Doublet Group distance statistics: 51585

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N7	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
O6	A	0, 0.000, 0.031, 0.061, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.031 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.000, 0.034, 0.067, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.034 std_dev=0.034
N1	A	0, 0.000, 0.035, 0.069, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.035 std_dev=0.035
C2	A	0, 0.000, 0.038, 0.077, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.038 std_dev=0.038
C4	A	0, 0.000, 0.038, 0.077, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.038 std_dev=0.038
N3	A	0, 0.000, 0.043, 0.086, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.043 std_dev=0.043
N9	A	0, 0.000, 0.051, 0.102, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.051 std_dev=0.051
C1'	A	0, 0.000, 0.060, 0.121, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.060 std_dev=0.060
N2	A	0, 0.000, 0.102, 0.205, 0.205 max_d=0.205 avg_d=0.102 std_dev=0.102
C2'	B	0, 0.000, 0.110, 0.220, 0.220 max_d=0.220 avg_d=0.110 std_dev=0.110
O4'	A	0, 0.000, 0.182, 0.364, 0.364 max_d=0.364 avg_d=0.182 std_dev=0.182
O5'	A	0, 0.000, 0.268, 0.536, 0.536 max_d=0.536 avg_d=0.268 std_dev=0.268
C2'	A	0, 0.000, 0.270, 0.539, 0.539 max_d=0.539 avg_d=0.270 std_dev=0.270
C4'	A	0, 0.000, 0.365, 0.729, 0.729 max_d=0.729 avg_d=0.365 std_dev=0.365
C1'	B	0, 0.000, 0.365, 0.730, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.365 std_dev=0.365
C3'	A	0, 0.000, 0.368, 0.735, 0.735 max_d=0.735 avg_d=0.368 std_dev=0.368
O2'	A	0, 0.000, 0.368, 0.737, 0.737 max_d=0.737 avg_d=0.368 std_dev=0.368
OP2	A	0, 0.000, 0.469, 0.937, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.469 std_dev=0.469
P	A	0, 0.000, 0.496, 0.992, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.496 std_dev=0.496
C5'	A	0, 0.000, 0.552, 1.104, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.552 std_dev=0.552
O3'	A	0, 0.000, 0.588, 1.177, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.588 std_dev=0.588
O2'	B	0, 0.000, 0.634, 1.269, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.634 std_dev=0.634
OP1	A	0, 0.000, 0.701, 1.402, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.701 std_dev=0.701
C3'	B	0, 0.000, 0.776, 1.551, 1.551 max_d=1.551 avg_d=0.776 std_dev=0.776
N1	B	0, 0.000, 0.833, 1.667, 1.667 max_d=1.667 avg_d=0.833 std_dev=0.833
O3'	B	0, 0.000, 0.959, 1.917, 1.917 max_d=1.917 avg_d=0.959 std_dev=0.959
O4'	B	0, 0.000, 1.104, 2.209, 2.209 max_d=2.209 avg_d=1.104 std_dev=1.104
C6	B	0, 0.000, 1.549, 3.097, 3.097 max_d=3.097 avg_d=1.549 std_dev=1.549
C4'	B	0, 0.000, 1.739, 3.478, 3.478 max_d=3.478 avg_d=1.739 std_dev=1.739
C2	B	0, 0.000, 1.918, 3.835, 3.835 max_d=3.835 avg_d=1.918 std_dev=1.918
C5	B	0, 0.000, 2.360, 4.721, 4.721 max_d=4.721 avg_d=2.360 std_dev=2.360
N3	B	0, 0.000, 2.584, 5.168, 5.168 max_d=5.168 avg_d=2.584 std_dev=2.584
O2	B	0, 0.000, 2.658, 5.315, 5.315 max_d=5.315 avg_d=2.658 std_dev=2.658
C4	B	0, 0.000, 2.697, 5.395, 5.395 max_d=5.395 avg_d=2.697 std_dev=2.697
C5'	B	0, 0.000, 2.770, 5.541, 5.541 max_d=5.541 avg_d=2.770 std_dev=2.770
O5'	B	0, 0.000, 2.894, 5.788, 5.788 max_d=5.788 avg_d=2.894 std_dev=2.894
O4	B	0, 0.000, 3.548, 7.096, 7.096 max_d=7.096 avg_d=3.548 std_dev=3.548
OP1	B	0, 0.000, 3.773, 7.547, 7.547 max_d=7.547 avg_d=3.773 std_dev=3.773
P	B	0, 0.000, 3.854, 7.708, 7.708 max_d=7.708 avg_d=3.854 std_dev=3.854
OP2	B	0, 0.000, 4.893, 9.787, 9.787 max_d=9.787 avg_d=4.893 std_dev=4.893

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.06	0.09	0.07	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.05	0.09	0.01	0.04
C2	0.07	0.00	0.19	0.15	0.00	0.09	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.23	0.22	0.03	0.05	0.00	0.05	0.12	0.04
C2'	0.00	0.19	0.00	0.01	0.10	0.02	0.08	0.02	0.12	0.03	0.16	0.23	0.18	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.11	0.05	0.06	0.02
C3'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.07	0.01	0.03	0.01	0.07	0.08	0.12	0.21	0.15	0.04	0.00	0.02	0.01	0.01	0.08	0.06	0.02	0.09	0.06
C4	0.03	0.00	0.10	0.07	0.00	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.11	0.10	0.01	0.04	0.04	0.03	0.08	0.03
C4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.08	0.06	0.14	0.10	0.06	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.00	0.01
C5	0.03	0.00	0.08	0.03	0.02	0.01	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.06	0.00	0.01	0.02	0.05	0.16	0.11
C5'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.00	0.06	0.12	0.01	0.08	0.05	0.13	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.08	0.10	0.01	0.02
C6	0.05	0.00	0.12	0.07	0.03	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.15	0.11	0.01	0.01	0.00	0.06	0.20	0.13
C8	0.01	0.00	0.03	0.08	0.01	0.08	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.02	0.02	0.02	0.04	0.09	0.08
N1	0.06	0.00	0.16	0.12	0.02	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.20	0.18	0.02	0.02	0.00	0.01	0.17	0.09
N2	0.09	0.00	0.23	0.21	0.00	0.14	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.29	0.30	0.06	0.08	0.02	0.09	0.10	0.01
N3	0.07	0.01	0.18	0.15	0.00	0.10	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.20	0.21	0.04	0.08	0.03	0.09	0.06	0.01
N7	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.06	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.04	0.02	0.06	0.02	0.10	0.19	0.16
N9	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.04	0.05	0.04	0.01
O2'	0.00	0.23	0.01	0.02	0.11	0.02	0.09	0.03	0.15	0.02	0.20	0.29	0.20	0.03	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.14	0.07	0.03	0.01
O3'	0.03	0.22	0.03	0.01	0.10	0.02	0.06	0.02	0.11	0.08	0.18	0.30	0.21	0.04	0.01	0.05	0.00	0.02	0.14	0.09	0.03	0.14	0.11
O4'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.06	0.04	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.12	0.01	0.14	0.08	0.10
O5'	0.06	0.05	0.02	0.08	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.08	0.08	0.06	0.04	0.01	0.14	0.12	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01
O6	0.05	0.00	0.11	0.06	0.04	0.01	0.02	0.08	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.04	0.14	0.09	0.01	0.03	0.00	0.10	0.23	0.16
OP1	0.09	0.05	0.05	0.02	0.03	0.08	0.05	0.10	0.06	0.04	0.01	0.09	0.09	0.10	0.05	0.07	0.03	0.14	0.02	0.10	0.00	0.02	0.01
OP2	0.01	0.12	0.06	0.09	0.08	0.00	0.16	0.01	0.20	0.09	0.17	0.10	0.06	0.19	0.04	0.03	0.14	0.08	0.02	0.23	0.02	0.00	0.01
P	0.04	0.04	0.02	0.06	0.03	0.01	0.11	0.02	0.13	0.08	0.09	0.01	0.01	0.16	0.01	0.01	0.11	0.10	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	1.10	0.04	0.43	1.76	0.95	1.17	0.99	0.59	0.55	1.68	1.04	0.04	0.37	2.24	0.71	0.34	0.97	0.29	0.45
C2	0.16	0.75	0.00	0.31	1.48	0.73	1.32	0.54	0.86	0.56	1.21	0.46	0.08	0.34	1.69	0.60	0.11	0.41	0.43	0.10
C2'	0.25	1.07	0.17	0.57	1.60	1.06	0.87	1.17	0.31	0.40	1.65	1.12	0.14	0.43	2.10	0.83	0.58	1.34	0.69	0.78
C3'	0.29	1.00	0.18	0.55	1.60	1.02	0.87	1.11	0.28	0.35	1.60	1.03	0.17	0.42	2.15	0.82	0.51	1.32	0.60	0.71
C4	0.14	0.92	0.01	0.30	1.80	0.73	1.44	0.59	0.84	0.58	1.51	0.67	0.08	0.32	2.20	0.58	0.10	0.49	0.39	0.07
C4'	0.23	1.03	0.11	0.51	1.67	1.03	1.00	1.12	0.40	0.43	1.63	1.04	0.09	0.42	2.22	0.80	0.48	1.20	0.52	0.64
C5	0.19	0.72	0.01	0.24	1.80	0.59	1.59	0.32	0.95	0.53	1.33	0.35	0.18	0.32	2.22	0.50	0.39	0.17	0.88	0.44
C5'	0.22	1.00	0.07	0.45	1.72	0.94	1.09	0.98	0.48	0.44	1.61	0.95	0.07	0.38	2.29	0.75	0.31	1.04	0.28	0.45
C6	0.23	0.48	0.03	0.20	1.62	0.47	1.63	0.10	1.03	0.47	1.05	0.02	0.25	0.32	1.95	0.43	0.61	0.11	1.24	0.72
C8	0.15	0.91	0.00	0.28	1.90	0.68	1.50	0.51	0.85	0.57	1.56	0.65	0.12	0.31	2.44	0.54	0.20	0.41	0.55	0.20
N1	0.22	0.48	0.03	0.22	1.46	0.53	1.51	0.20	1.01	0.48	0.98	0.05	0.23	0.34	1.68	0.47	0.49	0.01	1.02	0.55
N2	0.11	0.71	0.03	0.34	1.18	0.82	1.05	0.68	0.74	0.54	1.02	0.49	0.04	0.35	1.30	0.64	0.07	0.53	0.16	0.11
N3	0.11	0.97	0.02	0.33	1.65	0.82	1.29	0.73	0.77	0.60	1.47	0.78	0.01	0.32	1.94	0.63	0.07	0.65	0.12	0.14
N7	0.19	0.73	0.02	0.24	1.85	0.58	1.59	0.31	0.93	0.52	1.37	0.38	0.19	0.32	2.36	0.49	0.42	0.15	0.92	0.48
N9	0.12	1.02	0.01	0.33	1.87	0.78	1.39	0.69	0.78	0.59	1.63	0.83	0.06	0.32	2.35	0.60	0.01	0.63	0.21	0.06
O2'	0.27	1.08	0.22	0.67	1.43	1.22	0.65	1.46	0.14	0.34	1.60	1.24	0.13	0.50	1.88	0.93	0.91	1.64	1.18	1.16
O3'	0.38	0.93	0.28	0.67	1.39	1.12	0.58	1.28	0.04	0.21	1.50	1.06	0.24	0.49	1.95	0.91	0.75	1.63	0.97	1.01
O4'	0.15	1.07	0.02	0.42	1.77	0.94	1.18	0.99	0.59	0.53	1.66	1.01	0.02	0.36	2.28	0.72	0.32	0.95	0.26	0.43
O5'	0.19	0.98	0.05	0.37	1.83	0.80	1.25	0.73	0.61	0.49	1.62	0.86	0.12	0.34	2.44	0.63	0.05	0.77	0.12	0.13
O6	0.25	0.26	0.04	0.13	1.49	0.32	1.65	0.14	1.07	0.39	0.82	0.28	0.32	0.31	1.82	0.34	0.87	0.44	1.67	1.06
OP1	0.24	0.88	0.07	0.38	1.72	0.79	1.16	0.71	0.53	0.41	1.51	0.77	0.15	0.35	2.34	0.65	0.03	0.77	0.15	0.11
OP2	0.04	0.97	0.14	0.11	1.98	0.45	1.56	0.24	0.91	0.63	1.62	0.72	0.01	0.15	2.60	0.36	0.48	0.17	0.88	0.50
P	0.13	0.97	0.04	0.26	1.89	0.67	1.38	0.55	0.73	0.54	1.62	0.80	0.06	0.26	2.50	0.53	0.16	0.52	0.42	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.03	0.00	0.01	0.07	0.03	0.23	0.01	0.00	0.16	0.68	0.11	0.10
C2	0.04	0.00	0.26	0.25	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.01	0.01	0.21	0.06	1.08	0.20	0.24
C2'	0.01	0.26	0.00	0.00	0.04	0.00	0.15	0.16	0.23	0.01	0.20	0.44	0.00	0.01	0.06	0.00	0.32	0.22	0.44	0.17
C3'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.25	0.00	0.15	0.01	0.07	0.13	0.29	0.26	0.02	0.00	0.29	0.02	0.05	0.24	0.02	0.11
C4	0.01	0.01	0.04	0.25	0.00	0.09	0.02	0.04	0.04	0.01	0.00	0.02	0.20	0.06	0.01	0.01	0.02	1.40	0.19	0.40
C4'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.09	0.00	0.14	0.00	0.13	0.03	0.02	0.12	0.20	0.01	0.10	0.01	0.00	0.25	0.20	0.10
C5	0.02	0.01	0.15	0.15	0.02	0.14	0.00	0.09	0.01	0.00	0.02	0.02	0.37	0.01	0.04	0.16	0.04	1.35	0.23	0.35
C5'	0.05	0.09	0.16	0.01	0.04	0.00	0.09	0.00	0.06	0.04	0.03	0.17	0.03	0.16	0.07	0.01	0.00	0.04	0.28	0.00
C6	0.03	0.01	0.23	0.07	0.04	0.13	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.01	0.38	0.07	0.05	0.21	0.14	1.13	0.24	0.23
N1	0.00	0.00	0.01	0.13	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.12	0.08	0.02	0.01	0.12	0.99	0.20	0.19
N3	0.01	0.00	0.20	0.29	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	1.29	0.18	0.36
O2	0.07	0.01	0.44	0.26	0.02	0.12	0.02	0.17	0.01	0.01	0.02	0.00	0.36	0.02	0.02	0.36	0.07	0.95	0.19	0.19
O2'	0.03	0.11	0.00	0.02	0.20	0.20	0.37	0.03	0.38	0.12	0.00	0.36	0.00	0.01	0.20	0.15	0.25	0.16	0.45	0.17
O3'	0.23	0.01	0.01	0.00	0.06	0.01	0.01	0.16	0.07	0.08	0.06	0.02	0.01	0.00	0.10	0.17	0.25	0.26	0.22	0.26
O4	0.01	0.01	0.06	0.29	0.01	0.10	0.04	0.07	0.05	0.02	0.01	0.02	0.20	0.10	0.00	0.01	0.08	1.48	0.15	0.47
O4'	0.00	0.21	0.00	0.02	0.01	0.01	0.16	0.01	0.21	0.01	0.13	0.36	0.15	0.17	0.01	0.00	0.04	0.67	0.19	0.21
O5'	0.16	0.06	0.32	0.05	0.02	0.00	0.04	0.00	0.14	0.12	0.01	0.07	0.25	0.25	0.08	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.68	1.08	0.22	0.24	1.40	0.25	1.35	0.04	1.13	0.99	1.29	0.95	0.16	0.26	1.48	0.67	0.01	0.00	0.00	0.01
OP2	0.11	0.20	0.44	0.02	0.19	0.20	0.23	0.28	0.24	0.20	0.18	0.19	0.45	0.22	0.15	0.19	0.01	0.00	0.00	0.01
P	0.10	0.24	0.17	0.11	0.40	0.10	0.35	0.00	0.23	0.19	0.36	0.19	0.17	0.26	0.47	0.21	0.00	0.01	0.01	0.00