Doublet Group distance statistics: 51591

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 0, 1, 6, 4, 7, 12, 4, 4, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.018, 0.024, 0.029, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.024 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.009, 0.015, 0.022, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.014, 0.021, 0.029, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.021 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.010, 0.018, 0.026, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.018 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.033, 0.041, 0.050, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.041 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.015, 0.024, 0.032, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.024 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.011, 0.023, 0.035, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.023 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.030, 0.049, 0.068, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.049 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.028, 0.048, 0.068, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.048 std_dev=0.020
N6	A	0, 0.080, 0.102, 0.124, 0.152 max_d=0.152 avg_d=0.102 std_dev=0.022
C2'	A	0, 0.081, 0.189, 0.298, 0.684 max_d=0.684 avg_d=0.189 std_dev=0.108
O4'	A	0, 0.059, 0.170, 0.282, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.170 std_dev=0.112
C5	B	0, 0.400, 0.591, 0.782, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.591 std_dev=0.191
C4'	A	0, 0.084, 0.290, 0.497, 1.446 max_d=1.446 avg_d=0.290 std_dev=0.206
C6	B	0, 0.329, 0.539, 0.749, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.539 std_dev=0.210
N1	B	0, 0.460, 0.681, 0.903, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.681 std_dev=0.221
C3'	A	0, 0.077, 0.317, 0.556, 1.684 max_d=1.684 avg_d=0.317 std_dev=0.240
O2'	A	0, 0.092, 0.334, 0.575, 1.738 max_d=1.738 avg_d=0.334 std_dev=0.241
C2	B	0, 0.468, 0.717, 0.966, 1.191 max_d=1.191 avg_d=0.717 std_dev=0.249
C4	B	0, 0.290, 0.551, 0.812, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.551 std_dev=0.261
C5'	A	0, 0.231, 0.494, 0.758, 1.610 max_d=1.610 avg_d=0.494 std_dev=0.263
N3	B	0, 0.304, 0.606, 0.907, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.606 std_dev=0.301
N6	B	0, 0.368, 0.678, 0.988, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.678 std_dev=0.310
N7	B	0, 0.635, 0.945, 1.255, 1.580 max_d=1.580 avg_d=0.945 std_dev=0.310
N9	B	0, 0.513, 0.831, 1.150, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.831 std_dev=0.319
O5'	A	0, 0.415, 0.739, 1.063, 1.504 max_d=1.504 avg_d=0.739 std_dev=0.324
C8	B	0, 0.735, 1.072, 1.409, 1.585 max_d=1.585 avg_d=1.072 std_dev=0.337
C2'	B	0, 0.407, 0.771, 1.135, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.771 std_dev=0.364
O2'	B	0, 0.419, 0.797, 1.175, 1.554 max_d=1.554 avg_d=0.797 std_dev=0.378
O3'	A	0, 0.065, 0.477, 0.890, 2.941 max_d=2.941 avg_d=0.477 std_dev=0.412
C1'	B	0, 0.566, 0.990, 1.414, 1.641 max_d=1.641 avg_d=0.990 std_dev=0.424
P	A	0, 0.478, 0.928, 1.377, 1.608 max_d=1.608 avg_d=0.928 std_dev=0.450
C3'	B	0, 0.511, 0.983, 1.455, 1.685 max_d=1.685 avg_d=0.983 std_dev=0.472
O3'	B	0, 0.409, 0.900, 1.392, 1.660 max_d=1.660 avg_d=0.900 std_dev=0.491
OP2	A	0, 0.648, 1.178, 1.708, 2.063 max_d=2.063 avg_d=1.178 std_dev=0.530
OP1	A	0, 0.490, 1.022, 1.554, 2.130 max_d=2.130 avg_d=1.022 std_dev=0.532
O4'	B	0, 0.792, 1.350, 1.909, 2.154 max_d=2.154 avg_d=1.350 std_dev=0.559
C4'	B	0, 0.700, 1.305, 1.910, 2.135 max_d=2.135 avg_d=1.305 std_dev=0.605
C5'	B	0, 0.892, 1.646, 2.400, 2.591 max_d=2.591 avg_d=1.646 std_dev=0.754
O5'	B	0, 1.147, 1.901, 2.656, 3.014 max_d=3.014 avg_d=1.901 std_dev=0.754
P	B	0, 1.485, 2.502, 3.520, 4.053 max_d=4.053 avg_d=2.502 std_dev=1.017
OP2	B	0, 1.497, 2.561, 3.625, 4.535 max_d=4.535 avg_d=2.561 std_dev=1.064
OP1	B	0, 1.700, 2.841, 3.982, 4.481 max_d=4.481 avg_d=2.841 std_dev=1.141

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.10	0.00	0.11	0.11	0.12	0.09
C2	0.02	0.00	0.11	0.12	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.17	0.07	0.21	0.20	0.26	0.19
C2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.06	0.02	0.04	0.06	0.05	0.08	0.09	0.11	0.05	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.18	0.23	0.18	0.18
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.11	0.01	0.14	0.03	0.14	0.15	0.13	0.11	0.16	0.16	0.09	0.02	0.01	0.01	0.17	0.22	0.09	0.13
C4	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.09	0.04	0.21	0.19	0.23	0.19
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.11	0.05	0.04	0.08	0.11	0.05	0.12	0.02	0.00	0.02	0.08	0.13	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.14	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.09	0.02	0.25	0.25	0.30	0.25
C5'	0.03	0.10	0.06	0.03	0.10	0.01	0.15	0.00	0.15	0.16	0.12	0.08	0.17	0.18	0.10	0.07	0.08	0.01	0.01	0.11	0.20	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.14	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.11	0.03	0.26	0.27	0.34	0.26
C8	0.01	0.01	0.08	0.15	0.01	0.11	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.13	0.05	0.25	0.22	0.23	0.22
N1	0.02	0.01	0.09	0.13	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.14	0.05	0.24	0.24	0.31	0.24
N3	0.02	0.00	0.11	0.11	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.17	0.07	0.18	0.17	0.22	0.16
N6	0.01	0.01	0.05	0.16	0.01	0.08	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.15	0.13	0.03	0.29	0.32	0.38	0.30
N7	0.01	0.01	0.06	0.16	0.01	0.11	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.15	0.14	0.04	0.28	0.28	0.32	0.28
N9	0.00	0.01	0.02	0.09	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.05	0.01	0.19	0.16	0.18	0.16
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.10	0.12	0.13	0.07	0.14	0.13	0.13	0.11	0.15	0.15	0.08	0.00	0.05	0.09	0.11	0.18	0.20	0.13
O3'	0.10	0.17	0.02	0.01	0.09	0.02	0.09	0.08	0.11	0.13	0.14	0.17	0.13	0.14	0.05	0.05	0.00	0.07	0.17	0.28	0.18	0.18
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.05	0.07	0.03	0.04	0.01	0.09	0.07	0.00	0.07	0.09	0.13	0.10
O5'	0.11	0.21	0.18	0.17	0.21	0.02	0.25	0.01	0.26	0.25	0.24	0.18	0.29	0.28	0.19	0.11	0.17	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.11	0.20	0.23	0.22	0.19	0.08	0.25	0.11	0.27	0.22	0.24	0.17	0.32	0.28	0.16	0.18	0.28	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.26	0.18	0.09	0.23	0.13	0.30	0.20	0.34	0.23	0.31	0.22	0.38	0.32	0.18	0.20	0.18	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.19	0.18	0.13	0.19	0.03	0.25	0.02	0.26	0.22	0.24	0.16	0.30	0.28	0.16	0.13	0.18	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.32	0.18	0.16	0.14	0.17	0.16	0.16	0.22	0.19	0.29	0.24	0.23	0.19	0.14	0.29	0.18	0.16	0.26	0.33	0.46	0.32
C2	0.29	0.22	0.26	0.21	0.25	0.24	0.28	0.25	0.26	0.33	0.21	0.23	0.31	0.34	0.29	0.33	0.20	0.28	0.37	0.41	0.58	0.46
C2'	0.12	0.32	0.13	0.13	0.14	0.12	0.17	0.15	0.22	0.20	0.29	0.24	0.24	0.21	0.13	0.24	0.16	0.12	0.31	0.43	0.56	0.40
C3'	0.10	0.32	0.11	0.10	0.13	0.10	0.14	0.12	0.19	0.19	0.28	0.25	0.20	0.19	0.10	0.23	0.15	0.09	0.30	0.44	0.55	0.39
C4	0.24	0.24	0.24	0.20	0.16	0.21	0.21	0.23	0.20	0.29	0.23	0.16	0.24	0.28	0.23	0.31	0.20	0.23	0.35	0.40	0.56	0.43
C4'	0.12	0.35	0.10	0.08	0.18	0.10	0.16	0.08	0.22	0.15	0.31	0.30	0.21	0.15	0.11	0.23	0.12	0.10	0.22	0.35	0.42	0.28
C5	0.24	0.24	0.25	0.22	0.16	0.23	0.21	0.27	0.18	0.32	0.23	0.16	0.23	0.32	0.24	0.29	0.23	0.24	0.40	0.46	0.62	0.50
C5'	0.19	0.37	0.19	0.11	0.24	0.15	0.21	0.10	0.25	0.19	0.32	0.34	0.24	0.19	0.18	0.30	0.14	0.17	0.24	0.37	0.41	0.29
C6	0.26	0.21	0.25	0.23	0.20	0.24	0.25	0.29	0.19	0.35	0.19	0.17	0.25	0.36	0.27	0.29	0.23	0.27	0.42	0.48	0.65	0.53
C8	0.20	0.33	0.23	0.22	0.18	0.21	0.19	0.25	0.24	0.27	0.31	0.26	0.24	0.25	0.19	0.27	0.23	0.21	0.37	0.44	0.57	0.45
N1	0.29	0.23	0.26	0.22	0.25	0.24	0.29	0.28	0.25	0.35	0.20	0.22	0.31	0.36	0.29	0.31	0.21	0.29	0.40	0.45	0.63	0.51
N3	0.27	0.20	0.25	0.20	0.20	0.22	0.24	0.23	0.23	0.30	0.21	0.18	0.27	0.30	0.25	0.33	0.19	0.26	0.34	0.38	0.55	0.42
N6	0.25	0.22	0.25	0.24	0.18	0.25	0.23	0.32	0.16	0.35	0.21	0.17	0.22	0.37	0.26	0.27	0.25	0.27	0.45	0.54	0.70	0.59
N7	0.23	0.29	0.24	0.24	0.15	0.24	0.19	0.30	0.22	0.32	0.29	0.21	0.24	0.29	0.22	0.27	0.25	0.25	0.43	0.50	0.64	0.52
N9	0.19	0.31	0.21	0.18	0.14	0.18	0.18	0.20	0.21	0.24	0.28	0.22	0.23	0.23	0.17	0.29	0.19	0.19	0.32	0.38	0.53	0.39
O2'	0.17	0.34	0.16	0.13	0.17	0.15	0.20	0.13	0.26	0.19	0.33	0.26	0.30	0.21	0.14	0.31	0.15	0.16	0.27	0.39	0.53	0.35
O3'	0.11	0.37	0.11	0.12	0.16	0.12	0.17	0.14	0.23	0.19	0.33	0.30	0.24	0.19	0.11	0.23	0.18	0.10	0.32	0.50	0.59	0.42
O4'	0.12	0.35	0.13	0.15	0.16	0.15	0.16	0.14	0.23	0.15	0.31	0.29	0.23	0.14	0.10	0.26	0.19	0.12	0.21	0.28	0.37	0.24
O5'	0.14	0.39	0.15	0.08	0.25	0.06	0.22	0.09	0.28	0.16	0.36	0.35	0.27	0.17	0.16	0.20	0.02	0.10	0.27	0.40	0.44	0.33
OP1	0.04	0.30	0.06	0.02	0.16	0.08	0.16	0.15	0.22	0.13	0.28	0.25	0.22	0.14	0.07	0.11	0.02	0.05	0.23	0.40	0.34	0.28
OP2	0.09	0.34	0.11	0.05	0.23	0.10	0.25	0.20	0.30	0.20	0.35	0.29	0.31	0.22	0.15	0.10	0.02	0.08	0.32	0.49	0.47	0.40
P	0.04	0.30	0.07	0.01	0.17	0.05	0.17	0.11	0.22	0.13	0.28	0.25	0.22	0.14	0.09	0.09	0.01	0.02	0.24	0.39	0.36	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.10	0.10	0.15	0.14
C2	0.03	0.00	0.12	0.14	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.18	0.06	0.25	0.27	0.40	0.34
C2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.07	0.01	0.04	0.02	0.06	0.06	0.10	0.12	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.12	0.14	0.15	0.12
C3'	0.02	0.14	0.01	0.00	0.09	0.00	0.09	0.02	0.11	0.09	0.13	0.13	0.10	0.08	0.05	0.02	0.01	0.01	0.16	0.19	0.16	0.14
C4	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.10	0.04	0.25	0.25	0.34	0.32
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.08	0.05	0.04	0.08	0.09	0.05	0.04	0.02	0.00	0.02	0.07	0.05	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.10	0.03	0.30	0.33	0.43	0.40
C5'	0.03	0.11	0.02	0.02	0.12	0.01	0.17	0.00	0.17	0.17	0.14	0.09	0.20	0.20	0.11	0.04	0.04	0.02	0.01	0.06	0.10	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.07	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.13	0.04	0.32	0.36	0.48	0.44
C8	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.08	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.10	0.04	0.28	0.29	0.35	0.36
N1	0.03	0.01	0.10	0.13	0.01	0.05	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.16	0.05	0.30	0.33	0.46	0.40
N3	0.03	0.00	0.12	0.13	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.16	0.06	0.22	0.22	0.33	0.28
N6	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.08	0.01	0.20	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.13	0.03	0.35	0.42	0.53	0.49
N7	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.09	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.10	0.03	0.32	0.36	0.44	0.43
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02	0.21	0.20	0.27	0.27
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.06	0.04	0.05	0.04	0.07	0.04	0.10	0.12	0.06	0.04	0.02	0.00	0.05	0.04	0.06	0.14	0.10	0.06
O3'	0.02	0.18	0.02	0.01	0.10	0.02	0.10	0.04	0.13	0.10	0.16	0.16	0.13	0.10	0.05	0.05	0.00	0.02	0.16	0.28	0.22	0.18
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.04	0.05	0.06	0.03	0.03	0.02	0.04	0.02	0.00	0.10	0.10	0.18	0.15
O5'	0.10	0.25	0.12	0.16	0.25	0.02	0.30	0.01	0.32	0.28	0.30	0.22	0.35	0.32	0.21	0.06	0.16	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.10	0.27	0.14	0.19	0.25	0.07	0.33	0.06	0.36	0.29	0.33	0.22	0.42	0.36	0.20	0.14	0.28	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.40	0.15	0.16	0.34	0.05	0.43	0.10	0.48	0.35	0.46	0.33	0.53	0.44	0.27	0.10	0.22	0.18	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.34	0.12	0.14	0.32	0.03	0.40	0.02	0.44	0.36	0.40	0.28	0.49	0.43	0.27	0.06	0.18	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00