Doublet Group distance statistics: 51570

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 10, 18, 18, 6, 3, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.006, 0.016, 0.027, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.019 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.000, 0.014, 0.029, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.001, 0.016, 0.031, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.016 std_dev=0.015
C2	A	0, -0.006, 0.013, 0.032, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.013 std_dev=0.019
C1'	A	0, -0.003, 0.017, 0.036, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.017 std_dev=0.020
O6	A	0, 0.006, 0.028, 0.049, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.028 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.008, 0.033, 0.058, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.033 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.010, 0.036, 0.062, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.036 std_dev=0.026
N2	A	0, -0.010, 0.033, 0.076, 0.253 max_d=0.253 avg_d=0.033 std_dev=0.043
O4'	A	0, 0.025, 0.084, 0.144, 0.393 max_d=0.393 avg_d=0.084 std_dev=0.060
C2'	A	0, 0.043, 0.129, 0.216, 0.458 max_d=0.458 avg_d=0.129 std_dev=0.087
C4'	A	0, 0.018, 0.128, 0.238, 0.515 max_d=0.515 avg_d=0.128 std_dev=0.110
O3'	B	0, 0.165, 0.294, 0.423, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.294 std_dev=0.129
O2	B	0, 0.287, 0.421, 0.555, 0.753 max_d=0.753 avg_d=0.421 std_dev=0.134
C2	B	0, 0.298, 0.434, 0.571, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.434 std_dev=0.137
C1'	B	0, 0.219, 0.360, 0.502, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.360 std_dev=0.141
N1	B	0, 0.277, 0.422, 0.567, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.422 std_dev=0.145
O4'	B	0, 0.214, 0.360, 0.506, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.360 std_dev=0.146
C3'	B	0, 0.171, 0.319, 0.467, 0.810 max_d=0.810 avg_d=0.319 std_dev=0.148
N3	B	0, 0.337, 0.491, 0.644, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.491 std_dev=0.154
C2'	B	0, 0.159, 0.314, 0.469, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.314 std_dev=0.155
O2'	A	0, 0.042, 0.199, 0.356, 0.770 max_d=0.770 avg_d=0.199 std_dev=0.157
O2'	B	0, 0.158, 0.316, 0.475, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.316 std_dev=0.159
C4'	B	0, 0.181, 0.341, 0.502, 0.902 max_d=0.902 avg_d=0.341 std_dev=0.160
C4	B	0, 0.367, 0.541, 0.716, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.541 std_dev=0.175
C6	B	0, 0.307, 0.487, 0.667, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.487 std_dev=0.180
C3'	A	0, -0.040, 0.153, 0.346, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.153 std_dev=0.193
C5	B	0, 0.348, 0.541, 0.735, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.541 std_dev=0.194
O4	B	0, 0.407, 0.604, 0.802, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.604 std_dev=0.198
C5'	B	0, 0.183, 0.390, 0.596, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.390 std_dev=0.207
C5'	A	0, 0.052, 0.275, 0.497, 0.939 max_d=0.939 avg_d=0.275 std_dev=0.222
O5'	B	0, 0.177, 0.405, 0.633, 1.301 max_d=1.301 avg_d=0.405 std_dev=0.228
P	B	0, 0.255, 0.544, 0.834, 1.566 max_d=1.566 avg_d=0.544 std_dev=0.289
OP1	B	0, 0.376, 0.673, 0.970, 1.534 max_d=1.534 avg_d=0.673 std_dev=0.297
P	A	0, 0.055, 0.387, 0.719, 1.388 max_d=1.388 avg_d=0.387 std_dev=0.332
OP2	B	0, 0.241, 0.588, 0.936, 1.657 max_d=1.657 avg_d=0.588 std_dev=0.347
O3'	A	0, -0.180, 0.223, 0.627, 1.971 max_d=1.971 avg_d=0.223 std_dev=0.404
OP1	A	0, 0.092, 0.498, 0.903, 1.649 max_d=1.649 avg_d=0.498 std_dev=0.406
OP2	A	0, 0.016, 0.434, 0.852, 1.867 max_d=1.867 avg_d=0.434 std_dev=0.418
O5'	A	0, -0.022, 0.401, 0.823, 1.809 max_d=1.809 avg_d=0.401 std_dev=0.423

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.06	0.04	0.02	0.00	0.01	0.15	0.00	0.23	0.03	0.23	0.24	0.08
C2	0.04	0.00	0.04	0.05	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.26	0.06	0.28	0.01	0.18	0.30	0.09
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.08	0.03	0.05	0.03	0.06	0.03	0.05	0.02	0.00	0.04	0.02	0.24	0.04	0.29	0.17	0.14
C3'	0.02	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.02	0.03	0.08	0.03	0.09	0.05	0.08	0.03	0.02	0.01	0.01	0.07	0.04	0.22	0.32	0.11
C4	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.18	0.03	0.31	0.02	0.19	0.27	0.10
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.05	0.08	0.06	0.05	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.21	0.30	0.05
C5	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.14	0.02	0.36	0.02	0.19	0.26	0.13
C5'	0.03	0.12	0.08	0.02	0.10	0.01	0.11	0.00	0.13	0.11	0.13	0.12	0.10	0.12	0.07	0.05	0.07	0.02	0.01	0.13	0.20	0.27	0.02
C6	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.04	0.01	0.13	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.17	0.03	0.35	0.00	0.17	0.27	0.12
C8	0.02	0.02	0.05	0.08	0.01	0.05	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.06	0.03	0.39	0.03	0.24	0.22	0.18
N1	0.03	0.00	0.03	0.03	0.02	0.05	0.01	0.13	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.22	0.05	0.32	0.01	0.17	0.29	0.10
N2	0.06	0.00	0.06	0.09	0.02	0.08	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.11	0.31	0.07	0.25	0.02	0.19	0.31	0.09
N3	0.04	0.01	0.03	0.05	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.08	0.25	0.06	0.26	0.01	0.19	0.30	0.08
N7	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.07	0.02	0.39	0.03	0.22	0.23	0.18
N9	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.05	0.13	0.01	0.32	0.02	0.22	0.24	0.12
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.07	0.03	0.08	0.05	0.09	0.09	0.10	0.11	0.08	0.09	0.05	0.00	0.04	0.02	0.20	0.11	0.33	0.15	0.17
O3'	0.15	0.26	0.04	0.01	0.18	0.02	0.14	0.07	0.17	0.06	0.22	0.31	0.25	0.07	0.13	0.04	0.00	0.11	0.23	0.16	0.27	0.38	0.25
O4'	0.00	0.06	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.05	0.07	0.06	0.02	0.01	0.02	0.11	0.00	0.18	0.03	0.19	0.31	0.06
O5'	0.23	0.28	0.24	0.07	0.31	0.02	0.36	0.01	0.35	0.39	0.32	0.25	0.26	0.39	0.32	0.20	0.23	0.18	0.00	0.37	0.01	0.02	0.01
O6	0.03	0.01	0.04	0.04	0.02	0.04	0.02	0.13	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.11	0.16	0.03	0.37	0.00	0.18	0.26	0.14
OP1	0.23	0.18	0.29	0.22	0.19	0.21	0.19	0.20	0.17	0.24	0.17	0.19	0.19	0.22	0.22	0.33	0.27	0.19	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.30	0.17	0.32	0.27	0.30	0.26	0.27	0.27	0.22	0.29	0.31	0.30	0.23	0.24	0.15	0.38	0.31	0.02	0.26	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.09	0.14	0.11	0.10	0.05	0.13	0.02	0.12	0.18	0.10	0.09	0.08	0.18	0.12	0.17	0.25	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.10	0.07	0.07	0.14	0.06	0.11	0.06	0.09	0.08	0.13	0.10	0.11	0.08	0.17	0.08	0.09	0.17	0.19	0.12
C2	0.08	0.12	0.08	0.07	0.12	0.07	0.10	0.07	0.10	0.09	0.13	0.14	0.12	0.08	0.13	0.09	0.08	0.16	0.16	0.11
C2'	0.06	0.10	0.07	0.07	0.14	0.07	0.11	0.06	0.09	0.08	0.13	0.09	0.11	0.09	0.17	0.07	0.09	0.16	0.19	0.11
C3'	0.07	0.10	0.09	0.08	0.16	0.08	0.13	0.08	0.10	0.09	0.14	0.09	0.12	0.09	0.20	0.08	0.11	0.16	0.22	0.13
C4	0.07	0.11	0.08	0.07	0.13	0.06	0.11	0.07	0.09	0.09	0.13	0.13	0.12	0.08	0.15	0.08	0.08	0.15	0.16	0.10
C4'	0.09	0.11	0.11	0.11	0.15	0.11	0.13	0.10	0.10	0.10	0.14	0.10	0.15	0.12	0.19	0.08	0.09	0.12	0.16	0.10
C5	0.08	0.12	0.09	0.09	0.13	0.08	0.11	0.08	0.10	0.09	0.13	0.13	0.13	0.09	0.14	0.08	0.09	0.14	0.15	0.10
C5'	0.19	0.19	0.20	0.21	0.21	0.21	0.20	0.21	0.19	0.19	0.21	0.19	0.22	0.21	0.24	0.18	0.16	0.14	0.13	0.16
C6	0.09	0.12	0.10	0.10	0.12	0.09	0.11	0.10	0.10	0.10	0.13	0.14	0.13	0.10	0.13	0.09	0.10	0.15	0.15	0.11
C8	0.07	0.11	0.08	0.08	0.13	0.07	0.11	0.07	0.09	0.09	0.14	0.12	0.12	0.09	0.15	0.08	0.08	0.14	0.15	0.10
N1	0.09	0.12	0.10	0.09	0.12	0.08	0.11	0.09	0.10	0.10	0.13	0.15	0.13	0.09	0.13	0.09	0.09	0.16	0.15	0.11
N2	0.09	0.12	0.08	0.07	0.12	0.08	0.11	0.08	0.10	0.10	0.13	0.16	0.13	0.09	0.13	0.11	0.09	0.18	0.17	0.12
N3	0.07	0.11	0.07	0.07	0.13	0.06	0.11	0.06	0.09	0.09	0.13	0.13	0.11	0.08	0.14	0.08	0.08	0.16	0.17	0.11
N7	0.08	0.12	0.09	0.09	0.13	0.08	0.11	0.09	0.10	0.09	0.14	0.13	0.13	0.10	0.15	0.08	0.09	0.14	0.15	0.10
N9	0.06	0.11	0.07	0.07	0.13	0.06	0.11	0.06	0.09	0.09	0.14	0.12	0.11	0.08	0.16	0.08	0.08	0.15	0.16	0.10
O2'	0.10	0.14	0.11	0.10	0.18	0.08	0.15	0.09	0.13	0.13	0.17	0.14	0.14	0.11	0.20	0.10	0.13	0.23	0.24	0.16
O3'	0.27	0.29	0.28	0.26	0.32	0.23	0.31	0.25	0.29	0.28	0.31	0.28	0.29	0.25	0.35	0.26	0.34	0.41	0.47	0.37
O4'	0.07	0.11	0.10	0.09	0.15	0.08	0.12	0.08	0.10	0.09	0.15	0.10	0.13	0.10	0.19	0.08	0.09	0.13	0.17	0.10
O5'	0.17	0.15	0.18	0.22	0.19	0.21	0.17	0.21	0.15	0.15	0.18	0.15	0.20	0.24	0.23	0.18	0.20	0.24	0.22	0.20
O6	0.10	0.13	0.12	0.13	0.12	0.12	0.12	0.13	0.11	0.11	0.13	0.15	0.14	0.13	0.13	0.10	0.13	0.15	0.16	0.13
OP1	0.16	0.19	0.16	0.16	0.23	0.17	0.20	0.18	0.18	0.18	0.22	0.19	0.18	0.15	0.27	0.16	0.16	0.17	0.22	0.17
OP2	0.41	0.43	0.41	0.40	0.44	0.42	0.44	0.43	0.43	0.43	0.44	0.42	0.42	0.38	0.45	0.40	0.38	0.36	0.32	0.38
P	0.17	0.19	0.17	0.17	0.23	0.20	0.21	0.21	0.19	0.18	0.22	0.18	0.18	0.16	0.26	0.17	0.15	0.14	0.11	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.04	0.01	0.03	0.02	0.00	0.07	0.15	0.14	0.09
C2	0.02	0.00	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.05	0.02	0.04	0.12	0.19	0.22	0.15
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.05	0.01	0.04	0.07	0.00	0.02	0.04	0.01	0.08	0.21	0.16	0.13
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.06	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.15	0.08	0.06
C4	0.02	0.01	0.03	0.03	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.04	0.16	0.22	0.27	0.19
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03	0.05	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.09	0.04	0.02
C5	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.04	0.17	0.22	0.26	0.20
C5'	0.03	0.06	0.04	0.01	0.09	0.01	0.11	0.00	0.09	0.06	0.07	0.06	0.03	0.03	0.10	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.04	0.15	0.19	0.22	0.17
N1	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.12	0.18	0.20	0.14
N3	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.05	0.01	0.04	0.14	0.21	0.26	0.17
O2	0.04	0.00	0.07	0.06	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.09	0.02	0.06	0.11	0.18	0.21	0.13
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.05	0.01	0.05	0.03	0.05	0.02	0.07	0.11	0.00	0.04	0.07	0.01	0.08	0.25	0.21	0.16
O3'	0.03	0.05	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.05	0.09	0.04	0.00	0.04	0.03	0.03	0.13	0.08	0.05
O4	0.02	0.02	0.04	0.03	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.04	0.00	0.04	0.17	0.23	0.30	0.21
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.06	0.01	0.03	0.04	0.00	0.04	0.07	0.07	0.04
O5'	0.07	0.12	0.08	0.03	0.16	0.01	0.17	0.01	0.15	0.12	0.14	0.11	0.08	0.03	0.17	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.15	0.19	0.21	0.15	0.22	0.09	0.22	0.06	0.19	0.18	0.21	0.18	0.25	0.13	0.23	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.22	0.16	0.08	0.27	0.04	0.26	0.02	0.22	0.20	0.26	0.21	0.21	0.08	0.30	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.15	0.13	0.06	0.19	0.02	0.20	0.02	0.17	0.14	0.17	0.13	0.16	0.05	0.21	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00