Doublet Group distance statistics: 51598

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 2, 3, 5, 6, 3, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.012, 0.018, 0.025, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.018 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.015, 0.024, 0.032, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.024 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.022, 0.031, 0.040, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.031 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.010, 0.023, 0.036, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.023 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.027, 0.041, 0.054, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.041 std_dev=0.014
N6	A	0, 0.024, 0.038, 0.053, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.038 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.012, 0.028, 0.044, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.028 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.043, 0.059, 0.075, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.059 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.034, 0.055, 0.076, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.055 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.035, 0.058, 0.081, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.058 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.049, 0.073, 0.097, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.073 std_dev=0.024
O4'	A	0, 0.003, 0.161, 0.320, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.161 std_dev=0.159
C2'	A	0, 0.057, 0.237, 0.417, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.237 std_dev=0.180
C2	B	0, 0.195, 0.397, 0.599, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.397 std_dev=0.202
N1	B	0, 0.248, 0.452, 0.656, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.452 std_dev=0.204
C6	B	0, 0.354, 0.559, 0.764, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.559 std_dev=0.205
N3	B	0, 0.203, 0.415, 0.628, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.415 std_dev=0.212
C5	B	0, 0.342, 0.569, 0.796, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.569 std_dev=0.227
C4'	A	0, 0.213, 0.449, 0.685, 1.307 max_d=1.307 avg_d=0.449 std_dev=0.236
C4	B	0, 0.210, 0.451, 0.692, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.451 std_dev=0.241
C3'	A	0, 0.107, 0.383, 0.660, 1.508 max_d=1.508 avg_d=0.383 std_dev=0.276
O2'	A	0, 0.311, 0.601, 0.890, 1.744 max_d=1.744 avg_d=0.601 std_dev=0.290
N6	B	0, 0.480, 0.785, 1.091, 1.417 max_d=1.417 avg_d=0.785 std_dev=0.305
C5'	A	0, 0.497, 0.812, 1.126, 1.506 max_d=1.506 avg_d=0.812 std_dev=0.314
N9	B	0, 0.335, 0.661, 0.987, 1.609 max_d=1.609 avg_d=0.661 std_dev=0.326
N7	B	0, 0.482, 0.811, 1.141, 1.845 max_d=1.845 avg_d=0.811 std_dev=0.329
O5'	A	0, 0.645, 1.010, 1.376, 1.452 max_d=1.452 avg_d=1.010 std_dev=0.366
C2'	B	0, 0.394, 0.762, 1.129, 1.452 max_d=1.452 avg_d=0.762 std_dev=0.367
C8	B	0, 0.458, 0.829, 1.199, 1.979 max_d=1.979 avg_d=0.829 std_dev=0.371
O2'	B	0, 0.456, 0.875, 1.293, 1.823 max_d=1.823 avg_d=0.875 std_dev=0.419
C1'	B	0, 0.384, 0.829, 1.275, 1.984 max_d=1.984 avg_d=0.829 std_dev=0.445
C3'	B	0, 0.535, 0.995, 1.455, 1.872 max_d=1.872 avg_d=0.995 std_dev=0.460
O3'	A	0, 0.120, 0.590, 1.059, 2.486 max_d=2.486 avg_d=0.590 std_dev=0.470
O3'	B	0, 0.688, 1.208, 1.729, 2.015 max_d=2.015 avg_d=1.208 std_dev=0.520
P	A	0, 0.972, 1.517, 2.063, 2.198 max_d=2.198 avg_d=1.517 std_dev=0.546
C4'	B	0, 0.364, 0.987, 1.611, 2.631 max_d=2.631 avg_d=0.987 std_dev=0.623
OP2	A	0, 1.301, 1.954, 2.608, 3.289 max_d=3.289 avg_d=1.954 std_dev=0.653
O4'	B	0, 0.488, 1.150, 1.812, 2.820 max_d=2.820 avg_d=1.150 std_dev=0.662
C5'	B	0, 0.376, 1.127, 1.878, 3.133 max_d=3.133 avg_d=1.127 std_dev=0.751
OP1	A	0, 1.286, 2.046, 2.806, 3.489 max_d=3.489 avg_d=2.046 std_dev=0.760
O5'	B	0, 1.289, 2.154, 3.019, 4.432 max_d=4.432 avg_d=2.154 std_dev=0.865
P	B	0, 1.197, 2.244, 3.291, 5.216 max_d=5.216 avg_d=2.244 std_dev=1.047
OP2	B	0, 1.140, 2.235, 3.331, 5.136 max_d=5.136 avg_d=2.235 std_dev=1.095
OP1	B	0, 1.292, 2.440, 3.588, 5.690 max_d=5.690 avg_d=2.440 std_dev=1.148

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.03	0.02	0.04	0.05	0.02	0.02	0.01	0.02	0.14	0.01	0.13	0.12	0.44	0.19
C2	0.05	0.00	0.14	0.13	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.14	0.14	0.08	0.18	0.23	0.49	0.25
C2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.09	0.07	0.08	0.11	0.14	0.05	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.19	0.26	0.50	0.28
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.13	0.01	0.17	0.02	0.17	0.18	0.15	0.11	0.19	0.20	0.11	0.02	0.01	0.02	0.08	0.16	0.39	0.19
C4	0.02	0.01	0.07	0.13	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.11	0.08	0.04	0.20	0.21	0.47	0.23
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.06	0.11	0.04	0.04	0.08	0.11	0.05	0.15	0.02	0.01	0.02	0.10	0.29	0.10
C5	0.01	0.01	0.04	0.17	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.15	0.09	0.03	0.26	0.28	0.46	0.27
C5'	0.04	0.06	0.09	0.02	0.08	0.01	0.13	0.00	0.13	0.15	0.09	0.05	0.16	0.17	0.08	0.07	0.10	0.02	0.01	0.17	0.11	0.02
C6	0.03	0.01	0.07	0.17	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.16	0.09	0.04	0.27	0.30	0.48	0.28
C8	0.02	0.01	0.08	0.18	0.01	0.11	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.15	0.13	0.05	0.28	0.23	0.42	0.23
N1	0.04	0.01	0.11	0.15	0.02	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.10	0.06	0.22	0.28	0.49	0.27
N3	0.05	0.01	0.14	0.11	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.12	0.15	0.08	0.16	0.20	0.48	0.23
N6	0.02	0.02	0.05	0.19	0.02	0.08	0.02	0.16	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.18	0.12	0.04	0.30	0.35	0.48	0.32
N7	0.02	0.02	0.06	0.20	0.01	0.11	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.17	0.15	0.04	0.31	0.30	0.44	0.28
N9	0.01	0.02	0.02	0.11	0.01	0.05	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.10	0.06	0.02	0.19	0.18	0.46	0.21
O2'	0.02	0.14	0.01	0.02	0.11	0.15	0.15	0.07	0.16	0.15	0.15	0.12	0.18	0.17	0.10	0.00	0.05	0.10	0.14	0.22	0.48	0.23
O3'	0.14	0.14	0.02	0.01	0.08	0.02	0.09	0.10	0.09	0.13	0.10	0.15	0.12	0.15	0.06	0.05	0.00	0.10	0.19	0.26	0.39	0.24
O4'	0.01	0.08	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.05	0.06	0.08	0.04	0.04	0.02	0.10	0.10	0.00	0.11	0.08	0.38	0.17
O5'	0.13	0.18	0.19	0.08	0.20	0.02	0.26	0.01	0.27	0.28	0.22	0.16	0.30	0.31	0.19	0.14	0.19	0.11	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.12	0.23	0.26	0.16	0.21	0.10	0.28	0.17	0.30	0.23	0.28	0.20	0.35	0.30	0.18	0.22	0.26	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.44	0.49	0.50	0.39	0.47	0.29	0.46	0.11	0.48	0.42	0.49	0.48	0.48	0.44	0.46	0.48	0.39	0.38	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.19	0.25	0.28	0.19	0.23	0.10	0.27	0.02	0.28	0.23	0.27	0.23	0.32	0.28	0.21	0.23	0.24	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.34	0.20	0.23	0.19	0.20	0.20	0.26	0.24	0.20	0.30	0.28	0.25	0.21	0.17	0.31	0.26	0.18	0.66	0.92	0.84	0.76
C2	0.17	0.22	0.20	0.24	0.17	0.23	0.24	0.36	0.25	0.25	0.23	0.19	0.33	0.29	0.19	0.27	0.26	0.19	0.83	1.10	1.12	0.99
C2'	0.16	0.35	0.16	0.22	0.19	0.19	0.21	0.29	0.24	0.23	0.30	0.28	0.26	0.25	0.18	0.26	0.25	0.16	0.71	1.07	0.98	0.88
C3'	0.13	0.30	0.12	0.16	0.15	0.14	0.17	0.23	0.19	0.22	0.25	0.25	0.20	0.22	0.15	0.22	0.19	0.12	0.65	1.03	0.90	0.83
C4	0.17	0.26	0.21	0.25	0.17	0.24	0.22	0.35	0.23	0.24	0.25	0.21	0.27	0.26	0.19	0.27	0.26	0.20	0.81	1.06	1.05	0.95
C4'	0.15	0.32	0.12	0.13	0.19	0.11	0.19	0.16	0.22	0.21	0.28	0.27	0.22	0.21	0.17	0.22	0.19	0.11	0.50	0.82	0.68	0.62
C5	0.21	0.21	0.24	0.29	0.19	0.30	0.23	0.43	0.19	0.29	0.18	0.19	0.24	0.30	0.23	0.27	0.28	0.26	0.89	1.13	1.14	1.04
C5'	0.20	0.31	0.20	0.11	0.22	0.09	0.22	0.11	0.22	0.26	0.26	0.29	0.21	0.25	0.22	0.24	0.12	0.14	0.42	0.74	0.58	0.53
C6	0.22	0.19	0.24	0.29	0.20	0.31	0.25	0.46	0.20	0.32	0.16	0.18	0.27	0.34	0.24	0.26	0.29	0.28	0.92	1.17	1.21	1.09
C8	0.22	0.26	0.26	0.29	0.19	0.30	0.19	0.39	0.19	0.24	0.22	0.26	0.21	0.24	0.21	0.30	0.28	0.26	0.83	1.05	0.99	0.94
N1	0.18	0.20	0.22	0.27	0.19	0.27	0.25	0.42	0.24	0.29	0.18	0.18	0.32	0.32	0.21	0.26	0.27	0.23	0.88	1.15	1.19	1.06
N3	0.17	0.26	0.20	0.24	0.18	0.21	0.23	0.32	0.26	0.23	0.27	0.20	0.31	0.26	0.18	0.28	0.26	0.18	0.79	1.05	1.05	0.93
N6	0.27	0.19	0.28	0.33	0.22	0.37	0.27	0.53	0.19	0.37	0.17	0.18	0.25	0.39	0.29	0.28	0.31	0.35	0.97	1.21	1.27	1.15
N7	0.26	0.20	0.29	0.32	0.20	0.35	0.20	0.47	0.16	0.30	0.17	0.21	0.21	0.29	0.26	0.30	0.30	0.33	0.92	1.13	1.12	1.06
N9	0.17	0.30	0.21	0.25	0.18	0.23	0.20	0.32	0.22	0.22	0.26	0.26	0.24	0.23	0.18	0.29	0.26	0.19	0.76	1.01	0.95	0.88
O2'	0.20	0.39	0.20	0.19	0.21	0.17	0.24	0.23	0.29	0.23	0.35	0.31	0.33	0.26	0.18	0.36	0.22	0.18	0.64	1.00	0.93	0.81
O3'	0.14	0.34	0.12	0.16	0.18	0.14	0.19	0.24	0.22	0.24	0.29	0.28	0.22	0.24	0.17	0.21	0.20	0.11	0.63	1.07	0.92	0.84
O4'	0.16	0.32	0.18	0.22	0.19	0.20	0.21	0.23	0.24	0.20	0.29	0.27	0.25	0.21	0.17	0.29	0.28	0.17	0.56	0.79	0.68	0.63
O5'	0.27	0.31	0.28	0.14	0.29	0.10	0.32	0.12	0.30	0.39	0.30	0.30	0.32	0.38	0.31	0.29	0.02	0.18	0.53	0.89	0.66	0.66
OP1	0.07	0.26	0.10	0.08	0.14	0.15	0.16	0.29	0.18	0.20	0.23	0.22	0.18	0.20	0.11	0.17	0.05	0.12	0.51	0.74	0.77	0.61
OP2	0.13	0.46	0.15	0.07	0.29	0.16	0.29	0.30	0.34	0.29	0.42	0.41	0.33	0.30	0.20	0.15	0.03	0.13	0.66	1.08	0.74	0.80
P	0.06	0.27	0.10	0.02	0.14	0.07	0.15	0.16	0.16	0.22	0.23	0.23	0.16	0.21	0.12	0.14	0.01	0.03	0.49	0.80	0.60	0.58

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.04	0.06	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.19	0.27	0.26	0.14
C2	0.06	0.00	0.15	0.17	0.01	0.09	0.01	0.16	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.18	0.22	0.05	0.50	0.58	0.63	0.51
C2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.08	0.02	0.05	0.03	0.08	0.07	0.12	0.15	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.26	0.36	0.22	0.23
C3'	0.02	0.17	0.01	0.00	0.08	0.01	0.07	0.03	0.08	0.14	0.14	0.16	0.07	0.11	0.06	0.03	0.01	0.02	0.34	0.44	0.23	0.31
C4	0.03	0.01	0.08	0.08	0.00	0.06	0.01	0.15	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.09	0.03	0.49	0.52	0.53	0.45
C4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.12	0.08	0.09	0.09	0.12	0.05	0.06	0.02	0.00	0.02	0.16	0.24	0.04
C5	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.08	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.08	0.04	0.61	0.64	0.69	0.59
C5'	0.04	0.16	0.03	0.03	0.15	0.01	0.21	0.00	0.22	0.23	0.20	0.14	0.26	0.26	0.14	0.06	0.05	0.02	0.01	0.18	0.33	0.02
C6	0.03	0.02	0.08	0.08	0.01	0.08	0.01	0.22	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.11	0.10	0.04	0.64	0.71	0.79	0.66
C8	0.02	0.01	0.07	0.14	0.01	0.12	0.01	0.23	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.16	0.05	0.58	0.54	0.55	0.47
N1	0.04	0.01	0.12	0.14	0.02	0.08	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.15	0.17	0.04	0.59	0.68	0.75	0.62
N3	0.06	0.01	0.15	0.16	0.01	0.09	0.01	0.14	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.16	0.20	0.05	0.43	0.49	0.51	0.41
N6	0.03	0.02	0.06	0.07	0.02	0.09	0.02	0.26	0.01	0.03	0.02	0.03	0.00	0.04	0.02	0.10	0.08	0.05	0.71	0.79	0.89	0.75
N7	0.02	0.01	0.05	0.11	0.01	0.12	0.00	0.26	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.04	0.13	0.05	0.66	0.66	0.72	0.61
N9	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.05	0.01	0.14	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.42	0.43	0.41	0.34
O2'	0.02	0.18	0.00	0.03	0.09	0.06	0.07	0.06	0.11	0.04	0.15	0.16	0.10	0.04	0.03	0.00	0.07	0.05	0.10	0.25	0.17	0.10
O3'	0.02	0.22	0.02	0.01	0.09	0.02	0.08	0.05	0.10	0.16	0.17	0.20	0.08	0.13	0.06	0.07	0.00	0.02	0.31	0.51	0.35	0.33
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05	0.05	0.02	0.05	0.02	0.00	0.13	0.23	0.37	0.17
O5'	0.19	0.50	0.26	0.34	0.49	0.02	0.61	0.01	0.64	0.58	0.59	0.43	0.71	0.66	0.42	0.10	0.31	0.13	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.27	0.58	0.36	0.44	0.52	0.16	0.64	0.18	0.71	0.54	0.68	0.49	0.79	0.66	0.43	0.25	0.51	0.23	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.26	0.63	0.22	0.23	0.53	0.24	0.69	0.33	0.79	0.55	0.75	0.51	0.89	0.72	0.41	0.17	0.35	0.37	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.14	0.51	0.23	0.31	0.45	0.04	0.59	0.02	0.66	0.47	0.62	0.41	0.75	0.61	0.34	0.10	0.33	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00