Doublet Group distance statistics: 51500

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 15, 8, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.013, 0.017, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.013 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.008, 0.014, 0.020, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.017, 0.024, 0.032, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.024 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.013, 0.020, 0.027, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.017, 0.026, 0.035, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.026 std_dev=0.009
N2	A	0, 0.022, 0.032, 0.043, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.032 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.016, 0.027, 0.038, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.027 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.021, 0.033, 0.045, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.033 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.017, 0.031, 0.045, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.031 std_dev=0.014
O6	A	0, 0.028, 0.043, 0.059, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.043 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.034, 0.058, 0.082, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.058 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.038, 0.066, 0.094, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.066 std_dev=0.028
O2'	B	0, 0.111, 0.293, 0.474, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.293 std_dev=0.181
C2'	B	0, 0.681, 0.877, 1.072, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.877 std_dev=0.196
C3'	B	0, 0.965, 1.246, 1.527, 1.663 max_d=1.663 avg_d=1.246 std_dev=0.281
O4'	A	0, -0.128, 0.155, 0.439, 1.530 max_d=1.530 avg_d=0.155 std_dev=0.284
O3'	B	0, 0.440, 0.733, 1.026, 1.941 max_d=1.941 avg_d=0.733 std_dev=0.293
C2'	A	0, -0.215, 0.127, 0.468, 1.795 max_d=1.795 avg_d=0.127 std_dev=0.341
N9	B	0, 1.347, 1.706, 2.065, 2.110 max_d=2.110 avg_d=1.706 std_dev=0.359
C1'	B	0, 1.282, 1.686, 2.090, 1.922 max_d=1.922 avg_d=1.686 std_dev=0.404
C3'	A	0, -0.205, 0.219, 0.643, 2.286 max_d=2.286 avg_d=0.219 std_dev=0.424
C4'	A	0, -0.251, 0.193, 0.637, 2.358 max_d=2.358 avg_d=0.193 std_dev=0.444
O3'	A	0, -0.070, 0.383, 0.835, 2.557 max_d=2.557 avg_d=0.383 std_dev=0.452
O2'	A	0, -0.290, 0.206, 0.702, 2.622 max_d=2.622 avg_d=0.206 std_dev=0.496
O5'	A	0, 0.095, 0.599, 1.103, 3.011 max_d=3.011 avg_d=0.599 std_dev=0.504
C4	B	0, 1.230, 1.738, 2.246, 3.563 max_d=3.563 avg_d=1.738 std_dev=0.508
O4'	B	0, 2.097, 2.641, 3.185, 2.945 max_d=2.945 avg_d=2.641 std_dev=0.544
C4'	B	0, 1.719, 2.273, 2.826, 3.785 max_d=3.785 avg_d=2.273 std_dev=0.554
C8	B	0, 1.150, 1.744, 2.338, 4.124 max_d=4.124 avg_d=1.744 std_dev=0.594
OP2	A	0, 0.041, 0.652, 1.264, 3.566 max_d=3.566 avg_d=0.652 std_dev=0.611
N3	B	0, 1.165, 1.806, 2.448, 4.436 max_d=4.436 avg_d=1.806 std_dev=0.641
C5'	A	0, -0.178, 0.473, 1.124, 3.638 max_d=3.638 avg_d=0.473 std_dev=0.651
P	A	0, -0.009, 0.674, 1.357, 3.947 max_d=3.947 avg_d=0.674 std_dev=0.683
C5	B	0, 0.936, 1.745, 2.554, 5.351 max_d=5.351 avg_d=1.745 std_dev=0.809
C5'	B	0, 2.367, 3.220, 4.073, 5.976 max_d=5.976 avg_d=3.220 std_dev=0.853
N7	B	0, 0.887, 1.747, 2.607, 5.629 max_d=5.629 avg_d=1.747 std_dev=0.860
OP1	A	0, 0.085, 0.958, 1.831, 5.122 max_d=5.122 avg_d=0.958 std_dev=0.873
O5'	B	0, 2.116, 2.999, 3.881, 6.212 max_d=6.212 avg_d=2.999 std_dev=0.883
C2	B	0, 0.833, 1.860, 2.888, 6.600 max_d=6.600 avg_d=1.860 std_dev=1.027
C6	B	0, 0.607, 1.790, 2.974, 7.356 max_d=7.356 avg_d=1.790 std_dev=1.184
N1	B	0, 0.597, 1.843, 3.088, 7.719 max_d=7.719 avg_d=1.843 std_dev=1.246
N2	B	0, 0.627, 1.966, 3.304, 8.292 max_d=8.292 avg_d=1.966 std_dev=1.338
P	B	0, 0.854, 2.239, 3.624, 8.717 max_d=8.717 avg_d=2.239 std_dev=1.385
OP2	B	0, -0.045, 1.443, 2.932, 8.624 max_d=8.624 avg_d=1.443 std_dev=1.488
O6	B	0, 0.278, 1.809, 3.340, 9.136 max_d=9.136 avg_d=1.809 std_dev=1.531
OP1	B	0, 1.152, 2.863, 4.574, 10.841 max_d=10.841 avg_d=2.863 std_dev=1.711

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.00	0.05	0.01	0.05	0.10	0.06
C2	0.01	0.00	0.24	0.22	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.10	0.11	0.04	0.00	0.06	0.07	0.04
C2'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.12	0.01	0.05	0.09	0.10	0.11	0.18	0.29	0.24	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.07	0.22	0.29	0.24
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.18	0.00	0.19	0.01	0.22	0.10	0.23	0.23	0.20	0.15	0.11	0.01	0.00	0.01	0.05	0.22	0.06	0.04	0.06
C4	0.01	0.00	0.12	0.18	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.07	0.06	0.04	0.00	0.05	0.07	0.04
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.06	0.04	0.03	0.03	0.06	0.04	0.15	0.01	0.00	0.01	0.06	0.04	0.02	0.01
C5	0.00	0.00	0.05	0.19	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.10	0.03	0.06	0.00	0.06	0.07	0.05
C5'	0.04	0.03	0.09	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.03	0.03	0.04	0.04	0.04	0.02	0.06	0.10	0.01	0.00	0.04	0.07	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.10	0.22	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.13	0.05	0.07	0.00	0.08	0.08	0.06
C8	0.00	0.00	0.11	0.10	0.00	0.06	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.04	0.06	0.05	0.01	0.05	0.08	0.05
N1	0.01	0.00	0.18	0.23	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.13	0.08	0.06	0.00	0.07	0.07	0.05
N2	0.02	0.00	0.29	0.23	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.19	0.11	0.13	0.04	0.01	0.06	0.07	0.04
N3	0.01	0.00	0.24	0.20	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.07	0.10	0.04	0.00	0.04	0.07	0.04
N7	0.00	0.00	0.06	0.15	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.08	0.03	0.07	0.01	0.07	0.08	0.06
N9	0.00	0.00	0.01	0.11	0.00	0.04	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.08	0.05
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.03	0.15	0.12	0.06	0.09	0.21	0.03	0.19	0.13	0.21	0.09	0.00	0.02	0.10	0.16	0.13	0.18	0.31	0.20
O3'	0.11	0.10	0.01	0.00	0.07	0.01	0.10	0.10	0.13	0.04	0.13	0.11	0.07	0.08	0.02	0.02	0.00	0.08	0.05	0.14	0.12	0.08	0.07
O4'	0.00	0.11	0.01	0.01	0.06	0.00	0.03	0.01	0.05	0.06	0.08	0.13	0.10	0.03	0.01	0.10	0.08	0.00	0.06	0.04	0.08	0.05	0.06
O5'	0.05	0.04	0.22	0.05	0.04	0.01	0.06	0.00	0.07	0.05	0.06	0.04	0.04	0.07	0.03	0.16	0.05	0.06	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.07	0.22	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.13	0.14	0.04	0.09	0.00	0.09	0.09	0.07
OP1	0.05	0.06	0.22	0.06	0.05	0.04	0.06	0.07	0.08	0.05	0.07	0.06	0.04	0.07	0.04	0.18	0.12	0.08	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00
OP2	0.10	0.07	0.29	0.04	0.07	0.02	0.07	0.01	0.08	0.08	0.07	0.07	0.07	0.08	0.08	0.31	0.08	0.05	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00
P	0.06	0.04	0.24	0.06	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.05	0.05	0.04	0.04	0.06	0.05	0.20	0.07	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.24	1.53	0.06	0.15	0.97	0.35	1.13	0.46	1.48	0.58	1.68	1.75	1.14	0.88	0.59	0.09	0.17	0.11	0.18	1.60	0.43	0.12	0.27
C2	0.23	1.07	0.06	0.14	0.84	0.33	0.98	0.32	1.16	0.62	1.20	1.03	0.86	0.84	0.57	0.09	0.21	0.10	0.11	1.23	0.12	0.37	0.10
C2'	0.13	1.33	0.27	0.45	0.71	0.66	0.88	0.76	1.27	0.28	1.50	1.60	0.90	0.60	0.29	0.39	0.45	0.38	0.48	1.41	0.79	0.30	0.62
C3'	0.13	1.22	0.26	0.40	0.62	0.61	0.76	0.73	1.13	0.20	1.36	1.51	0.82	0.48	0.23	0.36	0.34	0.37	0.48	1.25	0.79	0.35	0.65
C4	0.23	1.32	0.06	0.14	0.93	0.32	1.14	0.34	1.43	0.67	1.52	1.38	0.99	0.96	0.60	0.10	0.20	0.10	0.11	1.55	0.16	0.35	0.09
C4'	0.13	1.38	0.05	0.19	0.81	0.43	0.94	0.58	1.29	0.39	1.50	1.63	1.00	0.67	0.43	0.12	0.15	0.19	0.32	1.40	0.63	0.18	0.48
C5	0.20	1.17	0.06	0.13	0.90	0.29	1.17	0.24	1.46	0.74	1.46	1.13	0.85	1.05	0.61	0.13	0.22	0.09	0.18	1.64	0.13	0.55	0.19
C5'	0.11	1.32	0.05	0.18	0.78	0.43	0.94	0.56	1.30	0.40	1.48	1.54	0.94	0.69	0.41	0.11	0.14	0.21	0.29	1.44	0.58	0.14	0.44
C6	0.19	0.94	0.06	0.12	0.81	0.26	1.11	0.17	1.34	0.78	1.25	0.81	0.69	1.06	0.59	0.14	0.23	0.08	0.26	1.52	0.26	0.69	0.33
C8	0.21	1.36	0.06	0.13	0.95	0.31	1.21	0.31	1.57	0.72	1.64	1.43	0.98	1.04	0.61	0.12	0.20	0.10	0.13	1.76	0.15	0.41	0.09
N1	0.20	0.88	0.06	0.13	0.79	0.27	1.02	0.20	1.19	0.72	1.12	0.76	0.68	0.96	0.57	0.13	0.23	0.08	0.22	1.30	0.22	0.61	0.27
N2	0.24	0.89	0.06	0.15	0.73	0.35	0.80	0.37	0.92	0.51	0.96	0.87	0.77	0.68	0.51	0.06	0.21	0.11	0.12	0.95	0.14	0.27	0.09
N3	0.24	1.29	0.06	0.15	0.91	0.35	1.04	0.39	1.29	0.59	1.40	1.37	1.01	0.85	0.58	0.08	0.19	0.10	0.12	1.36	0.23	0.25	0.13
N7	0.20	1.21	0.06	0.13	0.91	0.29	1.21	0.24	1.54	0.76	1.54	1.19	0.87	1.09	0.61	0.13	0.22	0.09	0.19	1.76	0.12	0.56	0.19
N9	0.23	1.43	0.06	0.14	0.97	0.33	1.17	0.37	1.51	0.66	1.64	1.56	1.06	0.96	0.61	0.10	0.19	0.10	0.12	1.65	0.25	0.28	0.12
O2'	0.13	1.61	0.14	0.35	0.92	0.54	1.08	0.67	1.50	0.43	1.77	1.91	1.14	0.76	0.47	0.26	0.37	0.24	0.40	1.63	0.80	0.26	0.58
O3'	0.08	1.29	0.15	0.27	0.66	0.49	0.75	0.65	1.10	0.19	1.36	1.62	0.91	0.45	0.27	0.24	0.18	0.28	0.45	1.18	0.80	0.41	0.67
O4'	0.30	1.51	0.15	0.05	0.99	0.27	1.13	0.40	1.47	0.61	1.65	1.73	1.15	0.89	0.63	0.06	0.05	0.10	0.15	1.58	0.39	0.15	0.24
O5'	0.11	1.29	0.08	0.21	0.79	0.43	0.99	0.50	1.36	0.46	1.51	1.47	0.90	0.77	0.43	0.17	0.20	0.21	0.23	1.54	0.46	0.10	0.32
O6	0.17	0.74	0.07	0.11	0.73	0.22	1.09	0.10	1.29	0.82	1.11	0.55	0.53	1.11	0.56	0.16	0.24	0.08	0.36	1.52	0.42	0.86	0.48
OP1	0.09	1.19	0.13	0.26	0.70	0.48	0.91	0.56	1.29	0.38	1.43	1.37	0.81	0.70	0.35	0.22	0.23	0.28	0.28	1.50	0.54	0.10	0.40
OP2	0.12	1.17	0.10	0.20	0.77	0.39	1.04	0.39	1.41	0.56	1.47	1.26	0.80	0.89	0.45	0.19	0.21	0.19	0.14	1.65	0.26	0.29	0.15
P	0.11	1.25	0.07	0.19	0.78	0.41	1.01	0.46	1.38	0.50	1.49	1.39	0.86	0.82	0.44	0.16	0.18	0.20	0.18	1.59	0.39	0.15	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.10	0.00	0.14	0.01	0.23	0.18	0.11
C2	0.02	0.00	0.20	0.18	0.00	0.03	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.08	0.13	0.16	0.00	0.19	0.15	0.12
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.10	0.01	0.04	0.11	0.08	0.11	0.15	0.25	0.20	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.26	0.06	0.48	0.43	0.35
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.15	0.00	0.16	0.01	0.18	0.10	0.19	0.18	0.16	0.13	0.10	0.01	0.00	0.01	0.06	0.19	0.34	0.17	0.16
C4	0.01	0.00	0.10	0.15	0.00	0.02	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.06	0.07	0.15	0.01	0.19	0.16	0.12
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.05	0.02	0.04	0.03	0.05	0.02	0.15	0.01	0.00	0.01	0.03	0.14	0.07	0.03
C5	0.01	0.00	0.04	0.16	0.00	0.03	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.10	0.03	0.15	0.01	0.17	0.14	0.12
C5'	0.06	0.13	0.11	0.01	0.11	0.01	0.12	0.00	0.12	0.10	0.13	0.13	0.12	0.11	0.10	0.05	0.10	0.01	0.00	0.12	0.04	0.04	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.18	0.00	0.02	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.12	0.05	0.15	0.00	0.16	0.14	0.11
C8	0.01	0.00	0.11	0.10	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.19	0.06	0.07	0.15	0.01	0.17	0.16	0.11
N1	0.01	0.00	0.15	0.19	0.00	0.02	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.11	0.10	0.16	0.00	0.17	0.14	0.12
N2	0.02	0.00	0.25	0.18	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.20	0.08	0.15	0.15	0.01	0.19	0.16	0.12
N3	0.02	0.00	0.20	0.16	0.00	0.03	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.06	0.12	0.15	0.00	0.20	0.16	0.12
N7	0.00	0.00	0.06	0.13	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.09	0.04	0.15	0.01	0.15	0.14	0.11
N9	0.00	0.01	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.02	0.01	0.15	0.01	0.20	0.17	0.11
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.04	0.15	0.10	0.05	0.07	0.19	0.07	0.20	0.13	0.18	0.08	0.00	0.03	0.09	0.19	0.10	0.44	0.46	0.31
O3'	0.10	0.08	0.01	0.00	0.06	0.01	0.10	0.10	0.12	0.06	0.11	0.08	0.06	0.09	0.02	0.03	0.00	0.08	0.08	0.14	0.22	0.11	0.07
O4'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.07	0.00	0.03	0.01	0.05	0.07	0.10	0.15	0.12	0.04	0.01	0.09	0.08	0.00	0.04	0.04	0.06	0.12	0.09
O5'	0.14	0.16	0.26	0.06	0.15	0.01	0.15	0.00	0.15	0.15	0.16	0.15	0.15	0.15	0.15	0.19	0.08	0.04	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.06	0.19	0.01	0.03	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.14	0.04	0.14	0.00	0.14	0.13	0.11
OP1	0.23	0.19	0.48	0.34	0.19	0.14	0.17	0.04	0.16	0.17	0.17	0.19	0.20	0.15	0.20	0.44	0.22	0.06	0.01	0.14	0.00	0.00	0.00
OP2	0.18	0.15	0.43	0.17	0.16	0.07	0.14	0.04	0.14	0.16	0.14	0.16	0.16	0.14	0.17	0.46	0.11	0.12	0.01	0.13	0.00	0.00	0.00
P	0.11	0.12	0.35	0.16	0.12	0.03	0.12	0.01	0.11	0.11	0.12	0.12	0.12	0.11	0.11	0.31	0.07	0.09	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00