Doublet Group distance statistics: 51554

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 1, 0, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.002, 0.010, 0.017, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.002, 0.013, 0.023, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.013 std_dev=0.011
N1	A	0, -0.002, 0.013, 0.027, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.013 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.009, 0.024, 0.038, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.024 std_dev=0.015
O6	A	0, 0.008, 0.023, 0.039, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.023 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.009, 0.026, 0.043, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.002, 0.020, 0.038, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.020 std_dev=0.018
N3	A	0, -0.006, 0.017, 0.040, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.017 std_dev=0.023
C2	A	0, -0.009, 0.015, 0.038, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.015 std_dev=0.023
C1'	A	0, -0.009, 0.022, 0.053, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.022 std_dev=0.031
N2	A	0, -0.010, 0.033, 0.077, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.033 std_dev=0.044
O4'	A	0, 0.039, 0.167, 0.294, 0.388 max_d=0.388 avg_d=0.167 std_dev=0.127
C2'	A	0, 0.051, 0.193, 0.334, 0.403 max_d=0.403 avg_d=0.193 std_dev=0.141
O5'	A	0, 0.096, 0.265, 0.435, 0.559 max_d=0.559 avg_d=0.265 std_dev=0.170
O2'	A	0, 0.064, 0.258, 0.452, 0.589 max_d=0.589 avg_d=0.258 std_dev=0.194
C3'	A	0, 0.076, 0.296, 0.515, 0.620 max_d=0.620 avg_d=0.296 std_dev=0.219
O4'	B	0, 0.099, 0.336, 0.572, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.336 std_dev=0.236
C4'	A	0, 0.034, 0.300, 0.565, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.300 std_dev=0.265
O3'	A	0, 0.122, 0.398, 0.674, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.398 std_dev=0.276
C1'	B	0, 0.082, 0.379, 0.676, 0.885 max_d=0.885 avg_d=0.379 std_dev=0.297
C2'	B	0, 0.094, 0.413, 0.731, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.413 std_dev=0.319
O2'	B	0, 0.158, 0.492, 0.826, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.492 std_dev=0.334
C3'	B	0, 0.180, 0.521, 0.862, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.521 std_dev=0.341
C4'	B	0, 0.145, 0.486, 0.828, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.486 std_dev=0.342
O3'	B	0, 0.180, 0.608, 1.036, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.608 std_dev=0.428
N1	B	0, 0.061, 0.510, 0.958, 1.119 max_d=1.119 avg_d=0.510 std_dev=0.449
P	A	0, -0.050, 0.511, 1.072, 1.710 max_d=1.710 avg_d=0.511 std_dev=0.561
C6	B	0, 0.118, 0.683, 1.248, 1.395 max_d=1.395 avg_d=0.683 std_dev=0.565
C5'	A	0, -0.012, 0.566, 1.144, 1.766 max_d=1.766 avg_d=0.566 std_dev=0.578
C2	B	0, -0.016, 0.612, 1.239, 1.633 max_d=1.633 avg_d=0.612 std_dev=0.628
C5'	B	0, 0.116, 0.752, 1.388, 1.624 max_d=1.624 avg_d=0.752 std_dev=0.636
OP1	A	0, -0.079, 0.572, 1.222, 1.984 max_d=1.984 avg_d=0.572 std_dev=0.650
O2	B	0, 0.030, 0.692, 1.355, 1.737 max_d=1.737 avg_d=0.692 std_dev=0.662
C5	B	0, 0.068, 0.818, 1.568, 2.005 max_d=2.005 avg_d=0.818 std_dev=0.750
N3	B	0, -0.077, 0.756, 1.588, 2.253 max_d=2.253 avg_d=0.756 std_dev=0.833
O5'	B	0, 0.088, 0.937, 1.785, 2.177 max_d=2.177 avg_d=0.937 std_dev=0.848
C4	B	0, -0.063, 0.804, 1.672, 2.369 max_d=2.369 avg_d=0.804 std_dev=0.868
OP2	A	0, -0.247, 0.730, 1.707, 2.862 max_d=2.862 avg_d=0.730 std_dev=0.977
P	B	0, 0.008, 1.095, 2.182, 2.696 max_d=2.696 avg_d=1.095 std_dev=1.087
N4	B	0, -0.129, 0.969, 2.067, 3.032 max_d=3.032 avg_d=0.969 std_dev=1.098
OP2	B	0, -0.017, 1.172, 2.361, 2.941 max_d=2.941 avg_d=1.172 std_dev=1.189
OP1	B	0, -0.011, 1.268, 2.547, 3.058 max_d=3.058 avg_d=1.268 std_dev=1.279

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.02	0.03	0.01	0.03	0.09	0.04	0.01	0.05	0.07	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.05	0.31	0.13	0.15
C2	0.06	0.00	0.16	0.15	0.01	0.10	0.00	0.30	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.19	0.18	0.05	0.08	0.01	0.15	0.46	0.09
C2'	0.00	0.16	0.00	0.01	0.08	0.02	0.06	0.05	0.09	0.07	0.13	0.20	0.16	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.19	0.08	0.27	0.28	0.05
C3'	0.02	0.15	0.01	0.00	0.05	0.00	0.02	0.01	0.05	0.12	0.11	0.20	0.14	0.08	0.03	0.01	0.02	0.01	0.31	0.04	0.22	0.35	0.12
C4	0.03	0.01	0.08	0.05	0.00	0.09	0.01	0.30	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.06	0.03	0.05	0.02	0.14	0.42	0.07
C4'	0.01	0.10	0.02	0.00	0.09	0.00	0.11	0.01	0.12	0.12	0.11	0.12	0.09	0.13	0.08	0.11	0.03	0.01	0.01	0.14	0.42	0.11	0.26
C5	0.03	0.00	0.06	0.02	0.01	0.11	0.00	0.37	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.07	0.05	0.03	0.05	0.02	0.08	0.54	0.16
C5'	0.09	0.30	0.05	0.01	0.30	0.01	0.37	0.00	0.40	0.33	0.36	0.29	0.26	0.39	0.25	0.08	0.11	0.02	0.01	0.43	0.04	0.04	0.01
C6	0.04	0.01	0.09	0.05	0.02	0.12	0.01	0.40	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.11	0.07	0.04	0.06	0.00	0.08	0.60	0.19
C8	0.01	0.01	0.07	0.12	0.01	0.12	0.00	0.33	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.13	0.02	0.07	0.02	0.08	0.44	0.13
N1	0.05	0.01	0.13	0.11	0.01	0.11	0.00	0.36	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.16	0.13	0.04	0.06	0.01	0.09	0.55	0.14
N2	0.07	0.00	0.20	0.20	0.01	0.12	0.00	0.29	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.24	0.25	0.06	0.10	0.02	0.19	0.44	0.09
N3	0.06	0.00	0.16	0.14	0.01	0.09	0.00	0.26	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.17	0.16	0.05	0.09	0.01	0.19	0.39	0.07
N7	0.02	0.00	0.05	0.08	0.00	0.13	0.00	0.39	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.11	0.03	0.08	0.02	0.11	0.57	0.21
N9	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.08	0.02	0.25	0.03	0.00	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.04	0.04	0.17	0.33	0.04
O2'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.09	0.11	0.07	0.08	0.11	0.05	0.16	0.24	0.17	0.04	0.02	0.00	0.02	0.03	0.17	0.11	0.39	0.13	0.16
O3'	0.01	0.18	0.03	0.02	0.06	0.03	0.05	0.11	0.07	0.13	0.13	0.25	0.16	0.11	0.04	0.02	0.00	0.02	0.33	0.07	0.30	0.31	0.15
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.04	0.06	0.05	0.03	0.02	0.03	0.02	0.00	0.07	0.04	0.42	0.10	0.29
O5'	0.06	0.08	0.19	0.31	0.05	0.01	0.05	0.01	0.06	0.07	0.06	0.10	0.09	0.08	0.04	0.17	0.33	0.07	0.00	0.07	0.02	0.01	0.01
O6	0.05	0.01	0.08	0.04	0.02	0.14	0.02	0.43	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.11	0.07	0.04	0.07	0.00	0.13	0.67	0.25
OP1	0.31	0.15	0.27	0.22	0.14	0.42	0.08	0.04	0.08	0.08	0.09	0.19	0.19	0.11	0.17	0.39	0.30	0.42	0.02	0.13	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.46	0.28	0.35	0.42	0.11	0.54	0.04	0.60	0.44	0.55	0.44	0.39	0.57	0.33	0.13	0.31	0.10	0.01	0.67	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.09	0.05	0.12	0.07	0.26	0.16	0.01	0.19	0.13	0.14	0.09	0.07	0.21	0.04	0.16	0.15	0.29	0.01	0.25	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.55	0.22	0.21	0.79	0.20	0.68	0.18	0.54	0.43	0.76	0.92	0.47	0.31	0.29	0.16	0.29	0.19	0.58	0.32
C2	0.16	0.40	0.16	0.14	0.58	0.15	0.55	0.12	0.45	0.32	0.54	0.64	0.38	0.30	0.17	0.11	0.27	0.24	0.63	0.36
C2'	0.30	0.50	0.30	0.31	0.73	0.35	0.65	0.36	0.54	0.42	0.69	0.85	0.44	0.40	0.39	0.27	0.28	0.34	0.70	0.47
C3'	0.28	0.50	0.27	0.28	0.76	0.34	0.67	0.36	0.53	0.41	0.72	0.92	0.43	0.37	0.36	0.26	0.26	0.39	0.74	0.51
C4	0.19	0.48	0.19	0.17	0.75	0.16	0.67	0.14	0.52	0.39	0.70	0.87	0.37	0.32	0.21	0.13	0.35	0.27	0.63	0.37
C4'	0.23	0.56	0.22	0.21	0.81	0.23	0.69	0.23	0.53	0.43	0.78	0.97	0.49	0.31	0.31	0.17	0.25	0.26	0.68	0.41
C5	0.19	0.40	0.22	0.20	0.78	0.15	0.71	0.18	0.54	0.36	0.67	0.92	0.28	0.34	0.20	0.14	0.45	0.38	0.69	0.45
C5'	0.28	0.59	0.19	0.21	0.86	0.31	0.72	0.34	0.55	0.46	0.82	1.04	0.52	0.28	0.25	0.28	0.27	0.51	0.93	0.65
C6	0.19	0.32	0.23	0.21	0.71	0.15	0.70	0.22	0.53	0.32	0.55	0.84	0.31	0.34	0.20	0.14	0.50	0.45	0.72	0.49
C8	0.19	0.47	0.21	0.20	0.83	0.16	0.73	0.16	0.55	0.39	0.73	1.00	0.31	0.33	0.22	0.14	0.42	0.34	0.68	0.42
N1	0.19	0.32	0.21	0.18	0.60	0.14	0.62	0.18	0.50	0.31	0.50	0.67	0.34	0.32	0.17	0.13	0.42	0.38	0.68	0.43
N2	0.12	0.34	0.12	0.12	0.42	0.16	0.40	0.13	0.35	0.25	0.43	0.47	0.38	0.25	0.17	0.07	0.14	0.18	0.61	0.34
N3	0.16	0.48	0.15	0.14	0.66	0.16	0.59	0.13	0.47	0.36	0.64	0.74	0.44	0.29	0.21	0.10	0.24	0.19	0.61	0.33
N7	0.19	0.40	0.22	0.21	0.81	0.15	0.74	0.19	0.55	0.37	0.68	1.00	0.25	0.34	0.21	0.14	0.49	0.41	0.71	0.47
N9	0.20	0.51	0.20	0.19	0.80	0.17	0.70	0.15	0.54	0.41	0.74	0.94	0.40	0.32	0.23	0.14	0.35	0.26	0.63	0.37
O2'	0.34	0.51	0.35	0.38	0.68	0.41	0.62	0.43	0.53	0.44	0.67	0.79	0.46	0.43	0.48	0.32	0.32	0.37	0.67	0.47
O3'	0.32	0.49	0.32	0.34	0.74	0.41	0.66	0.44	0.54	0.42	0.70	0.89	0.43	0.41	0.43	0.32	0.30	0.45	0.74	0.55
O4'	0.24	0.60	0.21	0.19	0.86	0.15	0.73	0.13	0.56	0.46	0.83	1.01	0.51	0.28	0.27	0.15	0.33	0.17	0.56	0.30
O5'	0.21	0.51	0.20	0.19	0.85	0.17	0.74	0.16	0.56	0.41	0.77	1.05	0.38	0.31	0.25	0.16	0.38	0.27	0.65	0.38
O6	0.20	0.26	0.24	0.23	0.67	0.16	0.69	0.28	0.50	0.28	0.44	0.84	0.37	0.35	0.22	0.13	0.59	0.55	0.77	0.56
OP1	0.24	0.49	0.25	0.24	0.85	0.29	0.74	0.26	0.53	0.39	0.75	1.08	0.39	0.41	0.30	0.20	0.30	0.38	0.74	0.49
OP2	0.42	0.61	0.35	0.39	1.06	0.38	1.02	0.47	0.81	0.60	0.88	1.29	0.40	0.36	0.37	0.46	0.81	0.49	0.53	0.50
P	0.20	0.49	0.20	0.19	0.90	0.17	0.81	0.16	0.59	0.41	0.77	1.13	0.32	0.35	0.24	0.16	0.44	0.29	0.61	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.15	0.07	0.56	0.23
C2	0.01	0.00	0.11	0.13	0.00	0.06	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.15	0.03	0.35	0.18	0.51	0.22
C2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.05	0.02	0.06	0.02	0.08	0.03	0.10	0.06	0.19	0.00	0.01	0.01	0.10	0.17	0.45	0.14
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.08	0.00	0.06	0.03	0.08	0.04	0.13	0.09	0.19	0.02	0.01	0.02	0.06	0.24	0.37	0.09
C4	0.02	0.00	0.05	0.08	0.00	0.11	0.00	0.28	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.11	0.06	0.48	0.22	0.39	0.21
C4'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.11	0.00	0.13	0.01	0.11	0.06	0.09	0.12	0.06	0.06	0.03	0.00	0.03	0.21	0.36	0.12
C5	0.02	0.01	0.06	0.06	0.00	0.13	0.00	0.31	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.10	0.08	0.47	0.18	0.37	0.16
C5'	0.04	0.16	0.02	0.03	0.28	0.01	0.31	0.00	0.26	0.16	0.23	0.31	0.11	0.06	0.02	0.02	0.01	0.26	0.12	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.08	0.01	0.11	0.00	0.26	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.10	0.09	0.40	0.13	0.49	0.14
N1	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.05	0.03	0.31	0.12	0.53	0.19
N3	0.01	0.01	0.10	0.13	0.00	0.09	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.15	0.05	0.43	0.22	0.46	0.23
N4	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.12	0.01	0.31	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.12	0.07	0.51	0.26	0.35	0.24
O2	0.01	0.00	0.19	0.19	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.11	0.22	0.04	0.30	0.19	0.54	0.25
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.05	0.06	0.06	0.06	0.05	0.03	0.06	0.06	0.11	0.00	0.04	0.05	0.07	0.22	0.44	0.14
O3'	0.01	0.15	0.01	0.01	0.11	0.03	0.10	0.02	0.10	0.05	0.15	0.12	0.22	0.04	0.00	0.01	0.10	0.38	0.26	0.03
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.06	0.00	0.08	0.02	0.09	0.03	0.05	0.07	0.04	0.05	0.01	0.00	0.08	0.09	0.59	0.30
O5'	0.15	0.35	0.10	0.06	0.48	0.03	0.47	0.01	0.40	0.31	0.43	0.51	0.30	0.07	0.10	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.07	0.18	0.17	0.24	0.22	0.21	0.18	0.26	0.13	0.12	0.22	0.26	0.19	0.22	0.38	0.09	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.56	0.51	0.45	0.37	0.39	0.36	0.37	0.12	0.49	0.53	0.46	0.35	0.54	0.44	0.26	0.59	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.23	0.22	0.14	0.09	0.21	0.12	0.16	0.02	0.14	0.19	0.23	0.24	0.25	0.14	0.03	0.30	0.01	0.00	0.01	0.00