Doublet Group distance statistics: 51514

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, -0.001, 0.006, 0.013, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.006 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N2	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.020 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.002, 0.015, 0.028, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.015 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.002, 0.015, 0.029, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.015 std_dev=0.013
C4	A	0, -0.001, 0.016, 0.033, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.016 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.007, 0.024, 0.042, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.024 std_dev=0.018
N9	A	0, -0.002, 0.022, 0.047, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.022 std_dev=0.025
N7	A	0, -0.003, 0.033, 0.068, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.033 std_dev=0.035
C8	A	0, -0.008, 0.040, 0.088, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.040 std_dev=0.048
C2'	B	0, 0.086, 0.345, 0.604, 0.596 max_d=0.596 avg_d=0.345 std_dev=0.259
O2'	B	0, 0.240, 0.644, 1.049, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.644 std_dev=0.405
C3'	B	0, 0.158, 0.611, 1.064, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.611 std_dev=0.453
C1'	B	0, 0.175, 0.637, 1.099, 1.304 max_d=1.304 avg_d=0.637 std_dev=0.462
O3'	B	0, 0.149, 0.647, 1.144, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.647 std_dev=0.498
C4'	B	0, 0.314, 0.822, 1.330, 1.349 max_d=1.349 avg_d=0.822 std_dev=0.508
N9	B	0, 0.188, 0.720, 1.252, 1.434 max_d=1.434 avg_d=0.720 std_dev=0.532
O4'	B	0, 0.231, 0.799, 1.367, 1.607 max_d=1.607 avg_d=0.799 std_dev=0.568
N3	B	0, 0.037, 0.630, 1.223, 1.583 max_d=1.583 avg_d=0.630 std_dev=0.593
C4	B	0, 0.121, 0.724, 1.326, 1.593 max_d=1.593 avg_d=0.724 std_dev=0.603
O4'	A	0, 0.032, 0.660, 1.288, 1.408 max_d=1.408 avg_d=0.660 std_dev=0.628
C2	B	0, -0.009, 0.653, 1.314, 1.713 max_d=1.713 avg_d=0.653 std_dev=0.661
C8	B	0, 0.221, 0.884, 1.548, 1.603 max_d=1.603 avg_d=0.884 std_dev=0.664
N2	B	0, -0.091, 0.597, 1.285, 1.736 max_d=1.736 avg_d=0.597 std_dev=0.688
C2'	A	0, 0.042, 0.742, 1.441, 1.554 max_d=1.554 avg_d=0.742 std_dev=0.699
P	B	0, 0.333, 1.041, 1.749, 1.965 max_d=1.965 avg_d=1.041 std_dev=0.708
O5'	B	0, 0.215, 0.929, 1.643, 1.997 max_d=1.997 avg_d=0.929 std_dev=0.714
N1	B	0, 0.119, 0.865, 1.610, 1.947 max_d=1.947 avg_d=0.865 std_dev=0.746
C5	B	0, 0.171, 0.928, 1.686, 1.866 max_d=1.866 avg_d=0.928 std_dev=0.758
N7	B	0, 0.215, 1.045, 1.874, 1.929 max_d=1.929 avg_d=1.045 std_dev=0.829
C6	B	0, 0.204, 1.045, 1.886, 2.106 max_d=2.106 avg_d=1.045 std_dev=0.841
C4'	A	0, 0.071, 1.001, 1.931, 2.067 max_d=2.067 avg_d=1.001 std_dev=0.930
C3'	A	0, 0.077, 1.016, 1.955, 2.127 max_d=2.127 avg_d=1.016 std_dev=0.939
OP2	B	0, 0.251, 1.211, 2.171, 2.671 max_d=2.671 avg_d=1.211 std_dev=0.960
O6	B	0, 0.306, 1.308, 2.310, 2.468 max_d=2.468 avg_d=1.308 std_dev=1.002
C5'	B	0, 0.284, 1.297, 2.310, 2.773 max_d=2.773 avg_d=1.297 std_dev=1.013
O2'	A	0, 0.030, 1.134, 2.239, 2.338 max_d=2.338 avg_d=1.134 std_dev=1.104
C5'	A	0, 0.102, 1.288, 2.474, 2.483 max_d=2.483 avg_d=1.288 std_dev=1.186
O3'	A	0, 0.134, 1.372, 2.611, 2.874 max_d=2.874 avg_d=1.372 std_dev=1.238
OP1	B	0, 0.492, 2.007, 3.523, 3.925 max_d=3.925 avg_d=2.007 std_dev=1.515
OP2	A	0, 0.285, 1.931, 3.578, 3.671 max_d=3.671 avg_d=1.931 std_dev=1.646
O5'	A	0, 0.119, 2.143, 4.167, 4.237 max_d=4.237 avg_d=2.143 std_dev=2.024
P	A	0, 0.247, 2.321, 4.396, 4.556 max_d=4.556 avg_d=2.321 std_dev=2.074
OP1	A	0, 0.307, 3.055, 5.803, 6.316 max_d=6.316 avg_d=3.055 std_dev=2.748

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.14	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.29	0.00	0.18	0.01	0.08	0.61	0.20
C2	0.02	0.00	0.45	0.43	0.00	0.08	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.11	0.16	0.35	0.00	0.15	0.46	0.22
C2'	0.00	0.45	0.00	0.00	0.23	0.03	0.11	0.31	0.20	0.19	0.35	0.54	0.44	0.10	0.02	0.00	0.02	0.01	0.11	0.15	0.09	0.69	0.24
C3'	0.02	0.43	0.00	0.00	0.36	0.00	0.40	0.02	0.46	0.25	0.46	0.42	0.37	0.34	0.24	0.01	0.00	0.02	0.34	0.47	0.38	0.22	0.15
C4	0.01	0.00	0.23	0.36	0.00	0.08	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.09	0.08	0.39	0.01	0.08	0.46	0.15
C4'	0.01	0.08	0.03	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.12	0.11	0.10	0.07	0.06	0.13	0.08	0.27	0.01	0.00	0.03	0.14	0.10	0.47	0.13
C5	0.01	0.00	0.11	0.40	0.00	0.12	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.27	0.17	0.03	0.50	0.01	0.07	0.31	0.07
C5'	0.14	0.12	0.31	0.02	0.14	0.01	0.16	0.00	0.17	0.17	0.14	0.10	0.11	0.18	0.15	0.15	0.21	0.01	0.01	0.19	0.26	0.42	0.01
C6	0.01	0.00	0.20	0.46	0.00	0.12	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.23	0.22	0.07	0.51	0.00	0.12	0.26	0.10
C8	0.00	0.00	0.19	0.25	0.00	0.11	0.00	0.17	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.39	0.10	0.12	0.53	0.01	0.06	0.35	0.06
N1	0.02	0.00	0.35	0.46	0.00	0.10	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.18	0.13	0.43	0.00	0.15	0.35	0.16
N2	0.03	0.00	0.54	0.42	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.32	0.10	0.19	0.30	0.01	0.18	0.49	0.27
N3	0.02	0.00	0.44	0.37	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.19	0.08	0.16	0.30	0.00	0.13	0.51	0.23
N7	0.00	0.00	0.10	0.34	0.00	0.13	0.00	0.18	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.40	0.18	0.06	0.58	0.01	0.02	0.20	0.10
N9	0.00	0.01	0.02	0.24	0.00	0.08	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.20	0.06	0.01	0.37	0.01	0.05	0.51	0.11
O2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.12	0.27	0.27	0.15	0.23	0.39	0.14	0.32	0.19	0.40	0.20	0.00	0.06	0.19	0.24	0.29	0.15	0.65	0.10
O3'	0.29	0.11	0.02	0.00	0.09	0.01	0.17	0.21	0.22	0.10	0.18	0.10	0.08	0.18	0.06	0.06	0.00	0.24	0.40	0.27	0.62	0.12	0.26
O4'	0.00	0.16	0.01	0.02	0.08	0.00	0.03	0.01	0.07	0.12	0.13	0.19	0.16	0.06	0.01	0.19	0.24	0.00	0.16	0.05	0.09	0.59	0.22
O5'	0.18	0.35	0.11	0.34	0.39	0.03	0.50	0.01	0.51	0.53	0.43	0.30	0.30	0.58	0.37	0.24	0.40	0.16	0.00	0.56	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.15	0.47	0.01	0.14	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.29	0.27	0.05	0.56	0.00	0.13	0.16	0.11
OP1	0.08	0.15	0.09	0.38	0.08	0.10	0.07	0.26	0.12	0.06	0.15	0.18	0.13	0.02	0.05	0.15	0.62	0.09	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00
OP2	0.61	0.46	0.69	0.22	0.46	0.47	0.31	0.42	0.26	0.35	0.35	0.49	0.51	0.20	0.51	0.65	0.12	0.59	0.01	0.16	0.01	0.00	0.00
P	0.20	0.22	0.24	0.15	0.15	0.13	0.07	0.01	0.10	0.06	0.16	0.27	0.23	0.10	0.11	0.10	0.26	0.22	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.21	0.03	0.08	0.20	0.21	0.28	0.25	0.33	0.24	0.31	0.19	0.15	0.29	0.19	0.06	0.25	0.18	0.09	0.39	0.64	0.20	0.24
C2	0.19	0.19	0.04	0.09	0.26	0.16	0.31	0.27	0.31	0.30	0.25	0.13	0.17	0.33	0.26	0.10	0.20	0.19	0.05	0.33	0.54	0.30	0.21
C2'	0.51	0.27	0.46	0.45	0.35	0.72	0.35	0.45	0.40	0.38	0.37	0.20	0.35	0.36	0.41	0.45	0.33	0.61	0.36	0.49	0.34	0.52	0.22
C3'	0.67	0.67	0.54	0.48	0.68	0.82	0.67	0.60	0.66	0.67	0.65	0.67	0.68	0.67	0.67	0.44	0.25	0.77	0.54	0.65	0.30	0.76	0.39
C4	0.13	0.07	0.03	0.06	0.17	0.14	0.25	0.38	0.27	0.24	0.20	0.08	0.08	0.28	0.18	0.13	0.20	0.17	0.15	0.32	0.59	0.31	0.27
C4'	0.32	0.43	0.15	0.08	0.39	0.42	0.43	0.26	0.46	0.38	0.46	0.43	0.39	0.42	0.36	0.07	0.22	0.42	0.17	0.49	0.46	0.40	0.08
C5	0.15	0.19	0.06	0.07	0.20	0.12	0.25	0.53	0.25	0.24	0.18	0.25	0.20	0.29	0.20	0.20	0.14	0.18	0.29	0.30	0.58	0.38	0.36
C5'	0.27	0.43	0.15	0.08	0.35	0.35	0.36	0.41	0.41	0.30	0.44	0.48	0.37	0.34	0.30	0.19	0.23	0.38	0.25	0.43	0.60	0.50	0.26
C6	0.19	0.23	0.07	0.08	0.26	0.12	0.31	0.59	0.29	0.30	0.22	0.25	0.25	0.35	0.25	0.23	0.09	0.20	0.32	0.31	0.55	0.43	0.38
C8	0.13	0.15	0.06	0.06	0.15	0.13	0.19	0.49	0.21	0.19	0.14	0.24	0.15	0.23	0.15	0.17	0.17	0.18	0.28	0.27	0.63	0.35	0.35
N1	0.18	0.07	0.04	0.06	0.22	0.10	0.29	0.46	0.25	0.31	0.15	0.09	0.12	0.34	0.25	0.20	0.11	0.18	0.18	0.29	0.51	0.39	0.29
N2	0.26	0.28	0.10	0.15	0.33	0.24	0.35	0.13	0.34	0.33	0.31	0.24	0.29	0.35	0.32	0.06	0.26	0.24	0.15	0.35	0.54	0.26	0.16
N3	0.16	0.23	0.03	0.10	0.25	0.18	0.31	0.24	0.33	0.27	0.30	0.19	0.19	0.31	0.23	0.08	0.24	0.18	0.06	0.36	0.59	0.26	0.21
N7	0.16	0.27	0.08	0.08	0.21	0.14	0.25	0.59	0.26	0.23	0.25	0.35	0.25	0.27	0.19	0.21	0.13	0.20	0.36	0.30	0.62	0.40	0.41
N9	0.12	0.07	0.03	0.06	0.15	0.15	0.23	0.37	0.26	0.21	0.19	0.07	0.07	0.26	0.16	0.12	0.21	0.17	0.16	0.32	0.62	0.28	0.28
O2'	0.24	0.80	0.12	0.18	0.58	0.36	0.77	0.07	0.98	0.54	1.02	0.84	0.52	0.71	0.43	0.16	0.21	0.29	0.24	1.10	0.76	0.10	0.34
O3'	0.42	0.54	0.26	0.19	0.50	0.61	0.54	0.47	0.58	0.49	0.58	0.55	0.49	0.53	0.46	0.20	0.15	0.56	0.38	0.61	0.41	0.60	0.20
O4'	0.10	0.19	0.13	0.23	0.19	0.10	0.27	0.35	0.32	0.22	0.29	0.13	0.13	0.28	0.17	0.26	0.44	0.13	0.16	0.39	0.70	0.29	0.31
O5'	0.81	1.17	0.51	0.42	1.04	0.79	1.14	0.54	1.26	0.99	1.29	1.18	1.02	1.09	0.94	0.24	0.26	0.93	0.61	1.32	0.38	0.90	0.54
O6	0.23	0.34	0.10	0.11	0.36	0.17	0.42	0.73	0.40	0.37	0.34	0.34	0.34	0.43	0.32	0.27	0.05	0.23	0.44	0.40	0.57	0.49	0.47
OP1	0.43	0.96	0.13	0.12	0.74	0.39	0.87	0.48	1.08	0.64	1.13	1.03	0.76	0.79	0.59	0.32	0.31	0.59	0.37	1.21	0.50	0.71	0.39
OP2	0.11	0.53	0.25	0.31	0.40	0.02	0.59	0.55	0.80	0.40	0.77	0.49	0.34	0.57	0.29	0.58	0.57	0.23	0.31	0.98	0.56	0.44	0.35
P	0.29	0.78	0.10	0.16	0.60	0.23	0.76	0.44	0.95	0.54	0.98	0.81	0.59	0.70	0.47	0.38	0.42	0.41	0.29	1.10	0.51	0.57	0.32

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.29	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.23	0.01	0.08	0.01	0.77	0.29	0.33
C2	0.01	0.00	0.13	0.09	0.00	0.06	0.00	0.41	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.23	0.34	0.10	0.30	0.01	0.83	0.17	0.39
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.09	0.06	0.08	0.42	0.09	0.05	0.12	0.14	0.12	0.05	0.04	0.00	0.03	0.01	0.12	0.09	0.48	0.45	0.28
C3'	0.02	0.09	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.04	0.05	0.08	0.07	0.11	0.08	0.07	0.03	0.01	0.00	0.03	0.40	0.05	0.31	0.54	0.25
C4	0.01	0.00	0.09	0.05	0.00	0.07	0.00	0.52	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.16	0.24	0.06	0.37	0.00	0.83	0.21	0.45
C4'	0.02	0.06	0.06	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.13	0.27	0.06	0.12	0.07	0.25	0.13	0.16	0.03	0.01	0.03	0.16	0.84	0.48	0.37
C5	0.00	0.00	0.08	0.04	0.00	0.15	0.00	0.67	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.19	0.18	0.04	0.54	0.00	0.85	0.21	0.55
C5'	0.29	0.41	0.42	0.04	0.52	0.00	0.67	0.00	0.66	0.79	0.53	0.32	0.37	0.81	0.56	0.27	0.17	0.01	0.01	0.72	0.39	0.18	0.03
C6	0.00	0.00	0.09	0.05	0.00	0.13	0.00	0.66	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.22	0.21	0.06	0.55	0.00	0.85	0.18	0.54
C8	0.00	0.01	0.05	0.08	0.00	0.27	0.00	0.79	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.15	0.08	0.04	0.62	0.01	0.86	0.31	0.62
N1	0.01	0.00	0.12	0.07	0.00	0.06	0.00	0.53	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.22	0.29	0.09	0.43	0.01	0.84	0.16	0.47
N2	0.01	0.00	0.14	0.11	0.01	0.12	0.01	0.32	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.25	0.40	0.12	0.22	0.01	0.83	0.17	0.35
N3	0.01	0.00	0.12	0.08	0.00	0.07	0.00	0.37	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.20	0.33	0.10	0.24	0.01	0.82	0.18	0.37
N7	0.00	0.00	0.05	0.07	0.00	0.25	0.00	0.81	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.19	0.09	0.02	0.69	0.00	0.87	0.27	0.65
N9	0.00	0.01	0.04	0.03	0.00	0.13	0.00	0.56	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.17	0.01	0.36	0.00	0.83	0.26	0.47
O2'	0.02	0.23	0.00	0.01	0.16	0.16	0.19	0.27	0.22	0.15	0.22	0.25	0.20	0.19	0.10	0.00	0.13	0.08	0.19	0.23	0.43	0.48	0.26
O3'	0.23	0.34	0.03	0.00	0.24	0.03	0.18	0.17	0.21	0.08	0.29	0.40	0.33	0.09	0.17	0.13	0.00	0.26	0.49	0.18	0.33	0.57	0.25
O4'	0.01	0.10	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.04	0.09	0.12	0.10	0.02	0.01	0.08	0.26	0.00	0.15	0.05	0.93	0.21	0.34
O5'	0.08	0.30	0.12	0.40	0.37	0.03	0.54	0.01	0.55	0.62	0.43	0.22	0.24	0.69	0.36	0.19	0.49	0.15	0.00	0.64	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.09	0.05	0.00	0.16	0.00	0.72	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.23	0.18	0.05	0.64	0.00	0.86	0.19	0.59
OP1	0.77	0.83	0.48	0.31	0.83	0.84	0.85	0.39	0.85	0.86	0.84	0.83	0.82	0.87	0.83	0.43	0.33	0.93	0.02	0.86	0.00	0.01	0.00
OP2	0.29	0.17	0.45	0.54	0.21	0.48	0.21	0.18	0.18	0.31	0.16	0.17	0.18	0.27	0.26	0.48	0.57	0.21	0.02	0.19	0.01	0.00	0.00
P	0.33	0.39	0.28	0.25	0.45	0.37	0.55	0.03	0.54	0.62	0.47	0.35	0.37	0.65	0.47	0.26	0.25	0.34	0.00	0.59	0.00	0.00	0.00