Doublet Group distance statistics: 51520

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.010, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N2	A	0, 0.000, 0.026, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.026 std_dev=0.026
C6	A	0, 0.000, 0.044, 0.088, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.044 std_dev=0.044
N3	A	0, 0.000, 0.047, 0.094, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.047 std_dev=0.047
C5	A	0, 0.000, 0.047, 0.095, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.047 std_dev=0.047
N1	A	0, 0.000, 0.050, 0.100, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.050 std_dev=0.050
C4	A	0, 0.000, 0.054, 0.108, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.054 std_dev=0.054
C1'	A	0, 0.000, 0.060, 0.120, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.060 std_dev=0.060
N9	A	0, 0.000, 0.063, 0.126, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.063 std_dev=0.063
O6	A	0, 0.000, 0.068, 0.136, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.068 std_dev=0.068
N7	A	0, 0.000, 0.098, 0.196, 0.196 max_d=0.196 avg_d=0.098 std_dev=0.098
C8	A	0, 0.000, 0.120, 0.240, 0.240 max_d=0.240 avg_d=0.120 std_dev=0.120
O4'	A	0, 0.000, 0.264, 0.527, 0.527 max_d=0.527 avg_d=0.264 std_dev=0.264
C2'	A	0, 0.000, 0.304, 0.608, 0.608 max_d=0.608 avg_d=0.304 std_dev=0.304
C2'	B	0, 0.000, 0.311, 0.622, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.311 std_dev=0.311
O2'	A	0, 0.000, 0.447, 0.895, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.447 std_dev=0.447
C3'	B	0, 0.000, 0.474, 0.948, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.474 std_dev=0.474
O2'	B	0, 0.000, 0.499, 0.997, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.499 std_dev=0.499
O5'	A	0, 0.000, 0.594, 1.188, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.594 std_dev=0.594
C4'	B	0, 0.000, 0.602, 1.203, 1.203 max_d=1.203 avg_d=0.602 std_dev=0.602
C4'	A	0, 0.000, 0.668, 1.336, 1.336 max_d=1.336 avg_d=0.668 std_dev=0.668
P	A	0, 0.000, 0.696, 1.391, 1.391 max_d=1.391 avg_d=0.696 std_dev=0.696
C1'	B	0, 0.000, 0.719, 1.439, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.719 std_dev=0.719
O4'	B	0, 0.000, 0.808, 1.617, 1.617 max_d=1.617 avg_d=0.808 std_dev=0.808
C3'	A	0, 0.000, 0.817, 1.634, 1.634 max_d=1.634 avg_d=0.817 std_dev=0.817
OP1	A	0, 0.000, 0.897, 1.793, 1.793 max_d=1.793 avg_d=0.897 std_dev=0.897
C5'	A	0, 0.000, 0.902, 1.804, 1.804 max_d=1.804 avg_d=0.902 std_dev=0.902
OP2	A	0, 0.000, 0.923, 1.845, 1.845 max_d=1.845 avg_d=0.923 std_dev=0.923
O3'	B	0, 0.000, 0.944, 1.888, 1.888 max_d=1.888 avg_d=0.944 std_dev=0.944
N9	B	0, 0.000, 1.023, 2.046, 2.046 max_d=2.046 avg_d=1.023 std_dev=1.023
O3'	A	0, 0.000, 1.049, 2.097, 2.097 max_d=2.097 avg_d=1.049 std_dev=1.049
C5'	B	0, 0.000, 1.063, 2.126, 2.126 max_d=2.126 avg_d=1.063 std_dev=1.063
O5'	B	0, 0.000, 1.179, 2.358, 2.358 max_d=2.358 avg_d=1.179 std_dev=1.179
N3	B	0, 0.000, 1.192, 2.385, 2.385 max_d=2.385 avg_d=1.192 std_dev=1.192
C8	B	0, 0.000, 1.194, 2.387, 2.387 max_d=2.387 avg_d=1.194 std_dev=1.194
C4	B	0, 0.000, 1.199, 2.399, 2.399 max_d=2.399 avg_d=1.199 std_dev=1.199
P	B	0, 0.000, 1.250, 2.501, 2.501 max_d=2.501 avg_d=1.250 std_dev=1.250
OP2	B	0, 0.000, 1.344, 2.688, 2.688 max_d=2.688 avg_d=1.344 std_dev=1.344
C2	B	0, 0.000, 1.391, 2.782, 2.782 max_d=2.782 avg_d=1.391 std_dev=1.391
C5	B	0, 0.000, 1.392, 2.783, 2.783 max_d=2.783 avg_d=1.392 std_dev=1.392
N7	B	0, 0.000, 1.395, 2.790, 2.790 max_d=2.790 avg_d=1.395 std_dev=1.395
N2	B	0, 0.000, 1.448, 2.895, 2.895 max_d=2.895 avg_d=1.448 std_dev=1.448
OP1	B	0, 0.000, 1.466, 2.931, 2.931 max_d=2.931 avg_d=1.466 std_dev=1.466
N1	B	0, 0.000, 1.561, 3.122, 3.122 max_d=3.122 avg_d=1.561 std_dev=1.561
C6	B	0, 0.000, 1.577, 3.154, 3.154 max_d=3.154 avg_d=1.577 std_dev=1.577
O6	B	0, 0.000, 1.755, 3.510, 3.510 max_d=3.510 avg_d=1.755 std_dev=1.755

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.03	0.10	0.05	0.03	0.06	0.00	0.07	0.04	0.06	0.02	0.04	0.06	0.03	0.04	0.09	0.00	0.22	0.07	0.08	0.32	0.01
C2	0.04	0.00	0.20	0.23	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.12	0.03	0.31	0.01	0.13	0.13	0.14
C2'	0.03	0.20	0.00	0.03	0.18	0.01	0.17	0.05	0.19	0.10	0.20	0.19	0.21	0.13	0.13	0.00	0.09	0.00	0.21	0.18	0.14	0.34	0.02
C3'	0.10	0.23	0.03	0.00	0.28	0.01	0.35	0.02	0.35	0.37	0.30	0.17	0.21	0.39	0.28	0.02	0.03	0.05	0.05	0.38	0.11	0.49	0.07
C4	0.05	0.01	0.18	0.28	0.00	0.09	0.00	0.09	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.22	0.00	0.32	0.01	0.09	0.19	0.10
C4'	0.03	0.03	0.01	0.01	0.09	0.00	0.16	0.00	0.15	0.22	0.09	0.02	0.02	0.22	0.12	0.17	0.11	0.01	0.01	0.17	0.12	0.41	0.05
C5	0.06	0.00	0.17	0.35	0.00	0.16	0.00	0.17	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.02	0.30	0.05	0.31	0.01	0.00	0.20	0.05
C5'	0.00	0.03	0.05	0.02	0.09	0.00	0.17	0.00	0.17	0.23	0.11	0.02	0.02	0.24	0.10	0.13	0.15	0.02	0.01	0.21	0.15	0.39	0.04
C6	0.07	0.01	0.19	0.35	0.02	0.15	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.28	0.05	0.30	0.00	0.00	0.17	0.06
C8	0.04	0.01	0.10	0.37	0.02	0.22	0.00	0.23	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.36	0.08	0.30	0.02	0.03	0.31	0.01
N1	0.06	0.01	0.20	0.30	0.02	0.09	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.20	0.01	0.31	0.00	0.06	0.14	0.10
N2	0.02	0.00	0.19	0.17	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.04	0.06	0.31	0.01	0.17	0.10	0.17
N3	0.04	0.00	0.21	0.21	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.12	0.04	0.31	0.00	0.15	0.15	0.14
N7	0.06	0.01	0.13	0.39	0.01	0.22	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.37	0.08	0.30	0.01	0.07	0.25	0.00
N9	0.03	0.01	0.13	0.28	0.00	0.12	0.03	0.10	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.24	0.02	0.30	0.03	0.06	0.27	0.05
O2'	0.04	0.03	0.00	0.02	0.00	0.17	0.02	0.13	0.03	0.02	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.14	0.08	0.04	0.08	0.46	0.19
O3'	0.09	0.12	0.09	0.03	0.22	0.11	0.30	0.15	0.28	0.36	0.20	0.04	0.12	0.37	0.24	0.09	0.00	0.09	0.21	0.32	0.01	0.55	0.18
O4'	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.05	0.02	0.05	0.08	0.01	0.06	0.04	0.08	0.02	0.14	0.09	0.00	0.17	0.06	0.08	0.33	0.01
O5'	0.22	0.31	0.21	0.05	0.32	0.01	0.31	0.01	0.30	0.30	0.31	0.31	0.31	0.30	0.30	0.08	0.21	0.17	0.00	0.30	0.03	0.01	0.02
O6	0.07	0.01	0.18	0.38	0.01	0.17	0.01	0.21	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.32	0.06	0.30	0.00	0.06	0.16	0.03
OP1	0.08	0.13	0.14	0.11	0.09	0.12	0.00	0.15	0.00	0.03	0.06	0.17	0.15	0.07	0.06	0.08	0.01	0.08	0.03	0.06	0.00	0.06	0.00
OP2	0.32	0.13	0.34	0.49	0.19	0.41	0.20	0.39	0.17	0.31	0.14	0.10	0.15	0.25	0.27	0.46	0.55	0.33	0.01	0.16	0.06	0.00	0.01
P	0.01	0.14	0.02	0.07	0.10	0.05	0.05	0.04	0.06	0.01	0.10	0.17	0.14	0.00	0.05	0.19	0.18	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.28	0.02	0.19	0.12	0.26	0.19	0.38	0.14	0.37	0.43	0.19	0.25	0.06	0.46	0.32	0.15	0.02	0.26	0.10	0.45	0.12	0.31	0.01
C2	0.15	0.41	0.20	0.14	0.11	0.15	0.02	0.07	0.11	0.17	0.28	0.56	0.34	0.12	0.07	0.21	0.14	0.14	0.17	0.05	0.21	0.19	0.10
C2'	0.16	0.13	0.00	0.07	0.27	0.03	0.42	0.02	0.49	0.38	0.35	0.11	0.09	0.47	0.26	0.08	0.24	0.15	0.18	0.59	0.24	0.22	0.08
C3'	0.01	0.15	0.08	0.12	0.01	0.06	0.11	0.09	0.12	0.13	0.01	0.35	0.13	0.17	0.05	0.12	0.23	0.01	0.32	0.21	0.36	0.03	0.24
C4	0.17	0.44	0.18	0.18	0.02	0.20	0.10	0.16	0.01	0.28	0.27	0.70	0.30	0.26	0.15	0.14	0.17	0.19	0.15	0.07	0.11	0.28	0.01
C4'	0.18	0.12	0.14	0.10	0.11	0.14	0.19	0.09	0.15	0.27	0.01	0.34	0.05	0.27	0.18	0.12	0.04	0.17	0.18	0.22	0.19	0.21	0.07
C5	0.09	0.69	0.16	0.25	0.22	0.22	0.11	0.21	0.29	0.18	0.58	0.88	0.50	0.13	0.03	0.12	0.31	0.14	0.18	0.20	0.05	0.30	0.01
C5'	0.10	0.27	0.10	0.09	0.01	0.11	0.06	0.07	0.00	0.17	0.18	0.48	0.17	0.17	0.09	0.08	0.08	0.11	0.25	0.06	0.20	0.16	0.12
C6	0.01	0.79	0.14	0.28	0.41	0.22	0.34	0.21	0.50	0.04	0.72	0.89	0.65	0.07	0.12	0.12	0.40	0.08	0.21	0.42	0.05	0.27	0.02
C8	0.16	0.48	0.17	0.23	0.03	0.23	0.09	0.23	0.04	0.30	0.35	0.77	0.30	0.29	0.15	0.11	0.24	0.20	0.14	0.06	0.02	0.35	0.05
N1	0.04	0.64	0.17	0.24	0.35	0.19	0.25	0.14	0.36	0.04	0.54	0.74	0.57	0.04	0.09	0.17	0.34	0.08	0.21	0.29	0.14	0.21	0.08
N2	0.15	0.26	0.20	0.03	0.07	0.08	0.01	0.04	0.06	0.13	0.18	0.38	0.23	0.09	0.06	0.29	0.01	0.11	0.18	0.02	0.30	0.11	0.16
N3	0.21	0.29	0.20	0.13	0.04	0.17	0.14	0.10	0.06	0.28	0.14	0.51	0.20	0.26	0.18	0.19	0.08	0.19	0.14	0.12	0.18	0.24	0.05
N7	0.09	0.69	0.15	0.26	0.20	0.24	0.10	0.25	0.30	0.20	0.62	0.92	0.48	0.15	0.04	0.09	0.33	0.15	0.17	0.21	0.01	0.34	0.04
N9	0.21	0.29	0.18	0.18	0.09	0.21	0.22	0.18	0.14	0.35	0.12	0.59	0.16	0.36	0.22	0.14	0.14	0.22	0.12	0.22	0.08	0.32	0.02
O2'	0.57	0.71	0.33	0.19	0.74	0.35	0.86	0.30	0.92	0.78	0.86	0.56	0.63	0.86	0.69	0.27	0.07	0.54	0.19	0.98	0.07	0.55	0.26
O3'	0.13	0.02	0.03	0.03	0.13	0.05	0.20	0.01	0.20	0.22	0.11	0.12	0.03	0.24	0.16	0.01	0.16	0.12	0.19	0.26	0.27	0.11	0.14
O4'	0.26	0.09	0.23	0.18	0.18	0.22	0.27	0.16	0.23	0.36	0.04	0.33	0.01	0.37	0.27	0.21	0.14	0.25	0.12	0.29	0.11	0.30	0.01
O5'	0.51	0.08	0.49	0.49	0.40	0.52	0.51	0.49	0.44	0.64	0.21	0.18	0.18	0.65	0.52	0.43	0.48	0.52	0.16	0.52	0.24	0.64	0.34
O6	0.08	0.88	0.10	0.31	0.57	0.23	0.56	0.25	0.73	0.12	0.89	0.95	0.73	0.27	0.26	0.09	0.50	0.02	0.25	0.67	0.00	0.27	0.01
OP1	0.21	0.29	0.28	0.29	0.00	0.27	0.03	0.20	0.08	0.21	0.25	0.47	0.16	0.16	0.14	0.30	0.40	0.21	0.19	0.06	0.07	0.25	0.02
OP2	0.10	0.76	0.01	0.08	0.36	0.04	0.30	0.03	0.45	0.05	0.70	1.00	0.59	0.10	0.17	0.03	0.21	0.06	0.38	0.40	0.21	0.12	0.18
P	0.24	0.30	0.30	0.32	0.03	0.30	0.09	0.25	0.03	0.27	0.24	0.52	0.16	0.23	0.18	0.29	0.40	0.25	0.13	0.01	0.01	0.33	0.05

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.04	0.07	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.18	0.00	0.20	0.02	0.37	0.08	0.28
C2	0.02	0.00	0.20	0.24	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.38	0.01	0.32	0.01	0.34	0.09	0.25
C2'	0.04	0.20	0.00	0.03	0.14	0.00	0.06	0.02	0.08	0.03	0.15	0.25	0.23	0.01	0.06	0.00	0.14	0.02	0.16	0.05	0.35	0.03	0.23
C3'	0.07	0.24	0.03	0.00	0.15	0.02	0.05	0.03	0.07	0.07	0.16	0.31	0.26	0.06	0.06	0.04	0.05	0.05	0.15	0.02	0.32	0.14	0.17
C4	0.03	0.00	0.14	0.15	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.24	0.00	0.34	0.00	0.34	0.09	0.26
C4'	0.00	0.08	0.00	0.02	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.12	0.09	0.06	0.00	0.01	0.12	0.00	0.04	0.02	0.35	0.09	0.18
C5	0.02	0.00	0.06	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.11	0.00	0.37	0.00	0.29	0.09	0.25
C5'	0.02	0.10	0.02	0.03	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.06	0.13	0.10	0.08	0.00	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.27	0.24	0.05
C6	0.03	0.01	0.08	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.14	0.00	0.38	0.00	0.28	0.09	0.24
C8	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.36	0.00	0.28	0.09	0.26
N1	0.03	0.01	0.15	0.16	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.26	0.00	0.36	0.00	0.31	0.09	0.25
N2	0.03	0.00	0.25	0.31	0.00	0.12	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.19	0.47	0.00	0.30	0.00	0.36	0.08	0.25
N3	0.02	0.00	0.23	0.26	0.00	0.09	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.40	0.01	0.30	0.00	0.36	0.09	0.26
N7	0.02	0.01	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.38	0.00	0.25	0.09	0.23
N9	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.15	0.00	0.31	0.00	0.34	0.09	0.27
O2'	0.01	0.16	0.00	0.04	0.10	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.13	0.19	0.16	0.02	0.05	0.00	0.22	0.01	0.02	0.06	0.35	0.01	0.21
O3'	0.18	0.38	0.14	0.05	0.24	0.12	0.11	0.06	0.14	0.02	0.26	0.47	0.40	0.02	0.15	0.22	0.00	0.15	0.07	0.06	0.29	0.20	0.14
O4'	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.15	0.00	0.17	0.00	0.38	0.08	0.28
O5'	0.20	0.32	0.16	0.15	0.34	0.04	0.37	0.01	0.38	0.36	0.36	0.30	0.30	0.38	0.31	0.02	0.07	0.17	0.00	0.39	0.03	0.06	0.02
O6	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.06	0.00	0.39	0.00	0.25	0.09	0.22
OP1	0.37	0.34	0.35	0.32	0.34	0.35	0.29	0.27	0.28	0.28	0.31	0.36	0.36	0.25	0.34	0.35	0.29	0.38	0.03	0.25	0.00	0.05	0.00
OP2	0.08	0.09	0.03	0.14	0.09	0.09	0.09	0.24	0.09	0.09	0.09	0.08	0.09	0.09	0.09	0.01	0.20	0.08	0.06	0.09	0.05	0.00	0.00
P	0.28	0.25	0.23	0.17	0.26	0.18	0.25	0.05	0.24	0.26	0.25	0.25	0.26	0.23	0.27	0.21	0.14	0.28	0.02	0.22	0.00	0.00	0.00