Doublet Group distance statistics: 51590

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 6, 8, 5, 6, 2, 8, 4, 4, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.013, 0.019, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.013 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.009, 0.020, 0.030, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.003, 0.014, 0.026, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.014 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.010, 0.023, 0.036, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.023 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.006, 0.019, 0.033, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.011, 0.025, 0.039, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.025 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.013, 0.031, 0.049, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.031 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.012, 0.035, 0.057, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.035 std_dev=0.023
N6	A	0, 0.019, 0.042, 0.066, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.042 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.015, 0.042, 0.070, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.042 std_dev=0.027
O4'	A	0, 0.009, 0.135, 0.262, 0.751 max_d=0.751 avg_d=0.135 std_dev=0.126
C2'	A	0, 0.029, 0.157, 0.285, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.157 std_dev=0.128
N3	B	0, 0.198, 0.425, 0.652, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.425 std_dev=0.227
C2	B	0, 0.221, 0.450, 0.679, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.450 std_dev=0.229
C4'	A	0, 0.070, 0.304, 0.538, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.304 std_dev=0.234
C4	B	0, 0.188, 0.429, 0.669, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.429 std_dev=0.241
N1	B	0, 0.236, 0.482, 0.728, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.482 std_dev=0.246
C2'	B	0, 0.225, 0.476, 0.728, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.476 std_dev=0.252
O2'	A	0, 0.007, 0.266, 0.525, 1.643 max_d=1.643 avg_d=0.266 std_dev=0.259
O3'	B	0, 0.308, 0.569, 0.831, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.569 std_dev=0.262
N9	B	0, 0.215, 0.480, 0.745, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.480 std_dev=0.265
C3'	B	0, 0.275, 0.540, 0.805, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.540 std_dev=0.265
C6	B	0, 0.218, 0.491, 0.764, 1.119 max_d=1.119 avg_d=0.491 std_dev=0.273
O2'	B	0, 0.262, 0.537, 0.811, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.537 std_dev=0.275
O5'	A	0, 0.183, 0.458, 0.734, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.458 std_dev=0.276
C5	B	0, 0.190, 0.467, 0.745, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.467 std_dev=0.278
C1'	B	0, 0.234, 0.516, 0.798, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.516 std_dev=0.282
P	A	0, 0.284, 0.568, 0.853, 1.171 max_d=1.171 avg_d=0.568 std_dev=0.284
C3'	A	0, 0.041, 0.326, 0.611, 1.780 max_d=1.780 avg_d=0.326 std_dev=0.285
C5'	A	0, 0.153, 0.446, 0.739, 1.472 max_d=1.472 avg_d=0.446 std_dev=0.293
C8	B	0, 0.226, 0.545, 0.865, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.545 std_dev=0.320
C4'	B	0, 0.300, 0.623, 0.945, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.623 std_dev=0.322
OP2	A	0, 0.300, 0.625, 0.950, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.625 std_dev=0.325
OP1	A	0, 0.354, 0.685, 1.017, 1.382 max_d=1.382 avg_d=0.685 std_dev=0.332
N7	B	0, 0.208, 0.543, 0.879, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.543 std_dev=0.335
N6	B	0, 0.236, 0.577, 0.918, 1.458 max_d=1.458 avg_d=0.577 std_dev=0.341
O4'	B	0, 0.262, 0.610, 0.958, 1.442 max_d=1.442 avg_d=0.610 std_dev=0.348
C5'	B	0, 0.301, 0.705, 1.108, 2.023 max_d=2.023 avg_d=0.705 std_dev=0.403
O3'	A	0, 0.022, 0.512, 1.001, 3.142 max_d=3.142 avg_d=0.512 std_dev=0.489
O5'	B	0, 0.210, 0.785, 1.361, 3.009 max_d=3.009 avg_d=0.785 std_dev=0.575
P	B	0, 0.310, 1.126, 1.942, 3.475 max_d=3.475 avg_d=1.126 std_dev=0.816
OP2	B	0, 0.394, 1.416, 2.439, 4.408 max_d=4.408 avg_d=1.416 std_dev=1.022
OP1	B	0, 0.508, 1.557, 2.605, 3.552 max_d=3.552 avg_d=1.557 std_dev=1.049

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.13	0.01	0.11	0.10	0.19	0.12
C2	0.03	0.00	0.12	0.12	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.21	0.06	0.16	0.16	0.26	0.17
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.02	0.06	0.08	0.08	0.06	0.11	0.12	0.07	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.19	0.20	0.25	0.19
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.12	0.01	0.16	0.03	0.16	0.17	0.15	0.11	0.19	0.19	0.10	0.02	0.01	0.01	0.13	0.14	0.11	0.10
C4	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.13	0.03	0.16	0.16	0.25	0.17
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.11	0.05	0.04	0.09	0.11	0.05	0.11	0.03	0.00	0.02	0.07	0.11	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.16	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.14	0.03	0.20	0.21	0.28	0.21
C5'	0.04	0.07	0.08	0.03	0.08	0.01	0.12	0.00	0.12	0.14	0.10	0.06	0.15	0.16	0.08	0.06	0.08	0.01	0.01	0.09	0.13	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.16	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.17	0.03	0.21	0.22	0.30	0.22
C8	0.01	0.01	0.06	0.17	0.01	0.11	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.12	0.14	0.05	0.20	0.19	0.25	0.19
N1	0.02	0.00	0.11	0.15	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.18	0.05	0.19	0.20	0.29	0.20
N3	0.03	0.00	0.12	0.11	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.20	0.06	0.15	0.14	0.24	0.15
N6	0.02	0.01	0.07	0.19	0.01	0.09	0.01	0.15	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.16	0.19	0.04	0.23	0.26	0.33	0.25
N7	0.01	0.01	0.05	0.19	0.01	0.11	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.14	0.17	0.04	0.23	0.23	0.30	0.23
N9	0.00	0.01	0.02	0.10	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.08	0.09	0.01	0.15	0.14	0.22	0.15
O2'	0.01	0.14	0.00	0.02	0.10	0.11	0.13	0.06	0.14	0.12	0.14	0.12	0.16	0.14	0.08	0.00	0.06	0.08	0.13	0.17	0.26	0.15
O3'	0.13	0.21	0.03	0.01	0.13	0.03	0.14	0.08	0.17	0.14	0.18	0.20	0.19	0.17	0.09	0.06	0.00	0.09	0.16	0.23	0.17	0.17
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.05	0.06	0.04	0.04	0.01	0.08	0.09	0.00	0.08	0.09	0.17	0.10
O5'	0.11	0.16	0.19	0.13	0.16	0.02	0.20	0.01	0.21	0.20	0.19	0.15	0.23	0.23	0.15	0.13	0.16	0.08	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.10	0.16	0.20	0.14	0.16	0.07	0.21	0.09	0.22	0.19	0.20	0.14	0.26	0.23	0.14	0.17	0.23	0.09	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.19	0.26	0.25	0.11	0.25	0.11	0.28	0.13	0.30	0.25	0.29	0.24	0.33	0.30	0.22	0.26	0.17	0.17	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.12	0.17	0.19	0.10	0.17	0.03	0.21	0.02	0.22	0.19	0.20	0.15	0.25	0.23	0.15	0.15	0.17	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.23	0.16	0.16	0.11	0.15	0.14	0.18	0.16	0.18	0.18	0.21	0.20	0.19	0.12	0.28	0.17	0.14	0.36	0.49	0.76	0.47
C2	0.24	0.27	0.23	0.21	0.23	0.22	0.26	0.28	0.23	0.29	0.22	0.25	0.28	0.32	0.25	0.29	0.19	0.24	0.48	0.73	0.91	0.66
C2'	0.14	0.25	0.14	0.16	0.10	0.14	0.14	0.19	0.16	0.19	0.20	0.21	0.21	0.21	0.11	0.27	0.18	0.13	0.41	0.62	0.83	0.55
C3'	0.12	0.22	0.13	0.13	0.10	0.12	0.16	0.17	0.17	0.21	0.18	0.19	0.22	0.24	0.11	0.25	0.15	0.10	0.37	0.59	0.81	0.51
C4	0.20	0.26	0.20	0.19	0.14	0.19	0.15	0.25	0.14	0.23	0.18	0.22	0.20	0.24	0.18	0.28	0.18	0.19	0.47	0.65	0.88	0.63
C4'	0.14	0.23	0.12	0.11	0.13	0.11	0.16	0.13	0.18	0.19	0.19	0.20	0.21	0.21	0.13	0.25	0.13	0.12	0.28	0.50	0.69	0.39
C5	0.21	0.27	0.22	0.21	0.15	0.22	0.14	0.31	0.13	0.26	0.22	0.23	0.20	0.26	0.19	0.27	0.20	0.22	0.53	0.75	0.94	0.72
C5'	0.19	0.24	0.18	0.13	0.18	0.15	0.21	0.14	0.21	0.24	0.21	0.23	0.24	0.25	0.19	0.27	0.14	0.16	0.26	0.57	0.66	0.37
C6	0.24	0.27	0.24	0.23	0.20	0.25	0.20	0.34	0.14	0.31	0.23	0.23	0.20	0.31	0.24	0.28	0.21	0.25	0.56	0.85	0.98	0.77
C8	0.17	0.28	0.20	0.19	0.14	0.18	0.15	0.27	0.19	0.20	0.24	0.26	0.23	0.22	0.13	0.27	0.19	0.17	0.49	0.64	0.87	0.64
N1	0.25	0.27	0.24	0.22	0.23	0.24	0.26	0.32	0.22	0.32	0.23	0.25	0.27	0.34	0.26	0.29	0.20	0.26	0.53	0.83	0.96	0.73
N3	0.22	0.25	0.21	0.20	0.18	0.19	0.21	0.24	0.19	0.25	0.18	0.23	0.24	0.27	0.21	0.29	0.18	0.21	0.45	0.64	0.87	0.60
N6	0.26	0.27	0.25	0.25	0.20	0.28	0.20	0.39	0.16	0.33	0.25	0.23	0.19	0.32	0.26	0.28	0.23	0.29	0.61	0.95	1.03	0.84
N7	0.20	0.28	0.22	0.21	0.15	0.22	0.13	0.32	0.19	0.22	0.25	0.25	0.24	0.22	0.16	0.26	0.21	0.21	0.55	0.75	0.94	0.74
N9	0.16	0.25	0.18	0.18	0.11	0.16	0.13	0.23	0.15	0.20	0.19	0.23	0.20	0.21	0.13	0.28	0.18	0.15	0.43	0.58	0.83	0.57
O2'	0.17	0.26	0.15	0.15	0.13	0.14	0.16	0.16	0.18	0.19	0.21	0.23	0.23	0.21	0.13	0.30	0.15	0.16	0.37	0.62	0.82	0.53
O3'	0.15	0.30	0.14	0.14	0.16	0.13	0.19	0.17	0.22	0.22	0.26	0.26	0.26	0.24	0.14	0.27	0.17	0.12	0.37	0.66	0.83	0.52
O4'	0.13	0.22	0.13	0.16	0.12	0.14	0.16	0.17	0.18	0.18	0.20	0.20	0.21	0.19	0.12	0.27	0.18	0.13	0.30	0.41	0.67	0.38
O5'	0.16	0.25	0.18	0.07	0.19	0.06	0.25	0.10	0.26	0.27	0.25	0.22	0.30	0.30	0.18	0.27	0.02	0.10	0.33	0.64	0.75	0.48
OP1	0.04	0.17	0.08	0.02	0.12	0.08	0.19	0.19	0.20	0.23	0.18	0.15	0.26	0.27	0.11	0.14	0.02	0.05	0.32	0.86	0.70	0.49
OP2	0.09	0.25	0.13	0.06	0.21	0.14	0.29	0.28	0.30	0.30	0.28	0.22	0.36	0.35	0.18	0.15	0.02	0.11	0.44	0.79	0.81	0.62
P	0.05	0.18	0.09	0.02	0.13	0.06	0.20	0.16	0.21	0.24	0.19	0.15	0.26	0.27	0.12	0.14	0.01	0.03	0.33	0.72	0.70	0.48

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.18	0.28	0.41	0.20
C2	0.04	0.00	0.11	0.10	0.01	0.04	0.01	0.13	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.18	0.13	0.05	0.34	0.53	0.71	0.44
C2'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.06	0.02	0.05	0.03	0.07	0.07	0.09	0.12	0.07	0.07	0.03	0.00	0.02	0.01	0.15	0.22	0.45	0.19
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.07	0.01	0.11	0.03	0.10	0.16	0.09	0.09	0.12	0.16	0.08	0.02	0.01	0.02	0.19	0.31	0.45	0.24
C4	0.02	0.01	0.06	0.07	0.00	0.04	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.08	0.02	0.34	0.53	0.67	0.43
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.08	0.13	0.05	0.04	0.10	0.13	0.06	0.07	0.02	0.00	0.02	0.17	0.31	0.08
C5	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.09	0.00	0.23	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.12	0.02	0.42	0.70	0.81	0.56
C5'	0.05	0.13	0.03	0.03	0.16	0.01	0.23	0.00	0.23	0.26	0.18	0.11	0.27	0.29	0.16	0.07	0.06	0.02	0.01	0.22	0.32	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.08	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.12	0.03	0.43	0.74	0.86	0.60
C8	0.02	0.02	0.07	0.16	0.01	0.13	0.01	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.18	0.04	0.42	0.66	0.70	0.52
N1	0.03	0.00	0.09	0.09	0.01	0.05	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.11	0.04	0.39	0.65	0.81	0.54
N3	0.04	0.01	0.12	0.09	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.17	0.13	0.05	0.30	0.45	0.63	0.37
N6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.10	0.01	0.27	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.10	0.15	0.03	0.47	0.85	0.94	0.67
N7	0.01	0.01	0.07	0.16	0.01	0.13	0.00	0.29	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.18	0.04	0.46	0.79	0.85	0.63
N9	0.01	0.02	0.03	0.08	0.01	0.06	0.01	0.16	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.31	0.47	0.58	0.38
O2'	0.02	0.18	0.00	0.02	0.10	0.07	0.08	0.07	0.11	0.04	0.15	0.17	0.10	0.05	0.03	0.00	0.05	0.06	0.07	0.28	0.40	0.14
O3'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.08	0.02	0.12	0.06	0.12	0.18	0.11	0.13	0.15	0.18	0.07	0.05	0.00	0.02	0.22	0.55	0.51	0.31
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.05	0.03	0.04	0.01	0.06	0.02	0.00	0.18	0.32	0.32	0.20
O5'	0.18	0.34	0.15	0.19	0.34	0.02	0.42	0.01	0.43	0.42	0.39	0.30	0.47	0.46	0.31	0.07	0.22	0.18	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.28	0.53	0.22	0.31	0.53	0.17	0.70	0.22	0.74	0.66	0.65	0.45	0.85	0.79	0.47	0.28	0.55	0.32	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.41	0.71	0.45	0.45	0.67	0.31	0.81	0.32	0.86	0.70	0.81	0.63	0.94	0.85	0.58	0.40	0.51	0.32	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.44	0.19	0.24	0.43	0.08	0.56	0.02	0.60	0.52	0.54	0.37	0.67	0.63	0.38	0.14	0.31	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00