Doublet Group distance statistics: 51595

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 3, 5, 8, 2, 0, 4, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.002, 0.011, 0.019, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.007, 0.019, 0.030, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.019 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.011, 0.023, 0.034, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.007, 0.019, 0.031, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.019 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.010, 0.023, 0.035, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.023 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.010, 0.027, 0.044, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.027 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.015, 0.035, 0.055, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.035 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.012, 0.038, 0.064, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.038 std_dev=0.026
N6	A	0, 0.013, 0.040, 0.067, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.040 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.016, 0.051, 0.085, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.051 std_dev=0.034
O4'	A	0, 0.043, 0.235, 0.427, 0.792 max_d=0.792 avg_d=0.235 std_dev=0.192
C2	B	0, 0.164, 0.363, 0.562, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.363 std_dev=0.199
N3	B	0, 0.148, 0.349, 0.549, 0.868 max_d=0.868 avg_d=0.349 std_dev=0.201
C2'	A	0, 0.053, 0.255, 0.456, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.255 std_dev=0.202
N1	B	0, 0.189, 0.402, 0.614, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.402 std_dev=0.212
C4	B	0, 0.162, 0.375, 0.588, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.375 std_dev=0.213
C6	B	0, 0.184, 0.417, 0.650, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.417 std_dev=0.233
C5	B	0, 0.165, 0.405, 0.646, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.405 std_dev=0.241
C2'	B	0, 0.263, 0.526, 0.789, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.526 std_dev=0.263
N9	B	0, 0.188, 0.460, 0.732, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.460 std_dev=0.272
C3'	B	0, 0.234, 0.510, 0.787, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.510 std_dev=0.276
N6	B	0, 0.237, 0.520, 0.803, 1.289 max_d=1.289 avg_d=0.520 std_dev=0.283
N7	B	0, 0.194, 0.500, 0.805, 1.254 max_d=1.254 avg_d=0.500 std_dev=0.306
P	A	0, 0.287, 0.598, 0.909, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.598 std_dev=0.311
C1'	B	0, 0.219, 0.534, 0.849, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.534 std_dev=0.315
C8	B	0, 0.205, 0.525, 0.844, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.525 std_dev=0.319
C4'	A	0, 0.123, 0.443, 0.762, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.443 std_dev=0.319
O3'	B	0, 0.283, 0.606, 0.929, 1.291 max_d=1.291 avg_d=0.606 std_dev=0.323
O2'	A	0, 0.003, 0.328, 0.653, 1.727 max_d=1.727 avg_d=0.328 std_dev=0.325
O2'	B	0, 0.348, 0.679, 1.009, 1.627 max_d=1.627 avg_d=0.679 std_dev=0.331
OP2	A	0, 0.260, 0.591, 0.923, 1.664 max_d=1.664 avg_d=0.591 std_dev=0.331
C4'	B	0, 0.267, 0.616, 0.964, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.616 std_dev=0.349
C3'	A	0, 0.118, 0.488, 0.858, 1.593 max_d=1.593 avg_d=0.488 std_dev=0.370
O5'	A	0, 0.191, 0.566, 0.941, 1.711 max_d=1.711 avg_d=0.566 std_dev=0.375
OP1	A	0, 0.327, 0.725, 1.122, 1.404 max_d=1.404 avg_d=0.725 std_dev=0.398
O4'	B	0, 0.243, 0.647, 1.052, 1.584 max_d=1.584 avg_d=0.647 std_dev=0.405
C5'	A	0, 0.187, 0.615, 1.043, 1.759 max_d=1.759 avg_d=0.615 std_dev=0.428
C5'	B	0, 0.280, 0.714, 1.147, 1.607 max_d=1.607 avg_d=0.714 std_dev=0.434
O3'	A	0, 0.219, 0.839, 1.458, 2.809 max_d=2.809 avg_d=0.839 std_dev=0.619
O5'	B	0, 0.297, 0.921, 1.544, 2.873 max_d=2.873 avg_d=0.921 std_dev=0.623
P	B	0, 0.412, 1.280, 2.148, 3.213 max_d=3.213 avg_d=1.280 std_dev=0.868
OP1	B	0, 1.202, 2.329, 3.456, 3.859 max_d=3.859 avg_d=2.329 std_dev=1.127
OP2	B	0, 0.922, 2.224, 3.527, 5.774 max_d=5.774 avg_d=2.224 std_dev=1.302

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.15	0.01	0.15	0.13	0.30	0.16
C2	0.03	0.00	0.18	0.20	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.27	0.07	0.22	0.15	0.26	0.16
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.10	0.02	0.08	0.11	0.11	0.10	0.15	0.18	0.11	0.08	0.04	0.00	0.03	0.02	0.27	0.29	0.34	0.25
C3'	0.02	0.20	0.00	0.00	0.17	0.01	0.21	0.02	0.22	0.21	0.22	0.17	0.24	0.23	0.13	0.02	0.01	0.02	0.17	0.23	0.16	0.09
C4	0.02	0.01	0.10	0.17	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.13	0.17	0.04	0.23	0.15	0.27	0.16
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.11	0.06	0.05	0.09	0.11	0.05	0.15	0.03	0.00	0.02	0.10	0.24	0.07
C5	0.02	0.01	0.08	0.21	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.16	0.20	0.03	0.27	0.18	0.25	0.18
C5'	0.05	0.09	0.11	0.02	0.09	0.01	0.12	0.00	0.12	0.13	0.11	0.08	0.14	0.14	0.08	0.09	0.11	0.02	0.02	0.14	0.19	0.02
C6	0.02	0.01	0.11	0.22	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.23	0.04	0.28	0.19	0.25	0.19
C8	0.01	0.01	0.10	0.21	0.01	0.11	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.15	0.19	0.05	0.28	0.17	0.26	0.17
N1	0.02	0.00	0.15	0.22	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.26	0.06	0.25	0.17	0.26	0.18
N3	0.03	0.01	0.18	0.17	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.25	0.07	0.20	0.14	0.27	0.15
N6	0.03	0.01	0.11	0.24	0.02	0.09	0.02	0.14	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.20	0.26	0.04	0.30	0.22	0.26	0.22
N7	0.01	0.01	0.08	0.23	0.01	0.11	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.18	0.22	0.04	0.31	0.20	0.24	0.20
N9	0.00	0.01	0.04	0.13	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.10	0.11	0.02	0.22	0.14	0.28	0.15
O2'	0.02	0.18	0.00	0.02	0.13	0.15	0.16	0.09	0.18	0.15	0.18	0.16	0.20	0.18	0.10	0.00	0.07	0.10	0.18	0.23	0.38	0.22
O3'	0.15	0.27	0.03	0.01	0.17	0.03	0.20	0.11	0.23	0.19	0.26	0.25	0.26	0.22	0.11	0.07	0.00	0.11	0.18	0.35	0.22	0.19
O4'	0.01	0.07	0.02	0.02	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.05	0.06	0.07	0.04	0.04	0.02	0.10	0.11	0.00	0.07	0.09	0.33	0.18
O5'	0.15	0.22	0.27	0.17	0.23	0.02	0.27	0.02	0.28	0.28	0.25	0.20	0.30	0.31	0.22	0.18	0.18	0.07	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.13	0.15	0.29	0.23	0.15	0.10	0.18	0.14	0.19	0.17	0.17	0.14	0.22	0.20	0.14	0.23	0.35	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.30	0.26	0.34	0.16	0.27	0.24	0.25	0.19	0.25	0.26	0.26	0.27	0.26	0.24	0.28	0.38	0.22	0.33	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.16	0.16	0.25	0.09	0.16	0.07	0.18	0.02	0.19	0.17	0.18	0.15	0.22	0.20	0.15	0.22	0.19	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.27	0.18	0.19	0.20	0.17	0.19	0.20	0.22	0.16	0.25	0.25	0.21	0.17	0.17	0.24	0.22	0.15	0.50	0.56	0.71	0.55
C2	0.23	0.23	0.23	0.21	0.19	0.22	0.20	0.24	0.17	0.27	0.22	0.19	0.17	0.27	0.23	0.27	0.20	0.25	0.71	1.14	1.13	0.93
C2'	0.16	0.31	0.17	0.17	0.19	0.16	0.20	0.19	0.25	0.16	0.29	0.26	0.25	0.18	0.16	0.25	0.22	0.14	0.49	0.50	0.69	0.51
C3'	0.16	0.23	0.15	0.09	0.19	0.08	0.23	0.14	0.24	0.23	0.24	0.20	0.28	0.26	0.19	0.24	0.09	0.10	0.50	0.54	0.67	0.51
C4	0.17	0.23	0.21	0.19	0.12	0.19	0.10	0.21	0.18	0.15	0.25	0.17	0.21	0.12	0.14	0.25	0.19	0.19	0.66	0.91	1.00	0.82
C4'	0.18	0.24	0.15	0.09	0.18	0.08	0.18	0.12	0.19	0.19	0.21	0.23	0.20	0.20	0.18	0.26	0.12	0.12	0.41	0.45	0.50	0.37
C5	0.23	0.21	0.26	0.23	0.12	0.25	0.10	0.27	0.21	0.20	0.26	0.15	0.27	0.14	0.19	0.27	0.21	0.28	0.73	1.03	1.13	0.94
C5'	0.27	0.26	0.28	0.15	0.23	0.16	0.21	0.11	0.20	0.24	0.22	0.27	0.21	0.23	0.24	0.39	0.12	0.21	0.39	0.53	0.45	0.35
C6	0.28	0.20	0.28	0.26	0.17	0.29	0.14	0.31	0.16	0.30	0.24	0.16	0.23	0.24	0.26	0.29	0.23	0.33	0.78	1.22	1.26	1.06
C8	0.18	0.23	0.21	0.21	0.17	0.21	0.24	0.25	0.29	0.18	0.28	0.18	0.32	0.23	0.16	0.24	0.20	0.22	0.62	0.69	0.89	0.73
N1	0.27	0.20	0.27	0.25	0.21	0.28	0.21	0.29	0.14	0.33	0.21	0.18	0.15	0.31	0.27	0.29	0.22	0.31	0.77	1.26	1.24	1.04
N3	0.18	0.24	0.20	0.18	0.15	0.18	0.14	0.19	0.15	0.19	0.23	0.19	0.15	0.18	0.17	0.25	0.19	0.19	0.65	0.97	1.01	0.82
N6	0.32	0.19	0.30	0.29	0.19	0.34	0.15	0.36	0.19	0.35	0.24	0.16	0.28	0.27	0.29	0.30	0.25	0.39	0.83	1.34	1.36	1.17
N7	0.23	0.21	0.26	0.24	0.14	0.27	0.19	0.29	0.28	0.18	0.28	0.15	0.35	0.18	0.17	0.27	0.22	0.30	0.72	0.90	1.07	0.90
N9	0.15	0.25	0.18	0.18	0.16	0.17	0.18	0.20	0.24	0.14	0.26	0.20	0.25	0.16	0.13	0.24	0.19	0.16	0.59	0.70	0.85	0.69
O2'	0.23	0.36	0.22	0.19	0.23	0.19	0.19	0.19	0.22	0.17	0.30	0.33	0.21	0.16	0.20	0.32	0.22	0.19	0.45	0.46	0.65	0.45
O3'	0.18	0.30	0.17	0.12	0.19	0.11	0.21	0.15	0.25	0.21	0.28	0.25	0.28	0.23	0.17	0.27	0.14	0.13	0.49	0.59	0.68	0.50
O4'	0.16	0.24	0.14	0.19	0.19	0.15	0.19	0.20	0.20	0.18	0.22	0.23	0.20	0.18	0.17	0.21	0.23	0.13	0.45	0.47	0.55	0.44
O5'	0.25	0.28	0.26	0.12	0.29	0.08	0.33	0.10	0.33	0.35	0.30	0.27	0.35	0.37	0.30	0.27	0.02	0.16	0.43	0.55	0.55	0.42
OP1	0.06	0.14	0.10	0.05	0.10	0.14	0.16	0.27	0.17	0.20	0.14	0.12	0.21	0.23	0.11	0.16	0.02	0.10	0.30	0.92	0.49	0.37
OP2	0.10	0.21	0.10	0.07	0.18	0.16	0.23	0.28	0.25	0.25	0.23	0.18	0.29	0.29	0.16	0.10	0.02	0.14	0.50	0.82	0.69	0.56
P	0.07	0.14	0.10	0.02	0.11	0.07	0.17	0.16	0.17	0.21	0.14	0.12	0.21	0.23	0.12	0.14	0.00	0.04	0.32	0.69	0.45	0.33

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.26	0.73	0.34	0.24
C2	0.03	0.00	0.11	0.12	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.15	0.03	0.51	1.06	0.77	0.60
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.06	0.06	0.09	0.11	0.07	0.05	0.02	0.01	0.03	0.01	0.26	0.45	0.26	0.18
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.08	0.01	0.10	0.02	0.10	0.14	0.10	0.11	0.12	0.14	0.07	0.02	0.01	0.02	0.30	0.33	0.26	0.20
C4	0.02	0.00	0.06	0.08	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.08	0.02	0.55	1.07	0.76	0.62
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.08	0.13	0.05	0.05	0.11	0.13	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.37	0.24	0.13
C5	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.08	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.10	0.03	0.69	1.28	1.02	0.85
C5'	0.03	0.10	0.02	0.02	0.13	0.01	0.20	0.00	0.20	0.24	0.15	0.08	0.24	0.26	0.13	0.05	0.04	0.02	0.01	0.24	0.35	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.08	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.11	0.03	0.70	1.32	1.09	0.89
C8	0.02	0.01	0.06	0.14	0.01	0.13	0.01	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.15	0.06	0.71	1.24	0.93	0.82
N1	0.03	0.00	0.09	0.10	0.01	0.05	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.13	0.03	0.62	1.20	0.96	0.77
N3	0.04	0.00	0.11	0.11	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.14	0.04	0.45	0.96	0.64	0.50
N6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.11	0.02	0.24	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.09	0.14	0.05	0.78	1.44	1.26	1.03
N7	0.01	0.01	0.05	0.14	0.01	0.13	0.00	0.26	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.15	0.05	0.78	1.40	1.16	0.98
N9	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.06	0.02	0.52	0.99	0.65	0.55
O2'	0.02	0.16	0.01	0.02	0.08	0.05	0.07	0.05	0.10	0.04	0.14	0.15	0.09	0.04	0.03	0.00	0.06	0.06	0.08	0.49	0.33	0.18
O3'	0.02	0.15	0.03	0.01	0.08	0.02	0.10	0.04	0.11	0.15	0.13	0.14	0.14	0.15	0.06	0.06	0.00	0.02	0.23	0.53	0.33	0.21
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.06	0.03	0.04	0.05	0.05	0.02	0.06	0.02	0.00	0.18	0.70	0.33	0.21
O5'	0.26	0.51	0.26	0.30	0.55	0.02	0.69	0.01	0.70	0.71	0.62	0.45	0.78	0.78	0.52	0.08	0.23	0.18	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.73	1.06	0.45	0.33	1.07	0.37	1.28	0.24	1.32	1.24	1.20	0.96	1.44	1.40	0.99	0.49	0.53	0.70	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.34	0.77	0.26	0.26	0.76	0.24	1.02	0.35	1.09	0.93	0.96	0.64	1.26	1.16	0.65	0.33	0.33	0.33	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.24	0.60	0.18	0.20	0.62	0.13	0.85	0.02	0.89	0.82	0.77	0.50	1.03	0.98	0.55	0.18	0.21	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00