Doublet Group distance statistics: 51534

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 4, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.014, 0.026, 0.038, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.026 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.012, 0.025, 0.038, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.025 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.011, 0.025, 0.039, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.025 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.003, 0.017, 0.031, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.017 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.019, 0.036, 0.052, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.036 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.005, 0.022, 0.039, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.022 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.020, 0.039, 0.057, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.039 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.006, 0.025, 0.045, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.025 std_dev=0.019
O6	A	0, 0.026, 0.050, 0.074, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.050 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.021, 0.046, 0.071, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.046 std_dev=0.025
N2	A	0, 0.016, 0.045, 0.075, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.045 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.020, 0.053, 0.085, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.053 std_dev=0.032
P	A	0, 0.068, 0.244, 0.420, 0.696 max_d=0.696 avg_d=0.244 std_dev=0.176
O4'	A	0, -0.033, 0.148, 0.329, 0.674 max_d=0.674 avg_d=0.148 std_dev=0.181
C2'	A	0, 0.010, 0.202, 0.394, 0.731 max_d=0.731 avg_d=0.202 std_dev=0.192
OP1	A	0, 0.221, 0.427, 0.633, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.427 std_dev=0.206
OP2	A	0, 0.245, 0.454, 0.662, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.454 std_dev=0.209
C4'	A	0, -0.006, 0.237, 0.481, 0.826 max_d=0.826 avg_d=0.237 std_dev=0.244
O3'	B	0, 0.261, 0.512, 0.764, 0.999 max_d=0.999 avg_d=0.512 std_dev=0.252
C3'	B	0, 0.225, 0.497, 0.770, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.497 std_dev=0.273
C3'	A	0, -0.007, 0.269, 0.544, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.269 std_dev=0.275
C2'	B	0, 0.299, 0.587, 0.875, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.587 std_dev=0.288
C4'	B	0, 0.310, 0.611, 0.911, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.611 std_dev=0.300
C5'	B	0, 0.271, 0.583, 0.895, 1.150 max_d=1.150 avg_d=0.583 std_dev=0.312
O2'	B	0, 0.375, 0.693, 1.012, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.693 std_dev=0.319
C1'	B	0, 0.342, 0.667, 0.991, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.667 std_dev=0.325
O5'	A	0, 0.317, 0.646, 0.976, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.646 std_dev=0.330
O5'	B	0, 0.355, 0.692, 1.029, 1.304 max_d=1.304 avg_d=0.692 std_dev=0.337
N3	B	0, 0.520, 0.863, 1.206, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.863 std_dev=0.343
O4'	B	0, 0.360, 0.706, 1.052, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.706 std_dev=0.346
N9	B	0, 0.441, 0.798, 1.155, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.798 std_dev=0.357
C4	B	0, 0.480, 0.859, 1.238, 1.452 max_d=1.452 avg_d=0.859 std_dev=0.379
C2	B	0, 0.635, 1.046, 1.457, 1.608 max_d=1.608 avg_d=1.046 std_dev=0.411
P	B	0, 0.359, 0.771, 1.183, 1.614 max_d=1.614 avg_d=0.771 std_dev=0.412
O2'	A	0, 0.027, 0.444, 0.862, 1.326 max_d=1.326 avg_d=0.444 std_dev=0.417
C8	B	0, 0.590, 1.010, 1.431, 1.684 max_d=1.684 avg_d=1.010 std_dev=0.420
OP1	B	0, 0.446, 0.879, 1.312, 1.563 max_d=1.563 avg_d=0.879 std_dev=0.433
C5	B	0, 0.581, 1.048, 1.514, 1.800 max_d=1.800 avg_d=1.048 std_dev=0.466
C5'	A	0, -0.057, 0.428, 0.912, 1.658 max_d=1.658 avg_d=0.428 std_dev=0.484
N7	B	0, 0.657, 1.147, 1.636, 1.930 max_d=1.930 avg_d=1.147 std_dev=0.489
N1	B	0, 0.662, 1.162, 1.662, 1.926 max_d=1.926 avg_d=1.162 std_dev=0.500
C6	B	0, 0.628, 1.158, 1.688, 2.011 max_d=2.011 avg_d=1.158 std_dev=0.530
OP2	B	0, 0.164, 0.766, 1.368, 1.941 max_d=1.941 avg_d=0.766 std_dev=0.602
O3'	A	0, -0.174, 0.437, 1.049, 2.240 max_d=2.240 avg_d=0.437 std_dev=0.611
N6	B	0, 0.715, 1.349, 1.982, 2.354 max_d=2.354 avg_d=1.349 std_dev=0.633

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.02	0.00	0.02	0.24	0.01	0.07	0.02	0.10	0.13	0.04
C2	0.03	0.00	0.14	0.06	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.28	0.39	0.12	0.14	0.02	0.07	0.05	0.07
C2'	0.00	0.14	0.00	0.01	0.07	0.02	0.03	0.12	0.05	0.10	0.10	0.17	0.14	0.07	0.02	0.01	0.05	0.02	0.23	0.03	0.32	0.11	0.26
C3'	0.02	0.06	0.01	0.00	0.04	0.01	0.09	0.02	0.08	0.17	0.05	0.10	0.06	0.16	0.07	0.02	0.01	0.01	0.17	0.11	0.22	0.22	0.25
C4	0.01	0.01	0.07	0.04	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.17	0.26	0.07	0.12	0.02	0.07	0.04	0.07
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.08	0.09	0.08	0.09	0.07	0.09	0.05	0.09	0.03	0.01	0.02	0.09	0.09	0.19	0.07
C5	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.19	0.17	0.04	0.15	0.02	0.07	0.03	0.09
C5'	0.02	0.14	0.12	0.02	0.10	0.01	0.13	0.00	0.16	0.09	0.16	0.15	0.11	0.13	0.07	0.05	0.13	0.03	0.01	0.18	0.03	0.07	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.08	0.01	0.16	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.20	0.21	0.07	0.17	0.01	0.09	0.05	0.11
C8	0.02	0.02	0.10	0.17	0.01	0.09	0.01	0.09	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.23	0.08	0.06	0.11	0.03	0.08	0.02	0.08
N1	0.02	0.00	0.10	0.05	0.02	0.08	0.01	0.16	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.23	0.31	0.10	0.16	0.02	0.08	0.04	0.09
N2	0.05	0.01	0.17	0.10	0.03	0.09	0.02	0.15	0.02	0.03	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.34	0.48	0.15	0.14	0.03	0.08	0.07	0.07
N3	0.02	0.01	0.14	0.06	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.27	0.39	0.12	0.12	0.01	0.07	0.07	0.06
N7	0.02	0.02	0.07	0.16	0.01	0.09	0.01	0.13	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.24	0.08	0.04	0.15	0.03	0.08	0.06	0.11
N9	0.00	0.02	0.02	0.07	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.13	0.16	0.01	0.09	0.02	0.08	0.07	0.06
O2'	0.02	0.28	0.01	0.02	0.17	0.09	0.19	0.05	0.20	0.23	0.23	0.34	0.27	0.24	0.13	0.00	0.06	0.08	0.24	0.21	0.43	0.10	0.32
O3'	0.24	0.39	0.05	0.01	0.26	0.03	0.17	0.13	0.21	0.08	0.31	0.48	0.39	0.08	0.16	0.06	0.00	0.17	0.20	0.16	0.28	0.46	0.37
O4'	0.01	0.12	0.02	0.01	0.07	0.01	0.04	0.03	0.07	0.06	0.10	0.15	0.12	0.04	0.01	0.08	0.17	0.00	0.08	0.06	0.22	0.28	0.16
O5'	0.07	0.14	0.23	0.17	0.12	0.02	0.15	0.01	0.17	0.11	0.16	0.14	0.12	0.15	0.09	0.24	0.20	0.08	0.00	0.19	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.02	0.03	0.11	0.02	0.09	0.02	0.18	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.21	0.16	0.06	0.19	0.00	0.11	0.09	0.13
OP1	0.10	0.07	0.32	0.22	0.07	0.09	0.07	0.03	0.09	0.08	0.08	0.08	0.07	0.08	0.08	0.43	0.28	0.22	0.02	0.11	0.00	0.03	0.01
OP2	0.13	0.05	0.11	0.22	0.04	0.19	0.03	0.07	0.05	0.02	0.04	0.07	0.07	0.06	0.07	0.10	0.46	0.28	0.02	0.09	0.03	0.00	0.02
P	0.04	0.07	0.26	0.25	0.07	0.07	0.09	0.01	0.11	0.08	0.09	0.07	0.06	0.11	0.06	0.32	0.37	0.16	0.00	0.13	0.01	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.25	0.12	0.07	0.16	0.14	0.14	0.21	0.16	0.13	0.22	0.21	0.15	0.13	0.13	0.17	0.08	0.12	0.10	0.25	0.37	0.17
C2	0.12	0.23	0.13	0.07	0.15	0.11	0.14	0.15	0.15	0.13	0.19	0.21	0.15	0.13	0.12	0.18	0.07	0.09	0.05	0.14	0.33	0.11
C2'	0.26	0.36	0.24	0.21	0.29	0.27	0.28	0.35	0.30	0.23	0.35	0.34	0.29	0.24	0.26	0.27	0.20	0.23	0.27	0.45	0.48	0.34
C3'	0.22	0.32	0.19	0.15	0.25	0.19	0.23	0.24	0.25	0.20	0.30	0.30	0.24	0.21	0.22	0.23	0.12	0.19	0.17	0.31	0.35	0.22
C4	0.11	0.25	0.11	0.05	0.16	0.11	0.14	0.17	0.17	0.12	0.23	0.22	0.16	0.12	0.12	0.16	0.07	0.09	0.06	0.17	0.32	0.12
C4'	0.13	0.27	0.11	0.07	0.16	0.14	0.14	0.20	0.17	0.13	0.24	0.23	0.15	0.13	0.13	0.16	0.08	0.13	0.09	0.18	0.36	0.14
C5	0.08	0.26	0.09	0.03	0.15	0.09	0.14	0.13	0.18	0.11	0.24	0.22	0.18	0.12	0.10	0.11	0.09	0.07	0.06	0.13	0.28	0.09
C5'	0.14	0.31	0.10	0.11	0.18	0.16	0.16	0.23	0.20	0.12	0.28	0.27	0.18	0.11	0.13	0.13	0.16	0.13	0.13	0.20	0.43	0.19
C6	0.07	0.25	0.09	0.05	0.14	0.07	0.15	0.11	0.18	0.12	0.23	0.21	0.18	0.13	0.10	0.08	0.10	0.06	0.09	0.11	0.24	0.07
C8	0.10	0.28	0.10	0.04	0.16	0.11	0.15	0.16	0.20	0.11	0.26	0.23	0.19	0.11	0.11	0.12	0.09	0.09	0.07	0.17	0.31	0.12
N1	0.08	0.22	0.10	0.03	0.14	0.07	0.13	0.11	0.15	0.13	0.20	0.20	0.15	0.13	0.10	0.12	0.08	0.05	0.08	0.12	0.27	0.07
N2	0.15	0.22	0.17	0.12	0.17	0.13	0.15	0.17	0.16	0.15	0.19	0.21	0.16	0.16	0.15	0.22	0.11	0.13	0.06	0.16	0.36	0.13
N3	0.14	0.24	0.14	0.08	0.16	0.13	0.14	0.19	0.16	0.13	0.21	0.22	0.15	0.13	0.13	0.19	0.08	0.12	0.08	0.19	0.36	0.14
N7	0.08	0.28	0.09	0.04	0.16	0.09	0.15	0.14	0.20	0.11	0.26	0.22	0.20	0.11	0.10	0.09	0.10	0.07	0.07	0.13	0.27	0.09
N9	0.11	0.26	0.11	0.05	0.16	0.11	0.14	0.17	0.18	0.12	0.23	0.22	0.17	0.12	0.12	0.16	0.07	0.10	0.07	0.19	0.33	0.14
O2'	0.39	0.47	0.39	0.35	0.42	0.38	0.40	0.45	0.42	0.36	0.45	0.45	0.41	0.37	0.39	0.45	0.34	0.35	0.41	0.63	0.56	0.48
O3'	0.46	0.42	0.48	0.45	0.45	0.44	0.46	0.41	0.45	0.50	0.43	0.43	0.46	0.49	0.47	0.51	0.42	0.47	0.45	0.48	0.32	0.45
O4'	0.11	0.21	0.10	0.10	0.10	0.16	0.10	0.22	0.11	0.15	0.18	0.17	0.11	0.13	0.10	0.14	0.12	0.14	0.14	0.16	0.38	0.17
O5'	0.10	0.28	0.10	0.11	0.15	0.14	0.13	0.20	0.18	0.11	0.25	0.22	0.17	0.10	0.10	0.11	0.16	0.11	0.12	0.16	0.39	0.17
O6	0.08	0.24	0.09	0.09	0.14	0.09	0.16	0.11	0.19	0.15	0.23	0.19	0.20	0.15	0.11	0.06	0.12	0.09	0.13	0.13	0.20	0.07
OP1	0.09	0.19	0.06	0.09	0.07	0.15	0.07	0.19	0.12	0.10	0.18	0.13	0.12	0.06	0.07	0.08	0.14	0.13	0.11	0.19	0.35	0.15
OP2	0.10	0.22	0.10	0.06	0.14	0.13	0.13	0.20	0.16	0.12	0.21	0.18	0.16	0.11	0.11	0.11	0.09	0.10	0.08	0.25	0.36	0.17
P	0.08	0.22	0.07	0.08	0.10	0.14	0.09	0.19	0.14	0.10	0.20	0.16	0.13	0.07	0.07	0.08	0.13	0.11	0.10	0.17	0.36	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.04	0.05	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.11	0.14	0.09
C2	0.05	0.00	0.08	0.03	0.02	0.04	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.17	0.06	0.06	0.18	0.25	0.32	0.24
C2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.06	0.05	0.08	0.03	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.14	0.18	0.09
C3'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.11	0.03	0.10	0.16	0.05	0.03	0.14	0.15	0.08	0.02	0.01	0.00	0.07	0.15	0.19	0.07
C4	0.02	0.02	0.03	0.05	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.09	0.03	0.04	0.18	0.21	0.29	0.22
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.11	0.16	0.06	0.04	0.15	0.16	0.08	0.03	0.02	0.00	0.02	0.10	0.11	0.03
C5	0.02	0.01	0.01	0.11	0.01	0.12	0.00	0.23	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.06	0.11	0.05	0.26	0.33	0.43	0.33
C5'	0.03	0.11	0.03	0.03	0.14	0.01	0.23	0.00	0.23	0.26	0.17	0.09	0.29	0.29	0.14	0.04	0.03	0.02	0.01	0.12	0.05	0.01
C6	0.03	0.01	0.02	0.10	0.01	0.11	0.01	0.23	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.09	0.05	0.28	0.38	0.49	0.37
C8	0.02	0.02	0.06	0.16	0.00	0.16	0.01	0.26	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.18	0.05	0.23	0.26	0.35	0.28
N1	0.04	0.01	0.05	0.05	0.02	0.06	0.01	0.17	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.14	0.04	0.06	0.24	0.33	0.42	0.31
N3	0.05	0.01	0.08	0.03	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.16	0.06	0.06	0.14	0.19	0.26	0.19
N6	0.03	0.02	0.03	0.14	0.02	0.15	0.02	0.29	0.01	0.04	0.02	0.02	0.00	0.04	0.03	0.07	0.14	0.07	0.34	0.48	0.61	0.46
N7	0.02	0.02	0.04	0.15	0.02	0.16	0.00	0.29	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.01	0.17	0.05	0.29	0.37	0.51	0.38
N9	0.00	0.03	0.02	0.08	0.01	0.08	0.02	0.14	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.07	0.02	0.14	0.15	0.22	0.17
O2'	0.01	0.17	0.01	0.02	0.09	0.03	0.06	0.04	0.09	0.04	0.14	0.16	0.07	0.01	0.02	0.00	0.05	0.06	0.07	0.15	0.17	0.07
O3'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.02	0.11	0.03	0.09	0.18	0.04	0.06	0.14	0.17	0.07	0.05	0.00	0.02	0.12	0.20	0.22	0.08
O4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.05	0.05	0.06	0.06	0.07	0.05	0.02	0.06	0.02	0.00	0.13	0.15	0.13	0.10
O5'	0.09	0.18	0.07	0.07	0.18	0.02	0.26	0.01	0.28	0.23	0.24	0.14	0.34	0.29	0.14	0.07	0.12	0.13	0.00	0.01	0.03	0.01
OP1	0.11	0.25	0.14	0.15	0.21	0.10	0.33	0.12	0.38	0.26	0.33	0.19	0.48	0.37	0.15	0.15	0.20	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.32	0.18	0.19	0.29	0.11	0.43	0.05	0.49	0.35	0.42	0.26	0.61	0.51	0.22	0.17	0.22	0.13	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.24	0.09	0.07	0.22	0.03	0.33	0.01	0.37	0.28	0.31	0.19	0.46	0.38	0.17	0.07	0.08	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00