Doublet Group distance statistics: 51563

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.011, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.000, 0.024, 0.049, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C1'	A	0, 0.000, 0.026, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.026
C5	A	0, 0.000, 0.027, 0.053, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.000, 0.028, 0.056, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.028 std_dev=0.028
C4	A	0, 0.000, 0.030, 0.060, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.030 std_dev=0.030
N2	A	0, 0.000, 0.035, 0.069, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.035 std_dev=0.035
O6	A	0, 0.000, 0.037, 0.073, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.037 std_dev=0.037
N7	A	0, 0.000, 0.064, 0.128, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.064 std_dev=0.064
C8	A	0, 0.000, 0.077, 0.154, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.077 std_dev=0.077
O4'	A	0, 0.000, 0.088, 0.177, 0.177 max_d=0.177 avg_d=0.088 std_dev=0.088
C4'	A	0, 0.000, 0.105, 0.211, 0.211 max_d=0.211 avg_d=0.105 std_dev=0.105
C2'	A	0, 0.000, 0.162, 0.325, 0.325 max_d=0.325 avg_d=0.162 std_dev=0.162
O5'	A	0, 0.000, 0.250, 0.501, 0.501 max_d=0.501 avg_d=0.250 std_dev=0.250
O2'	B	0, 0.000, 0.279, 0.557, 0.557 max_d=0.557 avg_d=0.279 std_dev=0.279
C3'	B	0, 0.000, 0.306, 0.612, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.306 std_dev=0.306
P	A	0, 0.000, 0.383, 0.766, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.383 std_dev=0.383
C3'	A	0, 0.000, 0.416, 0.833, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.416 std_dev=0.416
C5'	A	0, 0.000, 0.460, 0.921, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.460 std_dev=0.460
O2'	A	0, 0.000, 0.464, 0.927, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.464 std_dev=0.464
OP2	A	0, 0.000, 0.614, 1.229, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.614 std_dev=0.614
C2'	B	0, 0.000, 0.701, 1.403, 1.403 max_d=1.403 avg_d=0.701 std_dev=0.701
O3'	A	0, 0.000, 0.957, 1.914, 1.914 max_d=1.914 avg_d=0.957 std_dev=0.957
OP2	B	0, 0.000, 1.128, 2.256, 2.256 max_d=2.256 avg_d=1.128 std_dev=1.128
OP1	A	0, 0.000, 1.234, 2.469, 2.469 max_d=2.469 avg_d=1.234 std_dev=1.234
O3'	B	0, 0.000, 1.240, 2.479, 2.479 max_d=2.479 avg_d=1.240 std_dev=1.240
C4'	B	0, 0.000, 1.595, 3.190, 3.190 max_d=3.190 avg_d=1.595 std_dev=1.595
C1'	B	0, 0.000, 1.900, 3.801, 3.801 max_d=3.801 avg_d=1.900 std_dev=1.900
C5'	B	0, 0.000, 2.088, 4.176, 4.176 max_d=4.176 avg_d=2.088 std_dev=2.088
O4'	B	0, 0.000, 2.248, 4.496, 4.496 max_d=4.496 avg_d=2.248 std_dev=2.248
P	B	0, 0.000, 2.303, 4.607, 4.607 max_d=4.607 avg_d=2.303 std_dev=2.303
O5'	B	0, 0.000, 2.754, 5.509, 5.509 max_d=5.509 avg_d=2.754 std_dev=2.754
N1	B	0, 0.000, 2.772, 5.545, 5.545 max_d=5.545 avg_d=2.772 std_dev=2.772
OP1	B	0, 0.000, 2.937, 5.874, 5.874 max_d=5.874 avg_d=2.937 std_dev=2.937
C6	B	0, 0.000, 2.938, 5.876, 5.876 max_d=5.876 avg_d=2.938 std_dev=2.938
O2	B	0, 0.000, 3.481, 6.962, 6.962 max_d=6.962 avg_d=3.481 std_dev=3.481
C2	B	0, 0.000, 3.614, 7.227, 7.227 max_d=7.227 avg_d=3.614 std_dev=3.614
C5	B	0, 0.000, 3.828, 7.655, 7.655 max_d=7.655 avg_d=3.828 std_dev=3.828
N3	B	0, 0.000, 4.614, 9.229, 9.229 max_d=9.229 avg_d=4.614 std_dev=4.614
C4	B	0, 0.000, 4.717, 9.433, 9.433 max_d=9.433 avg_d=4.717 std_dev=4.717
N4	B	0, 0.000, 5.728, 11.456, 11.456 max_d=11.456 avg_d=5.728 std_dev=5.728

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.00	0.00	0.04	0.10	0.00	0.08	0.01	0.63	0.05	0.24
C2	0.03	0.00	0.10	0.02	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.26	0.14	0.01	0.14	0.01	0.65	0.21	0.25
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.06	0.03	0.03	0.05	0.05	0.01	0.07	0.12	0.10	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.43	0.10	0.14
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.10	0.17	0.04	0.07	0.03	0.17	0.08	0.01	0.01	0.01	0.17	0.13	0.18	0.21	0.06
C4	0.01	0.00	0.06	0.04	0.00	0.01	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.03	0.01	0.14	0.00	0.59	0.20	0.24
C4'	0.00	0.03	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.39	0.07	0.13
C5	0.01	0.00	0.03	0.11	0.00	0.00	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.09	0.01	0.14	0.01	0.47	0.29	0.20
C5'	0.04	0.09	0.05	0.00	0.10	0.01	0.11	0.00	0.12	0.11	0.11	0.09	0.09	0.11	0.09	0.15	0.11	0.00	0.00	0.13	0.01	0.12	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.01	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.07	0.02	0.15	0.00	0.48	0.31	0.20
C8	0.01	0.01	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.01	0.13	0.01	0.39	0.25	0.17
N1	0.02	0.00	0.07	0.04	0.00	0.02	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.23	0.04	0.02	0.14	0.01	0.58	0.27	0.23
N2	0.03	0.00	0.12	0.07	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.30	0.23	0.01	0.14	0.02	0.70	0.19	0.26
N3	0.03	0.00	0.10	0.03	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.24	0.17	0.01	0.13	0.01	0.67	0.17	0.25
N7	0.00	0.00	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.20	0.01	0.13	0.01	0.34	0.33	0.15
N9	0.00	0.01	0.02	0.08	0.01	0.00	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.02	0.01	0.13	0.01	0.57	0.15	0.24
O2'	0.04	0.26	0.00	0.01	0.16	0.21	0.13	0.15	0.18	0.01	0.23	0.30	0.24	0.06	0.05	0.00	0.16	0.15	0.10	0.17	0.37	0.15	0.04
O3'	0.10	0.14	0.05	0.01	0.03	0.01	0.09	0.11	0.07	0.18	0.04	0.23	0.17	0.20	0.02	0.16	0.00	0.08	0.29	0.14	0.08	0.27	0.15
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.08	0.00	0.08	0.02	0.66	0.07	0.26
O5'	0.08	0.14	0.02	0.17	0.14	0.01	0.14	0.00	0.15	0.13	0.14	0.14	0.13	0.13	0.13	0.10	0.29	0.08	0.00	0.15	0.03	0.00	0.01
O6	0.01	0.01	0.03	0.13	0.00	0.01	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.17	0.14	0.02	0.15	0.00	0.41	0.35	0.17
OP1	0.63	0.65	0.43	0.18	0.59	0.39	0.47	0.01	0.48	0.39	0.58	0.70	0.67	0.34	0.57	0.37	0.08	0.66	0.03	0.41	0.00	0.00	0.00
OP2	0.05	0.21	0.10	0.21	0.20	0.07	0.29	0.12	0.31	0.25	0.27	0.19	0.17	0.33	0.15	0.15	0.27	0.07	0.00	0.35	0.00	0.00	0.00
P	0.24	0.25	0.14	0.06	0.24	0.13	0.20	0.02	0.20	0.17	0.23	0.26	0.25	0.15	0.24	0.04	0.15	0.26	0.01	0.17	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.53	1.62	0.44	0.05	1.94	0.34	1.45	0.43	1.04	1.07	2.04	2.26	1.65	0.01	0.31	0.07	0.64	0.72	0.15	0.43
C2	0.48	1.31	0.41	0.04	1.44	0.27	1.13	0.30	0.87	0.92	1.53	1.59	1.32	0.06	0.31	0.04	0.47	0.45	0.11	0.30
C2'	0.69	1.75	0.52	0.15	2.02	0.14	1.55	0.21	1.17	1.21	2.14	2.34	1.80	0.10	0.26	0.16	0.38	0.50	0.02	0.22
C3'	0.66	1.77	0.46	0.04	2.09	0.24	1.57	0.33	1.15	1.20	2.21	2.45	1.83	0.04	0.40	0.10	0.54	0.70	0.17	0.38
C4	0.60	1.70	0.44	0.02	1.98	0.33	1.52	0.39	1.13	1.17	2.09	2.26	1.72	0.06	0.43	0.02	0.60	0.66	0.15	0.40
C4'	0.57	1.75	0.45	0.04	2.13	0.36	1.58	0.47	1.12	1.15	2.22	2.52	1.78	0.01	0.36	0.05	0.69	0.82	0.18	0.48
C5	0.74	1.94	0.47	0.01	2.30	0.30	1.80	0.36	1.35	1.37	2.40	2.61	1.91	0.08	0.56	0.15	0.59	0.68	0.14	0.39
C5'	0.71	1.99	0.54	0.09	2.44	0.32	1.83	0.45	1.32	1.35	2.53	2.90	2.02	0.05	0.36	0.06	0.68	0.85	0.12	0.45
C6	0.79	1.95	0.47	0.00	2.28	0.24	1.82	0.28	1.42	1.42	2.36	2.51	1.86	0.10	0.62	0.25	0.50	0.57	0.11	0.31
C8	0.71	1.99	0.47	0.00	2.42	0.34	1.85	0.44	1.35	1.36	2.51	2.82	1.97	0.06	0.52	0.10	0.68	0.81	0.17	0.46
N1	0.68	1.61	0.46	0.03	1.77	0.22	1.44	0.25	1.15	1.19	1.87	1.91	1.57	0.09	0.49	0.15	0.44	0.44	0.09	0.27
N2	0.26	0.84	0.32	0.06	0.92	0.25	0.71	0.26	0.53	0.57	0.98	1.02	0.85	0.04	0.13	0.18	0.38	0.32	0.09	0.25
N3	0.46	1.39	0.41	0.04	1.58	0.32	1.21	0.37	0.89	0.94	1.68	1.78	1.42	0.04	0.30	0.09	0.55	0.56	0.13	0.36
N7	0.78	2.08	0.47	0.01	2.56	0.31	1.98	0.40	1.47	1.46	2.63	2.96	2.04	0.08	0.60	0.19	0.65	0.78	0.16	0.43
N9	0.61	1.77	0.45	0.02	2.11	0.35	1.60	0.43	1.17	1.20	2.21	2.44	1.78	0.05	0.42	0.00	0.65	0.74	0.16	0.44
O2'	0.78	1.71	0.68	0.35	1.92	0.06	1.50	0.02	1.17	1.22	2.04	2.18	1.78	0.32	0.02	0.26	0.17	0.27	0.16	0.03
O3'	0.76	1.78	0.56	0.17	2.06	0.06	1.58	0.15	1.20	1.25	2.18	2.39	1.85	0.19	0.25	0.25	0.37	0.55	0.09	0.25
O4'	0.48	1.64	0.42	0.01	2.02	0.44	1.49	0.56	1.04	1.06	2.11	2.40	1.67	0.05	0.34	0.16	0.80	0.89	0.22	0.56
O5'	0.79	2.11	0.59	0.13	2.60	0.28	1.99	0.40	1.45	1.46	2.67	3.08	2.10	0.07	0.36	0.14	0.67	0.84	0.09	0.43
O6	0.88	2.11	0.45	0.01	2.58	0.18	2.10	0.22	1.63	1.58	2.61	2.83	1.92	0.12	0.74	0.39	0.45	0.54	0.09	0.27
OP1	1.12	2.34	1.04	0.58	2.80	0.08	2.23	0.10	1.72	1.74	2.86	3.25	2.34	0.57	0.18	0.44	0.47	0.69	0.15	0.24
OP2	0.36	1.70	0.16	0.34	2.27	0.78	1.64	0.94	1.05	1.04	2.30	2.80	1.67	0.35	0.84	0.31	1.28	1.51	0.66	1.04
P	0.80	2.11	0.66	0.19	2.62	0.29	2.01	0.45	1.47	1.47	2.67	3.11	2.09	0.15	0.27	0.12	0.78	0.97	0.13	0.52

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.07	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.28	0.29	0.39	0.27
C2	0.01	0.00	0.07	0.11	0.00	0.09	0.01	0.23	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.11	0.01	0.25	0.25	0.44	0.25
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.12	0.00	0.01	0.01	0.03	0.10	0.05	0.00
C3'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.10	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.13	0.11	0.13	0.01	0.00	0.02	0.13	0.01	0.12	0.15
C4	0.02	0.00	0.02	0.10	0.00	0.18	0.00	0.40	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.04	0.13	0.18	0.55	0.20
C4'	0.00	0.09	0.02	0.01	0.18	0.00	0.19	0.00	0.18	0.10	0.13	0.19	0.04	0.07	0.00	0.00	0.01	0.11	0.06	0.00
C5	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.19	0.00	0.43	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.07	0.09	0.20	0.68	0.22
C5'	0.07	0.23	0.01	0.01	0.40	0.00	0.43	0.00	0.38	0.23	0.31	0.43	0.15	0.07	0.08	0.01	0.01	0.18	0.09	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.18	0.00	0.38	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.04	0.08	0.15	0.25	0.67	0.27
N1	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.23	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.25	0.28	0.51	0.28
N3	0.01	0.00	0.05	0.13	0.00	0.13	0.01	0.31	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.00	0.20	0.21	0.46	0.22
N4	0.02	0.00	0.02	0.11	0.00	0.19	0.00	0.43	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.04	0.10	0.13	0.52	0.16
O2	0.00	0.01	0.12	0.13	0.01	0.04	0.02	0.15	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.16	0.05	0.29	0.26	0.35	0.25
O2'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.07	0.02	0.07	0.03	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.03	0.02	0.01	0.06	0.06	0.03
O3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.07	0.00	0.01	0.08	0.04	0.03	0.11	0.08	0.16	0.03	0.00	0.01	0.37	0.19	0.47	0.39
O4'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.07	0.01	0.08	0.01	0.00	0.04	0.05	0.02	0.01	0.00	0.41	0.39	0.48	0.40
O5'	0.28	0.25	0.03	0.13	0.13	0.01	0.09	0.01	0.15	0.25	0.20	0.10	0.29	0.01	0.37	0.41	0.00	0.02	0.00	0.00
OP1	0.29	0.25	0.10	0.01	0.18	0.11	0.20	0.18	0.25	0.28	0.21	0.13	0.26	0.06	0.19	0.39	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.39	0.44	0.05	0.12	0.55	0.06	0.68	0.09	0.67	0.51	0.46	0.52	0.35	0.06	0.47	0.48	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.27	0.25	0.00	0.15	0.20	0.00	0.22	0.01	0.27	0.28	0.22	0.16	0.25	0.03	0.39	0.40	0.00	0.00	0.00	0.00