Doublet Group distance statistics: 51602

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 3, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.005, 0.013, 0.022, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.013 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.004, 0.017, 0.029, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.017 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.003, 0.018, 0.032, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.018 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.009, 0.025, 0.041, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.025 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.008, 0.024, 0.041, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.024 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.005, 0.028, 0.050, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.028 std_dev=0.023
N6	A	0, 0.026, 0.055, 0.084, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.055 std_dev=0.029
N7	A	0, 0.014, 0.049, 0.083, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.049 std_dev=0.034
C8	A	0, 0.013, 0.051, 0.088, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.051 std_dev=0.037
O4'	A	0, -0.063, 0.140, 0.342, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.140 std_dev=0.203
C2'	A	0, -0.017, 0.188, 0.393, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.188 std_dev=0.205
C2	B	0, 0.110, 0.359, 0.608, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.359 std_dev=0.249
C4	B	0, 0.188, 0.438, 0.688, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.438 std_dev=0.250
N3	B	0, 0.155, 0.407, 0.659, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.407 std_dev=0.252
N1	B	0, 0.089, 0.344, 0.600, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.344 std_dev=0.256
C6	B	0, 0.154, 0.413, 0.671, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.413 std_dev=0.258
C5	B	0, 0.201, 0.459, 0.718, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.459 std_dev=0.258
N9	B	0, 0.249, 0.513, 0.778, 1.150 max_d=1.150 avg_d=0.513 std_dev=0.265
C8	B	0, 0.296, 0.577, 0.858, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.577 std_dev=0.281
C2'	B	0, 0.205, 0.489, 0.773, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.489 std_dev=0.284
N6	B	0, 0.186, 0.474, 0.762, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.474 std_dev=0.288
N7	B	0, 0.269, 0.560, 0.851, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.560 std_dev=0.291
C1'	B	0, 0.256, 0.549, 0.843, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.549 std_dev=0.294
C3'	B	0, 0.270, 0.573, 0.876, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.573 std_dev=0.303
O2'	B	0, 0.217, 0.543, 0.869, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.543 std_dev=0.326
O2'	A	0, -0.041, 0.287, 0.616, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.287 std_dev=0.329
O3'	B	0, 0.261, 0.591, 0.921, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.591 std_dev=0.330
O4'	B	0, 0.319, 0.669, 1.020, 1.459 max_d=1.459 avg_d=0.669 std_dev=0.350
C4'	B	0, 0.319, 0.678, 1.036, 1.197 max_d=1.197 avg_d=0.678 std_dev=0.358
O5'	A	0, 0.055, 0.419, 0.784, 1.457 max_d=1.457 avg_d=0.419 std_dev=0.364
C4'	A	0, -0.136, 0.244, 0.624, 1.575 max_d=1.575 avg_d=0.244 std_dev=0.380
P	A	0, 0.134, 0.549, 0.964, 1.750 max_d=1.750 avg_d=0.549 std_dev=0.415
C5'	B	0, 0.404, 0.819, 1.235, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.819 std_dev=0.416
C5'	A	0, -0.049, 0.368, 0.785, 1.786 max_d=1.786 avg_d=0.368 std_dev=0.417
C3'	A	0, -0.131, 0.307, 0.745, 1.824 max_d=1.824 avg_d=0.307 std_dev=0.438
OP2	A	0, 0.186, 0.673, 1.160, 2.066 max_d=2.066 avg_d=0.673 std_dev=0.487
O5'	B	0, 0.361, 0.924, 1.487, 2.338 max_d=2.338 avg_d=0.924 std_dev=0.563
OP1	A	0, 0.067, 0.638, 1.209, 2.457 max_d=2.457 avg_d=0.638 std_dev=0.571
P	B	0, 0.482, 1.172, 1.862, 2.586 max_d=2.586 avg_d=1.172 std_dev=0.690
O3'	A	0, -0.223, 0.499, 1.221, 3.004 max_d=3.004 avg_d=0.499 std_dev=0.722
OP1	B	0, 0.549, 1.446, 2.342, 3.491 max_d=3.491 avg_d=1.446 std_dev=0.896
OP2	B	0, 0.245, 1.389, 2.533, 4.722 max_d=4.722 avg_d=1.389 std_dev=1.144

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.14	0.00	0.08	0.11	0.09	0.07
C2	0.03	0.00	0.18	0.19	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.12	0.07	0.13	0.15	0.28	0.19
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.10	0.02	0.07	0.09	0.11	0.07	0.15	0.18	0.09	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.22	0.32	0.31	0.27
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.19	0.00	0.24	0.01	0.25	0.21	0.23	0.16	0.28	0.25	0.15	0.02	0.01	0.02	0.13	0.23	0.11	0.14
C4	0.01	0.01	0.10	0.19	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.11	0.07	0.03	0.13	0.14	0.24	0.18
C4'	0.00	0.04	0.02	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.08	0.12	0.05	0.04	0.10	0.12	0.06	0.19	0.01	0.00	0.01	0.09	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.24	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.14	0.02	0.19	0.24	0.35	0.27
C5'	0.03	0.04	0.09	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.09	0.12	0.06	0.04	0.12	0.13	0.05	0.10	0.12	0.01	0.01	0.07	0.05	0.01
C6	0.02	0.01	0.11	0.25	0.00	0.08	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.16	0.15	0.03	0.21	0.26	0.40	0.30
C8	0.01	0.01	0.07	0.21	0.01	0.12	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.17	0.15	0.06	0.19	0.21	0.26	0.23
N1	0.03	0.01	0.15	0.23	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.13	0.13	0.05	0.17	0.21	0.35	0.25
N3	0.02	0.01	0.18	0.16	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.12	0.07	0.10	0.11	0.22	0.14
N6	0.02	0.01	0.09	0.28	0.01	0.10	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.18	0.20	0.02	0.25	0.34	0.48	0.36
N7	0.01	0.01	0.04	0.25	0.01	0.12	0.01	0.13	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.19	0.19	0.04	0.23	0.29	0.38	0.31
N9	0.01	0.01	0.02	0.15	0.00	0.06	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.04	0.01	0.11	0.11	0.17	0.14
O2'	0.02	0.11	0.01	0.02	0.11	0.19	0.16	0.10	0.16	0.17	0.13	0.09	0.18	0.19	0.11	0.00	0.03	0.13	0.14	0.26	0.34	0.22
O3'	0.14	0.12	0.01	0.01	0.07	0.01	0.14	0.12	0.15	0.15	0.13	0.12	0.20	0.19	0.04	0.03	0.00	0.10	0.22	0.24	0.19	0.19
O4'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.06	0.05	0.07	0.02	0.04	0.01	0.13	0.10	0.00	0.12	0.09	0.13	0.11
O5'	0.08	0.13	0.22	0.13	0.13	0.01	0.19	0.01	0.21	0.19	0.17	0.10	0.25	0.23	0.11	0.14	0.22	0.12	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.11	0.15	0.32	0.23	0.14	0.09	0.24	0.07	0.26	0.21	0.21	0.11	0.34	0.29	0.11	0.26	0.24	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.28	0.31	0.11	0.24	0.03	0.35	0.05	0.40	0.26	0.35	0.22	0.48	0.38	0.17	0.34	0.19	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.19	0.27	0.14	0.18	0.02	0.27	0.01	0.30	0.23	0.25	0.14	0.36	0.31	0.14	0.22	0.19	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.16	0.10	0.12	0.11	0.11	0.17	0.13	0.20	0.16	0.18	0.14	0.25	0.21	0.10	0.21	0.18	0.09	0.34	0.48	0.38	0.33
C2	0.19	0.20	0.21	0.22	0.16	0.20	0.10	0.19	0.08	0.12	0.12	0.22	0.11	0.10	0.16	0.24	0.25	0.19	0.50	0.55	0.77	0.51
C2'	0.17	0.15	0.16	0.22	0.17	0.20	0.24	0.27	0.22	0.29	0.16	0.14	0.28	0.32	0.21	0.17	0.23	0.18	0.23	0.43	0.29	0.26
C3'	0.15	0.18	0.14	0.15	0.15	0.14	0.20	0.19	0.21	0.21	0.19	0.16	0.25	0.24	0.15	0.22	0.17	0.13	0.38	0.65	0.43	0.42
C4	0.16	0.14	0.20	0.21	0.10	0.19	0.10	0.17	0.13	0.10	0.10	0.17	0.21	0.13	0.11	0.25	0.25	0.16	0.47	0.53	0.66	0.46
C4'	0.19	0.26	0.15	0.11	0.23	0.09	0.25	0.15	0.26	0.23	0.26	0.25	0.28	0.26	0.21	0.22	0.15	0.13	0.31	0.55	0.34	0.34
C5	0.20	0.15	0.26	0.27	0.13	0.24	0.10	0.22	0.13	0.10	0.08	0.20	0.24	0.12	0.15	0.28	0.30	0.20	0.54	0.59	0.80	0.54
C5'	0.32	0.34	0.31	0.19	0.32	0.19	0.31	0.19	0.31	0.30	0.32	0.35	0.31	0.31	0.31	0.37	0.16	0.25	0.30	0.54	0.34	0.34
C6	0.23	0.21	0.28	0.29	0.19	0.26	0.12	0.25	0.09	0.14	0.11	0.25	0.15	0.11	0.20	0.28	0.32	0.23	0.59	0.62	0.92	0.61
C8	0.17	0.16	0.24	0.24	0.13	0.21	0.21	0.19	0.25	0.16	0.20	0.17	0.32	0.24	0.12	0.30	0.29	0.17	0.47	0.55	0.60	0.45
N1	0.22	0.23	0.25	0.26	0.19	0.24	0.13	0.23	0.10	0.14	0.15	0.25	0.10	0.11	0.19	0.26	0.29	0.22	0.56	0.59	0.89	0.58
N3	0.16	0.16	0.18	0.19	0.11	0.18	0.08	0.16	0.09	0.09	0.09	0.18	0.16	0.10	0.12	0.23	0.23	0.16	0.45	0.52	0.65	0.45
N6	0.27	0.24	0.32	0.35	0.24	0.32	0.18	0.31	0.14	0.20	0.17	0.27	0.15	0.16	0.25	0.31	0.37	0.28	0.67	0.68	1.07	0.69
N7	0.21	0.14	0.29	0.30	0.14	0.26	0.18	0.24	0.23	0.13	0.16	0.19	0.33	0.20	0.15	0.31	0.34	0.22	0.55	0.60	0.78	0.54
N9	0.14	0.14	0.17	0.18	0.09	0.16	0.16	0.15	0.20	0.14	0.16	0.14	0.26	0.19	0.09	0.25	0.23	0.13	0.42	0.52	0.53	0.40
O2'	0.10	0.15	0.06	0.15	0.14	0.10	0.25	0.21	0.26	0.28	0.17	0.14	0.35	0.34	0.16	0.20	0.18	0.08	0.25	0.47	0.28	0.27
O3'	0.16	0.22	0.16	0.17	0.19	0.16	0.23	0.23	0.24	0.22	0.23	0.21	0.28	0.26	0.17	0.24	0.22	0.14	0.49	0.82	0.56	0.56
O4'	0.11	0.25	0.08	0.13	0.19	0.11	0.23	0.14	0.27	0.19	0.27	0.20	0.30	0.23	0.14	0.20	0.23	0.08	0.35	0.50	0.37	0.35
O5'	0.23	0.21	0.26	0.10	0.20	0.08	0.21	0.11	0.20	0.23	0.20	0.22	0.22	0.24	0.21	0.34	0.02	0.14	0.36	0.62	0.37	0.39
OP1	0.05	0.11	0.11	0.05	0.05	0.14	0.10	0.30	0.10	0.15	0.09	0.09	0.14	0.17	0.06	0.20	0.03	0.10	0.45	0.90	0.52	0.56
OP2	0.10	0.18	0.07	0.08	0.17	0.17	0.22	0.28	0.22	0.26	0.20	0.16	0.25	0.28	0.17	0.10	0.02	0.18	0.60	0.89	0.62	0.65
P	0.04	0.09	0.10	0.02	0.06	0.08	0.12	0.20	0.11	0.16	0.09	0.08	0.15	0.18	0.07	0.17	0.01	0.05	0.44	0.76	0.43	0.48

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.14	0.09	0.26	0.15
C2	0.02	0.00	0.06	0.08	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.10	0.02	0.30	0.21	0.62	0.33
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.05	0.06	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.18	0.23	0.17	0.16
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.07	0.08	0.08	0.07	0.07	0.08	0.04	0.02	0.01	0.02	0.26	0.35	0.13	0.21
C4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.31	0.21	0.60	0.33
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.02	0.04	0.05	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.13	0.10	0.03
C5	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.02	0.40	0.29	0.78	0.43
C5'	0.01	0.03	0.02	0.02	0.04	0.01	0.06	0.00	0.06	0.08	0.05	0.02	0.07	0.08	0.04	0.06	0.05	0.01	0.01	0.21	0.18	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.09	0.02	0.41	0.31	0.84	0.45
C8	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.05	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.10	0.04	0.39	0.28	0.70	0.40
N1	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.03	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.37	0.27	0.76	0.40
N3	0.03	0.00	0.06	0.07	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.07	0.09	0.03	0.26	0.17	0.52	0.28
N6	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.10	0.03	0.44	0.36	0.94	0.50
N7	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.05	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.03	0.11	0.04	0.44	0.34	0.86	0.48
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.29	0.19	0.52	0.29
O2'	0.01	0.08	0.01	0.02	0.04	0.05	0.03	0.06	0.05	0.03	0.07	0.07	0.04	0.03	0.01	0.00	0.04	0.03	0.07	0.18	0.04	0.08
O3'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.06	0.01	0.08	0.05	0.09	0.10	0.10	0.09	0.10	0.11	0.05	0.04	0.00	0.01	0.27	0.47	0.22	0.25
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.13	0.10	0.18	0.12
O5'	0.14	0.30	0.18	0.26	0.31	0.01	0.40	0.01	0.41	0.39	0.37	0.26	0.44	0.44	0.29	0.07	0.27	0.13	0.00	0.01	0.03	0.01
OP1	0.09	0.21	0.23	0.35	0.21	0.13	0.29	0.21	0.31	0.28	0.27	0.17	0.36	0.34	0.19	0.18	0.47	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.26	0.62	0.17	0.13	0.60	0.10	0.78	0.18	0.84	0.70	0.76	0.52	0.94	0.86	0.52	0.04	0.22	0.18	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.33	0.16	0.21	0.33	0.03	0.43	0.02	0.45	0.40	0.40	0.28	0.50	0.48	0.29	0.08	0.25	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00