Doublet Group distance statistics: 51572

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 7, 7, 0, 1, 3, 3, 2, 3, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.002, 0.010, 0.017, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.000, 0.008, 0.015, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C6	A	0, -0.002, 0.007, 0.016, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.007 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.002, 0.015, 0.029, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.015 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.004, 0.021, 0.038, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.021 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.003, 0.020, 0.038, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.020 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.006, 0.025, 0.044, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.025 std_dev=0.019
N2	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.021 std_dev=0.021
O3'	B	0, 0.122, 0.295, 0.469, 0.658 max_d=0.658 avg_d=0.295 std_dev=0.174
C3'	B	0, 0.131, 0.354, 0.576, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.354 std_dev=0.223
C4'	B	0, 0.131, 0.381, 0.631, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.381 std_dev=0.250
O4'	B	0, 0.144, 0.413, 0.682, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.413 std_dev=0.269
C1'	B	0, 0.139, 0.432, 0.724, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.432 std_dev=0.292
C2'	B	0, 0.119, 0.419, 0.719, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.419 std_dev=0.300
N1	B	0, 0.148, 0.522, 0.895, 1.361 max_d=1.361 avg_d=0.522 std_dev=0.374
O2'	B	0, 0.066, 0.456, 0.847, 1.586 max_d=1.586 avg_d=0.456 std_dev=0.390
O4'	A	0, -0.231, 0.181, 0.593, 1.775 max_d=1.775 avg_d=0.181 std_dev=0.412
C5'	B	0, 0.015, 0.440, 0.866, 1.859 max_d=1.859 avg_d=0.440 std_dev=0.425
C2'	A	0, -0.238, 0.189, 0.615, 1.894 max_d=1.894 avg_d=0.189 std_dev=0.427
C6	B	0, 0.128, 0.579, 1.031, 1.878 max_d=1.878 avg_d=0.579 std_dev=0.451
C2	B	0, 0.113, 0.596, 1.078, 1.984 max_d=1.984 avg_d=0.596 std_dev=0.482
O2	B	0, 0.102, 0.610, 1.119, 2.140 max_d=2.140 avg_d=0.610 std_dev=0.509
O5'	B	0, -0.001, 0.510, 1.020, 2.191 max_d=2.191 avg_d=0.510 std_dev=0.510
C3'	A	0, -0.289, 0.288, 0.864, 2.516 max_d=2.516 avg_d=0.288 std_dev=0.576
O3'	A	0, -0.262, 0.356, 0.974, 2.857 max_d=2.857 avg_d=0.356 std_dev=0.618
C5	B	0, 0.064, 0.690, 1.316, 2.756 max_d=2.756 avg_d=0.690 std_dev=0.626
O2'	A	0, -0.378, 0.250, 0.878, 2.849 max_d=2.849 avg_d=0.250 std_dev=0.628
N3	B	0, 0.059, 0.691, 1.324, 2.751 max_d=2.751 avg_d=0.691 std_dev=0.633
C4'	A	0, -0.337, 0.296, 0.930, 2.727 max_d=2.727 avg_d=0.296 std_dev=0.633
C4	B	0, 0.030, 0.742, 1.453, 3.145 max_d=3.145 avg_d=0.742 std_dev=0.712
P	B	0, -0.200, 0.607, 1.413, 3.555 max_d=3.555 avg_d=0.607 std_dev=0.806
OP1	B	0, -0.280, 0.587, 1.454, 3.782 max_d=3.782 avg_d=0.587 std_dev=0.867
O4	B	0, -0.039, 0.842, 1.723, 3.876 max_d=3.876 avg_d=0.842 std_dev=0.881
OP2	B	0, -0.225, 0.715, 1.654, 4.235 max_d=4.235 avg_d=0.715 std_dev=0.939
C5'	A	0, -0.530, 0.465, 1.460, 4.247 max_d=4.247 avg_d=0.465 std_dev=0.995
O5'	A	0, -0.498, 0.539, 1.576, 4.507 max_d=4.507 avg_d=0.539 std_dev=1.037
OP1	A	0, -0.405, 0.633, 1.671, 4.595 max_d=4.595 avg_d=0.633 std_dev=1.038
P	A	0, -0.581, 0.607, 1.796, 5.149 max_d=5.149 avg_d=0.607 std_dev=1.188
OP2	A	0, -0.559, 0.643, 1.844, 5.312 max_d=5.312 avg_d=0.643 std_dev=1.201

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.00	0.05	0.02	0.20	0.15	0.06
C2	0.01	0.00	0.26	0.19	0.01	0.08	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.16	0.06	0.19	0.04	0.02	0.39	0.20	0.13
C2'	0.00	0.26	0.00	0.00	0.13	0.01	0.06	0.08	0.11	0.13	0.20	0.32	0.25	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01	0.16	0.08	0.25	0.31	0.21
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.17	0.00	0.21	0.01	0.22	0.17	0.22	0.19	0.16	0.21	0.13	0.01	0.01	0.01	0.06	0.23	0.22	0.06	0.06
C4	0.01	0.01	0.13	0.17	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.10	0.07	0.01	0.43	0.18	0.17
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.03	0.17	0.04	0.12	0.09	0.15	0.06	0.16	0.02	0.00	0.01	0.05	0.09	0.10	0.02
C5	0.01	0.00	0.06	0.21	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.06	0.04	0.16	0.01	0.59	0.16	0.28
C5'	0.02	0.09	0.08	0.01	0.02	0.01	0.09	0.00	0.06	0.22	0.04	0.14	0.10	0.21	0.07	0.08	0.10	0.01	0.01	0.10	0.08	0.20	0.01
C6	0.01	0.01	0.11	0.22	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.10	0.07	0.09	0.15	0.01	0.61	0.17	0.28
C8	0.01	0.01	0.13	0.17	0.00	0.17	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.29	0.07	0.12	0.24	0.01	0.61	0.12	0.33
N1	0.01	0.00	0.20	0.22	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.06	0.15	0.09	0.02	0.51	0.19	0.20
N2	0.02	0.00	0.32	0.19	0.01	0.12	0.00	0.14	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.27	0.09	0.22	0.05	0.03	0.34	0.22	0.09
N3	0.01	0.01	0.25	0.16	0.00	0.09	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.17	0.08	0.19	0.04	0.02	0.33	0.20	0.10
N7	0.01	0.00	0.07	0.21	0.00	0.15	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.27	0.10	0.07	0.26	0.01	0.71	0.12	0.39
N9	0.00	0.01	0.01	0.13	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.12	0.04	0.01	0.09	0.01	0.40	0.16	0.16
O2'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.03	0.16	0.14	0.08	0.10	0.29	0.06	0.27	0.17	0.27	0.12	0.00	0.04	0.12	0.09	0.15	0.23	0.25	0.16
O3'	0.16	0.06	0.02	0.01	0.03	0.02	0.06	0.10	0.07	0.07	0.06	0.09	0.08	0.10	0.04	0.04	0.00	0.10	0.16	0.10	0.18	0.25	0.10
O4'	0.00	0.19	0.01	0.01	0.10	0.00	0.04	0.01	0.09	0.12	0.15	0.22	0.19	0.07	0.01	0.12	0.10	0.00	0.05	0.07	0.27	0.05	0.08
O5'	0.05	0.04	0.16	0.06	0.07	0.01	0.16	0.01	0.15	0.24	0.09	0.05	0.04	0.26	0.09	0.09	0.16	0.05	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.02	0.08	0.23	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.15	0.10	0.07	0.19	0.00	0.69	0.16	0.34
OP1	0.20	0.39	0.25	0.22	0.43	0.09	0.59	0.08	0.61	0.61	0.51	0.34	0.33	0.71	0.40	0.23	0.18	0.27	0.01	0.69	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.20	0.31	0.06	0.18	0.10	0.16	0.20	0.17	0.12	0.19	0.22	0.20	0.12	0.16	0.25	0.25	0.05	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.13	0.21	0.06	0.17	0.02	0.28	0.01	0.28	0.33	0.20	0.09	0.10	0.39	0.16	0.16	0.10	0.08	0.01	0.34	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.08	0.12	0.05	0.08	0.09	0.15	0.27	0.13	0.04	0.04	0.15	0.27	0.05	0.10	0.07	0.35	0.60	0.48	0.50
C2	0.08	0.08	0.10	0.04	0.05	0.07	0.08	0.18	0.08	0.05	0.06	0.12	0.21	0.04	0.06	0.06	0.24	0.36	0.26	0.29
C2'	0.32	0.30	0.24	0.37	0.41	0.47	0.48	0.65	0.47	0.37	0.33	0.23	0.11	0.32	0.41	0.44	0.70	0.89	0.78	0.82
C3'	0.18	0.17	0.14	0.24	0.24	0.28	0.29	0.41	0.29	0.21	0.19	0.14	0.08	0.23	0.25	0.25	0.46	0.62	0.53	0.56
C4	0.07	0.08	0.10	0.05	0.05	0.08	0.09	0.20	0.09	0.04	0.06	0.13	0.21	0.04	0.06	0.06	0.26	0.42	0.31	0.34
C4'	0.18	0.17	0.20	0.11	0.09	0.10	0.06	0.06	0.07	0.13	0.14	0.22	0.30	0.11	0.08	0.13	0.12	0.29	0.22	0.22
C5	0.08	0.10	0.10	0.05	0.07	0.07	0.07	0.14	0.07	0.06	0.09	0.14	0.17	0.06	0.08	0.06	0.19	0.29	0.20	0.23
C5'	0.20	0.18	0.20	0.14	0.14	0.15	0.12	0.08	0.12	0.16	0.17	0.21	0.27	0.12	0.14	0.17	0.06	0.13	0.09	0.08
C6	0.09	0.11	0.10	0.07	0.10	0.08	0.09	0.10	0.08	0.08	0.12	0.13	0.14	0.07	0.12	0.08	0.13	0.17	0.11	0.13
C8	0.08	0.10	0.11	0.05	0.05	0.07	0.09	0.19	0.08	0.05	0.08	0.15	0.20	0.05	0.06	0.06	0.25	0.40	0.30	0.33
N1	0.09	0.10	0.10	0.06	0.08	0.08	0.07	0.11	0.08	0.07	0.10	0.12	0.15	0.06	0.09	0.08	0.14	0.20	0.12	0.15
N2	0.08	0.07	0.11	0.05	0.06	0.07	0.09	0.20	0.09	0.04	0.05	0.11	0.24	0.06	0.07	0.06	0.26	0.39	0.29	0.32
N3	0.07	0.07	0.11	0.05	0.06	0.08	0.11	0.23	0.10	0.04	0.05	0.13	0.24	0.05	0.07	0.06	0.30	0.48	0.36	0.39
N7	0.08	0.11	0.11	0.05	0.08	0.07	0.08	0.14	0.07	0.07	0.10	0.15	0.17	0.06	0.09	0.06	0.19	0.30	0.20	0.23
N9	0.07	0.08	0.11	0.05	0.06	0.08	0.11	0.23	0.10	0.04	0.06	0.14	0.22	0.04	0.07	0.06	0.30	0.49	0.37	0.40
O2'	0.27	0.23	0.13	0.31	0.40	0.48	0.51	0.74	0.49	0.33	0.27	0.12	0.10	0.22	0.41	0.45	0.80	1.10	0.95	1.00
O3'	0.10	0.11	0.13	0.08	0.07	0.11	0.10	0.23	0.09	0.08	0.09	0.16	0.22	0.08	0.07	0.09	0.27	0.46	0.36	0.39
O4'	0.29	0.28	0.32	0.21	0.18	0.20	0.13	0.08	0.15	0.23	0.24	0.33	0.43	0.22	0.17	0.23	0.07	0.26	0.17	0.17
O5'	0.07	0.07	0.07	0.06	0.05	0.06	0.05	0.07	0.05	0.06	0.06	0.09	0.11	0.06	0.05	0.07	0.10	0.15	0.11	0.12
O6	0.10	0.13	0.11	0.09	0.15	0.09	0.13	0.09	0.12	0.11	0.15	0.14	0.11	0.09	0.17	0.09	0.09	0.10	0.12	0.09
OP1	0.28	0.31	0.31	0.38	0.36	0.32	0.38	0.38	0.37	0.32	0.33	0.29	0.23	0.41	0.37	0.28	0.45	0.54	0.51	0.49
OP2	0.20	0.22	0.22	0.21	0.23	0.18	0.21	0.16	0.19	0.20	0.23	0.22	0.24	0.21	0.25	0.18	0.14	0.13	0.17	0.13
P	0.10	0.10	0.11	0.12	0.08	0.10	0.09	0.11	0.10	0.10	0.09	0.12	0.09	0.14	0.08	0.09	0.14	0.17	0.14	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.04	0.02
C2	0.02	0.00	0.03	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.03	0.05	0.06	0.06	0.05
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.05	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.06	0.05	0.03
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.04	0.04	0.01	0.01	0.07	0.00	0.03	0.07	0.06	0.04
C4	0.01	0.02	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.07	0.00	0.02	0.08	0.09	0.09	0.08
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.04	0.02	0.01
C5	0.01	0.02	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.07	0.01	0.02	0.08	0.09	0.08	0.08
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.06	0.01	0.06	0.00	0.05	0.03	0.04	0.03	0.02	0.02	0.07	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.06	0.01	0.02	0.06	0.06	0.06	0.06
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.05	0.05	0.04
N3	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.03	0.03	0.06	0.01	0.03	0.06	0.07	0.08	0.07
O2	0.03	0.01	0.05	0.04	0.03	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.06	0.04	0.05	0.04	0.05	0.06	0.04
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.06	0.00	0.02	0.03	0.02	0.03	0.07	0.05	0.03
O3'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.07	0.01	0.07	0.02	0.06	0.03	0.06	0.06	0.02	0.00	0.09	0.01	0.04	0.09	0.09	0.06
O4	0.01	0.02	0.03	0.07	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.09	0.00	0.02	0.09	0.11	0.11	0.10
O4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.03	0.05	0.03
O5'	0.02	0.05	0.03	0.03	0.08	0.01	0.08	0.01	0.06	0.04	0.06	0.04	0.03	0.04	0.09	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.06	0.06	0.07	0.09	0.04	0.09	0.04	0.06	0.05	0.07	0.05	0.07	0.09	0.11	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.04	0.06	0.05	0.06	0.09	0.02	0.08	0.02	0.06	0.05	0.08	0.06	0.05	0.09	0.11	0.05	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.02	0.05	0.03	0.04	0.08	0.01	0.08	0.01	0.06	0.04	0.07	0.04	0.03	0.06	0.10	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00