Doublet Group distance statistics: 51594

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 1, 6, 2, 3, 4, 5, 5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.009, 0.015, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.019, 0.029, 0.039, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.017, 0.028, 0.040, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.028 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.016, 0.030, 0.045, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.030 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.015, 0.030, 0.045, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.030 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.027, 0.043, 0.059, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.043 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.018, 0.035, 0.051, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.035 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.020, 0.038, 0.055, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.038 std_dev=0.017
N6	A	0, 0.018, 0.036, 0.054, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.036 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.019, 0.037, 0.055, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.037 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.022, 0.043, 0.064, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.043 std_dev=0.021
O4'	A	0, 0.107, 0.274, 0.442, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.274 std_dev=0.167
C2'	A	0, 0.203, 0.401, 0.598, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.401 std_dev=0.197
N1	B	0, 0.374, 0.578, 0.782, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.578 std_dev=0.204
N3	B	0, 0.414, 0.618, 0.822, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.618 std_dev=0.204
C2	B	0, 0.345, 0.556, 0.766, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.556 std_dev=0.211
C4'	A	0, 0.332, 0.545, 0.757, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.545 std_dev=0.212
C6	B	0, 0.443, 0.671, 0.900, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.671 std_dev=0.228
C4	B	0, 0.439, 0.670, 0.901, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.670 std_dev=0.231
C5	B	0, 0.456, 0.718, 0.981, 1.182 max_d=1.182 avg_d=0.718 std_dev=0.262
C3'	A	0, 0.434, 0.697, 0.961, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.697 std_dev=0.264
O2'	A	0, 0.435, 0.745, 1.055, 1.756 max_d=1.756 avg_d=0.745 std_dev=0.310
C5'	A	0, 0.618, 0.932, 1.246, 1.468 max_d=1.468 avg_d=0.932 std_dev=0.314
C2'	B	0, 0.316, 0.641, 0.965, 1.827 max_d=1.827 avg_d=0.641 std_dev=0.324
P	A	0, 0.742, 1.080, 1.419, 1.618 max_d=1.618 avg_d=1.080 std_dev=0.338
N6	B	0, 0.511, 0.855, 1.200, 1.636 max_d=1.636 avg_d=0.855 std_dev=0.344
O3'	B	0, 0.666, 1.012, 1.358, 1.550 max_d=1.550 avg_d=1.012 std_dev=0.346
OP1	A	0, 0.817, 1.182, 1.547, 1.786 max_d=1.786 avg_d=1.182 std_dev=0.365
O5'	A	0, 0.699, 1.065, 1.432, 1.672 max_d=1.672 avg_d=1.065 std_dev=0.367
N9	B	0, 0.503, 0.869, 1.236, 1.450 max_d=1.450 avg_d=0.869 std_dev=0.367
OP2	A	0, 0.878, 1.263, 1.649, 1.838 max_d=1.838 avg_d=1.263 std_dev=0.385
C3'	B	0, 0.611, 1.003, 1.394, 1.701 max_d=1.701 avg_d=1.003 std_dev=0.392
O3'	A	0, 0.708, 1.105, 1.503, 1.971 max_d=1.971 avg_d=1.105 std_dev=0.398
N7	B	0, 0.526, 0.934, 1.341, 1.584 max_d=1.584 avg_d=0.934 std_dev=0.408
C1'	B	0, 0.562, 0.997, 1.432, 1.721 max_d=1.721 avg_d=0.997 std_dev=0.435
C8	B	0, 0.519, 0.982, 1.445, 1.650 max_d=1.650 avg_d=0.982 std_dev=0.463
O2'	B	0, 0.125, 0.747, 1.369, 3.820 max_d=3.820 avg_d=0.747 std_dev=0.622
C4'	B	0, 0.802, 1.426, 2.049, 2.453 max_d=2.453 avg_d=1.426 std_dev=0.623
O4'	B	0, 0.944, 1.595, 2.246, 2.663 max_d=2.663 avg_d=1.595 std_dev=0.651
C5'	B	0, 1.280, 2.140, 3.000, 3.731 max_d=3.731 avg_d=2.140 std_dev=0.860
O5'	B	0, 1.780, 2.679, 3.578, 4.213 max_d=4.213 avg_d=2.679 std_dev=0.899
OP1	B	0, 1.811, 2.828, 3.844, 6.272 max_d=6.272 avg_d=2.828 std_dev=1.017
P	B	0, 1.956, 3.102, 4.249, 5.734 max_d=5.734 avg_d=3.102 std_dev=1.146
OP2	B	0, 2.514, 3.728, 4.942, 5.917 max_d=5.917 avg_d=3.728 std_dev=1.214

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.10	0.01	0.13	0.13	0.19	0.15
C2	0.03	0.00	0.11	0.11	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.15	0.06	0.17	0.15	0.30	0.18
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.02	0.04	0.09	0.06	0.07	0.09	0.11	0.05	0.06	0.02	0.00	0.03	0.01	0.18	0.22	0.27	0.21
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.11	0.00	0.16	0.02	0.16	0.19	0.14	0.10	0.19	0.20	0.11	0.02	0.01	0.02	0.08	0.13	0.10	0.08
C4	0.02	0.01	0.06	0.11	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.07	0.03	0.17	0.15	0.28	0.18
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.07	0.12	0.04	0.04	0.10	0.12	0.05	0.14	0.03	0.00	0.02	0.08	0.05	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.16	0.00	0.08	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.10	0.03	0.21	0.21	0.33	0.22
C5'	0.05	0.08	0.09	0.02	0.09	0.01	0.13	0.00	0.14	0.16	0.10	0.07	0.17	0.18	0.09	0.06	0.08	0.02	0.01	0.09	0.03	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.16	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.10	0.03	0.22	0.23	0.36	0.24
C8	0.01	0.02	0.07	0.19	0.01	0.12	0.01	0.16	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.13	0.17	0.05	0.21	0.19	0.28	0.21
N1	0.03	0.00	0.09	0.14	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.17	0.11	0.05	0.20	0.19	0.34	0.21
N3	0.03	0.00	0.11	0.10	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.15	0.07	0.16	0.14	0.27	0.17
N6	0.02	0.01	0.05	0.19	0.01	0.10	0.01	0.17	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.17	0.14	0.04	0.25	0.28	0.41	0.28
N7	0.01	0.01	0.06	0.20	0.01	0.12	0.00	0.18	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.15	0.18	0.04	0.24	0.24	0.35	0.25
N9	0.00	0.01	0.02	0.11	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.08	0.06	0.01	0.16	0.14	0.24	0.16
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.12	0.14	0.14	0.06	0.16	0.13	0.17	0.15	0.17	0.15	0.08	0.00	0.06	0.10	0.12	0.18	0.28	0.16
O3'	0.10	0.15	0.03	0.01	0.07	0.03	0.10	0.08	0.10	0.17	0.11	0.15	0.14	0.18	0.06	0.06	0.00	0.08	0.16	0.23	0.17	0.16
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.05	0.07	0.04	0.04	0.01	0.10	0.08	0.00	0.10	0.15	0.14	0.15
O5'	0.13	0.17	0.18	0.08	0.17	0.02	0.21	0.01	0.22	0.21	0.20	0.16	0.25	0.24	0.16	0.12	0.16	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.13	0.15	0.22	0.13	0.15	0.08	0.21	0.09	0.23	0.19	0.19	0.14	0.28	0.24	0.14	0.18	0.23	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.30	0.27	0.10	0.28	0.05	0.33	0.03	0.36	0.28	0.34	0.27	0.41	0.35	0.24	0.28	0.17	0.14	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.18	0.21	0.08	0.18	0.04	0.22	0.02	0.24	0.21	0.21	0.17	0.28	0.25	0.16	0.16	0.16	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.22	0.28	0.19	0.13	0.21	0.17	0.21	0.23	0.13	0.25	0.17	0.27	0.16	0.13	0.34	0.27	0.27	0.31	0.34	0.33	0.29
C2	0.24	0.22	0.25	0.22	0.15	0.22	0.17	0.26	0.21	0.18	0.15	0.25	0.33	0.21	0.17	0.30	0.24	0.29	0.28	0.32	0.49	0.28
C2'	0.18	0.21	0.24	0.18	0.13	0.18	0.17	0.22	0.23	0.14	0.24	0.17	0.28	0.18	0.13	0.27	0.24	0.23	0.25	0.31	0.35	0.25
C3'	0.18	0.23	0.24	0.11	0.17	0.11	0.22	0.12	0.26	0.19	0.26	0.19	0.31	0.23	0.16	0.24	0.15	0.19	0.32	0.36	0.37	0.31
C4	0.22	0.17	0.23	0.22	0.11	0.21	0.16	0.25	0.21	0.16	0.19	0.18	0.29	0.19	0.15	0.27	0.25	0.27	0.29	0.31	0.44	0.28
C4'	0.17	0.25	0.30	0.12	0.19	0.13	0.21	0.12	0.25	0.18	0.27	0.21	0.28	0.21	0.16	0.36	0.16	0.18	0.28	0.34	0.33	0.28
C5	0.24	0.20	0.20	0.25	0.15	0.24	0.18	0.31	0.20	0.22	0.19	0.20	0.28	0.24	0.19	0.29	0.25	0.27	0.30	0.32	0.53	0.31
C5'	0.22	0.30	0.35	0.17	0.26	0.14	0.29	0.13	0.31	0.26	0.31	0.27	0.33	0.29	0.24	0.41	0.11	0.19	0.28	0.38	0.35	0.29
C6	0.25	0.25	0.20	0.25	0.18	0.25	0.20	0.33	0.19	0.26	0.18	0.25	0.30	0.28	0.22	0.31	0.24	0.28	0.30	0.33	0.60	0.33
C8	0.26	0.21	0.19	0.25	0.17	0.24	0.20	0.30	0.23	0.20	0.23	0.19	0.27	0.22	0.19	0.28	0.27	0.27	0.32	0.34	0.45	0.33
N1	0.24	0.27	0.22	0.23	0.18	0.23	0.19	0.29	0.20	0.22	0.17	0.27	0.33	0.26	0.20	0.28	0.23	0.27	0.29	0.32	0.57	0.31
N3	0.23	0.17	0.27	0.21	0.12	0.22	0.15	0.24	0.21	0.15	0.18	0.20	0.31	0.18	0.15	0.31	0.25	0.29	0.29	0.32	0.42	0.28
N6	0.27	0.28	0.21	0.28	0.21	0.29	0.23	0.40	0.19	0.32	0.23	0.25	0.29	0.33	0.26	0.37	0.25	0.30	0.34	0.38	0.70	0.39
N7	0.29	0.20	0.20	0.28	0.18	0.29	0.20	0.37	0.22	0.26	0.21	0.20	0.27	0.25	0.24	0.37	0.27	0.30	0.33	0.36	0.54	0.35
N9	0.21	0.20	0.23	0.21	0.13	0.21	0.17	0.24	0.22	0.15	0.23	0.17	0.27	0.18	0.14	0.25	0.26	0.26	0.30	0.32	0.39	0.29
O2'	0.20	0.22	0.30	0.16	0.14	0.18	0.19	0.19	0.25	0.15	0.25	0.18	0.31	0.20	0.14	0.40	0.19	0.25	0.27	0.32	0.33	0.26
O3'	0.17	0.24	0.25	0.14	0.17	0.13	0.21	0.15	0.25	0.18	0.26	0.20	0.30	0.22	0.15	0.26	0.16	0.18	0.34	0.41	0.41	0.34
O4'	0.18	0.25	0.30	0.17	0.16	0.21	0.19	0.20	0.24	0.15	0.27	0.20	0.26	0.17	0.14	0.38	0.28	0.24	0.32	0.37	0.32	0.31
O5'	0.20	0.26	0.28	0.14	0.26	0.09	0.32	0.14	0.34	0.30	0.31	0.23	0.38	0.34	0.24	0.26	0.02	0.14	0.32	0.45	0.39	0.34
OP1	0.13	0.13	0.08	0.08	0.09	0.13	0.16	0.17	0.18	0.17	0.16	0.12	0.24	0.21	0.07	0.14	0.01	0.13	0.27	0.56	0.47	0.37
OP2	0.10	0.23	0.12	0.05	0.20	0.13	0.30	0.28	0.34	0.26	0.30	0.17	0.40	0.34	0.14	0.37	0.02	0.09	0.44	0.64	0.55	0.51
P	0.11	0.14	0.09	0.01	0.12	0.05	0.20	0.16	0.22	0.21	0.19	0.11	0.28	0.25	0.10	0.16	0.01	0.06	0.31	0.50	0.41	0.36

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.05	0.02	0.01	0.01	0.02	0.14	0.01	0.14	0.25	0.18	0.17
C2	0.04	0.00	0.18	0.12	0.01	0.11	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.15	0.16	0.18	0.29	0.47	0.46	0.35
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.10	0.01	0.06	0.07	0.10	0.09	0.15	0.18	0.08	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.24	0.25	0.23	0.25
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.12	0.01	0.16	0.02	0.17	0.18	0.14	0.10	0.19	0.20	0.11	0.02	0.01	0.01	0.22	0.23	0.14	0.18
C4	0.03	0.01	0.10	0.12	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.05	0.08	0.09	0.29	0.41	0.43	0.33
C4'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.04	0.16	0.06	0.11	0.08	0.14	0.05	0.14	0.02	0.00	0.02	0.11	0.15	0.04
C5	0.01	0.01	0.06	0.16	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.11	0.08	0.04	0.36	0.47	0.57	0.39
C5'	0.03	0.13	0.07	0.02	0.06	0.01	0.11	0.00	0.10	0.20	0.10	0.13	0.15	0.19	0.07	0.07	0.10	0.01	0.01	0.13	0.25	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.17	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.09	0.07	0.36	0.50	0.61	0.41
C8	0.01	0.01	0.09	0.18	0.01	0.16	0.01	0.20	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.22	0.13	0.11	0.40	0.44	0.50	0.38
N1	0.03	0.00	0.15	0.14	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.12	0.13	0.33	0.49	0.55	0.38
N3	0.05	0.00	0.18	0.10	0.00	0.11	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.15	0.16	0.18	0.27	0.43	0.39	0.32
N6	0.02	0.02	0.08	0.19	0.02	0.08	0.02	0.15	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.04	0.02	0.12	0.12	0.06	0.40	0.54	0.69	0.45
N7	0.01	0.02	0.06	0.20	0.00	0.14	0.01	0.19	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.21	0.13	0.07	0.43	0.51	0.63	0.44
N9	0.01	0.01	0.02	0.11	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.09	0.06	0.01	0.28	0.35	0.36	0.28
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.05	0.14	0.11	0.07	0.08	0.22	0.09	0.15	0.12	0.21	0.09	0.00	0.04	0.10	0.13	0.17	0.22	0.16
O3'	0.14	0.16	0.01	0.01	0.08	0.02	0.08	0.10	0.09	0.13	0.12	0.16	0.12	0.13	0.06	0.04	0.00	0.09	0.20	0.35	0.26	0.22
O4'	0.01	0.18	0.01	0.01	0.09	0.00	0.04	0.01	0.07	0.11	0.13	0.18	0.06	0.07	0.01	0.10	0.09	0.00	0.09	0.23	0.18	0.13
O5'	0.14	0.29	0.24	0.22	0.29	0.02	0.36	0.01	0.36	0.40	0.33	0.27	0.40	0.43	0.28	0.13	0.20	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.25	0.47	0.25	0.23	0.41	0.11	0.47	0.13	0.50	0.44	0.49	0.43	0.54	0.51	0.35	0.17	0.35	0.23	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.46	0.23	0.14	0.43	0.15	0.57	0.25	0.61	0.50	0.55	0.39	0.69	0.63	0.36	0.22	0.26	0.18	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.35	0.25	0.18	0.33	0.04	0.39	0.02	0.41	0.38	0.38	0.32	0.45	0.44	0.28	0.16	0.22	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00