Doublet Group distance statistics: 51530

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 5, 4, 3, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.012, 0.016, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.012 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.011, 0.018, 0.025, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.018 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.008, 0.017, 0.026, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.017 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.013, 0.022, 0.031, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.022 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.014, 0.024, 0.034, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.024 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.012, 0.022, 0.032, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.022 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.019 std_dev=0.011
O6	A	0, 0.012, 0.031, 0.050, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.031 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.011, 0.030, 0.049, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.030 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.020, 0.040, 0.061, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.040 std_dev=0.020
N2	A	0, 0.013, 0.034, 0.054, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.034 std_dev=0.021
O3'	A	0, 0.226, 0.352, 0.479, 0.570 max_d=0.570 avg_d=0.352 std_dev=0.126
C2'	A	0, 0.064, 0.228, 0.392, 0.570 max_d=0.570 avg_d=0.228 std_dev=0.164
O4'	A	0, 0.086, 0.251, 0.415, 0.594 max_d=0.594 avg_d=0.251 std_dev=0.165
C3'	A	0, 0.106, 0.288, 0.470, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.288 std_dev=0.182
C4'	A	0, 0.130, 0.321, 0.512, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.321 std_dev=0.191
P	A	0, 0.295, 0.492, 0.688, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.492 std_dev=0.196
OP1	A	0, 0.360, 0.558, 0.757, 0.902 max_d=0.902 avg_d=0.558 std_dev=0.199
O5'	A	0, 0.305, 0.512, 0.720, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.512 std_dev=0.208
O2'	A	0, 0.169, 0.396, 0.623, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.396 std_dev=0.227
OP2	A	0, 0.306, 0.546, 0.785, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.546 std_dev=0.239
O3'	B	0, 0.538, 0.783, 1.028, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.783 std_dev=0.245
O2'	B	0, 0.559, 0.819, 1.078, 1.271 max_d=1.271 avg_d=0.819 std_dev=0.259
C3'	B	0, 0.597, 0.867, 1.138, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.867 std_dev=0.271
C2'	B	0, 0.606, 0.886, 1.166, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.886 std_dev=0.280
C4'	B	0, 0.621, 0.919, 1.218, 1.263 max_d=1.263 avg_d=0.919 std_dev=0.298
C1'	B	0, 0.659, 0.985, 1.310, 1.499 max_d=1.499 avg_d=0.985 std_dev=0.326
P	B	0, 0.537, 0.864, 1.190, 1.385 max_d=1.385 avg_d=0.864 std_dev=0.326
OP1	B	0, 0.448, 0.784, 1.119, 1.303 max_d=1.303 avg_d=0.784 std_dev=0.335
O4'	B	0, 0.697, 1.040, 1.384, 1.440 max_d=1.440 avg_d=1.040 std_dev=0.343
OP2	B	0, 0.541, 0.891, 1.242, 1.391 max_d=1.391 avg_d=0.891 std_dev=0.350
C5'	A	0, 0.259, 0.620, 0.980, 1.420 max_d=1.420 avg_d=0.620 std_dev=0.361
C5'	B	0, 0.589, 0.951, 1.312, 1.510 max_d=1.510 avg_d=0.951 std_dev=0.361
N9	B	0, 0.731, 1.097, 1.462, 1.708 max_d=1.708 avg_d=1.097 std_dev=0.366
O5'	B	0, 0.573, 0.959, 1.346, 1.627 max_d=1.627 avg_d=0.959 std_dev=0.386
C8	B	0, 0.683, 1.078, 1.474, 1.763 max_d=1.763 avg_d=1.078 std_dev=0.396
C4	B	0, 0.853, 1.251, 1.648, 1.883 max_d=1.883 avg_d=1.251 std_dev=0.397
C5	B	0, 0.856, 1.278, 1.699, 2.007 max_d=2.007 avg_d=1.278 std_dev=0.422
N7	B	0, 0.747, 1.178, 1.609, 1.937 max_d=1.937 avg_d=1.178 std_dev=0.431
N3	B	0, 0.934, 1.369, 1.804, 1.924 max_d=1.924 avg_d=1.369 std_dev=0.435
C6	B	0, 0.973, 1.424, 1.874, 2.180 max_d=2.180 avg_d=1.424 std_dev=0.451
N1	B	0, 1.067, 1.542, 2.017, 2.233 max_d=2.233 avg_d=1.542 std_dev=0.475
N6	B	0, 0.987, 1.466, 1.945, 2.293 max_d=2.293 avg_d=1.466 std_dev=0.479
C2	B	0, 1.033, 1.513, 1.993, 2.108 max_d=2.108 avg_d=1.513 std_dev=0.480

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.07	0.01	0.09	0.08	0.07
C2	0.03	0.00	0.13	0.10	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.12	0.05	0.15	0.01	0.17	0.14	0.16
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.07	0.06	0.06	0.10	0.16	0.13	0.04	0.01	0.00	0.03	0.01	0.10	0.05	0.14	0.10	0.12
C3'	0.02	0.10	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.04	0.05	0.07	0.12	0.09	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.08	0.03	0.10	0.05	0.07
C4	0.01	0.01	0.06	0.04	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.08	0.03	0.14	0.01	0.18	0.15	0.16
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.06	0.04	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.06	0.08	0.03
C5	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.06	0.03	0.17	0.01	0.22	0.19	0.20
C5'	0.03	0.06	0.07	0.02	0.06	0.01	0.09	0.00	0.08	0.11	0.06	0.07	0.06	0.12	0.07	0.07	0.03	0.01	0.01	0.10	0.10	0.06	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.04	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.08	0.04	0.17	0.00	0.23	0.20	0.21
C8	0.02	0.01	0.06	0.05	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.05	0.03	0.16	0.01	0.22	0.19	0.19
N1	0.02	0.00	0.10	0.07	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.11	0.04	0.16	0.00	0.21	0.17	0.19
N2	0.04	0.00	0.16	0.12	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.25	0.15	0.06	0.14	0.01	0.16	0.13	0.15
N3	0.03	0.00	0.13	0.09	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.11	0.04	0.14	0.01	0.15	0.13	0.14
N7	0.02	0.01	0.04	0.04	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.03	0.17	0.01	0.25	0.22	0.22
N9	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.13	0.01	0.16	0.14	0.14
O2'	0.02	0.21	0.00	0.02	0.10	0.02	0.07	0.07	0.11	0.07	0.17	0.25	0.19	0.05	0.03	0.00	0.07	0.02	0.12	0.10	0.16	0.13	0.15
O3'	0.05	0.12	0.03	0.01	0.08	0.02	0.06	0.03	0.08	0.05	0.11	0.15	0.11	0.05	0.05	0.07	0.00	0.04	0.06	0.07	0.07	0.04	0.04
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.04	0.06	0.04	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.11	0.05	0.10	0.13	0.11
O5'	0.07	0.15	0.10	0.08	0.14	0.02	0.17	0.01	0.17	0.16	0.16	0.14	0.14	0.17	0.13	0.12	0.06	0.11	0.00	0.18	0.02	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.03	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.07	0.05	0.18	0.00	0.25	0.23	0.22
OP1	0.09	0.17	0.14	0.10	0.18	0.06	0.22	0.10	0.23	0.22	0.21	0.16	0.15	0.25	0.16	0.16	0.07	0.10	0.02	0.25	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.14	0.10	0.05	0.15	0.08	0.19	0.06	0.20	0.19	0.17	0.13	0.13	0.22	0.14	0.13	0.04	0.13	0.01	0.23	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.16	0.12	0.07	0.16	0.03	0.20	0.01	0.21	0.19	0.19	0.15	0.14	0.22	0.14	0.15	0.04	0.11	0.00	0.22	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.17	0.19	0.17	0.17	0.19	0.18	0.17	0.17	0.23	0.16	0.16	0.18	0.22	0.19	0.21	0.16	0.21	0.18	0.29	0.25	0.22
C2	0.19	0.16	0.18	0.17	0.17	0.21	0.20	0.20	0.18	0.26	0.15	0.16	0.20	0.25	0.20	0.18	0.16	0.22	0.21	0.37	0.31	0.27
C2'	0.18	0.23	0.16	0.17	0.18	0.19	0.17	0.20	0.18	0.17	0.21	0.21	0.18	0.17	0.17	0.17	0.14	0.19	0.19	0.26	0.23	0.21
C3'	0.19	0.20	0.17	0.17	0.18	0.20	0.18	0.19	0.18	0.20	0.19	0.19	0.18	0.19	0.18	0.17	0.14	0.21	0.20	0.26	0.23	0.21
C4	0.20	0.17	0.20	0.18	0.17	0.20	0.19	0.18	0.18	0.26	0.16	0.16	0.19	0.25	0.20	0.22	0.17	0.21	0.20	0.35	0.30	0.26
C4'	0.19	0.19	0.19	0.18	0.18	0.21	0.19	0.20	0.18	0.23	0.17	0.18	0.18	0.22	0.20	0.19	0.17	0.23	0.22	0.34	0.29	0.26
C5	0.22	0.19	0.22	0.20	0.19	0.22	0.21	0.21	0.20	0.29	0.18	0.18	0.22	0.28	0.22	0.24	0.20	0.23	0.23	0.39	0.35	0.30
C5'	0.17	0.25	0.15	0.15	0.18	0.18	0.17	0.18	0.18	0.19	0.22	0.23	0.17	0.18	0.17	0.16	0.13	0.20	0.19	0.33	0.27	0.24
C6	0.22	0.21	0.23	0.22	0.20	0.23	0.23	0.23	0.21	0.30	0.20	0.20	0.23	0.29	0.23	0.23	0.22	0.24	0.25	0.42	0.38	0.32
C8	0.22	0.20	0.23	0.19	0.19	0.20	0.21	0.19	0.19	0.27	0.19	0.19	0.21	0.26	0.22	0.25	0.19	0.22	0.21	0.36	0.32	0.27
N1	0.21	0.19	0.21	0.21	0.19	0.23	0.22	0.23	0.20	0.29	0.18	0.19	0.22	0.28	0.22	0.20	0.21	0.23	0.25	0.41	0.36	0.31
N2	0.18	0.16	0.16	0.14	0.17	0.20	0.19	0.18	0.17	0.24	0.16	0.16	0.19	0.24	0.19	0.15	0.13	0.22	0.20	0.36	0.29	0.26
N3	0.18	0.14	0.18	0.16	0.16	0.19	0.18	0.17	0.16	0.24	0.14	0.14	0.18	0.24	0.19	0.19	0.16	0.21	0.19	0.33	0.28	0.24
N7	0.22	0.21	0.24	0.21	0.20	0.22	0.22	0.21	0.20	0.29	0.20	0.20	0.22	0.28	0.23	0.25	0.20	0.23	0.23	0.40	0.35	0.30
N9	0.20	0.17	0.21	0.18	0.17	0.19	0.19	0.17	0.18	0.25	0.17	0.17	0.19	0.24	0.20	0.22	0.17	0.21	0.20	0.33	0.29	0.25
O2'	0.22	0.24	0.20	0.22	0.22	0.25	0.21	0.27	0.22	0.21	0.23	0.23	0.22	0.21	0.21	0.20	0.19	0.23	0.27	0.32	0.29	0.28
O3'	0.26	0.21	0.24	0.23	0.24	0.26	0.25	0.24	0.24	0.29	0.22	0.22	0.25	0.28	0.26	0.25	0.20	0.29	0.24	0.29	0.27	0.25
O4'	0.21	0.17	0.21	0.20	0.19	0.22	0.21	0.20	0.19	0.27	0.17	0.17	0.20	0.26	0.22	0.22	0.19	0.24	0.22	0.36	0.31	0.28
O5'	0.15	0.25	0.13	0.15	0.16	0.16	0.14	0.16	0.16	0.15	0.22	0.23	0.14	0.14	0.14	0.14	0.13	0.16	0.16	0.26	0.21	0.18
O6	0.24	0.25	0.24	0.24	0.22	0.25	0.25	0.25	0.23	0.32	0.23	0.24	0.25	0.32	0.25	0.24	0.24	0.25	0.27	0.45	0.41	0.35
OP1	0.17	0.20	0.17	0.17	0.15	0.19	0.16	0.18	0.15	0.23	0.17	0.18	0.15	0.22	0.18	0.16	0.18	0.19	0.18	0.31	0.25	0.22
OP2	0.12	0.25	0.10	0.13	0.13	0.15	0.11	0.16	0.14	0.14	0.21	0.21	0.11	0.13	0.11	0.11	0.11	0.15	0.15	0.28	0.22	0.19
P	0.11	0.23	0.11	0.12	0.13	0.14	0.11	0.14	0.13	0.15	0.19	0.20	0.11	0.13	0.11	0.11	0.12	0.14	0.13	0.25	0.19	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.06	0.09	0.11
C2	0.02	0.00	0.16	0.11	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.17	0.06	0.09	0.09	0.16	0.13
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.01	0.03	0.01	0.06	0.08	0.12	0.16	0.04	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.12	0.08	0.05
C3'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.04	0.14	0.07	0.12	0.06	0.12	0.04	0.02	0.01	0.01	0.07	0.18	0.13	0.10
C4	0.01	0.01	0.08	0.04	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.06	0.03	0.10	0.10	0.15	0.13
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.04	0.09	0.02	0.03	0.06	0.09	0.04	0.03	0.02	0.00	0.02	0.05	0.03	0.03
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.02	0.15	0.15	0.20	0.17
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.07	0.01	0.12	0.00	0.12	0.14	0.09	0.04	0.14	0.15	0.07	0.04	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.04	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.05	0.04	0.15	0.16	0.22	0.17
C8	0.01	0.01	0.08	0.14	0.00	0.09	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.06	0.15	0.04	0.15	0.14	0.16	0.16
N1	0.02	0.00	0.12	0.07	0.01	0.02	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.12	0.05	0.13	0.13	0.20	0.16
N3	0.02	0.00	0.16	0.12	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.16	0.05	0.08	0.08	0.14	0.12
N6	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.05	0.03	0.18	0.20	0.25	0.20
N7	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.12	0.02	0.18	0.18	0.21	0.19
N9	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.09	0.08	0.12	0.12
O2'	0.01	0.20	0.00	0.02	0.09	0.03	0.05	0.04	0.09	0.06	0.16	0.19	0.07	0.03	0.01	0.00	0.04	0.03	0.05	0.14	0.09	0.05
O3'	0.01	0.17	0.01	0.01	0.06	0.02	0.04	0.03	0.05	0.15	0.12	0.16	0.05	0.12	0.03	0.04	0.00	0.01	0.10	0.30	0.22	0.18
O4'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.04	0.05	0.05	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.08	0.13	0.15	0.17
O5'	0.04	0.09	0.05	0.07	0.10	0.02	0.15	0.01	0.15	0.15	0.13	0.08	0.18	0.18	0.09	0.05	0.10	0.08	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.06	0.09	0.12	0.18	0.10	0.05	0.15	0.03	0.16	0.14	0.13	0.08	0.20	0.18	0.08	0.14	0.30	0.13	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.16	0.08	0.13	0.15	0.03	0.20	0.01	0.22	0.16	0.20	0.14	0.25	0.21	0.12	0.09	0.22	0.15	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.13	0.05	0.10	0.13	0.03	0.17	0.01	0.17	0.16	0.16	0.12	0.20	0.19	0.12	0.05	0.18	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00