Doublet Group distance statistics: 51558

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.003, 0.014, 0.024, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.005, 0.018, 0.030, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.018 std_dev=0.013
O6	A	0, 0.004, 0.018, 0.032, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.018 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.021 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.006, 0.021, 0.037, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.021 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.006, 0.021, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.021 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.007, 0.024, 0.041, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.024 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.006, 0.024, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.024 std_dev=0.018
N2	A	0, 0.010, 0.038, 0.065, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.038 std_dev=0.027
O4'	A	0, 0.005, 0.122, 0.239, 0.280 max_d=0.280 avg_d=0.122 std_dev=0.117
O2'	A	0, 0.006, 0.143, 0.279, 0.327 max_d=0.327 avg_d=0.143 std_dev=0.137
C2'	A	0, 0.015, 0.163, 0.310, 0.356 max_d=0.356 avg_d=0.163 std_dev=0.147
C4'	A	0, 0.045, 0.262, 0.480, 0.532 max_d=0.532 avg_d=0.262 std_dev=0.217
C3'	A	0, 0.038, 0.281, 0.524, 0.594 max_d=0.594 avg_d=0.281 std_dev=0.243
C2	B	0, 0.039, 0.346, 0.654, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.346 std_dev=0.308
N1	B	0, 0.109, 0.426, 0.744, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.426 std_dev=0.317
C5'	A	0, 0.032, 0.352, 0.671, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.352 std_dev=0.320
N3	B	0, 0.138, 0.486, 0.834, 0.797 max_d=0.797 avg_d=0.486 std_dev=0.348
O3'	A	0, 0.059, 0.417, 0.775, 0.874 max_d=0.874 avg_d=0.417 std_dev=0.358
C2'	B	0, 0.139, 0.520, 0.901, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.520 std_dev=0.381
C1'	B	0, 0.170, 0.581, 0.991, 0.885 max_d=0.885 avg_d=0.581 std_dev=0.411
C4	B	0, 0.158, 0.585, 1.011, 1.005 max_d=1.005 avg_d=0.585 std_dev=0.426
O2'	B	0, 0.166, 0.601, 1.036, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.601 std_dev=0.435
O5'	A	0, -0.028, 0.407, 0.842, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.407 std_dev=0.435
P	A	0, 0.143, 0.646, 1.150, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.646 std_dev=0.504
C6	B	0, 0.197, 0.782, 1.367, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.782 std_dev=0.585
C3'	B	0, 0.213, 0.812, 1.410, 1.426 max_d=1.426 avg_d=0.812 std_dev=0.599
O2	B	0, 0.040, 0.641, 1.243, 1.446 max_d=1.446 avg_d=0.641 std_dev=0.602
N4	B	0, 0.183, 0.796, 1.409, 1.492 max_d=1.492 avg_d=0.796 std_dev=0.613
C5	B	0, 0.221, 0.837, 1.453, 1.464 max_d=1.464 avg_d=0.837 std_dev=0.616
O4'	B	0, 0.272, 0.930, 1.588, 1.426 max_d=1.426 avg_d=0.930 std_dev=0.658
O3'	B	0, 0.242, 0.921, 1.600, 1.617 max_d=1.617 avg_d=0.921 std_dev=0.679
C4'	B	0, 0.284, 1.032, 1.780, 1.750 max_d=1.750 avg_d=1.032 std_dev=0.748
O5'	B	0, 0.350, 1.275, 2.201, 2.167 max_d=2.167 avg_d=1.275 std_dev=0.925
C5'	B	0, 0.365, 1.335, 2.304, 2.274 max_d=2.274 avg_d=1.335 std_dev=0.970
P	B	0, 0.498, 1.734, 2.970, 2.794 max_d=2.794 avg_d=1.734 std_dev=1.236
OP2	A	0, 0.530, 1.822, 3.114, 2.848 max_d=2.848 avg_d=1.822 std_dev=1.292
OP2	B	0, 0.566, 1.941, 3.316, 3.008 max_d=3.008 avg_d=1.941 std_dev=1.375
OP1	B	0, 0.466, 1.889, 3.313, 3.435 max_d=3.435 avg_d=1.889 std_dev=1.423
OP1	A	0, 0.452, 1.904, 3.355, 3.520 max_d=3.520 avg_d=1.904 std_dev=1.451

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.02	0.22	0.08	0.09
C2	0.01	0.00	0.08	0.11	0.01	0.05	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.13	0.02	0.05	0.00	0.39	0.29	0.08
C2'	0.00	0.08	0.00	0.02	0.05	0.03	0.03	0.01	0.04	0.03	0.05	0.10	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.04	0.15	0.07	0.05
C3'	0.02	0.11	0.02	0.00	0.08	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.09	0.13	0.11	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.05	0.08	0.25	0.13	0.11
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.04	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.08	0.00	0.04	0.01	0.40	0.27	0.09
C4'	0.02	0.05	0.03	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.04	0.07	0.06	0.02	0.03	0.06	0.01	0.01	0.01	0.04	0.10	0.15	0.00
C5	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.48	0.39	0.10
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.02	0.04	0.03	0.03	0.01	0.05	0.02	0.01	0.00	0.04	0.15	0.28	0.01
C6	0.02	0.00	0.04	0.08	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.01	0.02	0.00	0.49	0.44	0.09
C8	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.47	0.34	0.14
N1	0.00	0.00	0.05	0.09	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.11	0.02	0.03	0.00	0.44	0.38	0.08
N2	0.02	0.01	0.10	0.13	0.01	0.07	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.16	0.02	0.06	0.02	0.36	0.26	0.08
N3	0.02	0.00	0.08	0.11	0.00	0.06	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.12	0.01	0.05	0.01	0.35	0.22	0.08
N7	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.53	0.45	0.12
N9	0.01	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.36	0.22	0.11
O2'	0.02	0.07	0.01	0.03	0.04	0.06	0.02	0.05	0.04	0.01	0.04	0.09	0.07	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.05	0.04	0.15	0.10	0.04
O3'	0.01	0.13	0.02	0.01	0.08	0.01	0.06	0.02	0.08	0.02	0.11	0.16	0.12	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.08	0.08	0.47	0.23	0.19
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.08	0.02	0.22	0.13	0.13
O5'	0.05	0.05	0.03	0.05	0.04	0.01	0.03	0.00	0.02	0.05	0.03	0.06	0.05	0.03	0.05	0.05	0.08	0.08	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.00	0.04	0.08	0.01	0.04	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.08	0.02	0.02	0.00	0.53	0.51	0.08
OP1	0.22	0.39	0.15	0.25	0.40	0.10	0.48	0.15	0.49	0.47	0.44	0.36	0.35	0.53	0.36	0.15	0.47	0.22	0.01	0.53	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.29	0.07	0.13	0.27	0.15	0.39	0.28	0.44	0.34	0.38	0.26	0.22	0.45	0.22	0.10	0.23	0.13	0.02	0.51	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.08	0.05	0.11	0.09	0.00	0.10	0.01	0.09	0.14	0.08	0.08	0.08	0.12	0.11	0.04	0.19	0.13	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.11	0.07	0.07	0.29	0.10	0.28	0.09	0.21	0.13	0.21	0.37	0.03	0.09	0.12	0.15	0.14	0.17	0.61	0.30
C2	0.18	0.16	0.13	0.14	0.24	0.19	0.26	0.19	0.25	0.20	0.20	0.26	0.07	0.16	0.18	0.24	0.19	0.15	0.53	0.30
C2'	0.15	0.23	0.08	0.11	0.35	0.08	0.33	0.13	0.28	0.22	0.30	0.40	0.16	0.11	0.10	0.16	0.24	0.28	0.66	0.38
C3'	0.14	0.22	0.11	0.14	0.34	0.09	0.33	0.13	0.27	0.21	0.29	0.40	0.15	0.13	0.14	0.15	0.25	0.28	0.66	0.37
C4	0.16	0.13	0.13	0.13	0.28	0.19	0.29	0.18	0.25	0.17	0.21	0.32	0.03	0.16	0.17	0.23	0.18	0.15	0.57	0.30
C4'	0.05	0.11	0.05	0.09	0.29	0.04	0.27	0.03	0.20	0.11	0.21	0.37	0.03	0.03	0.12	0.10	0.14	0.19	0.61	0.29
C5	0.18	0.12	0.15	0.16	0.28	0.23	0.30	0.24	0.27	0.18	0.21	0.33	0.06	0.19	0.20	0.26	0.21	0.20	0.56	0.31
C5'	0.09	0.08	0.04	0.07	0.26	0.09	0.25	0.07	0.17	0.09	0.18	0.35	0.04	0.07	0.10	0.14	0.11	0.14	0.59	0.27
C6	0.20	0.14	0.17	0.19	0.27	0.26	0.31	0.27	0.29	0.20	0.20	0.31	0.07	0.22	0.23	0.29	0.24	0.24	0.54	0.33
C8	0.16	0.11	0.13	0.13	0.29	0.20	0.31	0.20	0.25	0.16	0.21	0.37	0.05	0.17	0.17	0.23	0.18	0.17	0.59	0.31
N1	0.20	0.15	0.16	0.18	0.25	0.24	0.29	0.24	0.28	0.21	0.19	0.27	0.08	0.20	0.23	0.28	0.23	0.21	0.52	0.31
N2	0.20	0.19	0.12	0.12	0.22	0.16	0.24	0.16	0.24	0.21	0.20	0.22	0.14	0.13	0.17	0.23	0.19	0.14	0.50	0.29
N3	0.16	0.14	0.11	0.11	0.26	0.16	0.26	0.15	0.23	0.17	0.20	0.29	0.03	0.14	0.15	0.21	0.17	0.14	0.56	0.29
N7	0.18	0.11	0.15	0.16	0.29	0.24	0.31	0.24	0.27	0.17	0.20	0.35	0.06	0.20	0.20	0.26	0.20	0.20	0.57	0.32
N9	0.15	0.12	0.11	0.10	0.29	0.17	0.30	0.16	0.24	0.16	0.21	0.36	0.03	0.14	0.15	0.21	0.16	0.15	0.60	0.31
O2'	0.15	0.24	0.11	0.13	0.35	0.11	0.33	0.16	0.28	0.22	0.30	0.40	0.18	0.13	0.12	0.16	0.28	0.36	0.70	0.42
O3'	0.20	0.27	0.20	0.23	0.36	0.17	0.35	0.22	0.31	0.26	0.32	0.41	0.23	0.22	0.24	0.19	0.33	0.39	0.70	0.44
O4'	0.13	0.04	0.11	0.11	0.25	0.15	0.25	0.13	0.17	0.08	0.16	0.35	0.11	0.13	0.15	0.18	0.11	0.15	0.59	0.27
O5'	0.09	0.08	0.05	0.07	0.25	0.12	0.22	0.10	0.15	0.07	0.18	0.33	0.06	0.07	0.09	0.15	0.08	0.07	0.54	0.22
O6	0.21	0.13	0.19	0.23	0.26	0.30	0.31	0.32	0.30	0.20	0.19	0.30	0.08	0.24	0.27	0.31	0.27	0.31	0.52	0.35
OP1	0.22	0.34	0.25	0.26	0.44	0.19	0.41	0.19	0.34	0.29	0.41	0.50	0.31	0.24	0.25	0.17	0.27	0.26	0.63	0.34
OP2	0.36	0.10	0.30	0.27	0.19	0.43	0.17	0.41	0.20	0.21	0.12	0.31	0.14	0.42	0.29	0.45	0.30	0.31	0.52	0.34
P	0.11	0.07	0.07	0.09	0.21	0.16	0.17	0.14	0.10	0.02	0.17	0.30	0.10	0.08	0.08	0.18	0.05	0.05	0.47	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.06	0.04	0.34	0.15
C2	0.01	0.00	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.03	0.01	0.12	0.22	0.48	0.25
C2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.04	0.02	0.08	0.00	0.08	0.02	0.01	0.05	0.12	0.00	0.02	0.01	0.07	0.03	0.23	0.10
C3'	0.02	0.02	0.01	0.00	0.10	0.00	0.16	0.02	0.17	0.07	0.03	0.11	0.09	0.03	0.01	0.01	0.05	0.04	0.09	0.05
C4	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.15	0.03	0.09	0.32	0.53	0.29
C4'	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.02	0.09	0.02	0.01	0.02	0.11	0.12	0.03
C5	0.02	0.02	0.08	0.16	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.22	0.05	0.03	0.26	0.49	0.25
C5'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.05	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.05	0.05	0.05	0.09	0.03	0.00	0.01	0.14	0.03	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.17	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.05	0.20	0.05	0.02	0.16	0.43	0.20
N1	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.07	0.15	0.43	0.21
N3	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.06	0.01	0.12	0.30	0.54	0.29
N4	0.01	0.02	0.05	0.11	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.17	0.03	0.09	0.37	0.54	0.30
O2	0.02	0.01	0.12	0.09	0.03	0.02	0.03	0.05	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.15	0.13	0.04	0.14	0.20	0.47	0.24
O2'	0.00	0.08	0.00	0.03	0.01	0.09	0.04	0.09	0.05	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.01	0.06	0.02	0.15	0.16	0.01
O3'	0.00	0.03	0.02	0.01	0.15	0.02	0.22	0.03	0.20	0.07	0.06	0.17	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.08	0.06
O4'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.04	0.06	0.01	0.00	0.03	0.03	0.29	0.11
O5'	0.06	0.12	0.07	0.05	0.09	0.02	0.03	0.01	0.02	0.07	0.12	0.09	0.14	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.04	0.22	0.03	0.04	0.32	0.11	0.26	0.14	0.16	0.15	0.30	0.37	0.20	0.15	0.15	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.34	0.48	0.23	0.09	0.53	0.12	0.49	0.03	0.43	0.43	0.54	0.54	0.47	0.16	0.08	0.29	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.15	0.25	0.10	0.05	0.29	0.03	0.25	0.01	0.20	0.21	0.29	0.30	0.24	0.01	0.06	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00