Doublet Group distance statistics: 51501

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 6, 3, 3, 4, 4, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.010, 0.017, 0.023, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.017 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.014, 0.023, 0.031, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.023 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.017, 0.028, 0.038, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.028 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.013, 0.025, 0.036, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.025 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.019, 0.032, 0.044, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.032 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.006, 0.020, 0.035, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.017, 0.034, 0.051, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.034 std_dev=0.017
C5	A	0, 0.014, 0.032, 0.049, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.032 std_dev=0.017
N2	A	0, 0.025, 0.044, 0.063, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.044 std_dev=0.019
O6	A	0, 0.032, 0.060, 0.088, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.060 std_dev=0.028
N7	A	0, 0.029, 0.066, 0.103, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.066 std_dev=0.037
C8	A	0, 0.034, 0.073, 0.112, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.073 std_dev=0.039
C2'	A	0, 0.019, 0.112, 0.205, 0.387 max_d=0.387 avg_d=0.112 std_dev=0.093
O2'	A	0, 0.059, 0.154, 0.249, 0.364 max_d=0.364 avg_d=0.154 std_dev=0.095
O4'	A	0, -0.009, 0.097, 0.202, 0.437 max_d=0.437 avg_d=0.097 std_dev=0.106
P	A	0, 0.170, 0.310, 0.451, 0.556 max_d=0.556 avg_d=0.310 std_dev=0.140
C5'	B	0, 0.268, 0.414, 0.561, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.414 std_dev=0.147
P	B	0, 0.166, 0.332, 0.498, 0.757 max_d=0.757 avg_d=0.332 std_dev=0.166
C3'	A	0, -0.003, 0.165, 0.332, 0.701 max_d=0.701 avg_d=0.165 std_dev=0.168
C4'	A	0, -0.003, 0.166, 0.334, 0.714 max_d=0.714 avg_d=0.166 std_dev=0.169
N3	B	0, 0.233, 0.401, 0.570, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.401 std_dev=0.169
O5'	B	0, 0.240, 0.415, 0.590, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.415 std_dev=0.175
C4'	B	0, 0.273, 0.458, 0.643, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.458 std_dev=0.185
O5'	A	0, 0.049, 0.244, 0.440, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.244 std_dev=0.196
O4'	B	0, 0.222, 0.427, 0.632, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.427 std_dev=0.205
C2	B	0, 0.287, 0.494, 0.701, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.494 std_dev=0.207
OP1	B	0, 0.164, 0.373, 0.582, 1.119 max_d=1.119 avg_d=0.373 std_dev=0.209
OP2	B	0, 0.227, 0.436, 0.646, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.436 std_dev=0.209
OP1	A	0, 0.224, 0.435, 0.646, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.435 std_dev=0.211
N2	B	0, 0.307, 0.519, 0.732, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.519 std_dev=0.212
C4	B	0, 0.279, 0.492, 0.705, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.492 std_dev=0.213
C1'	B	0, 0.258, 0.475, 0.691, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.475 std_dev=0.216
OP2	A	0, 0.145, 0.374, 0.604, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.374 std_dev=0.230
O3'	A	0, 0.029, 0.260, 0.490, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.260 std_dev=0.230
N9	B	0, 0.294, 0.527, 0.759, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.527 std_dev=0.232
C3'	B	0, 0.383, 0.621, 0.860, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.621 std_dev=0.239
C2'	B	0, 0.347, 0.588, 0.829, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.588 std_dev=0.241
O3'	B	0, 0.471, 0.727, 0.982, 1.096 max_d=1.096 avg_d=0.727 std_dev=0.255
N1	B	0, 0.356, 0.620, 0.885, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.620 std_dev=0.264
C5	B	0, 0.371, 0.642, 0.913, 1.089 max_d=1.089 avg_d=0.642 std_dev=0.271
O2'	B	0, 0.374, 0.652, 0.930, 1.320 max_d=1.320 avg_d=0.652 std_dev=0.278
C6	B	0, 0.404, 0.699, 0.994, 1.085 max_d=1.085 avg_d=0.699 std_dev=0.295
C5'	A	0, -0.023, 0.273, 0.570, 1.241 max_d=1.241 avg_d=0.273 std_dev=0.296
C8	B	0, 0.405, 0.705, 1.006, 1.227 max_d=1.227 avg_d=0.705 std_dev=0.300
N7	B	0, 0.446, 0.768, 1.090, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.768 std_dev=0.322
O6	B	0, 0.482, 0.831, 1.179, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.831 std_dev=0.348

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.23	0.07
C2	0.03	0.00	0.06	0.08	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.10	0.05	0.11	0.02	0.07	0.25	0.09
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.05	0.08	0.06	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.13	0.04	0.17	0.13	0.06
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.08	0.05	0.08	0.09	0.07	0.06	0.04	0.01	0.01	0.01	0.21	0.09	0.24	0.09	0.13
C4	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.08	0.02	0.12	0.01	0.07	0.25	0.09
C4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.05	0.06	0.02	0.04	0.02	0.06	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.06	0.09	0.20	0.03
C5	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.01	0.15	0.01	0.10	0.25	0.11
C5'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.05	0.00	0.09	0.00	0.09	0.10	0.06	0.04	0.03	0.12	0.05	0.05	0.03	0.01	0.01	0.12	0.09	0.22	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.02	0.15	0.00	0.11	0.25	0.12
C8	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.06	0.04	0.17	0.02	0.09	0.24	0.09
N1	0.02	0.00	0.05	0.08	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.10	0.04	0.14	0.01	0.09	0.25	0.10
N2	0.04	0.00	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.11	0.07	0.09	0.02	0.07	0.25	0.09
N3	0.03	0.00	0.06	0.07	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.05	0.09	0.01	0.06	0.25	0.08
N7	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.03	0.18	0.02	0.11	0.24	0.11
N9	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.11	0.01	0.07	0.24	0.08
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.04	0.04	0.05	0.06	0.03	0.07	0.09	0.06	0.04	0.02	0.00	0.04	0.04	0.04	0.06	0.15	0.16	0.04
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.08	0.02	0.09	0.03	0.11	0.06	0.10	0.11	0.08	0.08	0.04	0.04	0.00	0.02	0.21	0.12	0.32	0.08	0.18
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.07	0.05	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.08	0.02	0.05	0.28	0.13
O5'	0.04	0.11	0.13	0.21	0.12	0.01	0.15	0.01	0.15	0.17	0.14	0.09	0.09	0.18	0.11	0.04	0.21	0.08	0.00	0.17	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.02	0.04	0.09	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.12	0.02	0.17	0.00	0.13	0.26	0.13
OP1	0.05	0.07	0.17	0.24	0.07	0.09	0.10	0.09	0.11	0.09	0.09	0.07	0.06	0.11	0.07	0.15	0.32	0.05	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.25	0.13	0.09	0.25	0.20	0.25	0.22	0.25	0.24	0.25	0.25	0.25	0.24	0.24	0.16	0.08	0.28	0.02	0.26	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.09	0.06	0.13	0.09	0.03	0.11	0.01	0.12	0.09	0.10	0.09	0.08	0.11	0.08	0.04	0.18	0.13	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.20	0.12	0.17	0.17	0.16	0.19	0.24	0.21	0.17	0.22	0.23	0.17	0.18	0.15	0.12	0.17	0.13	0.15	0.22	0.09	0.13	0.09
C2	0.10	0.13	0.11	0.17	0.12	0.15	0.11	0.23	0.10	0.13	0.11	0.15	0.12	0.12	0.12	0.10	0.18	0.12	0.16	0.09	0.07	0.11	0.07
C2'	0.06	0.17	0.06	0.13	0.11	0.11	0.13	0.21	0.17	0.11	0.18	0.21	0.12	0.13	0.09	0.07	0.13	0.07	0.12	0.18	0.06	0.15	0.07
C3'	0.07	0.17	0.07	0.13	0.12	0.11	0.14	0.21	0.17	0.11	0.19	0.21	0.13	0.13	0.09	0.07	0.14	0.07	0.14	0.19	0.09	0.16	0.09
C4	0.12	0.17	0.13	0.19	0.16	0.16	0.17	0.23	0.18	0.17	0.18	0.19	0.15	0.18	0.15	0.12	0.18	0.13	0.16	0.18	0.08	0.11	0.07
C4'	0.14	0.24	0.14	0.17	0.19	0.15	0.20	0.23	0.23	0.17	0.25	0.27	0.20	0.19	0.16	0.14	0.16	0.14	0.13	0.24	0.06	0.12	0.07
C5	0.14	0.15	0.15	0.21	0.17	0.16	0.19	0.23	0.19	0.20	0.17	0.14	0.14	0.21	0.17	0.13	0.21	0.15	0.19	0.19	0.11	0.14	0.09
C5'	0.15	0.25	0.15	0.17	0.20	0.16	0.21	0.23	0.24	0.18	0.26	0.28	0.21	0.20	0.17	0.16	0.16	0.15	0.14	0.26	0.08	0.13	0.08
C6	0.14	0.11	0.16	0.22	0.15	0.17	0.17	0.23	0.14	0.20	0.11	0.12	0.12	0.20	0.16	0.14	0.23	0.15	0.23	0.13	0.13	0.14	0.12
C8	0.14	0.19	0.15	0.20	0.18	0.16	0.21	0.23	0.24	0.20	0.23	0.19	0.17	0.22	0.17	0.13	0.19	0.14	0.17	0.25	0.09	0.14	0.09
N1	0.12	0.11	0.14	0.21	0.12	0.17	0.12	0.24	0.09	0.15	0.10	0.13	0.10	0.14	0.13	0.12	0.21	0.13	0.22	0.09	0.10	0.10	0.09
N2	0.10	0.13	0.10	0.14	0.12	0.13	0.11	0.22	0.11	0.13	0.12	0.16	0.13	0.12	0.12	0.09	0.15	0.10	0.12	0.11	0.10	0.17	0.10
N3	0.11	0.16	0.11	0.16	0.13	0.14	0.13	0.22	0.13	0.13	0.15	0.20	0.14	0.13	0.12	0.10	0.16	0.12	0.13	0.13	0.07	0.10	0.07
N7	0.15	0.17	0.16	0.21	0.18	0.16	0.22	0.22	0.23	0.21	0.20	0.15	0.15	0.23	0.18	0.14	0.21	0.15	0.19	0.25	0.12	0.16	0.10
N9	0.12	0.19	0.13	0.18	0.16	0.15	0.19	0.23	0.21	0.17	0.21	0.20	0.16	0.19	0.15	0.11	0.18	0.13	0.15	0.22	0.08	0.13	0.08
O2'	0.10	0.19	0.09	0.15	0.14	0.14	0.16	0.25	0.18	0.13	0.20	0.23	0.16	0.15	0.12	0.09	0.16	0.10	0.14	0.20	0.13	0.18	0.13
O3'	0.07	0.16	0.07	0.13	0.10	0.12	0.11	0.21	0.15	0.09	0.17	0.21	0.12	0.11	0.08	0.08	0.14	0.07	0.15	0.17	0.11	0.18	0.11
O4'	0.18	0.26	0.18	0.21	0.22	0.20	0.24	0.26	0.26	0.21	0.27	0.28	0.23	0.23	0.20	0.18	0.20	0.18	0.17	0.27	0.10	0.12	0.10
O5'	0.19	0.25	0.19	0.24	0.25	0.21	0.31	0.28	0.34	0.28	0.31	0.22	0.22	0.32	0.24	0.18	0.23	0.19	0.22	0.38	0.18	0.21	0.18
O6	0.16	0.11	0.19	0.25	0.15	0.18	0.17	0.23	0.13	0.22	0.12	0.14	0.11	0.22	0.18	0.17	0.26	0.16	0.26	0.13	0.18	0.18	0.16
OP1	0.13	0.15	0.13	0.18	0.16	0.17	0.20	0.25	0.22	0.19	0.19	0.14	0.14	0.22	0.16	0.15	0.18	0.15	0.18	0.26	0.12	0.15	0.12
OP2	0.18	0.17	0.19	0.23	0.19	0.24	0.21	0.29	0.23	0.21	0.20	0.17	0.17	0.23	0.19	0.18	0.24	0.21	0.27	0.27	0.24	0.27	0.24
P	0.09	0.12	0.10	0.15	0.13	0.14	0.18	0.22	0.21	0.17	0.18	0.10	0.10	0.20	0.13	0.11	0.15	0.11	0.16	0.26	0.10	0.14	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.15	0.32	0.14
C2	0.02	0.00	0.04	0.05	0.01	0.09	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.03	0.08	0.17	0.01	0.19	0.25	0.16
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.05	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.02	0.18	0.27	0.11
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.05	0.05	0.04	0.08	0.04	0.02	0.01	0.01	0.10	0.06	0.21	0.21	0.12
C4	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.03	0.04	0.15	0.01	0.19	0.30	0.16
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.10	0.08	0.10	0.08	0.10	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.08	0.12	0.18	0.06
C5	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.05	0.03	0.18	0.01	0.25	0.29	0.20
C5'	0.02	0.15	0.01	0.01	0.10	0.00	0.13	0.00	0.14	0.16	0.15	0.18	0.13	0.17	0.08	0.02	0.03	0.01	0.01	0.16	0.07	0.06	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.04	0.20	0.00	0.27	0.28	0.22
C8	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.10	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.05	0.14	0.02	0.22	0.34	0.19
N1	0.02	0.00	0.03	0.05	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.04	0.07	0.19	0.01	0.24	0.26	0.19
N2	0.03	0.00	0.05	0.05	0.01	0.10	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.04	0.10	0.17	0.01	0.17	0.23	0.14
N3	0.02	0.00	0.04	0.04	0.00	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.03	0.08	0.14	0.01	0.16	0.26	0.14
N7	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.10	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.04	0.18	0.02	0.27	0.30	0.21
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.17	0.33	0.16
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.04	0.03	0.03	0.02	0.04	0.03	0.06	0.10	0.07	0.02	0.01	0.00	0.04	0.04	0.03	0.04	0.18	0.27	0.10
O3'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.03	0.05	0.08	0.04	0.04	0.03	0.08	0.04	0.04	0.00	0.01	0.10	0.06	0.27	0.19	0.16
O4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.07	0.10	0.08	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.04	0.15	0.29	0.16
O5'	0.04	0.17	0.06	0.10	0.15	0.01	0.18	0.01	0.20	0.14	0.19	0.17	0.14	0.18	0.11	0.03	0.10	0.06	0.00	0.22	0.02	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.02	0.06	0.01	0.08	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.06	0.04	0.22	0.00	0.31	0.27	0.24
OP1	0.15	0.19	0.18	0.21	0.19	0.12	0.25	0.07	0.27	0.22	0.24	0.17	0.16	0.27	0.17	0.18	0.27	0.15	0.02	0.31	0.00	0.01	0.00
OP2	0.32	0.25	0.27	0.21	0.30	0.18	0.29	0.06	0.28	0.34	0.26	0.23	0.26	0.30	0.33	0.27	0.19	0.29	0.01	0.27	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.16	0.11	0.12	0.16	0.06	0.20	0.01	0.22	0.19	0.19	0.14	0.14	0.21	0.16	0.10	0.16	0.16	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00