Doublet Group distance statistics: 51542

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.008, 0.014, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.005
O6	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.008, 0.025, 0.042, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.025 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.010, 0.028, 0.046, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.028 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.011, 0.034, 0.056, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.034 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.017, 0.047, 0.077, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.047 std_dev=0.030
N1	A	0, 0.007, 0.037, 0.068, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.037 std_dev=0.031
N7	A	0, 0.013, 0.045, 0.077, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.045 std_dev=0.032
N3	A	0, 0.009, 0.053, 0.097, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.053 std_dev=0.044
C1'	A	0, 0.006, 0.059, 0.111, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.059 std_dev=0.052
C2	A	0, 0.003, 0.055, 0.108, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.055 std_dev=0.052
O4'	A	0, 0.036, 0.091, 0.145, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.091 std_dev=0.054
N2	A	0, 0.009, 0.108, 0.207, 0.209 max_d=0.209 avg_d=0.108 std_dev=0.099
O2'	A	0, 0.075, 0.187, 0.298, 0.274 max_d=0.274 avg_d=0.187 std_dev=0.112
C2'	A	0, 0.053, 0.168, 0.282, 0.292 max_d=0.292 avg_d=0.168 std_dev=0.115
O3'	A	0, 0.103, 0.255, 0.408, 0.374 max_d=0.374 avg_d=0.255 std_dev=0.152
C3'	A	0, 0.069, 0.231, 0.393, 0.399 max_d=0.399 avg_d=0.231 std_dev=0.162
C4	B	0, 0.108, 0.285, 0.461, 0.483 max_d=0.483 avg_d=0.285 std_dev=0.176
C4'	A	0, 0.089, 0.285, 0.482, 0.481 max_d=0.481 avg_d=0.285 std_dev=0.197
C5'	A	0, 0.102, 0.377, 0.652, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.377 std_dev=0.275
N3	B	0, 0.182, 0.459, 0.736, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.459 std_dev=0.277
N9	B	0, 0.191, 0.480, 0.770, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.480 std_dev=0.289
C5	B	0, 0.188, 0.500, 0.812, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.500 std_dev=0.312
O2'	B	0, 0.243, 0.619, 0.995, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.619 std_dev=0.376
C1'	B	0, 0.218, 0.621, 1.023, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.621 std_dev=0.403
O4'	B	0, 0.296, 0.753, 1.211, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.753 std_dev=0.457
C6	B	0, 0.207, 0.697, 1.187, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.697 std_dev=0.490
C2	B	0, 0.212, 0.715, 1.219, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.715 std_dev=0.503
N7	B	0, 0.212, 0.719, 1.225, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.719 std_dev=0.507
C8	B	0, 0.224, 0.732, 1.241, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.732 std_dev=0.508
C2'	B	0, 0.225, 0.770, 1.314, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.770 std_dev=0.545
N1	B	0, 0.218, 0.811, 1.404, 1.396 max_d=1.396 avg_d=0.811 std_dev=0.593
N6	B	0, 0.219, 0.939, 1.660, 1.649 max_d=1.649 avg_d=0.939 std_dev=0.721
C4'	B	0, 0.336, 1.107, 1.879, 1.832 max_d=1.832 avg_d=1.107 std_dev=0.772
C5'	B	0, 0.341, 1.260, 2.179, 2.149 max_d=2.149 avg_d=1.260 std_dev=0.919
O5'	A	0, 0.085, 1.004, 1.923, 1.960 max_d=1.960 avg_d=1.004 std_dev=0.919
P	A	0, 0.087, 1.165, 2.243, 2.293 max_d=2.293 avg_d=1.165 std_dev=1.078
C3'	B	0, 0.413, 1.503, 2.592, 2.546 max_d=2.546 avg_d=1.503 std_dev=1.089
O3'	B	0, 0.677, 2.074, 3.470, 3.356 max_d=3.356 avg_d=2.074 std_dev=1.396
O5'	B	0, 0.198, 1.629, 3.059, 3.062 max_d=3.062 avg_d=1.629 std_dev=1.430
OP2	A	0, 0.084, 1.906, 3.728, 3.789 max_d=3.789 avg_d=1.906 std_dev=1.822
OP1	A	0, 0.141, 2.178, 4.216, 4.259 max_d=4.259 avg_d=2.178 std_dev=2.038
OP1	B	0, 0.209, 2.551, 4.892, 4.910 max_d=4.910 avg_d=2.551 std_dev=2.342
P	B	0, 0.192, 2.823, 5.454, 5.466 max_d=5.466 avg_d=2.823 std_dev=2.631
OP2	B	0, 0.188, 3.628, 7.069, 7.081 max_d=7.081 avg_d=3.628 std_dev=3.441

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.07	0.12	0.09	0.01	0.01	0.02	0.16	0.00	0.30	0.04	0.21	0.49	0.31
C2	0.09	0.00	0.12	0.10	0.03	0.09	0.01	0.12	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.09	0.22	0.07	0.12	0.02	0.20	0.77	0.19
C2'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.08	0.01	0.07	0.01	0.08	0.05	0.11	0.14	0.11	0.05	0.06	0.00	0.08	0.01	0.57	0.08	0.67	0.56	0.53
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.07	0.01	0.08	0.01	0.09	0.09	0.10	0.11	0.09	0.08	0.07	0.01	0.02	0.01	0.40	0.10	0.63	0.08	0.33
C4	0.04	0.03	0.08	0.07	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.18	0.03	0.22	0.02	0.04	0.82	0.29
C4'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.07	0.00	0.09	0.00	0.10	0.10	0.10	0.10	0.08	0.10	0.07	0.01	0.08	0.01	0.01	0.11	0.16	0.23	0.01
C5	0.02	0.01	0.07	0.08	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.17	0.03	0.24	0.02	0.05	1.03	0.33
C5'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.10	0.00	0.13	0.00	0.15	0.14	0.14	0.12	0.10	0.15	0.09	0.01	0.02	0.02	0.00	0.17	0.29	0.36	0.00
C6	0.04	0.01	0.08	0.09	0.01	0.10	0.01	0.15	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.19	0.05	0.19	0.00	0.15	1.06	0.29
C8	0.01	0.04	0.05	0.09	0.02	0.10	0.01	0.14	0.03	0.00	0.04	0.05	0.03	0.00	0.00	0.02	0.16	0.02	0.36	0.03	0.18	1.01	0.44
N1	0.07	0.01	0.11	0.10	0.03	0.10	0.02	0.14	0.00	0.04	0.00	0.02	0.00	0.02	0.04	0.06	0.21	0.06	0.15	0.02	0.21	0.93	0.23
N2	0.12	0.00	0.14	0.11	0.03	0.10	0.01	0.12	0.02	0.05	0.02	0.00	0.02	0.02	0.06	0.12	0.24	0.10	0.07	0.04	0.26	0.68	0.14
N3	0.09	0.01	0.11	0.09	0.01	0.08	0.01	0.10	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.08	0.22	0.06	0.14	0.02	0.13	0.68	0.20
N7	0.01	0.02	0.05	0.08	0.00	0.10	0.00	0.15	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.02	0.31	0.03	0.07	1.15	0.42
N9	0.01	0.05	0.06	0.07	0.02	0.07	0.01	0.09	0.03	0.00	0.04	0.06	0.04	0.01	0.00	0.02	0.17	0.02	0.29	0.03	0.11	0.76	0.34
O2'	0.02	0.09	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.06	0.12	0.08	0.01	0.02	0.00	0.07	0.02	0.56	0.03	0.70	0.59	0.54
O3'	0.16	0.22	0.08	0.02	0.18	0.08	0.17	0.02	0.19	0.16	0.21	0.24	0.22	0.16	0.17	0.07	0.00	0.17	0.22	0.18	0.54	0.14	0.19
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.06	0.10	0.06	0.02	0.02	0.02	0.17	0.00	0.01	0.05	0.09	0.11	0.05
O5'	0.30	0.12	0.57	0.40	0.22	0.01	0.24	0.00	0.19	0.36	0.15	0.07	0.14	0.31	0.29	0.56	0.22	0.01	0.00	0.19	0.01	0.02	0.00
O6	0.04	0.02	0.08	0.10	0.02	0.11	0.02	0.17	0.00	0.03	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.03	0.18	0.05	0.19	0.00	0.17	1.15	0.30
OP1	0.21	0.20	0.67	0.63	0.04	0.16	0.05	0.29	0.15	0.18	0.21	0.26	0.13	0.07	0.11	0.70	0.54	0.09	0.01	0.17	0.00	0.06	0.01
OP2	0.49	0.77	0.56	0.08	0.82	0.23	1.03	0.36	1.06	1.01	0.93	0.68	0.68	1.15	0.76	0.59	0.14	0.11	0.02	1.15	0.06	0.00	0.04
P	0.31	0.19	0.53	0.33	0.29	0.01	0.33	0.00	0.29	0.44	0.23	0.14	0.20	0.42	0.34	0.54	0.19	0.05	0.00	0.30	0.01	0.04	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.20	0.07	0.13	0.05	0.17	0.16	0.20	0.33	0.04	0.38	0.06	0.46	0.10	0.10	0.37	0.58	0.23	0.04	0.21	0.76	0.09
C2	0.18	0.25	0.11	0.10	0.03	0.12	0.05	0.25	0.09	0.25	0.22	0.15	0.09	0.18	0.17	0.33	0.32	0.18	0.23	0.51	0.22	0.33
C2'	0.21	0.11	0.07	0.16	0.07	0.21	0.16	0.20	0.34	0.05	0.33	0.12	0.50	0.15	0.11	0.34	0.70	0.27	0.11	0.08	0.85	0.23
C3'	0.21	0.10	0.07	0.17	0.06	0.22	0.15	0.21	0.30	0.05	0.29	0.11	0.47	0.14	0.10	0.34	0.72	0.27	0.09	0.11	0.85	0.21
C4	0.13	0.19	0.14	0.18	0.06	0.09	0.06	0.12	0.17	0.09	0.24	0.09	0.21	0.03	0.10	0.33	0.23	0.13	0.05	0.22	0.79	0.10
C4'	0.20	0.11	0.06	0.13	0.06	0.18	0.11	0.20	0.26	0.06	0.27	0.08	0.40	0.09	0.12	0.39	0.58	0.25	0.06	0.20	0.86	0.14
C5	0.09	0.09	0.23	0.41	0.08	0.20	0.04	0.04	0.06	0.08	0.09	0.09	0.06	0.05	0.09	0.31	0.18	0.11	0.21	0.07	1.11	0.33
C5'	0.20	0.08	0.07	0.13	0.10	0.15	0.09	0.16	0.19	0.08	0.16	0.13	0.33	0.08	0.13	0.43	0.45	0.23	0.12	0.13	1.09	0.28
C6	0.12	0.08	0.28	0.54	0.07	0.28	0.10	0.07	0.07	0.15	0.02	0.11	0.11	0.19	0.09	0.28	0.40	0.15	0.18	0.13	1.01	0.25
C8	0.09	0.07	0.20	0.34	0.08	0.15	0.12	0.03	0.18	0.09	0.13	0.09	0.27	0.12	0.08	0.32	0.12	0.10	0.30	0.09	1.31	0.49
N1	0.11	0.16	0.20	0.32	0.05	0.16	0.11	0.13	0.04	0.27	0.10	0.13	0.08	0.25	0.14	0.32	0.17	0.10	0.10	0.39	0.49	0.14
N2	0.26	0.28	0.11	0.31	0.04	0.23	0.07	0.37	0.10	0.30	0.24	0.17	0.09	0.22	0.22	0.30	0.60	0.26	0.45	0.72	0.23	0.66
N3	0.18	0.28	0.10	0.11	0.03	0.14	0.04	0.23	0.19	0.15	0.30	0.13	0.20	0.07	0.13	0.32	0.45	0.20	0.13	0.40	0.40	0.18
N7	0.10	0.07	0.26	0.49	0.09	0.24	0.08	0.11	0.07	0.09	0.05	0.09	0.09	0.09	0.10	0.30	0.24	0.13	0.37	0.14	1.44	0.58
N9	0.13	0.15	0.13	0.17	0.07	0.09	0.12	0.10	0.25	0.05	0.28	0.08	0.34	0.08	0.08	0.34	0.30	0.14	0.13	0.12	0.96	0.23
O2'	0.20	0.17	0.06	0.24	0.05	0.26	0.22	0.23	0.41	0.05	0.45	0.08	0.56	0.19	0.07	0.27	0.88	0.29	0.07	0.07	0.67	0.17
O3'	0.31	0.09	0.14	0.37	0.07	0.37	0.11	0.35	0.31	0.07	0.32	0.12	0.49	0.08	0.17	0.44	1.01	0.39	0.09	0.27	0.57	0.01
O4'	0.18	0.19	0.07	0.11	0.05	0.14	0.14	0.18	0.30	0.05	0.34	0.06	0.43	0.09	0.09	0.39	0.51	0.21	0.03	0.26	0.79	0.07
O5'	0.35	0.66	0.44	0.50	0.57	0.42	0.75	0.39	0.93	0.57	0.89	0.51	1.13	0.72	0.48	0.16	0.10	0.38	0.64	0.36	1.69	0.81
O6	0.20	0.04	0.37	0.80	0.08	0.45	0.16	0.21	0.17	0.13	0.08	0.10	0.26	0.24	0.11	0.22	0.77	0.27	0.35	0.07	1.32	0.48
OP1	0.22	0.68	0.19	0.33	0.52	0.30	0.72	0.26	0.96	0.47	0.94	0.49	1.22	0.66	0.39	0.48	0.18	0.31	0.49	0.15	1.68	0.70
OP2	1.16	1.06	1.30	1.47	1.29	1.35	1.54	1.40	1.59	1.53	1.32	1.06	1.86	1.67	1.32	0.67	0.98	1.23	1.76	1.60	3.04	2.08
P	0.48	0.67	0.57	0.71	0.67	0.60	0.85	0.58	0.99	0.72	0.88	0.57	1.21	0.86	0.61	0.12	0.28	0.53	0.87	0.60	2.06	1.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.39	0.01	0.04	0.01	0.12	0.01
C2	0.02	0.00	0.22	0.09	0.00	0.07	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.46	0.15	0.20	0.13	0.73	0.35
C2'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.13	0.06	0.09	0.31	0.13	0.13	0.19	0.21	0.11	0.09	0.05	0.00	0.03	0.04	0.41	0.48	0.31	0.55
C3'	0.02	0.09	0.00	0.00	0.15	0.01	0.26	0.03	0.25	0.31	0.17	0.05	0.30	0.33	0.17	0.02	0.01	0.01	0.04	0.06	0.23	0.25
C4	0.01	0.00	0.13	0.15	0.00	0.02	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.14	0.29	0.08	0.22	0.14	0.76	0.38
C4'	0.01	0.07	0.06	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.10	0.04	0.07	0.02	0.08	0.03	0.20	0.02	0.01	0.06	0.24	0.40	0.11
C5	0.01	0.01	0.09	0.26	0.00	0.02	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.25	0.12	0.05	0.30	0.20	1.11	0.58
C5'	0.11	0.15	0.31	0.03	0.13	0.01	0.12	0.00	0.13	0.08	0.15	0.14	0.12	0.09	0.11	0.12	0.25	0.04	0.01	0.36	0.39	0.02
C6	0.01	0.01	0.13	0.25	0.01	0.01	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.21	0.16	0.08	0.31	0.22	1.19	0.62
C8	0.01	0.01	0.13	0.31	0.01	0.10	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.39	0.08	0.09	0.32	0.19	1.05	0.56
N1	0.02	0.00	0.19	0.17	0.01	0.04	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.32	0.13	0.26	0.18	0.99	0.50
N3	0.02	0.00	0.21	0.05	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.15	0.49	0.14	0.17	0.10	0.56	0.26
N6	0.01	0.01	0.11	0.30	0.01	0.02	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.27	0.07	0.07	0.35	0.26	1.41	0.74
N7	0.00	0.01	0.09	0.33	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.38	0.09	0.05	0.35	0.24	1.32	0.70
N9	0.00	0.01	0.05	0.17	0.00	0.03	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.20	0.19	0.02	0.20	0.12	0.64	0.32
O2'	0.01	0.15	0.00	0.02	0.14	0.20	0.25	0.12	0.21	0.39	0.14	0.15	0.27	0.38	0.20	0.00	0.07	0.13	0.44	0.65	0.44	0.71
O3'	0.39	0.46	0.03	0.01	0.29	0.02	0.12	0.25	0.16	0.08	0.32	0.49	0.07	0.09	0.19	0.07	0.00	0.31	0.24	0.47	0.16	0.10
O4'	0.01	0.15	0.04	0.01	0.08	0.01	0.05	0.04	0.08	0.09	0.13	0.14	0.07	0.05	0.02	0.13	0.31	0.00	0.26	0.34	0.10	0.22
O5'	0.04	0.20	0.41	0.04	0.22	0.06	0.30	0.01	0.31	0.32	0.26	0.17	0.35	0.35	0.20	0.44	0.24	0.26	0.00	0.02	0.04	0.01
OP1	0.01	0.13	0.48	0.06	0.14	0.24	0.20	0.36	0.22	0.19	0.18	0.10	0.26	0.24	0.12	0.65	0.47	0.34	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.73	0.31	0.23	0.76	0.40	1.11	0.39	1.19	1.05	0.99	0.56	1.41	1.32	0.64	0.44	0.16	0.10	0.04	0.01	0.00	0.00
P	0.01	0.35	0.55	0.25	0.38	0.11	0.58	0.02	0.62	0.56	0.50	0.26	0.74	0.70	0.32	0.71	0.10	0.22	0.01	0.00	0.00	0.00