Doublet Group distance statistics: 51584

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C2	A	0, 0.000, 0.026, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.026 std_dev=0.026
C1'	A	0, 0.000, 0.026, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.026
C5	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
C4	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.029
N3	A	0, 0.000, 0.031, 0.063, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.031 std_dev=0.031
N9	A	0, 0.000, 0.034, 0.069, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.034 std_dev=0.034
N7	A	0, 0.000, 0.036, 0.071, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.036 std_dev=0.036
C8	A	0, 0.000, 0.038, 0.076, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.038 std_dev=0.038
N2	A	0, 0.000, 0.049, 0.099, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.049 std_dev=0.049
O6	A	0, 0.000, 0.052, 0.105, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.052 std_dev=0.052
O2	B	0, 0.000, 0.241, 0.481, 0.481 max_d=0.481 avg_d=0.241 std_dev=0.241
C2	B	0, 0.000, 0.284, 0.567, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.284 std_dev=0.284
N1	B	0, 0.000, 0.314, 0.628, 0.628 max_d=0.628 avg_d=0.314 std_dev=0.314
C1'	B	0, 0.000, 0.373, 0.746, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.373 std_dev=0.373
O4'	B	0, 0.000, 0.395, 0.790, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.395 std_dev=0.395
O4'	A	0, 0.000, 0.559, 1.118, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.559 std_dev=0.559
N3	B	0, 0.000, 0.563, 1.126, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.563 std_dev=0.563
C6	B	0, 0.000, 0.570, 1.140, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.570 std_dev=0.570
C2'	A	0, 0.000, 0.645, 1.291, 1.291 max_d=1.291 avg_d=0.645 std_dev=0.645
C5	B	0, 0.000, 0.721, 1.441, 1.441 max_d=1.441 avg_d=0.721 std_dev=0.721
C2'	B	0, 0.000, 0.723, 1.446, 1.446 max_d=1.446 avg_d=0.723 std_dev=0.723
C4	B	0, 0.000, 0.729, 1.459, 1.459 max_d=1.459 avg_d=0.729 std_dev=0.729
O2'	B	0, 0.000, 0.758, 1.516, 1.516 max_d=1.516 avg_d=0.758 std_dev=0.758
C4'	B	0, 0.000, 0.780, 1.560, 1.560 max_d=1.560 avg_d=0.780 std_dev=0.780
O5'	B	0, 0.000, 0.871, 1.742, 1.742 max_d=1.742 avg_d=0.871 std_dev=0.871
O4	B	0, 0.000, 0.894, 1.787, 1.787 max_d=1.787 avg_d=0.894 std_dev=0.894
O2'	A	0, 0.000, 0.909, 1.819, 1.819 max_d=1.819 avg_d=0.909 std_dev=0.909
C4'	A	0, 0.000, 0.966, 1.931, 1.931 max_d=1.931 avg_d=0.966 std_dev=0.966
C5'	B	0, 0.000, 0.991, 1.982, 1.982 max_d=1.982 avg_d=0.991 std_dev=0.991
C3'	B	0, 0.000, 1.019, 2.037, 2.037 max_d=2.037 avg_d=1.019 std_dev=1.019
C3'	A	0, 0.000, 1.044, 2.088, 2.088 max_d=2.088 avg_d=1.044 std_dev=1.044
C5'	A	0, 0.000, 1.121, 2.243, 2.243 max_d=2.243 avg_d=1.121 std_dev=1.121
O3'	B	0, 0.000, 1.216, 2.432, 2.432 max_d=2.432 avg_d=1.216 std_dev=1.216
OP1	A	0, 0.000, 1.488, 2.975, 2.975 max_d=2.975 avg_d=1.488 std_dev=1.488
O5'	A	0, 0.000, 1.496, 2.992, 2.992 max_d=2.992 avg_d=1.496 std_dev=1.496
P	A	0, 0.000, 1.499, 2.998, 2.998 max_d=2.998 avg_d=1.499 std_dev=1.499
OP2	A	0, 0.000, 1.520, 3.041, 3.041 max_d=3.041 avg_d=1.520 std_dev=1.520
O3'	A	0, 0.000, 1.585, 3.169, 3.169 max_d=3.169 avg_d=1.585 std_dev=1.585
P	B	0, 0.000, 1.610, 3.220, 3.220 max_d=3.220 avg_d=1.610 std_dev=1.610
OP1	B	0, 0.000, 2.146, 4.292, 4.292 max_d=4.292 avg_d=2.146 std_dev=2.146
OP2	B	0, 0.000, 2.215, 4.430, 4.430 max_d=4.430 avg_d=2.215 std_dev=2.215

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.00	0.03	0.02	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.27	0.00	0.20	0.02	0.01	0.18	0.04
C2	0.03	0.00	0.33	0.35	0.00	0.08	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.06	0.09	0.55	0.01	0.32	0.34	0.43
C2'	0.00	0.33	0.00	0.01	0.17	0.01	0.08	0.21	0.14	0.15	0.26	0.40	0.33	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01	0.17	0.09	0.44	0.57	0.39
C3'	0.00	0.35	0.01	0.00	0.29	0.00	0.32	0.03	0.37	0.19	0.39	0.35	0.30	0.27	0.20	0.01	0.00	0.01	0.12	0.37	0.19	0.27	0.20
C4	0.01	0.00	0.17	0.29	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.02	0.06	0.56	0.01	0.31	0.27	0.41
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.08	0.05	0.09	0.08	0.08	0.07	0.06	0.22	0.02	0.01	0.03	0.07	0.09	0.28	0.07
C5	0.01	0.01	0.08	0.32	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.11	0.06	0.69	0.01	0.45	0.45	0.57
C5'	0.08	0.03	0.21	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.04	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.14	0.01	0.02	0.02	0.28	0.36	0.03
C6	0.00	0.01	0.14	0.37	0.00	0.08	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.17	0.08	0.72	0.00	0.51	0.55	0.62
C8	0.03	0.01	0.15	0.19	0.00	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.28	0.04	0.01	0.66	0.03	0.38	0.26	0.48
N1	0.02	0.00	0.26	0.39	0.00	0.09	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.14	0.09	0.66	0.00	0.44	0.48	0.55
N2	0.04	0.00	0.40	0.35	0.01	0.08	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.13	0.04	0.10	0.50	0.01	0.28	0.31	0.39
N3	0.03	0.00	0.33	0.30	0.00	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.02	0.08	0.48	0.01	0.24	0.23	0.34
N7	0.02	0.01	0.07	0.27	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.29	0.13	0.02	0.74	0.03	0.51	0.48	0.63
N9	0.00	0.00	0.01	0.20	0.00	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.16	0.05	0.01	0.50	0.02	0.24	0.12	0.32
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.10	0.22	0.21	0.00	0.18	0.28	0.07	0.13	0.05	0.29	0.16	0.00	0.04	0.16	0.14	0.23	0.51	0.63	0.41
O3'	0.27	0.06	0.02	0.00	0.02	0.02	0.11	0.14	0.17	0.04	0.14	0.04	0.02	0.13	0.05	0.04	0.00	0.20	0.04	0.21	0.07	0.07	0.02
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.09	0.10	0.08	0.02	0.01	0.16	0.20	0.00	0.28	0.09	0.23	0.10	0.18
O5'	0.20	0.55	0.17	0.12	0.56	0.03	0.69	0.02	0.72	0.66	0.66	0.50	0.48	0.74	0.50	0.14	0.04	0.28	0.00	0.76	0.01	0.00	0.01
O6	0.02	0.01	0.09	0.37	0.01	0.07	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.23	0.21	0.09	0.76	0.00	0.58	0.64	0.69
OP1	0.01	0.32	0.44	0.19	0.31	0.09	0.45	0.28	0.51	0.38	0.44	0.28	0.24	0.51	0.24	0.51	0.07	0.23	0.01	0.58	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.34	0.57	0.27	0.27	0.28	0.45	0.36	0.55	0.26	0.48	0.31	0.23	0.48	0.12	0.63	0.07	0.10	0.00	0.64	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.43	0.39	0.20	0.41	0.07	0.57	0.03	0.62	0.48	0.55	0.39	0.34	0.63	0.32	0.41	0.02	0.18	0.01	0.69	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.18	0.16	0.30	0.43	0.18	0.33	0.03	0.19	0.11	0.38	0.07	0.28	0.56	0.50	0.05	0.18	0.21	0.75	0.35
C2	0.10	0.12	0.12	0.20	0.21	0.10	0.16	0.04	0.08	0.05	0.21	0.08	0.21	0.41	0.22	0.03	0.08	0.31	0.86	0.43
C2'	0.43	0.05	0.50	0.70	0.26	0.58	0.11	0.42	0.08	0.17	0.20	0.16	0.60	0.99	0.40	0.42	0.47	0.03	0.58	0.11
C3'	0.27	0.06	0.30	0.50	0.25	0.46	0.11	0.35	0.04	0.07	0.25	0.02	0.32	0.73	0.34	0.33	0.43	0.04	0.53	0.10
C4	0.05	0.17	0.07	0.17	0.37	0.07	0.30	0.09	0.19	0.12	0.33	0.06	0.18	0.41	0.41	0.00	0.11	0.32	0.82	0.41
C4'	0.06	0.37	0.04	0.16	0.61	0.12	0.48	0.00	0.34	0.27	0.57	0.28	0.01	0.42	0.70	0.00	0.16	0.20	0.75	0.34
C5	0.01	0.14	0.01	0.06	0.38	0.01	0.33	0.19	0.23	0.13	0.30	0.01	0.10	0.30	0.43	0.05	0.09	0.39	0.84	0.42
C5'	0.13	0.43	0.14	0.06	0.70	0.03	0.59	0.10	0.43	0.34	0.64	0.32	0.10	0.33	0.81	0.07	0.10	0.30	0.82	0.40
C6	0.00	0.08	0.05	0.00	0.29	0.06	0.28	0.24	0.19	0.11	0.19	0.02	0.05	0.22	0.29	0.06	0.06	0.44	0.87	0.43
C8	0.01	0.17	0.01	0.11	0.46	0.02	0.40	0.16	0.27	0.16	0.36	0.02	0.13	0.37	0.55	0.04	0.11	0.36	0.81	0.40
N1	0.04	0.07	0.01	0.06	0.19	0.01	0.17	0.17	0.12	0.07	0.15	0.01	0.10	0.26	0.18	0.03	0.05	0.40	0.90	0.45
N2	0.15	0.09	0.19	0.28	0.12	0.18	0.06	0.06	0.00	0.00	0.15	0.12	0.26	0.46	0.12	0.09	0.07	0.26	0.85	0.44
N3	0.09	0.16	0.14	0.25	0.30	0.13	0.22	0.01	0.13	0.08	0.29	0.10	0.25	0.48	0.32	0.03	0.11	0.27	0.82	0.41
N7	0.02	0.14	0.04	0.04	0.44	0.04	0.39	0.22	0.27	0.16	0.31	0.00	0.07	0.29	0.52	0.06	0.09	0.41	0.82	0.41
N9	0.04	0.18	0.08	0.19	0.43	0.09	0.35	0.07	0.22	0.13	0.37	0.06	0.20	0.45	0.49	0.00	0.13	0.30	0.80	0.39
O2'	0.34	0.03	0.49	0.67	0.37	0.46	0.24	0.27	0.05	0.07	0.28	0.10	0.66	1.00	0.50	0.26	0.23	0.24	0.87	0.41
O3'	0.10	0.43	0.07	0.14	0.52	0.14	0.38	0.08	0.27	0.28	0.57	0.45	0.09	0.35	0.58	0.00	0.10	0.23	0.82	0.40
O4'	0.19	0.45	0.15	0.01	0.69	0.06	0.59	0.20	0.46	0.38	0.64	0.34	0.06	0.27	0.76	0.17	0.01	0.34	0.85	0.47
O5'	0.44	0.22	0.42	0.57	0.06	0.55	0.16	0.45	0.26	0.30	0.08	0.26	0.44	0.77	0.02	0.48	0.67	0.24	0.21	0.18
O6	0.03	0.03	0.11	0.08	0.23	0.12	0.27	0.31	0.20	0.10	0.10	0.06	0.02	0.13	0.23	0.08	0.04	0.49	0.85	0.42
OP1	0.30	0.10	0.29	0.43	0.04	0.39	0.05	0.28	0.14	0.17	0.02	0.14	0.34	0.64	0.10	0.32	0.45	0.06	0.48	0.09
OP2	0.31	0.13	0.27	0.40	0.02	0.39	0.08	0.28	0.17	0.19	0.01	0.16	0.30	0.60	0.08	0.35	0.54	0.05	0.34	0.05
P	0.38	0.19	0.36	0.49	0.04	0.47	0.12	0.35	0.22	0.25	0.06	0.23	0.39	0.69	0.03	0.41	0.59	0.11	0.30	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.42	0.37	0.07	0.19
C2	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.11	0.01	0.04	0.49	0.31	0.02	0.22
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.11	0.02	0.01	0.08	0.01	0.01	0.06	0.00	0.51	0.63	0.23	0.41
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.01	0.07	0.00	0.01	0.05	0.01	0.20	0.47	0.02	0.17
C4	0.00	0.00	0.04	0.04	0.00	0.02	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.00	0.01	0.63	0.40	0.24	0.44
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.03	0.00	0.01	0.18	0.36	0.09
C5	0.02	0.02	0.11	0.09	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.03	0.12	0.03	0.02	0.02	0.68	0.48	0.39	0.56
C5'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.00	0.05	0.04	0.07	0.07	0.01	0.02	0.10	0.00	0.00	0.25	0.34	0.01
C6	0.02	0.02	0.11	0.09	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.04	0.13	0.03	0.01	0.04	0.69	0.51	0.31	0.53
N1	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.55	0.39	0.06	0.31
N3	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.09	0.02	0.02	0.56	0.33	0.08	0.30
O2	0.01	0.01	0.08	0.07	0.00	0.03	0.03	0.07	0.04	0.03	0.00	0.00	0.18	0.15	0.02	0.09	0.37	0.22	0.17	0.07
O2'	0.00	0.09	0.01	0.00	0.03	0.00	0.12	0.01	0.13	0.00	0.06	0.18	0.00	0.01	0.04	0.00	0.50	0.69	0.32	0.44
O3'	0.06	0.11	0.01	0.01	0.04	0.03	0.03	0.02	0.03	0.05	0.09	0.15	0.01	0.00	0.04	0.05	0.04	0.31	0.15	0.00
O4	0.00	0.01	0.06	0.05	0.00	0.03	0.02	0.10	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.04	0.00	0.01	0.62	0.36	0.26	0.44
O4'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.02	0.09	0.00	0.05	0.01	0.00	0.22	0.14	0.38	0.05
O5'	0.42	0.49	0.51	0.20	0.63	0.01	0.68	0.00	0.69	0.55	0.56	0.37	0.50	0.04	0.62	0.22	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.37	0.31	0.63	0.47	0.40	0.18	0.48	0.25	0.51	0.39	0.33	0.22	0.69	0.31	0.36	0.14	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.07	0.02	0.23	0.02	0.24	0.36	0.39	0.34	0.31	0.06	0.08	0.17	0.32	0.15	0.26	0.38	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.19	0.22	0.41	0.17	0.44	0.09	0.56	0.01	0.53	0.31	0.30	0.07	0.44	0.00	0.44	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00