.34	0.29	0.02
C6	0.46	1.15	0.47	0.48	1.87	0.06	1.65	0.17	1.14	0.91	1.58	0.97	0.49	0.33	2.23	0.15	0.10	0.10	0.30	0.12
C8	0.84	1.78	0.92	0.85	2.55	0.30	2.09	0.33	1.51	1.37	2.32	1.66	0.90	0.71	3.08	0.40	0.06	0.18	0.31	0.10
N1	0.73	1.47	0.71	0.67	2.15	0.25	1.93	0.31	1.43	1.22	1.89	1.29	0.72	0.52	2.45	0.41	0.07	0.26	0.39	0.09
N2	1.51	2.42	1.47	1.33	2.91	0.84	2.56	0.72	2.13	2.06	2.80	2.27	1.45	1.18	3.12	1.09	0.08	0.52	0.44	0.02
N3	1.34	2.40	1.37	1.22	3.10	0.65	2.60	0.56	2.01	1.94	2.94	2.28	1.34	1.09	3.53	0.85	0.01	0.37	0.43	0.07
N7	0.58	1.39	0.65	0.64	2.15	0.14	1.80	0.23	1.25	1.07	1.89	1.24	0.64	0.49	2.63	0.21	0.08	0.12	0.27	0.10
N9	1.11	2.17	1.19	1.06	2.93	0.48	2.39	0.44	1.78	1.69	2.74	2.06	1.16	0.94	3.48	0.62	0.04	0.26	0.37	0.10
O2'	1.59	2.98	1.63	1.30	3.68	0.63	2.86	0.36	2.20	2.26	3.65	2.99	1.62	1.20	4.36	0.93	0.25	0.14	0.58	0.29
O3'	1.54	2.84	1.52	1.24	3.59	0.62	2.82	0.37	2.15	2.17	3.50	2.83	1.53	1.13	4.29	0.92	0.12	0.25	0.35	0.14
O4'	1.23	2.37	1.37	1.22	3.09	0.57	2.47	0.53	1.87	1.83	2.96	2.32	1.34	1.12	3.68	0.70	0.02	0.30	0.39	0.08
O5'	1.05	2.05	1.14	1.06	2.77	0.47	2.23	0.46	1.65	1.58	2.60	1.98	1.12	0.95	3.35	0.58	0.06	0.34	0.21	0.03
O6	0.04	0.57	0.07	0.14	1.24	0.22	1.12	0.03	0.67	0.41	0.95	0.38	0.10	0.01	1.57	0.20	0.15	0.08	0.21	0.14
OP1	1.05	2.03	1.14	1.04	2.75	0.46	2.21	0.45	1.64	1.57	2.58	1.97	1.12	0.92	3.33	0.57	0.09	0.33	0.10	0.07
OP2	0.85	1.67	0.91	0.88	2.38	0.37	1.96	0.41	1.43	1.31	2.17	1.57	0.90	0.74	2.91	0.45	0.16	0.32	0.03	0.14
P	0.92	1.84	1.01	0.95	2.57	0.40	2.09	0.42	1.53	1.42	2.38	1.75	0.99	0.82	3.13	0.48	0.09	0.32	0.11	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.07	0.04	0.01	0.07	0.14	0.01	0.23	0.04	0.00	0.16	0.24	0.84	0.15
C2	0.08	0.00	0.10	0.27	0.02	0.08	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00	0.27	0.01	0.03	0.08	0.30	0.08	1.21	0.40
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.02	0.00	0.09	0.18	0.11	0.00	0.05	0.19	0.00	0.02	0.02	0.01	0.05	0.18	0.53	0.01
C3'	0.00	0.27	0.00	0.00	0.31	0.00	0.24	0.02	0.16	0.18	0.32	0.24	0.02	0.00	0.34	0.01	0.08	0.03	0.37	0.01
C4	0.03	0.02	0.02	0.31	0.00	0.16	0.01	0.21	0.01	0.02	0.01	0.01	0.36	0.12	0.00	0.03	0.55	0.52	1.66	0.76
C4'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.16	0.00	0.16	0.01	0.11	0.07	0.12	0.01	0.24	0.02	0.19	0.01	0.03	0.29	0.26	0.09
C5	0.02	0.00	0.09	0.24	0.01	0.16	0.00	0.16	0.01	0.00	0.00	0.00	0.29	0.10	0.03	0.10	0.57	0.52	1.71	0.79
C5'	0.07	0.09	0.18	0.02	0.21	0.01	0.16	0.00	0.05	0.02	0.17	0.04	0.05	0.14	0.27	0.02	0.01	0.07	0.12	0.03
C6	0.04	0.00	0.11	0.16	0.01	0.11	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.21	0.02	0.02	0.10	0.45	0.26	1.47	0.58
N1	0.01	0.01	0.00	0.18	0.02	0.07	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.18	0.03	0.02	0.01	0.30	0.02	1.18	0.37
N3	0.07	0.01	0.05	0.32	0.01	0.12	0.00	0.17	0.00	0.02	0.00	0.00	0.35	0.08	0.03	0.04	0.43	0.31	1.45	0.59
O2	0.14	0.00	0.19	0.24	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.02	0.00	0.00	0.24	0.06	0.04	0.16	0.17	0.08	1.00	0.24
O2'	0.01	0.27	0.00	0.02	0.36	0.24	0.29	0.05	0.21	0.18	0.35	0.24	0.00	0.02	0.41	0.18	0.19	0.07	0.67	0.16
O3'	0.23	0.01	0.02	0.00	0.12	0.02	0.10	0.14	0.02	0.03	0.08	0.06	0.02	0.00	0.15	0.17	0.08	0.10	0.20	0.05
O4	0.04	0.03	0.02	0.34	0.00	0.19	0.03	0.27	0.02	0.02	0.03	0.04	0.41	0.15	0.00	0.03	0.62	0.67	1.77	0.87
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.03	0.01	0.10	0.02	0.10	0.01	0.04	0.16	0.18	0.17	0.03	0.00	0.21	0.37	0.69	0.09
O5'	0.16	0.30	0.05	0.08	0.55	0.03	0.57	0.01	0.45	0.30	0.43	0.17	0.19	0.08	0.62	0.21	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.24	0.08	0.18	0.03	0.52	0.29	0.52	0.07	0.26	0.02	0.31	0.08	0.07	0.10	0.67	0.37	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.84	1.21	0.53	0.37	1.66	0.26	1.71	0.12	1.47	1.18	1.45	1.00	0.67	0.20	1.77	0.69	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.15	0.40	0.01	0.01	0.76	0.09	0.79	0.03	0.58	0.37	0.59	0.24	0.16	0.05	0.87	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00