Doublet Group distance statistics: 51603

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 2, 3, 3, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.010, 0.017, 0.024, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.017 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.010, 0.018, 0.027, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.018 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.014, 0.025, 0.035, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.025 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.017, 0.029, 0.041, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.029 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.011, 0.024, 0.036, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.012, 0.025, 0.038, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.025 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.017, 0.033, 0.050, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.033 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.020, 0.039, 0.059, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.039 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.019, 0.041, 0.064, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.041 std_dev=0.023
N6	A	0, 0.030, 0.055, 0.081, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.055 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.023, 0.054, 0.085, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.054 std_dev=0.031
N9	B	0, 0.383, 0.572, 0.761, 0.819 max_d=0.819 avg_d=0.572 std_dev=0.189
C1'	B	0, 0.394, 0.602, 0.810, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.602 std_dev=0.208
C4	B	0, 0.336, 0.547, 0.758, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.547 std_dev=0.211
C2'	B	0, 0.319, 0.531, 0.744, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.531 std_dev=0.213
C8	B	0, 0.388, 0.606, 0.823, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.606 std_dev=0.217
N3	B	0, 0.341, 0.566, 0.792, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.566 std_dev=0.225
O2'	B	0, 0.348, 0.579, 0.810, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.579 std_dev=0.231
O2'	A	0, 0.076, 0.308, 0.539, 0.710 max_d=0.710 avg_d=0.308 std_dev=0.232
C2'	A	0, 0.017, 0.261, 0.504, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.261 std_dev=0.244
C2	B	0, 0.328, 0.589, 0.849, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.589 std_dev=0.260
C5	B	0, 0.292, 0.556, 0.821, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.556 std_dev=0.264
O4'	A	0, 0.005, 0.269, 0.533, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.269 std_dev=0.264
N7	B	0, 0.321, 0.591, 0.861, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.591 std_dev=0.270
O4'	B	0, 0.544, 0.833, 1.122, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.833 std_dev=0.289
N1	B	0, 0.307, 0.607, 0.907, 1.227 max_d=1.227 avg_d=0.607 std_dev=0.300
C6	B	0, 0.274, 0.588, 0.903, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.588 std_dev=0.314
N6	B	0, 0.305, 0.673, 1.042, 1.557 max_d=1.557 avg_d=0.673 std_dev=0.369
C3'	B	0, 0.361, 0.734, 1.107, 1.336 max_d=1.336 avg_d=0.734 std_dev=0.373
C4'	A	0, 0.050, 0.431, 0.812, 1.273 max_d=1.273 avg_d=0.431 std_dev=0.381
C4'	B	0, 0.511, 0.918, 1.325, 1.602 max_d=1.602 avg_d=0.918 std_dev=0.407
C3'	A	0, -0.016, 0.409, 0.834, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.409 std_dev=0.425
P	A	0, 0.347, 0.788, 1.229, 1.639 max_d=1.639 avg_d=0.788 std_dev=0.441
OP1	A	0, 0.481, 0.946, 1.412, 1.827 max_d=1.827 avg_d=0.946 std_dev=0.466
O5'	A	0, 0.246, 0.717, 1.188, 1.634 max_d=1.634 avg_d=0.717 std_dev=0.471
O3'	B	0, 0.370, 0.846, 1.323, 1.689 max_d=1.689 avg_d=0.846 std_dev=0.476
OP2	A	0, 0.334, 0.834, 1.334, 1.858 max_d=1.858 avg_d=0.834 std_dev=0.500
O5'	B	0, 0.405, 0.974, 1.544, 2.288 max_d=2.288 avg_d=0.974 std_dev=0.569
O3'	A	0, 0.012, 0.584, 1.156, 1.755 max_d=1.755 avg_d=0.584 std_dev=0.572
C5'	B	0, 0.559, 1.147, 1.735, 2.233 max_d=2.233 avg_d=1.147 std_dev=0.588
C5'	A	0, 0.094, 0.750, 1.406, 2.162 max_d=2.162 avg_d=0.750 std_dev=0.656
P	B	0, 0.659, 1.353, 2.047, 2.823 max_d=2.823 avg_d=1.353 std_dev=0.694
OP1	B	0, 0.745, 1.518, 2.292, 3.546 max_d=3.546 avg_d=1.518 std_dev=0.773
OP2	B	0, 0.621, 1.416, 2.212, 3.557 max_d=3.557 avg_d=1.416 std_dev=0.796

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.07	0.20	0.21	0.23
C2	0.02	0.00	0.18	0.18	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.23	0.12	0.15	0.22	0.38	0.27
C2'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.09	0.01	0.05	0.02	0.08	0.10	0.14	0.18	0.06	0.07	0.02	0.01	0.02	0.01	0.10	0.15	0.19	0.10
C3'	0.02	0.18	0.00	0.00	0.12	0.00	0.10	0.02	0.13	0.07	0.16	0.16	0.12	0.07	0.06	0.02	0.01	0.02	0.17	0.24	0.26	0.16
C4	0.02	0.01	0.09	0.12	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.07	0.14	0.06	0.16	0.23	0.36	0.28
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.06	0.10	0.04	0.03	0.08	0.10	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.17	0.07	0.11
C5	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.06	0.12	0.03	0.22	0.30	0.46	0.35
C5'	0.02	0.09	0.02	0.02	0.09	0.01	0.15	0.00	0.15	0.19	0.12	0.08	0.18	0.20	0.10	0.05	0.02	0.01	0.01	0.10	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.13	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.16	0.05	0.23	0.32	0.49	0.36
C8	0.01	0.01	0.10	0.07	0.00	0.10	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.09	0.09	0.09	0.24	0.30	0.40	0.35
N1	0.02	0.00	0.14	0.16	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.21	0.09	0.20	0.28	0.45	0.32
N3	0.02	0.00	0.18	0.16	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.20	0.12	0.13	0.20	0.33	0.25
N6	0.03	0.01	0.06	0.12	0.02	0.08	0.02	0.18	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.08	0.15	0.05	0.27	0.39	0.55	0.41
N7	0.01	0.01	0.07	0.07	0.00	0.10	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.08	0.09	0.06	0.27	0.36	0.50	0.40
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.05	0.01	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.15	0.22	0.31	0.28
O2'	0.02	0.15	0.01	0.02	0.07	0.05	0.06	0.05	0.08	0.09	0.12	0.14	0.08	0.08	0.03	0.00	0.05	0.06	0.05	0.24	0.12	0.16
O3'	0.03	0.23	0.02	0.01	0.14	0.02	0.12	0.02	0.16	0.09	0.21	0.20	0.15	0.09	0.06	0.05	0.00	0.02	0.20	0.40	0.37	0.27
O4'	0.00	0.12	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.01	0.05	0.09	0.09	0.12	0.05	0.06	0.01	0.06	0.02	0.00	0.11	0.29	0.24	0.30
O5'	0.07	0.15	0.10	0.17	0.16	0.02	0.22	0.01	0.23	0.24	0.20	0.13	0.27	0.27	0.15	0.05	0.20	0.11	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.20	0.22	0.15	0.24	0.23	0.17	0.30	0.10	0.32	0.30	0.28	0.20	0.39	0.36	0.22	0.24	0.40	0.29	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.21	0.38	0.19	0.26	0.36	0.07	0.46	0.02	0.49	0.40	0.45	0.33	0.55	0.50	0.31	0.12	0.37	0.24	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.23	0.27	0.10	0.16	0.28	0.11	0.35	0.02	0.36	0.35	0.32	0.25	0.41	0.40	0.28	0.16	0.27	0.30	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.22	0.35	0.46	0.16	0.41	0.15	0.47	0.21	0.14	0.25	0.20	0.25	0.11	0.19	0.35	0.53	0.32	0.47	0.48	0.38	0.48
C2	0.26	0.19	0.32	0.40	0.21	0.35	0.23	0.43	0.22	0.28	0.15	0.23	0.32	0.28	0.25	0.28	0.43	0.27	0.51	0.79	0.22	0.58
C2'	0.18	0.25	0.21	0.29	0.16	0.26	0.15	0.32	0.20	0.11	0.23	0.23	0.24	0.13	0.14	0.24	0.35	0.20	0.34	0.31	0.33	0.37
C3'	0.14	0.24	0.12	0.09	0.18	0.08	0.20	0.16	0.24	0.18	0.26	0.19	0.26	0.20	0.16	0.20	0.15	0.08	0.23	0.22	0.33	0.28
C4	0.26	0.20	0.33	0.43	0.16	0.38	0.13	0.46	0.19	0.20	0.22	0.20	0.26	0.17	0.22	0.30	0.46	0.29	0.52	0.66	0.29	0.57
C4'	0.18	0.35	0.15	0.14	0.26	0.11	0.26	0.21	0.31	0.18	0.35	0.31	0.32	0.22	0.20	0.25	0.28	0.09	0.22	0.23	0.33	0.26
C5	0.29	0.21	0.33	0.44	0.16	0.42	0.09	0.52	0.16	0.25	0.23	0.19	0.24	0.18	0.24	0.30	0.45	0.33	0.58	0.73	0.29	0.64
C5'	0.43	0.47	0.45	0.19	0.42	0.20	0.37	0.11	0.39	0.33	0.44	0.47	0.37	0.32	0.39	0.59	0.12	0.31	0.17	0.25	0.31	0.18
C6	0.30	0.23	0.33	0.43	0.21	0.42	0.17	0.52	0.09	0.33	0.21	0.22	0.20	0.29	0.29	0.30	0.44	0.34	0.60	0.85	0.25	0.68
C8	0.27	0.22	0.33	0.46	0.13	0.44	0.14	0.53	0.23	0.14	0.26	0.17	0.28	0.10	0.17	0.32	0.49	0.33	0.56	0.53	0.40	0.58
N1	0.28	0.22	0.33	0.41	0.23	0.38	0.24	0.47	0.16	0.33	0.13	0.24	0.28	0.33	0.29	0.28	0.43	0.31	0.56	0.87	0.22	0.65
N3	0.25	0.19	0.33	0.40	0.18	0.35	0.18	0.42	0.22	0.22	0.21	0.21	0.30	0.21	0.22	0.28	0.44	0.27	0.49	0.69	0.25	0.54
N6	0.32	0.25	0.34	0.44	0.22	0.45	0.18	0.56	0.12	0.37	0.26	0.22	0.16	0.33	0.31	0.31	0.44	0.37	0.64	0.93	0.27	0.75
N7	0.28	0.22	0.33	0.45	0.12	0.45	0.09	0.56	0.22	0.19	0.26	0.17	0.28	0.09	0.20	0.32	0.47	0.34	0.61	0.65	0.36	0.66
N9	0.26	0.22	0.34	0.45	0.15	0.41	0.13	0.48	0.22	0.15	0.25	0.19	0.26	0.11	0.19	0.32	0.49	0.31	0.51	0.54	0.35	0.53
O2'	0.31	0.28	0.35	0.41	0.23	0.40	0.17	0.43	0.20	0.15	0.24	0.30	0.23	0.13	0.23	0.39	0.48	0.34	0.40	0.38	0.36	0.42
O3'	0.16	0.23	0.15	0.09	0.18	0.09	0.20	0.13	0.23	0.20	0.25	0.19	0.26	0.21	0.17	0.22	0.12	0.11	0.23	0.29	0.34	0.26
O4'	0.15	0.36	0.20	0.39	0.22	0.32	0.25	0.41	0.33	0.13	0.38	0.28	0.34	0.18	0.14	0.24	0.53	0.19	0.40	0.42	0.39	0.42
O5'	0.31	0.35	0.36	0.13	0.31	0.10	0.29	0.16	0.31	0.25	0.33	0.35	0.30	0.26	0.29	0.43	0.02	0.19	0.17	0.28	0.34	0.22
OP1	0.04	0.19	0.12	0.03	0.11	0.16	0.12	0.29	0.14	0.16	0.17	0.17	0.16	0.17	0.08	0.20	0.01	0.10	0.25	0.36	0.58	0.28
OP2	0.09	0.16	0.09	0.07	0.19	0.25	0.24	0.43	0.23	0.26	0.20	0.15	0.26	0.28	0.18	0.09	0.02	0.18	0.33	0.39	0.50	0.38
P	0.07	0.15	0.14	0.01	0.11	0.12	0.13	0.24	0.14	0.16	0.14	0.13	0.16	0.17	0.10	0.19	0.00	0.05	0.20	0.29	0.42	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.04	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.09	0.36	0.14	0.10
C2	0.04	0.00	0.11	0.13	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.15	0.04	0.20	0.59	0.35	0.24
C2'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.05	0.01	0.04	0.03	0.06	0.05	0.09	0.10	0.05	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.07	0.17	0.10	0.08
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.08	0.00	0.09	0.03	0.10	0.09	0.12	0.11	0.10	0.09	0.06	0.02	0.00	0.01	0.09	0.09	0.13	0.09
C4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.09	0.02	0.21	0.57	0.33	0.23
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.09	0.05	0.05	0.08	0.09	0.04	0.06	0.03	0.00	0.02	0.10	0.12	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.06	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.10	0.02	0.27	0.67	0.43	0.31
C5'	0.03	0.08	0.03	0.03	0.10	0.01	0.15	0.00	0.15	0.17	0.12	0.06	0.19	0.19	0.09	0.06	0.04	0.01	0.01	0.09	0.23	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.06	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.12	0.02	0.28	0.71	0.47	0.34
C8	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.10	0.05	0.27	0.62	0.37	0.28
N1	0.04	0.00	0.09	0.12	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.15	0.03	0.25	0.66	0.43	0.30
N3	0.04	0.00	0.10	0.11	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.13	0.05	0.17	0.52	0.29	0.19
N6	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.13	0.03	0.32	0.77	0.54	0.39
N7	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.09	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.11	0.04	0.30	0.71	0.47	0.35
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.18	0.51	0.27	0.19
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.07	0.06	0.06	0.06	0.09	0.04	0.12	0.12	0.08	0.04	0.02	0.00	0.06	0.06	0.06	0.13	0.08	0.07
O3'	0.02	0.15	0.02	0.00	0.09	0.03	0.10	0.04	0.12	0.10	0.15	0.13	0.13	0.11	0.06	0.06	0.00	0.02	0.14	0.24	0.24	0.13
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.05	0.03	0.04	0.01	0.06	0.02	0.00	0.07	0.34	0.12	0.06
O5'	0.09	0.20	0.07	0.09	0.21	0.02	0.27	0.01	0.28	0.27	0.25	0.17	0.32	0.30	0.18	0.06	0.14	0.07	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.36	0.59	0.17	0.09	0.57	0.10	0.67	0.09	0.71	0.62	0.66	0.52	0.77	0.71	0.51	0.13	0.24	0.34	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.35	0.10	0.13	0.33	0.12	0.43	0.23	0.47	0.37	0.43	0.29	0.54	0.47	0.27	0.08	0.24	0.12	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.24	0.08	0.09	0.23	0.03	0.31	0.02	0.34	0.28	0.30	0.19	0.39	0.35	0.19	0.07	0.13	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00