Doublet Group distance statistics: 51581

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.009, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.005, 0.024, 0.044, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.020
N9	A	0, -0.001, 0.019, 0.040, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.019 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.004, 0.027, 0.050, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.027 std_dev=0.023
C5	A	0, 0.001, 0.029, 0.057, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.029 std_dev=0.028
N3	A	0, 0.002, 0.031, 0.060, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.031 std_dev=0.029
C2	A	0, -0.003, 0.029, 0.062, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.029 std_dev=0.032
C8	A	0, 0.008, 0.045, 0.082, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.045 std_dev=0.037
O6	A	0, 0.015, 0.054, 0.092, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.054 std_dev=0.039
C1'	A	0, -0.002, 0.038, 0.078, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.038 std_dev=0.040
N7	A	0, 0.008, 0.049, 0.090, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.049 std_dev=0.041
N2	A	0, -0.010, 0.054, 0.118, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.054 std_dev=0.064
O4'	A	0, 0.029, 0.114, 0.199, 0.203 max_d=0.203 avg_d=0.114 std_dev=0.085
C2'	A	0, 0.014, 0.109, 0.204, 0.231 max_d=0.231 avg_d=0.109 std_dev=0.095
O2'	A	0, 0.045, 0.154, 0.263, 0.235 max_d=0.235 avg_d=0.154 std_dev=0.109
C4'	A	0, 0.060, 0.215, 0.370, 0.360 max_d=0.360 avg_d=0.215 std_dev=0.155
C3'	A	0, 0.008, 0.171, 0.335, 0.392 max_d=0.392 avg_d=0.171 std_dev=0.164
O5'	A	0, 0.073, 0.281, 0.489, 0.498 max_d=0.498 avg_d=0.281 std_dev=0.208
C5'	A	0, 0.096, 0.335, 0.573, 0.538 max_d=0.538 avg_d=0.335 std_dev=0.238
O3'	A	0, 0.030, 0.279, 0.528, 0.605 max_d=0.605 avg_d=0.279 std_dev=0.249
C2'	B	0, 0.108, 0.481, 0.854, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.481 std_dev=0.373
P	A	0, 0.152, 0.529, 0.906, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.529 std_dev=0.377
O2'	B	0, 0.123, 0.578, 1.033, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.578 std_dev=0.455
C3'	B	0, -0.046, 0.714, 1.473, 1.765 max_d=1.765 avg_d=0.714 std_dev=0.759
OP1	A	0, 0.035, 0.841, 1.647, 1.928 max_d=1.928 avg_d=0.841 std_dev=0.806
O5'	B	0, -0.036, 1.034, 2.104, 2.508 max_d=2.508 avg_d=1.034 std_dev=1.070
OP1	B	0, 0.119, 1.190, 2.261, 2.597 max_d=2.597 avg_d=1.190 std_dev=1.071
C4'	B	0, -0.150, 0.929, 2.007, 2.441 max_d=2.441 avg_d=0.929 std_dev=1.078
OP2	A	0, 0.447, 1.532, 2.617, 2.368 max_d=2.368 avg_d=1.532 std_dev=1.085
C5'	B	0, -0.092, 1.121, 2.334, 2.806 max_d=2.806 avg_d=1.121 std_dev=1.213
O4'	B	0, -0.203, 1.019, 2.241, 2.738 max_d=2.738 avg_d=1.019 std_dev=1.222
C1'	B	0, -0.244, 1.168, 2.581, 3.156 max_d=3.156 avg_d=1.168 std_dev=1.413
P	B	0, -0.328, 1.134, 2.596, 3.199 max_d=3.199 avg_d=1.134 std_dev=1.462
O3'	B	0, -0.342, 1.317, 2.977, 3.658 max_d=3.658 avg_d=1.317 std_dev=1.660
OP2	B	0, -0.007, 1.852, 3.712, 4.395 max_d=4.395 avg_d=1.852 std_dev=1.859
N1	B	0, -0.475, 1.871, 4.217, 5.179 max_d=5.179 avg_d=1.871 std_dev=2.346
C6	B	0, -0.515, 2.076, 4.667, 5.729 max_d=5.729 avg_d=2.076 std_dev=2.591
O2	B	0, -0.488, 2.566, 5.621, 6.859 max_d=6.859 avg_d=2.566 std_dev=3.055
C2	B	0, -0.616, 2.568, 5.752, 7.055 max_d=7.055 avg_d=2.568 std_dev=3.184
C5	B	0, -0.773, 2.948, 6.670, 8.198 max_d=8.198 avg_d=2.948 std_dev=3.722
N3	B	0, -0.882, 3.373, 7.629, 9.376 max_d=9.376 avg_d=3.373 std_dev=4.255
C4	B	0, -1.008, 3.624, 8.256, 10.161 max_d=10.161 avg_d=3.624 std_dev=4.632
O4	B	0, -1.254, 4.464, 10.183, 12.536 max_d=12.536 avg_d=4.464 std_dev=5.718

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.08	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.07	0.08	0.02
C2	0.06	0.00	0.04	0.08	0.00	0.04	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.10	0.09	0.07	0.09	0.02	0.13	0.24	0.10
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.10	0.04	0.09	0.08	0.07	0.07	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.08	0.14	0.03
C4	0.03	0.00	0.02	0.07	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.08	0.04	0.08	0.01	0.10	0.22	0.08
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.03	0.02	0.07	0.05	0.05	0.01	0.05	0.02	0.00	0.01	0.05	0.06	0.07	0.01
C5	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.04	0.10	0.02	0.12	0.01	0.14	0.32	0.13
C5'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.08	0.06	0.05	0.03	0.02	0.09	0.02	0.05	0.01	0.00	0.00	0.11	0.07	0.09	0.01
C6	0.02	0.02	0.02	0.10	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.06	0.12	0.02	0.15	0.00	0.19	0.37	0.17
C8	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.09	0.03	0.09	0.26	0.09
N1	0.04	0.01	0.03	0.09	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.09	0.11	0.05	0.12	0.01	0.17	0.32	0.14
N2	0.08	0.00	0.05	0.08	0.00	0.07	0.03	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.13	0.09	0.10	0.07	0.03	0.12	0.22	0.08
N3	0.06	0.00	0.04	0.07	0.00	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.07	0.08	0.06	0.02	0.09	0.18	0.06
N7	0.01	0.03	0.01	0.07	0.02	0.05	0.01	0.09	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.02	0.09	0.02	0.13	0.03	0.14	0.35	0.14
N9	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.06	0.01	0.08	0.18	0.06
O2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.05	0.04	0.05	0.06	0.02	0.09	0.13	0.09	0.02	0.02	0.00	0.05	0.05	0.03	0.05	0.08	0.09	0.04
O3'	0.02	0.09	0.02	0.00	0.08	0.02	0.10	0.01	0.12	0.05	0.11	0.09	0.07	0.09	0.04	0.05	0.00	0.02	0.02	0.14	0.14	0.27	0.07
O4'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.05	0.10	0.08	0.02	0.02	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.11	0.06	0.00
O5'	0.03	0.09	0.01	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.15	0.09	0.12	0.07	0.06	0.13	0.06	0.03	0.02	0.03	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01
O6	0.01	0.02	0.01	0.11	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.05	0.14	0.01	0.18	0.00	0.23	0.45	0.22
OP1	0.07	0.13	0.05	0.08	0.10	0.06	0.14	0.07	0.19	0.09	0.17	0.12	0.09	0.14	0.08	0.08	0.14	0.11	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.24	0.04	0.14	0.22	0.07	0.32	0.09	0.37	0.26	0.32	0.22	0.18	0.35	0.18	0.09	0.27	0.06	0.00	0.45	0.01	0.00	0.01
P	0.02	0.10	0.00	0.03	0.08	0.01	0.13	0.01	0.17	0.09	0.14	0.08	0.06	0.14	0.06	0.04	0.07	0.00	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.76	0.38	0.13	0.04	0.37	0.78	0.48	0.33	0.16	0.31	0.11	0.70	0.24	0.26	0.58	1.09	0.80	0.94	1.73	1.23
C2	0.83	0.70	0.08	0.16	0.13	0.58	0.13	0.09	0.06	0.51	0.46	1.02	0.31	0.02	0.10	0.97	0.79	0.42	1.40	0.90
C2'	0.93	0.65	0.07	0.01	0.05	0.81	0.10	0.34	0.17	0.57	0.39	0.91	0.33	0.26	0.13	1.24	0.76	1.01	1.64	1.22
C3'	1.03	0.82	0.10	0.03	0.25	0.83	0.11	0.33	0.34	0.72	0.59	1.07	0.38	0.25	0.10	1.30	0.74	1.03	1.58	1.20
C4	0.90	0.74	0.06	0.13	0.13	0.67	0.09	0.18	0.12	0.57	0.49	1.05	0.31	0.06	0.09	1.10	0.83	0.69	1.59	1.08
C4'	0.83	0.46	0.10	0.02	0.26	0.81	0.36	0.36	0.03	0.40	0.16	0.76	0.26	0.28	0.48	1.16	0.76	1.03	1.66	1.24
C5	0.97	0.99	0.10	0.21	0.44	0.57	0.19	0.09	0.32	0.75	0.81	1.31	0.34	0.12	0.37	1.08	0.84	0.64	1.53	1.03
C5'	0.90	0.60	0.06	0.01	0.09	0.81	0.21	0.34	0.10	0.51	0.30	0.90	0.28	0.24	0.30	1.21	0.76	1.01	1.63	1.23
C6	0.95	1.13	0.13	0.29	0.64	0.44	0.34	0.09	0.41	0.83	0.99	1.45	0.34	0.28	0.60	0.98	0.84	0.49	1.40	0.92
C8	0.95	0.85	0.07	0.15	0.25	0.67	0.03	0.17	0.23	0.66	0.63	1.17	0.31	0.04	0.14	1.14	0.85	0.85	1.65	1.16
N1	0.88	1.00	0.12	0.28	0.48	0.43	0.21	0.08	0.29	0.72	0.83	1.32	0.33	0.24	0.43	0.91	0.82	0.38	1.33	0.85
N2	0.71	0.49	0.08	0.11	0.13	0.59	0.30	0.10	0.14	0.33	0.25	0.81	0.30	0.10	0.22	0.86	0.73	0.22	1.24	0.76
N3	0.82	0.56	0.06	0.07	0.12	0.72	0.28	0.22	0.04	0.43	0.28	0.87	0.29	0.16	0.26	1.07	0.79	0.59	1.55	1.02
N7	1.00	1.04	0.10	0.21	0.50	0.59	0.24	0.11	0.37	0.80	0.87	1.36	0.34	0.12	0.42	1.12	0.86	0.74	1.58	1.09
N9	0.88	0.66	0.06	0.10	0.05	0.72	0.18	0.23	0.07	0.52	0.39	0.97	0.29	0.12	0.18	1.13	0.83	0.84	1.67	1.17
O2'	0.67	0.25	0.19	0.03	0.45	0.75	0.54	0.34	0.21	0.22	0.13	0.51	0.21	0.31	0.66	1.04	0.78	1.15	1.74	1.33
O3'	1.06	0.87	0.11	0.06	0.37	0.81	0.24	0.33	0.44	0.78	0.68	1.09	0.39	0.26	0.23	1.32	0.70	1.08	1.48	1.19
O4'	0.71	0.29	0.16	0.05	0.50	0.78	0.60	0.34	0.24	0.23	0.13	0.62	0.21	0.26	0.75	1.06	0.79	0.97	1.73	1.25
O5'	1.07	0.92	0.10	0.04	0.32	0.81	0.17	0.30	0.37	0.77	0.69	1.21	0.38	0.17	0.17	1.30	0.77	0.95	1.60	1.18
O6	0.96	1.30	0.16	0.36	0.88	0.33	0.54	0.17	0.54	0.93	1.23	1.63	0.34	0.43	0.89	0.92	0.85	0.45	1.34	0.87
OP1	1.17	1.10	0.18	0.07	0.59	0.84	0.44	0.34	0.58	0.93	0.91	1.37	0.44	0.18	0.48	1.39	0.73	0.94	1.51	1.14
OP2	1.19	1.24	0.22	0.18	0.76	0.76	0.52	0.25	0.65	1.02	1.10	1.52	0.42	0.20	0.68	1.35	0.77	0.83	1.50	1.08
P	1.11	1.02	0.13	0.07	0.45	0.79	0.27	0.29	0.46	0.85	0.81	1.31	0.38	0.14	0.32	1.32	0.76	0.91	1.57	1.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.00	0.01	0.02	0.08	0.03	0.24	0.01	0.01	0.27	1.10	0.18	0.29
C2	0.04	0.00	0.22	0.23	0.01	0.00	0.02	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.00	0.13	0.18	1.60	0.27	0.50
C2'	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.19	0.24	0.01	0.15	0.38	0.00	0.02	0.01	0.02	0.39	0.73	0.39	0.13
C3'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.21	0.01	0.10	0.03	0.04	0.12	0.26	0.24	0.02	0.01	0.23	0.02	0.02	0.62	0.08	0.27
C4	0.01	0.01	0.01	0.21	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.00	0.00	0.01	0.28	0.02	0.01	0.01	0.20	1.74	0.32	0.54
C4'	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.02	0.03	0.01	0.03	0.05	0.23	0.02	0.06	0.00	0.04	0.45	0.29	0.20
C5	0.01	0.02	0.19	0.10	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01	0.39	0.06	0.03	0.07	0.31	1.59	0.28	0.41
C5'	0.09	0.09	0.19	0.03	0.05	0.02	0.07	0.00	0.10	0.10	0.06	0.11	0.05	0.18	0.03	0.03	0.01	0.10	0.32	0.01
C6	0.00	0.01	0.24	0.04	0.02	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.03	0.01	0.35	0.10	0.03	0.11	0.39	1.46	0.23	0.32
N1	0.01	0.00	0.01	0.12	0.00	0.01	0.02	0.10	0.00	0.00	0.01	0.02	0.15	0.11	0.00	0.02	0.28	1.46	0.23	0.39
N3	0.02	0.00	0.15	0.26	0.00	0.03	0.01	0.06	0.03	0.01	0.00	0.01	0.13	0.01	0.00	0.09	0.15	1.75	0.32	0.58
O2	0.08	0.00	0.38	0.24	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.00	0.20	0.09	0.01	0.23	0.14	1.50	0.26	0.49
O2'	0.03	0.02	0.00	0.02	0.28	0.23	0.39	0.05	0.35	0.15	0.13	0.20	0.00	0.04	0.30	0.14	0.28	0.68	0.40	0.11
O3'	0.24	0.05	0.02	0.01	0.02	0.02	0.06	0.18	0.10	0.11	0.01	0.09	0.04	0.00	0.04	0.16	0.30	0.58	0.22	0.40
O4	0.01	0.00	0.01	0.23	0.01	0.06	0.03	0.03	0.03	0.00	0.00	0.01	0.30	0.04	0.00	0.01	0.16	1.76	0.34	0.58
O4'	0.01	0.13	0.02	0.02	0.01	0.00	0.07	0.03	0.11	0.02	0.09	0.23	0.14	0.16	0.01	0.00	0.15	0.96	0.43	0.35
O5'	0.27	0.18	0.39	0.02	0.20	0.04	0.31	0.01	0.39	0.28	0.15	0.14	0.28	0.30	0.16	0.15	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	1.10	1.60	0.73	0.62	1.74	0.45	1.59	0.10	1.46	1.46	1.75	1.50	0.68	0.58	1.76	0.96	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.27	0.39	0.08	0.32	0.29	0.28	0.32	0.23	0.23	0.32	0.26	0.40	0.22	0.34	0.43	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.29	0.50	0.13	0.27	0.54	0.20	0.41	0.01	0.32	0.39	0.58	0.49	0.11	0.40	0.58	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00