Doublet Group distance statistics: 51505

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 1, 0, 1, 2, 1, 2, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.012, 0.021, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.012 std_dev=0.009
O6	A	0, 0.018, 0.037, 0.057, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.037 std_dev=0.020
C5	A	0, 0.007, 0.027, 0.046, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.027 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.017, 0.043, 0.069, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.043 std_dev=0.026
C4	A	0, 0.007, 0.035, 0.062, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.035 std_dev=0.027
N1	A	0, 0.000, 0.028, 0.057, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.028 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.020, 0.050, 0.081, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.050 std_dev=0.030
N9	A	0, 0.006, 0.038, 0.071, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.038 std_dev=0.032
N3	A	0, 0.002, 0.035, 0.067, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.035 std_dev=0.033
C2	A	0, -0.002, 0.035, 0.071, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.035 std_dev=0.036
C1'	A	0, -0.001, 0.046, 0.094, 0.162 max_d=0.162 avg_d=0.046 std_dev=0.047
N2	A	0, -0.002, 0.072, 0.146, 0.239 max_d=0.239 avg_d=0.072 std_dev=0.074
O4'	A	0, 0.052, 0.150, 0.248, 0.343 max_d=0.343 avg_d=0.150 std_dev=0.098
C2'	A	0, 0.022, 0.125, 0.228, 0.351 max_d=0.351 avg_d=0.125 std_dev=0.103
C2	B	0, 0.135, 0.324, 0.513, 0.683 max_d=0.683 avg_d=0.324 std_dev=0.189
O2'	A	0, 0.040, 0.232, 0.424, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.232 std_dev=0.192
N3	B	0, 0.130, 0.330, 0.530, 0.745 max_d=0.745 avg_d=0.330 std_dev=0.200
C4	B	0, 0.160, 0.371, 0.582, 0.694 max_d=0.694 avg_d=0.371 std_dev=0.211
N1	B	0, 0.102, 0.321, 0.539, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.321 std_dev=0.218
N2	B	0, 0.148, 0.368, 0.589, 0.708 max_d=0.708 avg_d=0.368 std_dev=0.220
C6	B	0, 0.119, 0.350, 0.581, 0.772 max_d=0.772 avg_d=0.350 std_dev=0.231
C5	B	0, 0.142, 0.379, 0.616, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.379 std_dev=0.237
C4'	A	0, 0.083, 0.326, 0.569, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.326 std_dev=0.243
N9	B	0, 0.177, 0.443, 0.708, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.443 std_dev=0.265
O6	B	0, 0.110, 0.383, 0.657, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.383 std_dev=0.273
C3'	A	0, 0.032, 0.328, 0.624, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.328 std_dev=0.296
C1'	B	0, 0.199, 0.507, 0.814, 0.902 max_d=0.902 avg_d=0.507 std_dev=0.307
N7	B	0, 0.146, 0.454, 0.762, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.454 std_dev=0.308
O4'	B	0, 0.301, 0.618, 0.935, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.618 std_dev=0.317
C8	B	0, 0.163, 0.489, 0.814, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.489 std_dev=0.325
C2'	B	0, 0.245, 0.581, 0.918, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.581 std_dev=0.336
C5'	A	0, 0.110, 0.450, 0.791, 1.395 max_d=1.395 avg_d=0.450 std_dev=0.340
O2'	B	0, 0.229, 0.592, 0.954, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.592 std_dev=0.363
C4'	B	0, 0.320, 0.707, 1.093, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.707 std_dev=0.386
C3'	B	0, 0.295, 0.693, 1.091, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.693 std_dev=0.398
O3'	B	0, 0.283, 0.714, 1.145, 1.472 max_d=1.472 avg_d=0.714 std_dev=0.431
C5'	B	0, 0.363, 0.815, 1.266, 1.454 max_d=1.454 avg_d=0.815 std_dev=0.451
O3'	A	0, 0.036, 0.676, 1.317, 1.967 max_d=1.967 avg_d=0.676 std_dev=0.640
O5'	B	0, 0.257, 1.026, 1.794, 2.712 max_d=2.712 avg_d=1.026 std_dev=0.768
O5'	A	0, -0.157, 0.860, 1.876, 3.120 max_d=3.120 avg_d=0.860 std_dev=1.016
OP2	A	0, -0.255, 0.973, 2.200, 4.081 max_d=4.081 avg_d=0.973 std_dev=1.227
P	B	0, 0.146, 1.395, 2.643, 4.297 max_d=4.297 avg_d=1.395 std_dev=1.249
P	A	0, -0.392, 1.094, 2.580, 4.591 max_d=4.591 avg_d=1.094 std_dev=1.486
OP2	B	0, 0.322, 1.869, 3.416, 5.302 max_d=5.302 avg_d=1.869 std_dev=1.547
OP1	B	0, 0.406, 2.119, 3.831, 5.411 max_d=5.411 avg_d=2.119 std_dev=1.712
OP1	A	0, -0.591, 1.566, 3.723, 6.897 max_d=6.897 avg_d=1.566 std_dev=2.157

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.08	0.01	0.03	0.04	0.01	0.02	0.04	0.05	0.03	0.07	0.10	0.08	0.02	0.01	0.02	0.24	0.01	0.41	0.04	0.83	0.21	0.41
C2	0.08	0.00	0.11	0.17	0.01	0.11	0.02	0.09	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.21	0.50	0.08	0.55	0.02	1.19	0.37	0.65
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.05	0.03	0.03	0.10	0.06	0.06	0.09	0.14	0.11	0.05	0.02	0.00	0.10	0.02	0.42	0.05	0.66	0.24	0.39
C3'	0.03	0.17	0.01	0.00	0.06	0.01	0.02	0.02	0.05	0.11	0.12	0.23	0.16	0.09	0.02	0.02	0.01	0.01	0.21	0.03	0.32	0.23	0.09
C4	0.04	0.01	0.05	0.06	0.00	0.03	0.01	0.10	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.33	0.03	0.62	0.02	1.28	0.45	0.73
C4'	0.01	0.11	0.03	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.03	0.12	0.07	0.16	0.11	0.11	0.03	0.04	0.03	0.01	0.03	0.05	0.30	0.12	0.13
C5	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.05	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.14	0.26	0.03	0.75	0.02	1.55	0.61	0.92
C5'	0.04	0.09	0.10	0.02	0.10	0.01	0.17	0.00	0.15	0.22	0.11	0.11	0.09	0.23	0.11	0.08	0.09	0.02	0.01	0.19	0.22	0.17	0.03
C6	0.05	0.02	0.06	0.05	0.02	0.03	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.17	0.33	0.03	0.74	0.00	1.59	0.62	0.94
C8	0.03	0.01	0.06	0.11	0.00	0.12	0.01	0.22	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.11	0.07	0.80	0.02	1.56	0.65	0.95
N1	0.07	0.01	0.09	0.12	0.02	0.07	0.01	0.11	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.03	0.20	0.44	0.06	0.65	0.01	1.41	0.50	0.81
N2	0.10	0.01	0.14	0.23	0.01	0.16	0.02	0.11	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.23	0.59	0.11	0.49	0.03	1.07	0.31	0.57
N3	0.08	0.01	0.11	0.16	0.00	0.11	0.01	0.09	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.18	0.47	0.08	0.51	0.02	1.09	0.32	0.58
N7	0.02	0.02	0.05	0.09	0.01	0.11	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.12	0.15	0.07	0.84	0.02	1.72	0.73	1.06
N9	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.11	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.06	0.21	0.01	0.63	0.03	1.23	0.44	0.71
O2'	0.02	0.21	0.00	0.02	0.13	0.04	0.14	0.08	0.17	0.09	0.20	0.23	0.18	0.12	0.06	0.00	0.15	0.03	0.40	0.18	0.64	0.26	0.38
O3'	0.24	0.50	0.10	0.01	0.33	0.03	0.26	0.09	0.33	0.11	0.44	0.59	0.47	0.15	0.21	0.15	0.00	0.17	0.14	0.30	0.37	0.38	0.21
O4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.07	0.06	0.11	0.08	0.07	0.01	0.03	0.17	0.00	0.26	0.04	0.72	0.17	0.30
O5'	0.41	0.55	0.42	0.21	0.62	0.03	0.75	0.01	0.74	0.80	0.65	0.49	0.51	0.84	0.63	0.40	0.14	0.26	0.00	0.80	0.03	0.03	0.02
O6	0.04	0.02	0.05	0.03	0.02	0.05	0.02	0.19	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.18	0.30	0.04	0.80	0.00	1.73	0.71	1.05
OP1	0.83	1.19	0.66	0.32	1.28	0.30	1.55	0.22	1.59	1.56	1.41	1.07	1.09	1.72	1.23	0.64	0.37	0.72	0.03	1.73	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.37	0.24	0.23	0.45	0.12	0.61	0.17	0.62	0.65	0.50	0.31	0.32	0.73	0.44	0.26	0.38	0.17	0.03	0.71	0.01	0.00	0.00
P	0.41	0.65	0.39	0.09	0.73	0.13	0.92	0.03	0.94	0.95	0.81	0.57	0.58	1.06	0.71	0.38	0.21	0.30	0.02	1.05	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.14	0.13	0.17	0.10	0.15	0.14	0.14	0.18	0.10	0.19	0.15	0.09	0.13	0.09	0.22	0.23	0.14	0.30	0.22	0.76	0.22	0.31
C2	0.14	0.20	0.18	0.17	0.21	0.16	0.21	0.15	0.21	0.19	0.21	0.20	0.20	0.21	0.19	0.28	0.21	0.15	0.20	0.21	0.55	0.33	0.22
C2'	0.16	0.18	0.20	0.24	0.16	0.21	0.19	0.20	0.23	0.17	0.23	0.19	0.16	0.19	0.15	0.26	0.30	0.18	0.39	0.26	0.88	0.35	0.44
C3'	0.28	0.24	0.30	0.33	0.23	0.30	0.22	0.32	0.22	0.23	0.22	0.25	0.24	0.22	0.24	0.34	0.37	0.30	0.40	0.22	1.02	0.30	0.50
C4	0.11	0.23	0.16	0.17	0.19	0.15	0.21	0.15	0.24	0.17	0.25	0.26	0.19	0.20	0.16	0.24	0.21	0.15	0.22	0.25	0.60	0.30	0.23
C4'	0.18	0.15	0.21	0.23	0.16	0.21	0.15	0.23	0.15	0.16	0.15	0.15	0.16	0.15	0.16	0.26	0.27	0.21	0.32	0.17	0.88	0.20	0.38
C5	0.13	0.23	0.18	0.19	0.20	0.17	0.21	0.17	0.24	0.18	0.25	0.25	0.20	0.20	0.18	0.25	0.23	0.16	0.17	0.25	0.57	0.40	0.25
C5'	0.14	0.13	0.16	0.18	0.13	0.17	0.15	0.18	0.17	0.13	0.16	0.13	0.13	0.15	0.13	0.23	0.22	0.18	0.30	0.20	0.83	0.19	0.34
C6	0.16	0.22	0.20	0.21	0.21	0.19	0.22	0.20	0.22	0.20	0.23	0.23	0.20	0.21	0.20	0.28	0.24	0.18	0.19	0.23	0.59	0.50	0.34
C8	0.11	0.22	0.15	0.17	0.17	0.16	0.20	0.15	0.24	0.16	0.25	0.24	0.17	0.19	0.15	0.23	0.22	0.15	0.20	0.26	0.61	0.32	0.22
N1	0.17	0.21	0.21	0.21	0.21	0.18	0.22	0.19	0.22	0.21	0.21	0.21	0.20	0.22	0.21	0.29	0.23	0.18	0.18	0.22	0.56	0.46	0.31
N2	0.15	0.18	0.19	0.16	0.22	0.15	0.23	0.15	0.21	0.21	0.19	0.15	0.20	0.23	0.21	0.30	0.20	0.16	0.24	0.21	0.55	0.30	0.23
N3	0.11	0.22	0.16	0.16	0.19	0.15	0.21	0.14	0.23	0.17	0.23	0.24	0.19	0.20	0.16	0.25	0.21	0.14	0.26	0.23	0.63	0.28	0.25
N7	0.13	0.23	0.17	0.19	0.19	0.17	0.21	0.17	0.24	0.17	0.25	0.25	0.19	0.19	0.17	0.25	0.23	0.16	0.17	0.25	0.58	0.40	0.25
N9	0.10	0.22	0.14	0.16	0.17	0.15	0.20	0.14	0.24	0.16	0.25	0.24	0.17	0.18	0.14	0.23	0.21	0.14	0.25	0.26	0.65	0.27	0.24
O2'	0.23	0.29	0.27	0.32	0.25	0.28	0.29	0.28	0.35	0.25	0.35	0.33	0.25	0.28	0.23	0.33	0.39	0.24	0.47	0.39	0.95	0.44	0.53
O3'	0.67	0.60	0.66	0.69	0.59	0.69	0.53	0.71	0.47	0.57	0.51	0.65	0.63	0.52	0.61	0.66	0.73	0.68	0.60	0.39	1.28	0.49	0.72
O4'	0.11	0.10	0.13	0.16	0.09	0.15	0.09	0.15	0.11	0.09	0.12	0.12	0.09	0.09	0.10	0.21	0.20	0.17	0.28	0.14	0.73	0.17	0.26
O5'	0.28	0.15	0.39	0.40	0.17	0.31	0.11	0.28	0.15	0.15	0.14	0.19	0.22	0.10	0.21	0.50	0.44	0.26	0.27	0.23	0.62	0.38	0.15
O6	0.19	0.22	0.23	0.24	0.22	0.21	0.22	0.23	0.22	0.22	0.22	0.23	0.21	0.22	0.21	0.29	0.25	0.19	0.25	0.23	0.69	0.61	0.46
OP1	0.73	0.51	0.89	0.98	0.55	0.83	0.49	0.78	0.53	0.53	0.50	0.53	0.61	0.49	0.61	1.00	1.09	0.68	0.62	0.65	0.70	0.75	0.59
OP2	0.16	0.21	0.17	0.22	0.20	0.16	0.30	0.19	0.40	0.22	0.36	0.16	0.15	0.31	0.17	0.24	0.29	0.21	0.29	0.51	0.87	0.22	0.32
P	0.30	0.19	0.45	0.50	0.20	0.36	0.23	0.33	0.33	0.19	0.29	0.19	0.22	0.23	0.22	0.56	0.56	0.26	0.20	0.46	0.72	0.35	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.07	0.04	0.03	0.06	0.08	0.06	0.02	0.01	0.01	0.06	0.01	0.41	0.04	0.78	0.27	0.41
C2	0.06	0.00	0.12	0.11	0.01	0.08	0.02	0.12	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.22	0.16	0.09	0.52	0.02	1.08	0.45	0.60
C2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.07	0.01	0.04	0.09	0.07	0.05	0.10	0.15	0.12	0.03	0.01	0.00	0.03	0.02	0.41	0.06	0.68	0.42	0.39
C3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.05	0.01	0.03	0.02	0.05	0.06	0.09	0.15	0.10	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.17	0.05	0.42	0.33	0.08
C4	0.03	0.01	0.07	0.05	0.00	0.03	0.01	0.13	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.08	0.04	0.58	0.02	1.15	0.50	0.67
C4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.08	0.06	0.11	0.08	0.07	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.28	0.24	0.14
C5	0.02	0.02	0.04	0.03	0.01	0.04	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.09	0.07	0.03	0.67	0.02	1.34	0.65	0.82
C5'	0.07	0.12	0.09	0.02	0.13	0.01	0.16	0.00	0.16	0.19	0.14	0.13	0.12	0.20	0.13	0.08	0.04	0.02	0.01	0.18	0.31	0.32	0.02
C6	0.04	0.02	0.07	0.05	0.02	0.04	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.13	0.10	0.03	0.66	0.00	1.36	0.67	0.83
C8	0.03	0.01	0.05	0.06	0.00	0.08	0.01	0.19	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.07	0.09	0.72	0.02	1.36	0.67	0.85
N1	0.06	0.01	0.10	0.09	0.02	0.06	0.01	0.14	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.18	0.14	0.07	0.60	0.01	1.24	0.57	0.73
N2	0.08	0.01	0.15	0.15	0.01	0.11	0.03	0.13	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.26	0.20	0.12	0.48	0.03	1.00	0.39	0.54
N3	0.06	0.01	0.12	0.10	0.00	0.08	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.13	0.09	0.49	0.02	1.01	0.39	0.55
N7	0.02	0.02	0.03	0.04	0.01	0.07	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.07	0.74	0.02	1.46	0.76	0.92
N9	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.13	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.60	0.02	1.12	0.48	0.66
O2'	0.01	0.22	0.00	0.01	0.12	0.01	0.09	0.08	0.13	0.06	0.18	0.26	0.21	0.05	0.03	0.00	0.05	0.01	0.39	0.12	0.72	0.50	0.39
O3'	0.06	0.16	0.03	0.01	0.08	0.02	0.07	0.04	0.10	0.07	0.14	0.20	0.13	0.06	0.05	0.05	0.00	0.08	0.12	0.09	0.44	0.42	0.23
O4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.03	0.09	0.07	0.12	0.09	0.07	0.01	0.01	0.08	0.00	0.29	0.04	0.67	0.21	0.30
O5'	0.41	0.52	0.41	0.17	0.58	0.02	0.67	0.01	0.66	0.72	0.60	0.48	0.49	0.74	0.60	0.39	0.12	0.29	0.00	0.70	0.02	0.02	0.01
O6	0.04	0.02	0.06	0.05	0.02	0.05	0.02	0.18	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.12	0.09	0.04	0.70	0.00	1.45	0.76	0.90
OP1	0.78	1.08	0.68	0.42	1.15	0.28	1.34	0.31	1.36	1.36	1.24	1.00	1.01	1.46	1.12	0.72	0.44	0.67	0.02	1.45	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.45	0.42	0.33	0.50	0.24	0.65	0.32	0.67	0.67	0.57	0.39	0.39	0.76	0.48	0.50	0.42	0.21	0.02	0.76	0.01	0.00	0.00
P	0.41	0.60	0.39	0.08	0.67	0.14	0.82	0.02	0.83	0.85	0.73	0.54	0.55	0.92	0.66	0.39	0.23	0.30	0.01	0.90	0.01	0.00	0.00