Doublet Group distance statistics: 51599

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 5, 3, 1, 3, 3, 1, 5, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.010 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.008, 0.016, 0.025, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.016 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.020 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.010, 0.023, 0.036, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.023 std_dev=0.013
N6	A	0, 0.013, 0.033, 0.052, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.033 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.010, 0.030, 0.050, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.030 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.015, 0.040, 0.064, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.040 std_dev=0.024
C2'	A	0, 0.050, 0.151, 0.253, 0.419 max_d=0.419 avg_d=0.151 std_dev=0.101
O4'	A	0, 0.023, 0.127, 0.231, 0.399 max_d=0.399 avg_d=0.127 std_dev=0.104
O2'	A	0, 0.094, 0.219, 0.344, 0.542 max_d=0.542 avg_d=0.219 std_dev=0.125
C4'	A	0, 0.060, 0.202, 0.344, 0.516 max_d=0.516 avg_d=0.202 std_dev=0.142
C3'	A	0, 0.089, 0.244, 0.398, 0.618 max_d=0.618 avg_d=0.244 std_dev=0.154
P	A	0, 0.246, 0.438, 0.631, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.438 std_dev=0.193
O3'	A	0, 0.150, 0.376, 0.603, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.376 std_dev=0.227
C5'	A	0, 0.112, 0.351, 0.589, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.351 std_dev=0.239
O5'	A	0, 0.149, 0.404, 0.659, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.404 std_dev=0.255
OP1	A	0, 0.297, 0.557, 0.817, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.557 std_dev=0.260
OP2	A	0, 0.246, 0.511, 0.776, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.511 std_dev=0.265
N9	B	0, 0.222, 0.493, 0.764, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.493 std_dev=0.271
C4	B	0, 0.244, 0.519, 0.795, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.519 std_dev=0.275
C8	B	0, 0.263, 0.540, 0.816, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.540 std_dev=0.276
N7	B	0, 0.285, 0.566, 0.846, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.566 std_dev=0.281
C5	B	0, 0.244, 0.532, 0.820, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.532 std_dev=0.288
O3'	B	0, 0.304, 0.600, 0.895, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.600 std_dev=0.296
C2'	B	0, 0.238, 0.537, 0.836, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.537 std_dev=0.299
C1'	B	0, 0.217, 0.517, 0.817, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.517 std_dev=0.300
O2'	B	0, 0.295, 0.607, 0.919, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.607 std_dev=0.312
C3'	B	0, 0.332, 0.646, 0.960, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.646 std_dev=0.314
N3	B	0, 0.278, 0.610, 0.942, 1.244 max_d=1.244 avg_d=0.610 std_dev=0.332
O4'	B	0, 0.275, 0.612, 0.949, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.612 std_dev=0.337
C4'	B	0, 0.409, 0.758, 1.106, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.758 std_dev=0.348
C6	B	0, 0.223, 0.595, 0.967, 1.619 max_d=1.619 avg_d=0.595 std_dev=0.372
C2	B	0, 0.290, 0.683, 1.076, 1.691 max_d=1.691 avg_d=0.683 std_dev=0.393
N1	B	0, 0.253, 0.672, 1.092, 1.871 max_d=1.871 avg_d=0.672 std_dev=0.419
N6	B	0, 0.232, 0.663, 1.093, 2.090 max_d=2.090 avg_d=0.663 std_dev=0.430
C5'	B	0, 0.869, 1.499, 2.128, 2.863 max_d=2.863 avg_d=1.499 std_dev=0.630
O5'	B	0, 0.908, 1.797, 2.686, 3.621 max_d=3.621 avg_d=1.797 std_dev=0.889
OP2	B	0, 1.960, 3.227, 4.493, 4.771 max_d=4.771 avg_d=3.227 std_dev=1.266
P	B	0, 1.464, 2.746, 4.029, 5.197 max_d=5.197 avg_d=2.746 std_dev=1.283
OP1	B	0, 1.726, 3.301, 4.876, 6.808 max_d=6.808 avg_d=3.301 std_dev=1.575

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.09	0.28	0.14
C2	0.02	0.00	0.10	0.07	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.09	0.07	0.16	0.13	0.28	0.16
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.06	0.06	0.08	0.10	0.05	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.11	0.12	0.24	0.07
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.07	0.11	0.06	0.06	0.09	0.10	0.05	0.02	0.01	0.01	0.15	0.17	0.22	0.08
C4	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.06	0.04	0.17	0.13	0.28	0.16
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.04	0.03	0.06	0.07	0.03	0.05	0.03	0.00	0.02	0.08	0.21	0.06
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.08	0.03	0.21	0.17	0.28	0.19
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.11	0.12	0.10	0.07	0.13	0.13	0.07	0.04	0.06	0.01	0.01	0.09	0.14	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.07	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.08	0.04	0.22	0.18	0.28	0.19
C8	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.12	0.05	0.23	0.18	0.29	0.19
N1	0.02	0.00	0.08	0.06	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.08	0.06	0.19	0.16	0.28	0.18
N3	0.02	0.01	0.10	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.09	0.07	0.14	0.11	0.28	0.15
N6	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.08	0.10	0.04	0.24	0.21	0.29	0.21
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.12	0.03	0.25	0.20	0.28	0.21
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.05	0.02	0.15	0.13	0.28	0.15
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.07	0.05	0.06	0.04	0.08	0.05	0.11	0.13	0.08	0.05	0.03	0.00	0.05	0.04	0.07	0.13	0.23	0.06
O3'	0.02	0.09	0.03	0.01	0.06	0.03	0.08	0.06	0.08	0.12	0.08	0.09	0.10	0.12	0.05	0.05	0.00	0.02	0.17	0.27	0.25	0.16
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.06	0.07	0.04	0.03	0.02	0.04	0.02	0.00	0.09	0.12	0.31	0.17
O5'	0.08	0.16	0.11	0.15	0.17	0.02	0.21	0.01	0.22	0.23	0.19	0.14	0.24	0.25	0.15	0.07	0.17	0.09	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.09	0.13	0.12	0.17	0.13	0.08	0.17	0.09	0.18	0.18	0.16	0.11	0.21	0.20	0.13	0.13	0.27	0.12	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.28	0.28	0.24	0.22	0.28	0.21	0.28	0.14	0.28	0.29	0.28	0.28	0.29	0.28	0.28	0.23	0.25	0.31	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.16	0.07	0.08	0.16	0.06	0.19	0.02	0.19	0.19	0.18	0.15	0.21	0.21	0.15	0.06	0.16	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.30	0.21	0.28	0.18	0.22	0.22	0.28	0.27	0.25	0.31	0.23	0.30	0.25	0.19	0.29	0.30	0.20	0.51	0.62	0.91	0.61
C2	0.22	0.22	0.25	0.28	0.18	0.24	0.26	0.36	0.30	0.28	0.27	0.19	0.40	0.32	0.21	0.33	0.27	0.22	0.74	0.92	1.15	0.88
C2'	0.16	0.28	0.16	0.22	0.16	0.17	0.21	0.25	0.25	0.24	0.29	0.21	0.29	0.25	0.17	0.26	0.23	0.15	0.49	0.67	1.00	0.65
C3'	0.14	0.31	0.12	0.16	0.19	0.11	0.21	0.19	0.25	0.22	0.30	0.25	0.27	0.23	0.17	0.24	0.17	0.11	0.40	0.73	0.97	0.60
C4	0.19	0.23	0.23	0.29	0.12	0.24	0.20	0.37	0.24	0.27	0.25	0.15	0.31	0.28	0.18	0.30	0.28	0.20	0.71	0.83	1.13	0.85
C4'	0.16	0.35	0.13	0.17	0.22	0.14	0.22	0.17	0.27	0.20	0.33	0.30	0.27	0.21	0.18	0.24	0.22	0.14	0.31	0.63	0.81	0.48
C5	0.20	0.21	0.22	0.30	0.12	0.28	0.18	0.46	0.19	0.30	0.21	0.16	0.26	0.30	0.20	0.28	0.27	0.23	0.83	0.99	1.30	1.01
C5'	0.23	0.38	0.22	0.15	0.28	0.15	0.25	0.17	0.29	0.21	0.35	0.35	0.28	0.22	0.23	0.32	0.18	0.17	0.24	0.73	0.79	0.47
C6	0.23	0.23	0.24	0.29	0.16	0.29	0.20	0.48	0.17	0.32	0.19	0.21	0.28	0.33	0.23	0.29	0.26	0.25	0.89	1.11	1.39	1.09
C8	0.19	0.23	0.20	0.32	0.15	0.29	0.19	0.45	0.21	0.29	0.23	0.18	0.25	0.27	0.19	0.25	0.29	0.22	0.73	0.86	1.20	0.89
N1	0.23	0.22	0.25	0.29	0.19	0.27	0.25	0.42	0.24	0.30	0.19	0.22	0.37	0.34	0.23	0.31	0.27	0.24	0.83	1.06	1.30	1.01
N3	0.20	0.25	0.24	0.28	0.16	0.23	0.24	0.32	0.30	0.26	0.31	0.17	0.37	0.29	0.19	0.32	0.28	0.20	0.67	0.80	1.06	0.79
N6	0.25	0.30	0.23	0.29	0.21	0.33	0.22	0.55	0.18	0.34	0.26	0.26	0.25	0.36	0.25	0.27	0.26	0.28	0.97	1.27	1.54	1.23
N7	0.21	0.22	0.21	0.32	0.15	0.32	0.19	0.52	0.20	0.32	0.22	0.18	0.25	0.30	0.21	0.25	0.27	0.26	0.86	1.01	1.37	1.06
N9	0.17	0.25	0.21	0.30	0.14	0.24	0.20	0.35	0.24	0.26	0.26	0.18	0.28	0.26	0.18	0.28	0.29	0.19	0.64	0.74	1.06	0.77
O2'	0.20	0.32	0.19	0.24	0.21	0.19	0.25	0.23	0.30	0.26	0.33	0.25	0.34	0.27	0.21	0.26	0.25	0.19	0.44	0.63	0.92	0.58
O3'	0.16	0.31	0.14	0.17	0.19	0.13	0.21	0.20	0.25	0.23	0.30	0.25	0.27	0.23	0.17	0.25	0.18	0.13	0.37	0.81	0.98	0.61
O4'	0.17	0.35	0.17	0.26	0.22	0.20	0.23	0.24	0.28	0.22	0.33	0.29	0.29	0.23	0.18	0.25	0.31	0.17	0.39	0.55	0.77	0.49
O5'	0.26	0.37	0.28	0.09	0.29	0.08	0.27	0.12	0.30	0.23	0.35	0.35	0.29	0.23	0.25	0.40	0.02	0.16	0.30	0.78	0.88	0.55
OP1	0.05	0.18	0.12	0.04	0.11	0.14	0.13	0.27	0.15	0.17	0.17	0.16	0.18	0.17	0.08	0.19	0.02	0.09	0.40	1.05	0.95	0.66
OP2	0.11	0.22	0.18	0.07	0.17	0.19	0.19	0.42	0.22	0.19	0.23	0.19	0.25	0.21	0.14	0.22	0.02	0.12	0.54	1.08	1.16	0.87
P	0.09	0.19	0.16	0.02	0.13	0.09	0.14	0.22	0.16	0.16	0.19	0.17	0.18	0.16	0.11	0.22	0.01	0.03	0.32	0.87	0.86	0.58

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.31	0.52	0.40	0.28
C2	0.02	0.00	0.11	0.10	0.02	0.03	0.02	0.12	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.16	0.12	0.06	0.54	0.88	0.89	0.62
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.02	0.04	0.04	0.06	0.07	0.09	0.11	0.07	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.23	0.34	0.43	0.22
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.07	0.00	0.10	0.05	0.10	0.13	0.10	0.09	0.12	0.13	0.07	0.02	0.01	0.02	0.20	0.34	0.45	0.25
C4	0.01	0.02	0.06	0.07	0.00	0.04	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.06	0.04	0.59	0.85	0.92	0.66
C4'	0.02	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.08	0.15	0.05	0.03	0.12	0.15	0.06	0.06	0.02	0.00	0.02	0.28	0.21	0.11
C5	0.02	0.02	0.04	0.10	0.01	0.09	0.00	0.28	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.08	0.05	0.75	1.05	1.23	0.91
C5'	0.05	0.12	0.04	0.05	0.18	0.01	0.28	0.00	0.27	0.34	0.20	0.09	0.33	0.37	0.19	0.07	0.04	0.02	0.01	0.13	0.23	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.08	0.01	0.27	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.12	0.09	0.05	0.76	1.11	1.30	0.94
C8	0.03	0.02	0.07	0.13	0.01	0.15	0.01	0.34	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.05	0.13	0.08	0.80	0.99	1.17	0.91
N1	0.02	0.00	0.09	0.10	0.01	0.05	0.02	0.20	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.15	0.10	0.06	0.66	1.01	1.12	0.80
N3	0.02	0.00	0.11	0.09	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.11	0.06	0.47	0.78	0.75	0.51
N6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.12	0.01	0.33	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.11	0.11	0.06	0.84	1.24	1.50	1.09
N7	0.02	0.02	0.06	0.13	0.01	0.15	0.00	0.37	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.13	0.07	0.86	1.17	1.41	1.07
N9	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.06	0.01	0.19	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.05	0.02	0.57	0.75	0.81	0.61
O2'	0.01	0.16	0.00	0.02	0.10	0.06	0.09	0.07	0.12	0.05	0.15	0.15	0.11	0.06	0.04	0.00	0.05	0.05	0.11	0.45	0.42	0.22
O3'	0.01	0.12	0.02	0.01	0.06	0.02	0.08	0.04	0.09	0.13	0.10	0.11	0.11	0.13	0.05	0.05	0.00	0.02	0.22	0.59	0.60	0.37
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.04	0.00	0.05	0.02	0.05	0.08	0.06	0.06	0.06	0.07	0.02	0.05	0.02	0.00	0.22	0.53	0.25	0.24
O5'	0.31	0.54	0.23	0.20	0.59	0.02	0.75	0.01	0.76	0.80	0.66	0.47	0.84	0.86	0.57	0.11	0.22	0.22	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.52	0.88	0.34	0.34	0.85	0.28	1.05	0.13	1.11	0.99	1.01	0.78	1.24	1.17	0.75	0.45	0.59	0.53	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.40	0.89	0.43	0.45	0.92	0.21	1.23	0.23	1.30	1.17	1.12	0.75	1.50	1.41	0.81	0.42	0.60	0.25	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.28	0.62	0.22	0.25	0.66	0.11	0.91	0.01	0.94	0.91	0.80	0.51	1.09	1.07	0.61	0.22	0.37	0.24	0.01	0.01	0.01	0.00