Doublet Group distance statistics: 51536

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 6, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.008, 0.017, 0.027, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.009, 0.019, 0.030, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.019 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.012, 0.025, 0.037, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.025 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.010, 0.023, 0.036, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.023 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.015, 0.029, 0.044, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.029 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.022, 0.040, 0.058, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.040 std_dev=0.018
C2	A	0, 0.005, 0.024, 0.043, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.024 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.020, 0.039, 0.059, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.039 std_dev=0.020
O6	A	0, 0.005, 0.027, 0.049, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.027 std_dev=0.022
N2	A	0, 0.024, 0.060, 0.096, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.060 std_dev=0.036
C2'	A	0, 0.073, 0.130, 0.186, 0.204 max_d=0.204 avg_d=0.130 std_dev=0.057
O4'	A	0, 0.064, 0.147, 0.230, 0.273 max_d=0.273 avg_d=0.147 std_dev=0.083
O2'	A	0, 0.084, 0.168, 0.252, 0.298 max_d=0.298 avg_d=0.168 std_dev=0.084
C3'	A	0, 0.111, 0.214, 0.317, 0.376 max_d=0.376 avg_d=0.214 std_dev=0.103
C4'	A	0, 0.102, 0.228, 0.354, 0.432 max_d=0.432 avg_d=0.228 std_dev=0.126
O3'	A	0, 0.168, 0.305, 0.442, 0.506 max_d=0.506 avg_d=0.305 std_dev=0.137
O2'	B	0, 0.239, 0.406, 0.573, 0.558 max_d=0.558 avg_d=0.406 std_dev=0.167
C2'	B	0, 0.232, 0.411, 0.591, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.411 std_dev=0.180
N9	B	0, 0.277, 0.486, 0.695, 0.770 max_d=0.770 avg_d=0.486 std_dev=0.209
N7	B	0, 0.308, 0.518, 0.727, 0.756 max_d=0.756 avg_d=0.518 std_dev=0.209
C8	B	0, 0.324, 0.534, 0.744, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.534 std_dev=0.210
C1'	B	0, 0.266, 0.485, 0.705, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.485 std_dev=0.219
OP1	B	0, 0.066, 0.289, 0.513, 0.805 max_d=0.805 avg_d=0.289 std_dev=0.224
C5'	A	0, 0.187, 0.413, 0.640, 0.764 max_d=0.764 avg_d=0.413 std_dev=0.227
C5	B	0, 0.279, 0.512, 0.744, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.512 std_dev=0.232
C4	B	0, 0.269, 0.510, 0.750, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.510 std_dev=0.240
O5'	A	0, 0.221, 0.474, 0.727, 0.819 max_d=0.819 avg_d=0.474 std_dev=0.253
C3'	B	0, 0.262, 0.534, 0.805, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.534 std_dev=0.272
C6	B	0, 0.288, 0.569, 0.850, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.569 std_dev=0.281
N3	B	0, 0.266, 0.552, 0.838, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.552 std_dev=0.286
O3'	B	0, 0.404, 0.692, 0.979, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.692 std_dev=0.288
O4'	B	0, 0.267, 0.562, 0.857, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.562 std_dev=0.295
P	B	0, 0.299, 0.601, 0.902, 0.934 max_d=0.934 avg_d=0.601 std_dev=0.302
N6	B	0, 0.321, 0.637, 0.952, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.637 std_dev=0.316
C2	B	0, 0.293, 0.610, 0.926, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.610 std_dev=0.316
N1	B	0, 0.315, 0.632, 0.949, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.632 std_dev=0.317
P	A	0, 0.283, 0.618, 0.954, 1.096 max_d=1.096 avg_d=0.618 std_dev=0.335
C4'	B	0, 0.312, 0.662, 1.011, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.662 std_dev=0.349
OP2	A	0, 0.298, 0.664, 1.029, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.664 std_dev=0.365
OP2	B	0, 0.467, 0.843, 1.219, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.843 std_dev=0.376
O5'	B	0, 0.470, 0.877, 1.284, 1.384 max_d=1.384 avg_d=0.877 std_dev=0.407
C5'	B	0, 0.400, 0.845, 1.290, 1.384 max_d=1.384 avg_d=0.845 std_dev=0.445
OP1	A	0, 0.392, 0.866, 1.340, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.866 std_dev=0.474

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.01	0.09	0.06	0.03
C2	0.04	0.00	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.05	0.12	0.01	0.11	0.13	0.10
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.11	0.03	0.04
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.03	0.04	0.05	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.13	0.05	0.05
C4	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.12	0.01	0.11	0.12	0.10
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.02	0.06	0.04	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.12	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.02	0.14	0.01	0.14	0.18	0.14
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.07	0.08	0.05	0.06	0.05	0.09	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.09	0.11	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.15	0.01	0.15	0.20	0.16
C8	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.04	0.15	0.03	0.13	0.13	0.13
N1	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.13	0.01	0.13	0.18	0.13
N2	0.06	0.01	0.05	0.05	0.02	0.06	0.02	0.06	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.05	0.06	0.07	0.12	0.02	0.12	0.13	0.09
N3	0.04	0.01	0.03	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.11	0.01	0.11	0.10	0.08
N7	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.05	0.00	0.09	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.03	0.16	0.03	0.16	0.19	0.16
N9	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.11	0.01	0.11	0.09	0.08
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.13	0.03	0.03
O3'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.04	0.04	0.06	0.03	0.05	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.16	0.11	0.07
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.07	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.02	0.09	0.08	0.02
O5'	0.06	0.12	0.03	0.03	0.12	0.01	0.14	0.01	0.15	0.15	0.13	0.12	0.11	0.16	0.11	0.02	0.05	0.05	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01
O6	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.06	0.02	0.16	0.00	0.19	0.25	0.19
OP1	0.09	0.11	0.11	0.13	0.11	0.12	0.14	0.11	0.15	0.13	0.13	0.12	0.11	0.16	0.11	0.13	0.16	0.09	0.01	0.19	0.00	0.02	0.01
OP2	0.06	0.13	0.03	0.05	0.12	0.03	0.18	0.03	0.20	0.13	0.18	0.13	0.10	0.19	0.09	0.03	0.11	0.08	0.01	0.25	0.02	0.00	0.01
P	0.03	0.10	0.04	0.05	0.10	0.02	0.14	0.01	0.16	0.13	0.13	0.09	0.08	0.16	0.08	0.03	0.07	0.02	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.13	0.06	0.10	0.08	0.09	0.05	0.08	0.06	0.07	0.10	0.12	0.05	0.07	0.06	0.08	0.16	0.07	0.13	0.17	0.19	0.14
C2	0.06	0.08	0.05	0.07	0.05	0.05	0.05	0.04	0.05	0.07	0.05	0.09	0.08	0.08	0.04	0.08	0.13	0.05	0.11	0.18	0.19	0.14
C2'	0.08	0.15	0.05	0.08	0.09	0.06	0.08	0.05	0.08	0.08	0.12	0.13	0.08	0.08	0.08	0.07	0.14	0.06	0.12	0.17	0.18	0.13
C3'	0.08	0.15	0.05	0.09	0.10	0.07	0.09	0.05	0.10	0.10	0.12	0.14	0.10	0.11	0.09	0.08	0.14	0.06	0.11	0.16	0.16	0.12
C4	0.07	0.10	0.05	0.08	0.06	0.06	0.05	0.06	0.04	0.08	0.06	0.10	0.05	0.08	0.06	0.09	0.14	0.05	0.13	0.17	0.18	0.13
C4'	0.08	0.15	0.06	0.10	0.09	0.08	0.07	0.08	0.08	0.08	0.12	0.13	0.07	0.08	0.07	0.08	0.16	0.06	0.13	0.16	0.17	0.13
C5	0.08	0.09	0.07	0.09	0.07	0.06	0.07	0.06	0.06	0.10	0.06	0.10	0.09	0.10	0.08	0.11	0.14	0.05	0.15	0.18	0.18	0.14
C5'	0.07	0.14	0.07	0.12	0.08	0.10	0.06	0.11	0.07	0.08	0.10	0.12	0.07	0.09	0.06	0.08	0.17	0.07	0.11	0.15	0.14	0.10
C6	0.09	0.08	0.09	0.10	0.07	0.07	0.09	0.06	0.08	0.11	0.07	0.09	0.12	0.12	0.08	0.13	0.15	0.06	0.16	0.18	0.19	0.14
C8	0.08	0.12	0.06	0.08	0.09	0.06	0.08	0.05	0.07	0.10	0.09	0.12	0.08	0.10	0.09	0.10	0.14	0.05	0.14	0.18	0.17	0.14
N1	0.07	0.06	0.07	0.09	0.05	0.06	0.07	0.05	0.07	0.09	0.04	0.07	0.11	0.10	0.05	0.12	0.15	0.05	0.14	0.18	0.19	0.14
N2	0.07	0.10	0.06	0.07	0.08	0.06	0.09	0.06	0.10	0.09	0.09	0.10	0.12	0.11	0.07	0.07	0.13	0.06	0.10	0.19	0.22	0.17
N3	0.07	0.11	0.05	0.07	0.07	0.06	0.05	0.05	0.05	0.06	0.08	0.11	0.06	0.07	0.06	0.07	0.13	0.05	0.11	0.18	0.19	0.14
N7	0.09	0.10	0.08	0.09	0.09	0.06	0.09	0.06	0.08	0.11	0.08	0.11	0.10	0.12	0.09	0.11	0.14	0.05	0.15	0.19	0.17	0.14
N9	0.08	0.12	0.06	0.08	0.08	0.06	0.06	0.06	0.05	0.08	0.09	0.12	0.05	0.08	0.07	0.09	0.14	0.05	0.13	0.18	0.18	0.13
O2'	0.08	0.17	0.04	0.08	0.10	0.07	0.08	0.05	0.10	0.06	0.14	0.15	0.09	0.07	0.08	0.06	0.14	0.07	0.13	0.17	0.20	0.15
O3'	0.10	0.17	0.06	0.08	0.12	0.06	0.12	0.04	0.13	0.12	0.16	0.16	0.13	0.13	0.11	0.08	0.14	0.08	0.12	0.16	0.16	0.13
O4'	0.08	0.13	0.07	0.12	0.08	0.10	0.05	0.10	0.06	0.07	0.10	0.13	0.05	0.07	0.06	0.08	0.17	0.07	0.14	0.18	0.19	0.14
O5'	0.09	0.12	0.12	0.17	0.07	0.16	0.08	0.18	0.07	0.11	0.09	0.11	0.09	0.11	0.07	0.11	0.20	0.11	0.14	0.12	0.15	0.10
O6	0.12	0.10	0.12	0.13	0.11	0.10	0.13	0.10	0.14	0.15	0.11	0.11	0.18	0.16	0.11	0.16	0.17	0.09	0.19	0.20	0.20	0.17
OP1	0.09	0.12	0.12	0.16	0.08	0.15	0.08	0.17	0.07	0.12	0.08	0.11	0.08	0.12	0.07	0.12	0.20	0.11	0.10	0.15	0.09	0.08
OP2	0.13	0.12	0.13	0.15	0.11	0.16	0.11	0.20	0.09	0.16	0.09	0.12	0.10	0.16	0.13	0.13	0.15	0.15	0.08	0.20	0.07	0.12
P	0.09	0.12	0.11	0.15	0.09	0.14	0.09	0.17	0.08	0.13	0.09	0.11	0.09	0.13	0.09	0.10	0.17	0.11	0.09	0.14	0.08	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.05	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.04	0.04	0.15	0.09
C2	0.05	0.00	0.04	0.08	0.01	0.08	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.13	0.07	0.07	0.07	0.14	0.07
C2'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.02	0.04	0.04	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.11	0.21	0.14
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.05	0.08	0.02	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.12	0.20	0.12
C4	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.07	0.04	0.07	0.06	0.12	0.06
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.04	0.06	0.07	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.05
C5	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.05	0.02	0.10	0.07	0.09	0.04
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.08	0.07	0.07	0.09	0.09	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.10	0.08	0.01
C6	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.07	0.04	0.10	0.08	0.09	0.05
C8	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.05	0.03	0.02	0.11	0.06	0.09	0.05
N1	0.04	0.00	0.02	0.05	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.11	0.06	0.09	0.07	0.11	0.05
N3	0.05	0.00	0.04	0.08	0.00	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.07	0.07	0.07	0.16	0.09
N6	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.02	0.09	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.06	0.05	0.03	0.13	0.12	0.11	0.09
N7	0.02	0.01	0.05	0.04	0.01	0.04	0.01	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.06	0.03	0.01	0.12	0.07	0.10	0.06
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.07	0.06	0.12	0.07
O2'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.05	0.05	0.05	0.06	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.12	0.15	0.26	0.17
O3'	0.03	0.13	0.01	0.00	0.07	0.01	0.05	0.01	0.07	0.03	0.11	0.12	0.05	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.05	0.11	0.21	0.11
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.06	0.07	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.06	0.11	0.08
O5'	0.04	0.07	0.10	0.08	0.07	0.01	0.10	0.00	0.10	0.11	0.09	0.07	0.13	0.12	0.07	0.12	0.05	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.04	0.07	0.11	0.12	0.06	0.05	0.07	0.10	0.08	0.06	0.07	0.07	0.12	0.07	0.06	0.15	0.11	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.14	0.21	0.20	0.12	0.12	0.09	0.08	0.09	0.09	0.11	0.16	0.11	0.10	0.12	0.26	0.21	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.07	0.14	0.12	0.06	0.05	0.04	0.01	0.05	0.05	0.05	0.09	0.09	0.06	0.07	0.17	0.11	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00