Doublet Group distance statistics: 51555

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.006, 0.023, 0.040, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.023 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.005, 0.026, 0.047, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.026 std_dev=0.021
C4	A	0, 0.007, 0.029, 0.050, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.029 std_dev=0.022
N1	A	0, 0.005, 0.030, 0.056, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.030 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.014, 0.040, 0.065, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.040 std_dev=0.026
N9	A	0, 0.013, 0.041, 0.070, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.041 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.019, 0.050, 0.080, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.050 std_dev=0.031
C2	A	0, 0.003, 0.036, 0.069, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.036 std_dev=0.033
N3	A	0, 0.002, 0.036, 0.070, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.036 std_dev=0.034
C1'	A	0, 0.004, 0.046, 0.088, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.046 std_dev=0.042
N2	A	0, 0.001, 0.058, 0.114, 0.146 max_d=0.146 avg_d=0.058 std_dev=0.057
C2'	A	0, 0.139, 0.434, 0.729, 0.717 max_d=0.717 avg_d=0.434 std_dev=0.295
O4'	A	0, 0.110, 0.413, 0.716, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.413 std_dev=0.303
C4'	A	0, 0.180, 0.536, 0.892, 0.880 max_d=0.880 avg_d=0.536 std_dev=0.356
O2'	A	0, 0.216, 0.634, 1.052, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.634 std_dev=0.418
C3'	A	0, 0.205, 0.676, 1.147, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.676 std_dev=0.471
O5'	A	0, 0.253, 0.800, 1.347, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.800 std_dev=0.547
O2'	B	0, 0.110, 0.712, 1.313, 1.417 max_d=1.417 avg_d=0.712 std_dev=0.602
C2'	B	0, 0.377, 0.980, 1.584, 1.586 max_d=1.586 avg_d=0.980 std_dev=0.604
O3'	A	0, 0.298, 0.962, 1.626, 1.615 max_d=1.615 avg_d=0.962 std_dev=0.664
C5'	A	0, 0.325, 1.038, 1.752, 1.701 max_d=1.701 avg_d=1.038 std_dev=0.713
C4'	B	0, 0.624, 1.568, 2.512, 2.396 max_d=2.396 avg_d=1.568 std_dev=0.944
O5'	B	0, 0.200, 1.188, 2.176, 2.196 max_d=2.196 avg_d=1.188 std_dev=0.988
P	A	0, 0.297, 1.403, 2.510, 2.613 max_d=2.613 avg_d=1.403 std_dev=1.107
OP1	A	0, 0.295, 1.565, 2.835, 2.991 max_d=2.991 avg_d=1.565 std_dev=1.270
C3'	B	0, 0.141, 1.470, 2.798, 2.815 max_d=2.815 avg_d=1.470 std_dev=1.328
O4'	B	0, 0.015, 1.361, 2.707, 3.599 max_d=3.599 avg_d=1.361 std_dev=1.346
OP2	A	0, 0.258, 1.633, 3.008, 3.148 max_d=3.148 avg_d=1.633 std_dev=1.375
C1'	B	0, -0.072, 1.364, 2.799, 3.755 max_d=3.755 avg_d=1.364 std_dev=1.435
C5'	B	0, 0.271, 1.749, 3.227, 3.254 max_d=3.254 avg_d=1.749 std_dev=1.478
P	B	0, 0.342, 1.908, 3.474, 3.738 max_d=3.738 avg_d=1.908 std_dev=1.566
O3'	B	0, 0.698, 2.372, 4.047, 4.055 max_d=4.055 avg_d=2.372 std_dev=1.674
OP1	B	0, 0.958, 2.860, 4.762, 4.857 max_d=4.857 avg_d=2.860 std_dev=1.902
OP2	B	0, 0.335, 2.431, 4.527, 4.907 max_d=4.907 avg_d=2.431 std_dev=2.096
N1	B	0, 0.210, 2.394, 4.579, 5.939 max_d=5.939 avg_d=2.394 std_dev=2.185
C6	B	0, 0.626, 2.978, 5.329, 6.577 max_d=6.577 avg_d=2.978 std_dev=2.351
O2	B	0, 0.099, 2.788, 5.477, 7.234 max_d=7.234 avg_d=2.788 std_dev=2.689
C2	B	0, 0.127, 2.989, 5.852, 7.710 max_d=7.710 avg_d=2.989 std_dev=2.862
C5	B	0, 0.756, 4.005, 7.254, 9.061 max_d=9.061 avg_d=4.005 std_dev=3.249
N3	B	0, 0.305, 4.018, 7.731, 10.089 max_d=10.089 avg_d=4.018 std_dev=3.713
C4	B	0, 0.548, 4.481, 8.414, 10.810 max_d=10.810 avg_d=4.481 std_dev=3.933
N4	B	0, 0.699, 5.540, 10.381, 13.320 max_d=13.320 avg_d=5.540 std_dev=4.841

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.06	0.09	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.02	0.08	0.28	0.13
C2	0.08	0.00	0.08	0.07	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.10	0.06	0.27	0.01	0.20	0.68	0.40
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.07	0.05	0.10	0.08	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.04	0.08	0.34	0.16
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.05	0.16	0.03	0.11	0.07	0.15	0.06	0.01	0.01	0.00	0.30	0.06	0.09	0.34	0.22
C4	0.04	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.03	0.02	0.27	0.00	0.23	0.66	0.41
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.06	0.02	0.05	0.04	0.05	0.03	0.06	0.02	0.00	0.01	0.02	0.21	0.01	0.06
C5	0.02	0.01	0.03	0.07	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.02	0.33	0.01	0.38	0.81	0.54
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.09	0.04	0.05	0.03	0.07	0.04	0.05	0.01	0.01	0.00	0.07	0.10	0.10	0.01
C6	0.03	0.01	0.04	0.05	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.33	0.00	0.41	0.86	0.56
C8	0.02	0.01	0.07	0.16	0.01	0.06	0.01	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.17	0.05	0.34	0.02	0.40	0.74	0.53
N1	0.06	0.00	0.05	0.03	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.05	0.04	0.31	0.01	0.31	0.79	0.50
N2	0.09	0.00	0.10	0.11	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.12	0.16	0.08	0.25	0.01	0.14	0.64	0.36
N3	0.08	0.00	0.08	0.07	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.10	0.07	0.25	0.01	0.14	0.60	0.35
N7	0.01	0.01	0.07	0.15	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.17	0.05	0.36	0.02	0.50	0.88	0.62
N9	0.00	0.01	0.01	0.06	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.25	0.00	0.20	0.57	0.37
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.05	0.06	0.03	0.05	0.05	0.03	0.08	0.12	0.09	0.03	0.01	0.00	0.04	0.05	0.11	0.04	0.22	0.18	0.04
O3'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.03	0.02	0.08	0.01	0.06	0.17	0.05	0.16	0.10	0.17	0.05	0.04	0.00	0.02	0.28	0.09	0.13	0.28	0.15
O4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.04	0.08	0.07	0.05	0.01	0.05	0.02	0.00	0.09	0.03	0.15	0.11	0.09
O5'	0.09	0.27	0.20	0.30	0.27	0.01	0.33	0.00	0.33	0.34	0.31	0.25	0.25	0.36	0.25	0.11	0.28	0.09	0.00	0.34	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.02	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.09	0.03	0.34	0.00	0.49	0.93	0.62
OP1	0.08	0.20	0.08	0.09	0.23	0.21	0.38	0.10	0.41	0.40	0.31	0.14	0.14	0.50	0.20	0.22	0.13	0.15	0.01	0.49	0.00	0.00	0.00
OP2	0.28	0.68	0.34	0.34	0.66	0.01	0.81	0.10	0.86	0.74	0.79	0.64	0.60	0.88	0.57	0.18	0.28	0.11	0.01	0.93	0.00	0.00	0.00
P	0.13	0.40	0.16	0.22	0.41	0.06	0.54	0.01	0.56	0.53	0.50	0.36	0.35	0.62	0.37	0.04	0.15	0.09	0.00	0.62	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.56	1.08	0.31	0.05	1.13	0.16	0.88	0.06	0.71	0.79	1.25	1.26	1.19	0.21	0.26	0.45	0.18	0.30	0.15	0.24
C2	0.52	0.54	0.29	0.42	0.38	0.56	0.29	0.40	0.31	0.44	0.50	0.39	0.72	0.12	0.77	0.60	0.34	0.32	0.22	0.18
C2'	0.55	1.12	0.34	0.03	1.28	0.09	1.04	0.04	0.83	0.85	1.34	1.45	1.15	0.43	0.28	0.38	0.35	0.33	0.34	0.21
C3'	0.54	1.05	0.41	0.12	1.26	0.14	1.06	0.12	0.86	0.83	1.28	1.43	1.02	0.54	0.29	0.37	0.47	0.44	0.52	0.30
C4	0.52	0.66	0.31	0.34	0.55	0.47	0.43	0.34	0.41	0.52	0.67	0.58	0.81	0.17	0.62	0.55	0.33	0.31	0.23	0.17
C4'	0.55	1.14	0.34	0.02	1.32	0.09	1.05	0.00	0.83	0.85	1.38	1.50	1.17	0.39	0.28	0.39	0.30	0.28	0.26	0.16
C5	0.42	0.38	0.28	0.53	0.39	0.62	0.28	0.51	0.22	0.30	0.42	0.49	0.51	0.11	0.85	0.55	0.40	0.34	0.27	0.16
C5'	0.57	1.06	0.40	0.15	1.22	0.19	1.00	0.13	0.81	0.82	1.27	1.39	1.08	0.45	0.31	0.43	0.40	0.33	0.37	0.17
C6	0.33	0.36	0.23	0.67	0.61	0.76	0.45	0.65	0.23	0.19	0.57	0.80	0.39	0.10	1.07	0.55	0.44	0.36	0.27	0.17
C8	0.49	0.60	0.32	0.38	0.54	0.49	0.42	0.38	0.39	0.48	0.63	0.58	0.72	0.18	0.63	0.53	0.37	0.31	0.26	0.15
N1	0.37	0.31	0.24	0.65	0.49	0.74	0.36	0.61	0.19	0.19	0.46	0.64	0.40	0.12	1.07	0.58	0.42	0.35	0.25	0.17
N2	0.60	0.66	0.30	0.37	0.45	0.53	0.35	0.35	0.37	0.53	0.58	0.42	0.86	0.14	0.71	0.64	0.31	0.32	0.21	0.20
N3	0.59	0.84	0.33	0.26	0.72	0.41	0.56	0.26	0.52	0.65	0.85	0.74	1.00	0.20	0.52	0.58	0.30	0.30	0.21	0.18
N7	0.41	0.39	0.29	0.52	0.41	0.61	0.30	0.51	0.24	0.31	0.45	0.52	0.50	0.12	0.82	0.54	0.41	0.34	0.28	0.16
N9	0.54	0.81	0.33	0.25	0.76	0.38	0.59	0.25	0.53	0.63	0.87	0.81	0.93	0.22	0.49	0.53	0.31	0.29	0.22	0.17
O2'	0.60	1.44	0.29	0.21	1.69	0.10	1.33	0.19	1.02	1.04	1.77	1.94	1.47	0.43	0.43	0.35	0.27	0.30	0.21	0.23
O3'	0.55	1.16	0.46	0.09	1.51	0.11	1.30	0.12	1.02	0.93	1.47	1.75	1.07	0.66	0.36	0.32	0.54	0.55	0.68	0.42
O4'	0.57	1.11	0.32	0.05	1.19	0.17	0.92	0.06	0.74	0.82	1.30	1.34	1.20	0.24	0.27	0.46	0.18	0.28	0.16	0.23
O5'	0.35	0.74	0.28	0.09	0.83	0.11	0.64	0.10	0.51	0.54	0.89	0.94	0.78	0.10	0.19	0.27	0.13	0.30	0.15	0.23
O6	0.22	0.60	0.19	0.80	1.00	0.87	0.75	0.79	0.43	0.30	0.94	1.27	0.53	0.15	1.23	0.53	0.48	0.40	0.29	0.19
OP1	0.46	0.86	0.34	0.09	1.01	0.16	0.83	0.10	0.67	0.67	1.03	1.15	0.87	0.30	0.20	0.35	0.30	0.26	0.38	0.11
OP2	0.38	0.56	0.48	0.33	0.60	0.31	0.51	0.34	0.46	0.46	0.63	0.66	0.60	0.38	0.22	0.34	0.26	0.60	0.30	0.58
P	0.33	0.68	0.30	0.13	0.75	0.14	0.57	0.15	0.45	0.49	0.81	0.85	0.73	0.08	0.17	0.26	0.08	0.36	0.14	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.16	0.00	0.23	0.37	0.31	0.08
C2	0.01	0.00	0.10	0.15	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.06	0.04	0.30	0.71	0.55	0.16
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.08	0.11	0.10	0.02	0.08	0.06	0.17	0.00	0.03	0.01	0.35	0.45	0.28	0.31
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.21	0.00	0.20	0.01	0.16	0.12	0.19	0.23	0.12	0.01	0.01	0.01	0.18	0.23	0.11	0.15
C4	0.01	0.00	0.05	0.21	0.00	0.09	0.01	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.08	0.02	0.35	0.99	0.76	0.22
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.09	0.00	0.11	0.00	0.10	0.05	0.06	0.10	0.01	0.16	0.02	0.00	0.01	0.14	0.25	0.06
C5	0.02	0.00	0.08	0.20	0.01	0.11	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.20	0.10	0.04	0.35	1.00	0.77	0.22
C5'	0.04	0.04	0.11	0.01	0.10	0.00	0.11	0.00	0.09	0.04	0.07	0.12	0.02	0.05	0.11	0.01	0.00	0.28	0.38	0.01
C6	0.02	0.01	0.10	0.16	0.02	0.10	0.01	0.09	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.17	0.07	0.05	0.35	0.82	0.64	0.19
N1	0.01	0.01	0.02	0.12	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.05	0.00	0.31	0.64	0.51	0.15
N3	0.01	0.00	0.08	0.19	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.04	0.03	0.33	0.87	0.67	0.19
N4	0.02	0.01	0.06	0.23	0.01	0.10	0.02	0.12	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.20	0.10	0.02	0.35	1.08	0.82	0.24
O2	0.02	0.00	0.17	0.12	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.13	0.06	0.26	0.61	0.47	0.13
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.18	0.16	0.20	0.05	0.17	0.10	0.14	0.20	0.10	0.00	0.04	0.11	0.17	0.36	0.31	0.20
O3'	0.16	0.06	0.03	0.01	0.08	0.02	0.10	0.11	0.07	0.05	0.04	0.10	0.13	0.04	0.00	0.10	0.09	0.14	0.19	0.09
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.00	0.03	0.02	0.06	0.11	0.10	0.00	0.12	0.17	0.30	0.10
O5'	0.23	0.30	0.35	0.18	0.35	0.01	0.35	0.00	0.35	0.31	0.33	0.35	0.26	0.17	0.09	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.37	0.71	0.45	0.23	0.99	0.14	1.00	0.28	0.82	0.64	0.87	1.08	0.61	0.36	0.14	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.31	0.55	0.28	0.11	0.76	0.25	0.77	0.38	0.64	0.51	0.67	0.82	0.47	0.31	0.19	0.30	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.16	0.31	0.15	0.22	0.06	0.22	0.01	0.19	0.15	0.19	0.24	0.13	0.20	0.09	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00