Doublet Group distance statistics: 51496

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 13, 20, 11, 8, 3, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.013, 0.019, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.013 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C2	A	0, -0.001, 0.011, 0.022, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.005, 0.017, 0.030, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.008, 0.022, 0.035, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.022 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.002, 0.018, 0.034, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.018 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.009, 0.025, 0.041, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.025 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.013, 0.032, 0.051, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.032 std_dev=0.019
O6	A	0, 0.017, 0.040, 0.064, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.040 std_dev=0.024
N2	A	0, 0.000, 0.026, 0.052, 0.177 max_d=0.177 avg_d=0.026 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.022, 0.049, 0.076, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.049 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.024, 0.056, 0.089, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.056 std_dev=0.032
O2'	B	0, 0.158, 0.302, 0.445, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.302 std_dev=0.144
C2'	B	0, 0.100, 0.314, 0.528, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.314 std_dev=0.214
O4'	A	0, -0.100, 0.215, 0.530, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.215 std_dev=0.315
C3'	B	0, 0.174, 0.496, 0.819, 1.670 max_d=1.670 avg_d=0.496 std_dev=0.322
C2'	A	0, -0.099, 0.238, 0.575, 1.462 max_d=1.462 avg_d=0.238 std_dev=0.337
C1'	B	0, -0.088, 0.372, 0.833, 3.349 max_d=3.349 avg_d=0.372 std_dev=0.461
C4'	A	0, -0.138, 0.355, 0.847, 2.004 max_d=2.004 avg_d=0.355 std_dev=0.493
O3'	B	0, 0.129, 0.626, 1.124, 3.078 max_d=3.078 avg_d=0.626 std_dev=0.498
O2'	A	0, -0.136, 0.369, 0.874, 2.106 max_d=2.106 avg_d=0.369 std_dev=0.505
C3'	A	0, -0.148, 0.393, 0.933, 2.068 max_d=2.068 avg_d=0.393 std_dev=0.540
O5'	A	0, -0.086, 0.509, 1.105, 2.426 max_d=2.426 avg_d=0.509 std_dev=0.596
C4'	B	0, -0.057, 0.577, 1.211, 4.145 max_d=4.145 avg_d=0.577 std_dev=0.634
C5'	A	0, -0.117, 0.538, 1.192, 2.666 max_d=2.666 avg_d=0.538 std_dev=0.655
P	A	0, -0.056, 0.628, 1.313, 2.711 max_d=2.711 avg_d=0.628 std_dev=0.685
O4'	B	0, -0.206, 0.492, 1.189, 5.056 max_d=5.056 avg_d=0.492 std_dev=0.697
OP2	A	0, -0.032, 0.692, 1.417, 3.496 max_d=3.496 avg_d=0.692 std_dev=0.724
N9	B	0, -0.299, 0.458, 1.215, 4.896 max_d=4.896 avg_d=0.458 std_dev=0.757
OP1	A	0, 0.003, 0.806, 1.610, 3.759 max_d=3.759 avg_d=0.806 std_dev=0.804
O3'	A	0, -0.246, 0.562, 1.370, 3.308 max_d=3.308 avg_d=0.562 std_dev=0.808
N3	B	0, -0.295, 0.515, 1.324, 5.163 max_d=5.163 avg_d=0.515 std_dev=0.810
C4	B	0, -0.387, 0.488, 1.363, 4.935 max_d=4.935 avg_d=0.488 std_dev=0.875
C5'	B	0, -0.161, 0.729, 1.620, 5.184 max_d=5.184 avg_d=0.729 std_dev=0.891
O5'	B	0, -0.219, 0.782, 1.783, 5.705 max_d=5.705 avg_d=0.782 std_dev=1.001
C2	B	0, -0.443, 0.622, 1.687, 6.866 max_d=6.866 avg_d=0.622 std_dev=1.065
C8	B	0, -0.510, 0.618, 1.746, 7.127 max_d=7.127 avg_d=0.618 std_dev=1.128
N2	B	0, -0.469, 0.737, 1.943, 7.855 max_d=7.855 avg_d=0.737 std_dev=1.206
C5	B	0, -0.615, 0.628, 1.871, 7.190 max_d=7.190 avg_d=0.628 std_dev=1.243
N1	B	0, -0.644, 0.685, 2.014, 8.018 max_d=8.018 avg_d=0.685 std_dev=1.329
P	B	0, -0.491, 0.919, 2.329, 7.935 max_d=7.935 avg_d=0.919 std_dev=1.410
N7	B	0, -0.698, 0.716, 2.131, 8.664 max_d=8.664 avg_d=0.716 std_dev=1.414
C6	B	0, -0.756, 0.716, 2.187, 7.967 max_d=7.967 avg_d=0.716 std_dev=1.472
OP1	B	0, -0.540, 0.997, 2.533, 8.665 max_d=8.665 avg_d=0.997 std_dev=1.536
OP2	B	0, -0.606, 0.984, 2.573, 8.993 max_d=8.993 avg_d=0.984 std_dev=1.590
O6	B	0, -0.960, 0.862, 2.684, 9.875 max_d=9.875 avg_d=0.862 std_dev=1.822

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.18	0.01	0.15	0.02	0.18	0.22	0.15
C2	0.03	0.00	0.24	0.22	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.15	0.15	0.15	0.16	0.01	0.28	0.18	0.14
C2'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.13	0.02	0.08	0.14	0.12	0.12	0.19	0.29	0.24	0.08	0.04	0.00	0.02	0.01	0.31	0.11	0.38	0.39	0.34
C3'	0.02	0.22	0.00	0.00	0.22	0.00	0.28	0.01	0.30	0.27	0.27	0.21	0.19	0.31	0.19	0.02	0.01	0.02	0.12	0.33	0.20	0.07	0.09
C4	0.02	0.01	0.13	0.22	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.10	0.07	0.17	0.01	0.25	0.18	0.13
C4'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.09	0.17	0.05	0.10	0.06	0.16	0.08	0.20	0.01	0.00	0.01	0.12	0.10	0.12	0.03
C5	0.01	0.01	0.08	0.28	0.00	0.10	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.17	0.18	0.03	0.23	0.01	0.29	0.22	0.16
C5'	0.06	0.10	0.14	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.10	0.17	0.09	0.14	0.10	0.17	0.07	0.08	0.14	0.01	0.01	0.13	0.17	0.16	0.01
C6	0.02	0.01	0.12	0.30	0.01	0.09	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.16	0.19	0.05	0.24	0.01	0.33	0.24	0.18
C8	0.01	0.02	0.12	0.27	0.01	0.17	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.24	0.21	0.11	0.25	0.02	0.23	0.20	0.14
N1	0.03	0.00	0.19	0.27	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.14	0.11	0.20	0.01	0.31	0.21	0.15
N2	0.04	0.01	0.29	0.21	0.01	0.10	0.02	0.14	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.21	0.20	0.18	0.15	0.02	0.28	0.18	0.15
N3	0.03	0.00	0.24	0.19	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.15	0.15	0.15	0.01	0.25	0.18	0.14
N7	0.01	0.02	0.08	0.31	0.01	0.16	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.25	0.25	0.07	0.29	0.02	0.30	0.26	0.19
N9	0.01	0.01	0.04	0.19	0.01	0.08	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.12	0.09	0.01	0.16	0.02	0.21	0.18	0.12
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.10	0.20	0.17	0.08	0.16	0.24	0.12	0.21	0.15	0.25	0.12	0.00	0.05	0.14	0.22	0.20	0.31	0.42	0.28
O3'	0.18	0.15	0.02	0.01	0.10	0.01	0.18	0.14	0.19	0.21	0.14	0.20	0.15	0.25	0.09	0.05	0.00	0.13	0.18	0.24	0.32	0.20	0.19
O4'	0.01	0.15	0.01	0.02	0.07	0.00	0.03	0.01	0.05	0.11	0.11	0.18	0.15	0.07	0.01	0.14	0.13	0.00	0.06	0.03	0.08	0.16	0.10
O5'	0.15	0.16	0.31	0.12	0.17	0.01	0.23	0.01	0.24	0.25	0.20	0.15	0.15	0.29	0.16	0.22	0.18	0.06	0.00	0.28	0.02	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.11	0.33	0.01	0.12	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.20	0.24	0.03	0.28	0.00	0.36	0.30	0.22
OP1	0.18	0.28	0.38	0.20	0.25	0.10	0.29	0.17	0.33	0.23	0.31	0.28	0.25	0.30	0.21	0.31	0.32	0.08	0.02	0.36	0.00	0.01	0.00
OP2	0.22	0.18	0.39	0.07	0.18	0.12	0.22	0.16	0.24	0.20	0.21	0.18	0.18	0.26	0.18	0.42	0.20	0.16	0.01	0.30	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.14	0.34	0.09	0.13	0.03	0.16	0.01	0.18	0.14	0.15	0.15	0.14	0.19	0.12	0.28	0.19	0.10	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.64	0.11	0.07	0.61	0.08	0.91	0.16	1.08	0.76	0.90	0.70	0.48	0.98	0.52	0.11	0.15	0.23	0.33	1.31	0.23	0.60	0.36
C2	0.22	0.40	0.12	0.09	0.46	0.09	0.70	0.16	0.69	0.73	0.48	0.52	0.35	0.85	0.47	0.12	0.13	0.18	0.36	0.80	0.27	0.61	0.40
C2'	0.44	0.82	0.38	0.32	0.80	0.32	1.09	0.39	1.28	0.90	1.15	0.73	0.64	1.11	0.70	0.34	0.28	0.42	0.50	1.48	0.44	0.66	0.51
C3'	0.44	0.90	0.35	0.26	0.88	0.28	1.24	0.39	1.49	1.02	1.31	0.80	0.69	1.29	0.76	0.30	0.15	0.42	0.54	1.79	0.49	0.76	0.59
C4	0.24	0.52	0.12	0.08	0.55	0.09	0.88	0.20	0.96	0.82	0.70	0.69	0.41	1.02	0.52	0.12	0.13	0.22	0.41	1.17	0.30	0.71	0.47
C4'	0.29	0.73	0.15	0.12	0.71	0.12	1.05	0.21	1.28	0.85	1.09	0.68	0.54	1.11	0.59	0.15	0.21	0.27	0.37	1.59	0.30	0.64	0.42
C5	0.24	0.54	0.14	0.12	0.52	0.13	0.88	0.26	0.93	0.89	0.67	0.73	0.40	1.11	0.53	0.14	0.16	0.24	0.51	1.18	0.44	0.87	0.62
C5'	0.25	0.62	0.15	0.14	0.64	0.12	1.01	0.22	1.22	0.84	0.99	0.58	0.45	1.11	0.55	0.18	0.23	0.25	0.38	1.57	0.32	0.70	0.46
C6	0.24	0.54	0.17	0.15	0.48	0.16	0.81	0.30	0.81	0.90	0.61	0.73	0.41	1.09	0.52	0.17	0.21	0.24	0.57	1.01	0.52	0.93	0.68
C8	0.25	0.55	0.13	0.09	0.56	0.11	0.93	0.24	1.05	0.87	0.77	0.73	0.41	1.11	0.54	0.13	0.13	0.25	0.48	1.35	0.38	0.84	0.58
N1	0.23	0.45	0.15	0.14	0.43	0.14	0.71	0.24	0.67	0.83	0.48	0.61	0.37	0.96	0.49	0.16	0.18	0.21	0.49	0.81	0.42	0.79	0.57
N2	0.21	0.34	0.11	0.08	0.38	0.09	0.53	0.10	0.51	0.57	0.39	0.41	0.32	0.64	0.40	0.10	0.13	0.14	0.25	0.58	0.21	0.45	0.26
N3	0.23	0.50	0.11	0.07	0.53	0.07	0.80	0.14	0.86	0.73	0.66	0.61	0.41	0.90	0.49	0.11	0.14	0.19	0.32	1.00	0.23	0.57	0.35
N7	0.25	0.56	0.15	0.12	0.54	0.14	0.91	0.29	1.00	0.91	0.72	0.76	0.40	1.15	0.54	0.14	0.17	0.26	0.55	1.30	0.48	0.94	0.67
N9	0.24	0.56	0.11	0.07	0.58	0.08	0.91	0.19	1.04	0.81	0.79	0.70	0.43	1.04	0.53	0.11	0.13	0.23	0.40	1.30	0.29	0.71	0.46
O2'	0.24	0.75	0.22	0.19	0.60	0.16	0.82	0.16	1.02	0.60	0.99	0.75	0.53	0.79	0.46	0.27	0.25	0.21	0.26	1.18	0.32	0.37	0.22
O3'	0.32	0.95	0.24	0.18	0.82	0.18	1.18	0.27	1.48	0.89	1.36	0.87	0.68	1.18	0.65	0.26	0.23	0.32	0.40	1.79	0.41	0.60	0.44
O4'	0.26	0.62	0.14	0.20	0.59	0.18	0.90	0.18	1.09	0.74	0.89	0.67	0.48	0.98	0.50	0.18	0.31	0.26	0.31	1.37	0.24	0.61	0.35
O5'	0.30	0.53	0.19	0.16	0.63	0.22	1.02	0.36	1.20	0.92	0.90	0.54	0.39	1.18	0.59	0.16	0.22	0.33	0.53	1.58	0.39	0.89	0.62
O6	0.25	0.61	0.19	0.19	0.48	0.20	0.80	0.36	0.82	0.93	0.68	0.82	0.46	1.11	0.51	0.19	0.27	0.26	0.66	1.01	0.66	1.07	0.82
OP1	0.27	0.29	0.32	0.30	0.45	0.29	0.84	0.36	0.99	0.78	0.65	0.39	0.23	1.03	0.46	0.32	0.32	0.31	0.48	1.38	0.37	0.80	0.57
OP2	0.32	0.53	0.18	0.16	0.61	0.22	1.01	0.40	1.14	0.97	0.81	0.66	0.42	1.23	0.61	0.18	0.21	0.36	0.62	1.53	0.54	1.06	0.77
P	0.21	0.42	0.15	0.13	0.52	0.15	0.92	0.29	1.08	0.85	0.75	0.52	0.30	1.12	0.50	0.17	0.22	0.25	0.48	1.46	0.39	0.88	0.61

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.13	0.00	0.11	0.01	0.23	0.21	0.14
C2	0.03	0.00	0.18	0.13	0.01	0.08	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.11	0.15	0.17	0.01	0.32	0.32	0.20
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.09	0.02	0.04	0.08	0.07	0.11	0.13	0.22	0.17	0.07	0.02	0.00	0.03	0.01	0.23	0.05	0.27	0.33	0.25
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.12	0.00	0.14	0.01	0.15	0.12	0.14	0.14	0.11	0.14	0.09	0.02	0.01	0.01	0.12	0.16	0.23	0.11	0.12
C4	0.01	0.01	0.09	0.12	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.09	0.08	0.17	0.01	0.33	0.32	0.20
C4'	0.01	0.08	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.04	0.11	0.05	0.12	0.08	0.10	0.04	0.13	0.02	0.00	0.01	0.05	0.13	0.11	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.14	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.10	0.03	0.20	0.01	0.40	0.38	0.24
C5'	0.04	0.11	0.08	0.01	0.07	0.01	0.09	0.00	0.09	0.13	0.09	0.14	0.10	0.13	0.06	0.07	0.10	0.01	0.01	0.11	0.12	0.15	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.15	0.01	0.04	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.10	0.06	0.20	0.00	0.41	0.40	0.25
C8	0.02	0.01	0.11	0.12	0.01	0.11	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.21	0.10	0.09	0.20	0.02	0.42	0.35	0.25
N1	0.02	0.00	0.13	0.14	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.10	0.11	0.19	0.01	0.37	0.37	0.23
N2	0.04	0.00	0.22	0.14	0.01	0.12	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.27	0.12	0.18	0.17	0.01	0.30	0.31	0.19
N3	0.03	0.00	0.17	0.11	0.00	0.08	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.11	0.15	0.17	0.01	0.29	0.29	0.18
N7	0.01	0.01	0.07	0.14	0.01	0.10	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.19	0.11	0.06	0.22	0.02	0.46	0.41	0.27
N9	0.00	0.01	0.02	0.09	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.08	0.01	0.16	0.01	0.32	0.29	0.19
O2'	0.01	0.19	0.00	0.02	0.08	0.13	0.10	0.07	0.09	0.21	0.12	0.27	0.19	0.19	0.08	0.00	0.03	0.09	0.14	0.12	0.22	0.33	0.18
O3'	0.13	0.11	0.03	0.01	0.09	0.02	0.10	0.10	0.10	0.10	0.10	0.12	0.11	0.11	0.08	0.03	0.00	0.09	0.07	0.11	0.21	0.12	0.08
O4'	0.00	0.15	0.01	0.01	0.08	0.00	0.03	0.01	0.06	0.09	0.11	0.18	0.15	0.06	0.01	0.09	0.09	0.00	0.06	0.05	0.23	0.17	0.11
O5'	0.11	0.17	0.23	0.12	0.17	0.01	0.20	0.01	0.20	0.20	0.19	0.17	0.17	0.22	0.16	0.14	0.07	0.06	0.00	0.22	0.02	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.05	0.16	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.12	0.11	0.05	0.22	0.00	0.45	0.44	0.28
OP1	0.23	0.32	0.27	0.23	0.33	0.13	0.40	0.12	0.41	0.42	0.37	0.30	0.29	0.46	0.32	0.22	0.21	0.23	0.02	0.45	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.32	0.33	0.11	0.32	0.11	0.38	0.15	0.40	0.35	0.37	0.31	0.29	0.41	0.29	0.33	0.12	0.17	0.01	0.44	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.20	0.25	0.12	0.20	0.04	0.24	0.01	0.25	0.25	0.23	0.19	0.18	0.27	0.19	0.18	0.08	0.11	0.00	0.28	0.01	0.01	0.00