Doublet Group distance statistics: 51560

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.005, 0.011, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.000, 0.014, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.000, 0.019, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.000, 0.022, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.000, 0.023, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C2	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C1'	A	0, 0.000, 0.024, 0.047, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.000, 0.026, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.026
O6	A	0, 0.000, 0.028, 0.056, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.028 std_dev=0.028
N2	A	0, 0.000, 0.035, 0.070, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.035 std_dev=0.035
O3'	A	0, 0.000, 0.171, 0.341, 0.341 max_d=0.341 avg_d=0.171 std_dev=0.171
C2'	B	0, 0.000, 0.420, 0.840, 0.840 max_d=0.840 avg_d=0.420 std_dev=0.420
C3'	A	0, 0.000, 0.511, 1.022, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.511 std_dev=0.511
C2'	A	0, 0.000, 0.578, 1.156, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.578 std_dev=0.578
O4'	A	0, 0.000, 0.648, 1.295, 1.295 max_d=1.295 avg_d=0.648 std_dev=0.648
C4'	A	0, 0.000, 0.861, 1.722, 1.722 max_d=1.722 avg_d=0.861 std_dev=0.861
OP1	A	0, 0.000, 0.865, 1.730, 1.730 max_d=1.730 avg_d=0.865 std_dev=0.865
O2'	B	0, 0.000, 0.935, 1.870, 1.870 max_d=1.870 avg_d=0.935 std_dev=0.935
O2'	A	0, 0.000, 0.976, 1.952, 1.952 max_d=1.952 avg_d=0.976 std_dev=0.976
C1'	B	0, 0.000, 1.414, 2.828, 2.828 max_d=2.828 avg_d=1.414 std_dev=1.414
C5'	A	0, 0.000, 1.574, 3.149, 3.149 max_d=3.149 avg_d=1.574 std_dev=1.574
C3'	B	0, 0.000, 1.676, 3.353, 3.353 max_d=3.353 avg_d=1.676 std_dev=1.676
P	A	0, 0.000, 1.733, 3.467, 3.467 max_d=3.467 avg_d=1.733 std_dev=1.733
O5'	A	0, 0.000, 1.775, 3.551, 3.551 max_d=3.551 avg_d=1.775 std_dev=1.775
O4'	B	0, 0.000, 2.012, 4.023, 4.023 max_d=4.023 avg_d=2.012 std_dev=2.012
C4'	B	0, 0.000, 2.208, 4.416, 4.416 max_d=4.416 avg_d=2.208 std_dev=2.208
O3'	B	0, 0.000, 2.421, 4.841, 4.841 max_d=4.841 avg_d=2.421 std_dev=2.421
OP2	A	0, 0.000, 2.458, 4.916, 4.916 max_d=4.916 avg_d=2.458 std_dev=2.458
N1	B	0, 0.000, 2.494, 4.988, 4.988 max_d=4.988 avg_d=2.494 std_dev=2.494
O2	B	0, 0.000, 2.842, 5.684, 5.684 max_d=5.684 avg_d=2.842 std_dev=2.842
C2	B	0, 0.000, 2.936, 5.873, 5.873 max_d=5.873 avg_d=2.936 std_dev=2.936
C6	B	0, 0.000, 3.469, 6.939, 6.939 max_d=6.939 avg_d=3.469 std_dev=3.469
C5'	B	0, 0.000, 3.615, 7.230, 7.230 max_d=7.230 avg_d=3.615 std_dev=3.615
N3	B	0, 0.000, 3.937, 7.873, 7.873 max_d=7.873 avg_d=3.937 std_dev=3.937
O5'	B	0, 0.000, 4.245, 8.490, 8.490 max_d=8.490 avg_d=4.245 std_dev=4.245
C5	B	0, 0.000, 4.412, 8.824, 8.824 max_d=8.824 avg_d=4.412 std_dev=4.412
C4	B	0, 0.000, 4.519, 9.039, 9.039 max_d=9.039 avg_d=4.519 std_dev=4.519
N4	B	0, 0.000, 5.526, 11.052, 11.052 max_d=11.052 avg_d=5.526 std_dev=5.526
P	B	0, 0.000, 5.575, 11.150, 11.150 max_d=11.150 avg_d=5.575 std_dev=5.575
OP2	B	0, 0.000, 6.007, 12.014, 12.014 max_d=12.014 avg_d=6.007 std_dev=6.007
OP1	B	0, 0.000, 6.285, 12.569, 12.569 max_d=12.569 avg_d=6.285 std_dev=6.285

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.04	0.03	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.30	0.00	0.35	0.50	0.34
C2	0.03	0.00	0.16	0.02	0.01	0.23	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.39	0.05	0.29	0.53	0.00	0.40	0.75	0.50
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.10	0.01	0.06	0.05	0.09	0.08	0.13	0.19	0.15	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.24	0.08	0.64	0.52	0.42
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.55	0.13	0.23
C4	0.01	0.01	0.10	0.02	0.00	0.09	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.19	0.04	0.14	0.47	0.00	0.34	0.77	0.46
C4'	0.01	0.23	0.01	0.00	0.09	0.00	0.02	0.00	0.07	0.14	0.17	0.29	0.22	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.01	0.04
C5	0.01	0.00	0.06	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.02	0.06	0.48	0.00	0.28	0.89	0.46
C5'	0.02	0.22	0.05	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.01	0.26	0.14	0.31	0.20	0.21	0.07	0.04	0.03	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00
C6	0.01	0.00	0.09	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.18	0.03	0.12	0.51	0.00	0.29	0.92	0.49
C8	0.01	0.00	0.08	0.00	0.00	0.14	0.01	0.26	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.01	0.16	0.38	0.01	0.24	0.88	0.39
N1	0.03	0.00	0.13	0.02	0.01	0.17	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.30	0.04	0.22	0.54	0.00	0.35	0.86	0.51
N2	0.04	0.00	0.19	0.02	0.01	0.29	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.47	0.05	0.35	0.53	0.01	0.43	0.69	0.51
N3	0.03	0.00	0.15	0.02	0.00	0.22	0.00	0.20	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.36	0.05	0.28	0.49	0.00	0.40	0.69	0.48
N7	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00	0.10	0.00	0.21	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.00	0.09	0.42	0.01	0.21	0.96	0.42
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.41	0.00	0.32	0.73	0.41
O2'	0.00	0.39	0.00	0.00	0.19	0.00	0.09	0.04	0.18	0.19	0.30	0.47	0.36	0.10	0.00	0.00	0.03	0.00	0.19	0.13	0.78	0.54	0.45
O3'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.04	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.05	0.05	0.00	0.02	0.03	0.00	0.04	0.08	0.03	0.46	0.05	0.12
O4'	0.00	0.29	0.01	0.01	0.14	0.00	0.06	0.00	0.12	0.16	0.22	0.35	0.28	0.09	0.00	0.00	0.04	0.00	0.25	0.08	0.08	0.31	0.19
O5'	0.30	0.53	0.24	0.01	0.47	0.00	0.48	0.00	0.51	0.38	0.54	0.53	0.49	0.42	0.41	0.19	0.08	0.25	0.00	0.51	0.01	0.01	0.00
O6	0.00	0.00	0.08	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.13	0.03	0.08	0.51	0.00	0.25	0.99	0.48
OP1	0.35	0.40	0.64	0.55	0.34	0.10	0.28	0.01	0.29	0.24	0.35	0.43	0.40	0.21	0.32	0.78	0.46	0.08	0.01	0.25	0.00	0.00	0.00
OP2	0.50	0.75	0.52	0.13	0.77	0.01	0.89	0.01	0.92	0.88	0.86	0.69	0.69	0.96	0.73	0.54	0.05	0.31	0.01	0.99	0.00	0.00	0.00
P	0.34	0.50	0.42	0.23	0.46	0.04	0.46	0.00	0.49	0.39	0.51	0.51	0.48	0.42	0.41	0.45	0.12	0.19	0.00	0.48	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.49	0.38	0.29	0.51	0.71	0.67	0.92	0.90	0.87	0.59	0.47	0.75	0.11	0.06	0.43	0.73	1.70	1.87	1.86	1.87
C2	0.32	0.40	0.21	0.14	0.43	0.08	0.40	0.00	0.38	0.37	0.42	0.44	0.39	0.17	0.09	0.22	0.55	0.37	0.52	0.45
C2'	0.25	0.13	0.03	0.26	0.60	0.51	0.86	0.84	0.79	0.40	0.26	0.66	0.23	0.33	0.13	0.58	1.66	1.99	1.99	1.98
C3'	0.34	0.09	0.15	0.52	0.52	0.78	0.85	1.17	0.82	0.43	0.17	0.55	0.28	0.12	0.48	0.73	2.00	2.48	2.30	2.35
C4	0.48	0.58	0.24	0.24	0.77	0.29	0.81	0.31	0.74	0.62	0.67	0.82	0.45	0.07	0.10	0.50	1.01	0.90	1.09	1.02
C4'	0.60	0.35	0.48	0.79	0.67	0.98	0.94	1.27	0.94	0.64	0.40	0.67	0.07	0.29	0.80	0.90	2.10	2.50	2.27	2.34
C5	0.52	0.82	0.21	0.05	0.99	0.04	0.91	0.03	0.79	0.74	0.94	1.07	0.75	0.05	0.18	0.40	0.65	0.41	0.78	0.63
C5'	0.56	0.36	0.42	0.69	0.67	0.87	0.91	1.13	0.90	0.61	0.42	0.68	0.10	0.23	0.67	0.83	1.97	2.36	2.15	2.21
C6	0.48	0.90	0.18	0.12	0.95	0.22	0.78	0.40	0.65	0.70	1.01	1.03	0.94	0.08	0.38	0.21	0.21	0.14	0.31	0.12
C8	0.57	0.77	0.24	0.21	1.08	0.29	1.10	0.34	0.97	0.79	0.93	1.18	0.59	0.00	0.02	0.59	1.11	1.02	1.32	1.20
N1	0.38	0.70	0.18	0.10	0.67	0.24	0.52	0.43	0.44	0.52	0.75	0.72	0.77	0.14	0.27	0.10	0.12	0.18	0.17	0.01
N2	0.12	0.11	0.21	0.19	0.07	0.08	0.05	0.02	0.06	0.09	0.09	0.06	0.14	0.29	0.28	0.02	0.40	0.27	0.29	0.25
N3	0.37	0.34	0.24	0.31	0.48	0.36	0.56	0.40	0.54	0.43	0.38	0.49	0.22	0.12	0.26	0.44	1.04	0.96	1.02	1.01
N7	0.58	0.92	0.22	0.06	1.16	0.09	1.09	0.04	0.94	0.84	1.08	1.27	0.81	0.01	0.21	0.48	0.77	0.55	0.96	0.79
N9	0.51	0.57	0.26	0.33	0.86	0.43	0.95	0.54	0.87	0.67	0.68	0.91	0.37	0.04	0.18	0.62	1.30	1.29	1.45	1.39
O2'	0.02	0.09	0.31	0.02	0.50	0.32	0.81	0.74	0.70	0.23	0.09	0.59	0.52	0.69	0.14	0.42	1.53	1.91	1.98	1.92
O3'	0.34	0.01	0.22	0.67	0.43	0.94	0.83	1.40	0.82	0.39	0.05	0.44	0.41	0.05	0.68	0.79	2.21	2.81	2.54	2.62
O4'	0.67	0.50	0.56	0.78	0.75	0.91	0.95	1.10	0.94	0.71	0.55	0.76	0.28	0.40	0.77	0.88	1.90	2.10	1.97	2.03
O5'	0.75	0.56	0.56	0.81	0.90	1.01	1.15	1.27	1.12	0.82	0.63	0.92	0.28	0.36	0.76	1.03	2.10	2.44	2.29	2.34
O6	0.49	1.08	0.15	0.28	1.09	0.42	0.83	0.69	0.65	0.76	1.21	1.20	1.18	0.06	0.62	0.12	0.10	0.56	0.02	0.21
OP1	0.84	0.70	0.65	0.91	1.10	1.09	1.35	1.38	1.29	0.95	0.79	1.15	0.39	0.41	0.84	1.11	2.26	2.67	2.58	2.57
OP2	0.94	0.79	0.70	0.92	1.19	1.14	1.43	1.40	1.37	1.05	0.89	1.23	0.48	0.48	0.82	1.21	2.21	2.54	2.47	2.48
P	0.79	0.64	0.58	0.82	1.01	1.02	1.26	1.29	1.20	0.89	0.73	1.06	0.34	0.36	0.74	1.06	2.14	2.50	2.40	2.41

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.15	0.15	0.07	0.17
C2	0.02	0.00	0.07	0.05	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.07	0.02	0.33	0.32	0.33	0.36
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.06	0.03	0.12	0.00	0.01	0.01	0.22	0.17	0.10	0.19
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.30	0.21	0.07	0.22
C4	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.50	0.53	0.55	0.55
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.03	0.06	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.17	0.01
C5	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.03	0.52	0.55	0.55	0.58
C5'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.02	0.04	0.05	0.04	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.30	0.00
C6	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.03	0.45	0.44	0.38	0.47
N1	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.33	0.31	0.26	0.34
N3	0.02	0.00	0.06	0.04	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.05	0.02	0.42	0.43	0.46	0.47
N4	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.53	0.59	0.63	0.61
O2	0.03	0.00	0.12	0.11	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.13	0.02	0.24	0.22	0.25	0.27
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.04	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.06	0.04	0.11	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04
O3'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.13	0.03	0.00	0.02	0.21	0.14	0.01	0.14
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.07	0.10	0.05
O5'	0.15	0.33	0.22	0.30	0.50	0.01	0.52	0.00	0.45	0.33	0.42	0.53	0.24	0.03	0.21	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.15	0.32	0.17	0.21	0.53	0.03	0.55	0.10	0.44	0.31	0.43	0.59	0.22	0.01	0.14	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.33	0.10	0.07	0.55	0.17	0.55	0.30	0.38	0.26	0.46	0.63	0.25	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.36	0.19	0.22	0.55	0.01	0.58	0.00	0.47	0.34	0.47	0.61	0.27	0.04	0.14	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00