Doublet Group distance statistics: 51541

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.011 std_dev=0.009
N2	A	0, 0.009, 0.023, 0.036, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.023 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.004, 0.018, 0.031, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.004, 0.017, 0.031, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.008, 0.023, 0.039, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.023 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.009, 0.029, 0.049, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.029 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.011, 0.035, 0.059, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.035 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.013, 0.041, 0.068, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.041 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.017, 0.047, 0.076, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.047 std_dev=0.030
O6	A	0, 0.015, 0.046, 0.077, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.046 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.040, 0.148, 0.256, 0.291 max_d=0.291 avg_d=0.148 std_dev=0.108
C2'	A	0, 0.077, 0.203, 0.330, 0.312 max_d=0.312 avg_d=0.203 std_dev=0.126
C4'	A	0, 0.108, 0.282, 0.456, 0.437 max_d=0.437 avg_d=0.282 std_dev=0.174
C3'	A	0, 0.119, 0.317, 0.516, 0.491 max_d=0.491 avg_d=0.317 std_dev=0.199
O2'	A	0, 0.127, 0.339, 0.551, 0.533 max_d=0.533 avg_d=0.339 std_dev=0.212
C5'	A	0, 0.174, 0.458, 0.742, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.458 std_dev=0.284
O3'	A	0, 0.187, 0.506, 0.826, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.506 std_dev=0.320
O5'	A	0, 0.203, 0.583, 0.964, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.583 std_dev=0.380
P	A	0, 0.271, 0.788, 1.305, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.788 std_dev=0.517
O2'	B	0, 0.224, 0.746, 1.269, 1.389 max_d=1.389 avg_d=0.746 std_dev=0.523
OP1	A	0, 0.315, 0.889, 1.463, 1.584 max_d=1.584 avg_d=0.889 std_dev=0.574
C2'	B	0, 0.396, 1.001, 1.607, 1.585 max_d=1.585 avg_d=1.001 std_dev=0.605
C3'	B	0, 0.426, 1.112, 1.797, 1.824 max_d=1.824 avg_d=1.112 std_dev=0.685
OP2	A	0, 0.308, 0.997, 1.686, 1.813 max_d=1.813 avg_d=0.997 std_dev=0.689
O3'	B	0, 1.060, 2.522, 3.985, 3.488 max_d=3.488 avg_d=2.522 std_dev=1.462
C1'	B	0, 1.147, 2.729, 4.312, 3.769 max_d=3.769 avg_d=2.729 std_dev=1.582
C4'	B	0, 1.145, 2.780, 4.415, 4.212 max_d=4.212 avg_d=2.780 std_dev=1.635
O4'	B	0, 1.387, 3.321, 5.255, 4.810 max_d=4.810 avg_d=3.321 std_dev=1.934
N9	B	0, 1.600, 3.800, 6.000, 5.229 max_d=5.229 avg_d=3.800 std_dev=2.200
C8	B	0, 1.629, 3.870, 6.110, 5.327 max_d=5.327 avg_d=3.870 std_dev=2.240
OP2	B	0, 1.638, 3.946, 6.253, 5.751 max_d=5.751 avg_d=3.946 std_dev=2.308
C5'	B	0, 1.668, 4.044, 6.420, 6.105 max_d=6.105 avg_d=4.044 std_dev=2.376
O5'	B	0, 1.748, 4.138, 6.529, 5.606 max_d=5.606 avg_d=4.138 std_dev=2.390
P	B	0, 2.040, 4.832, 7.623, 6.548 max_d=6.548 avg_d=4.832 std_dev=2.792
N7	B	0, 2.161, 5.125, 8.088, 6.986 max_d=6.986 avg_d=5.125 std_dev=2.964
OP1	B	0, 2.232, 5.294, 8.355, 7.244 max_d=7.244 avg_d=5.294 std_dev=3.062
C4	B	0, 2.268, 5.375, 8.483, 7.402 max_d=7.402 avg_d=5.375 std_dev=3.108
N3	B	0, 2.597, 6.151, 9.706, 8.444 max_d=8.444 avg_d=6.151 std_dev=3.555
C5	B	0, 2.618, 6.203, 9.788, 8.498 max_d=8.498 avg_d=6.203 std_dev=3.585
C2	B	0, 3.368, 7.975, 12.582, 10.882 max_d=10.882 avg_d=7.975 std_dev=4.607
C6	B	0, 3.403, 8.058, 12.712, 10.997 max_d=10.997 avg_d=8.058 std_dev=4.655
N1	B	0, 3.783, 8.956, 14.128, 12.194 max_d=12.194 avg_d=8.956 std_dev=5.173
N6	B	0, 3.825, 9.059, 14.293, 12.382 max_d=12.382 avg_d=9.059 std_dev=5.234

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03
C2	0.01	0.00	0.08	0.07	0.02	0.04	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.10	0.11	0.02	0.05	0.01	0.07	0.06	0.06
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.08	0.05	0.08	0.08	0.08	0.06	0.03	0.01	0.01	0.01	0.05	0.10	0.07	0.10	0.06
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.02	0.08	0.07	0.08	0.07	0.07	0.07	0.02	0.02	0.01	0.01	0.09	0.10	0.11	0.15	0.10
C4	0.01	0.02	0.06	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.02	0.05	0.02	0.07	0.07	0.06
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.05	0.05	0.03	0.03	0.06	0.02	0.05	0.03	0.00	0.02	0.08	0.03	0.03	0.02
C5	0.02	0.02	0.07	0.06	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.08	0.03	0.08	0.02	0.12	0.10	0.09
C5'	0.01	0.04	0.02	0.02	0.04	0.01	0.06	0.00	0.07	0.07	0.06	0.03	0.03	0.08	0.03	0.05	0.04	0.00	0.01	0.09	0.02	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.08	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.11	0.03	0.09	0.01	0.14	0.12	0.10
C8	0.02	0.03	0.05	0.07	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.04	0.08	0.04	0.09	0.03	0.11	0.10	0.09
N1	0.01	0.01	0.08	0.08	0.01	0.05	0.02	0.06	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.08	0.11	0.03	0.07	0.01	0.11	0.09	0.08
N2	0.01	0.00	0.08	0.07	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.10	0.12	0.02	0.04	0.01	0.05	0.06	0.05
N3	0.01	0.01	0.08	0.07	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.09	0.10	0.01	0.04	0.01	0.05	0.06	0.05
N7	0.02	0.02	0.06	0.07	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.04	0.11	0.02	0.15	0.14	0.12
N9	0.00	0.03	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.05	0.03	0.06	0.06	0.05
O2'	0.03	0.10	0.01	0.02	0.05	0.05	0.05	0.05	0.07	0.04	0.08	0.10	0.09	0.04	0.01	0.00	0.02	0.06	0.06	0.08	0.10	0.10	0.07
O3'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.07	0.03	0.08	0.04	0.11	0.08	0.11	0.12	0.10	0.09	0.03	0.02	0.00	0.02	0.12	0.13	0.18	0.20	0.15
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.00	0.05	0.05	0.04	0.07	0.07
O5'	0.02	0.05	0.05	0.09	0.05	0.02	0.08	0.01	0.09	0.09	0.07	0.04	0.04	0.11	0.05	0.06	0.12	0.05	0.00	0.12	0.01	0.03	0.01
O6	0.03	0.01	0.10	0.10	0.02	0.08	0.02	0.09	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.08	0.13	0.05	0.12	0.00	0.18	0.16	0.13
OP1	0.03	0.07	0.07	0.11	0.07	0.03	0.12	0.02	0.14	0.11	0.11	0.05	0.05	0.15	0.06	0.10	0.18	0.04	0.01	0.18	0.00	0.05	0.02
OP2	0.03	0.06	0.10	0.15	0.07	0.03	0.10	0.02	0.12	0.10	0.09	0.06	0.06	0.14	0.06	0.10	0.20	0.07	0.03	0.16	0.05	0.00	0.03
P	0.03	0.06	0.06	0.10	0.06	0.02	0.09	0.01	0.10	0.09	0.08	0.05	0.05	0.12	0.05	0.07	0.15	0.07	0.01	0.13	0.02	0.03	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.50	0.32	0.15	0.12	0.43	0.45	0.44	0.48	0.39	0.53	0.34	0.36	0.40	0.50	0.49	0.11	0.19	0.69	0.49	0.41	0.46	0.47
C2	0.65	0.59	0.19	0.11	0.65	0.45	0.66	0.45	0.64	0.68	0.61	0.60	0.65	0.68	0.66	0.12	0.38	0.81	0.51	0.34	0.47	0.44
C2'	0.45	0.16	0.16	0.22	0.27	0.52	0.28	0.58	0.20	0.44	0.17	0.18	0.20	0.37	0.39	0.13	0.17	0.66	0.55	0.53	0.51	0.55
C3'	0.44	0.25	0.17	0.27	0.24	0.58	0.24	0.68	0.20	0.43	0.25	0.19	0.20	0.35	0.37	0.14	0.20	0.70	0.64	0.62	0.58	0.65
C4	0.60	0.50	0.16	0.13	0.57	0.49	0.59	0.55	0.56	0.64	0.52	0.51	0.57	0.64	0.61	0.09	0.31	0.80	0.58	0.40	0.54	0.53
C4'	0.46	0.21	0.15	0.20	0.31	0.52	0.32	0.59	0.25	0.47	0.23	0.23	0.26	0.41	0.42	0.12	0.16	0.69	0.58	0.52	0.53	0.57
C5	0.65	0.59	0.17	0.17	0.65	0.55	0.68	0.64	0.66	0.72	0.63	0.59	0.68	0.73	0.68	0.09	0.38	0.88	0.69	0.42	0.64	0.62
C5'	0.47	0.27	0.14	0.21	0.32	0.55	0.33	0.65	0.28	0.48	0.28	0.26	0.29	0.43	0.43	0.10	0.18	0.73	0.64	0.55	0.59	0.63
C6	0.70	0.69	0.19	0.20	0.74	0.56	0.78	0.66	0.77	0.80	0.74	0.68	0.79	0.81	0.75	0.11	0.45	0.93	0.73	0.40	0.68	0.65
C8	0.59	0.47	0.15	0.16	0.55	0.54	0.58	0.63	0.55	0.65	0.51	0.48	0.57	0.64	0.60	0.08	0.30	0.83	0.66	0.44	0.62	0.62
N1	0.70	0.69	0.19	0.17	0.74	0.52	0.77	0.57	0.76	0.78	0.73	0.69	0.77	0.80	0.75	0.11	0.47	0.91	0.65	0.36	0.59	0.56
N2	0.64	0.60	0.22	0.06	0.65	0.34	0.65	0.31	0.63	0.64	0.61	0.61	0.63	0.65	0.65	0.16	0.40	0.72	0.38	0.30	0.36	0.32
N3	0.58	0.48	0.17	0.10	0.55	0.43	0.57	0.45	0.54	0.61	0.50	0.50	0.54	0.60	0.58	0.12	0.29	0.74	0.48	0.37	0.44	0.43
N7	0.64	0.56	0.16	0.18	0.62	0.57	0.67	0.68	0.65	0.72	0.61	0.56	0.67	0.72	0.66	0.08	0.36	0.89	0.72	0.44	0.68	0.67
N9	0.56	0.42	0.14	0.14	0.51	0.49	0.53	0.55	0.49	0.60	0.45	0.44	0.50	0.58	0.56	0.09	0.27	0.77	0.57	0.41	0.54	0.53
O2'	0.41	0.12	0.19	0.22	0.25	0.45	0.25	0.49	0.17	0.40	0.12	0.17	0.17	0.34	0.36	0.16	0.15	0.59	0.46	0.49	0.44	0.46
O3'	0.40	0.38	0.22	0.35	0.20	0.61	0.20	0.72	0.26	0.36	0.38	0.24	0.28	0.27	0.30	0.20	0.30	0.66	0.65	0.70	0.60	0.68
O4'	0.50	0.33	0.14	0.12	0.43	0.45	0.45	0.50	0.40	0.53	0.35	0.36	0.41	0.51	0.49	0.11	0.19	0.69	0.51	0.41	0.48	0.48
O5'	0.50	0.27	0.14	0.21	0.35	0.59	0.36	0.72	0.29	0.52	0.28	0.27	0.30	0.46	0.46	0.08	0.20	0.78	0.71	0.58	0.65	0.70
O6	0.72	0.78	0.21	0.23	0.80	0.59	0.86	0.72	0.87	0.86	0.83	0.75	0.90	0.90	0.80	0.13	0.49	0.97	0.81	0.42	0.77	0.72
OP1	0.47	0.29	0.12	0.25	0.27	0.63	0.28	0.80	0.25	0.48	0.30	0.22	0.26	0.40	0.40	0.08	0.22	0.78	0.77	0.66	0.71	0.79
OP2	0.53	0.24	0.12	0.21	0.36	0.65	0.39	0.83	0.29	0.58	0.25	0.26	0.30	0.52	0.49	0.07	0.22	0.85	0.83	0.64	0.76	0.83
P	0.51	0.27	0.13	0.22	0.35	0.62	0.37	0.77	0.30	0.55	0.28	0.27	0.30	0.48	0.47	0.07	0.22	0.81	0.76	0.60	0.71	0.76

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.06	0.05	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.15	0.24	0.18	0.03
C2	0.06	0.00	0.23	0.22	0.02	0.09	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.25	0.27	0.06	0.27	0.34	0.15	0.15
C2'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.12	0.01	0.07	0.01	0.12	0.08	0.19	0.23	0.09	0.05	0.03	0.00	0.03	0.02	0.22	0.42	0.11	0.16
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.09	0.01	0.05	0.02	0.09	0.14	0.17	0.21	0.05	0.10	0.03	0.01	0.01	0.02	0.27	0.48	0.08	0.22
C4	0.02	0.02	0.12	0.09	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.11	0.10	0.02	0.29	0.36	0.14	0.16
C4'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.07	0.07	0.09	0.03	0.06	0.02	0.07	0.01	0.00	0.02	0.17	0.26	0.03
C5	0.01	0.02	0.07	0.05	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.08	0.05	0.02	0.38	0.44	0.19	0.25
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.04	0.01	0.07	0.00	0.07	0.12	0.06	0.06	0.10	0.12	0.05	0.06	0.05	0.04	0.01	0.14	0.27	0.02
C6	0.04	0.02	0.12	0.09	0.02	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.14	0.11	0.04	0.39	0.45	0.22	0.27
C8	0.02	0.02	0.08	0.14	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.14	0.03	0.41	0.44	0.13	0.24
N1	0.06	0.01	0.19	0.17	0.03	0.07	0.02	0.06	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.03	0.22	0.21	0.05	0.34	0.40	0.19	0.22
N3	0.05	0.02	0.23	0.21	0.01	0.09	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.22	0.24	0.05	0.23	0.30	0.15	0.11
N6	0.03	0.04	0.09	0.05	0.03	0.03	0.02	0.10	0.01	0.03	0.03	0.03	0.00	0.03	0.02	0.13	0.07	0.05	0.45	0.51	0.31	0.34
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.10	0.02	0.44	0.49	0.23	0.30
N9	0.00	0.03	0.03	0.03	0.01	0.02	0.00	0.05	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.29	0.35	0.12	0.14
O2'	0.02	0.25	0.00	0.01	0.11	0.07	0.08	0.06	0.14	0.05	0.22	0.22	0.13	0.03	0.02	0.00	0.02	0.06	0.12	0.35	0.14	0.10
O3'	0.01	0.27	0.03	0.01	0.10	0.01	0.05	0.05	0.11	0.14	0.21	0.24	0.07	0.10	0.02	0.02	0.00	0.01	0.19	0.49	0.08	0.22
O4'	0.01	0.06	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.04	0.04	0.03	0.05	0.05	0.05	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.09	0.09	0.30	0.10
O5'	0.15	0.27	0.22	0.27	0.29	0.02	0.38	0.01	0.39	0.41	0.34	0.23	0.45	0.44	0.29	0.12	0.19	0.09	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.24	0.34	0.42	0.48	0.36	0.17	0.44	0.14	0.45	0.44	0.40	0.30	0.51	0.49	0.35	0.35	0.49	0.09	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.18	0.15	0.11	0.08	0.14	0.26	0.19	0.27	0.22	0.13	0.19	0.15	0.31	0.23	0.12	0.14	0.08	0.30	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.03	0.15	0.16	0.22	0.16	0.03	0.25	0.02	0.27	0.24	0.22	0.11	0.34	0.30	0.14	0.10	0.22	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00