Doublet Group distance statistics: 51604

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 1, 3, 2, 1, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.014, 0.021, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.014 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.006, 0.013, 0.021, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.010, 0.021, 0.031, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.021 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.010, 0.022, 0.033, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.022 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.011, 0.023, 0.035, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.011, 0.025, 0.039, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.025 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.016, 0.030, 0.045, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.030 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.019, 0.036, 0.052, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.036 std_dev=0.017
N6	A	0, 0.029, 0.050, 0.071, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.050 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.018, 0.042, 0.065, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.042 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.020, 0.051, 0.082, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.051 std_dev=0.031
C2'	A	0, 0.064, 0.160, 0.256, 0.346 max_d=0.346 avg_d=0.160 std_dev=0.096
O4'	A	0, 0.006, 0.135, 0.264, 0.425 max_d=0.425 avg_d=0.135 std_dev=0.129
O2'	A	0, 0.062, 0.219, 0.376, 0.529 max_d=0.529 avg_d=0.219 std_dev=0.157
C2	B	0, 0.192, 0.398, 0.603, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.398 std_dev=0.205
N3	B	0, 0.160, 0.372, 0.584, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.372 std_dev=0.212
N1	B	0, 0.181, 0.402, 0.623, 0.795 max_d=0.795 avg_d=0.402 std_dev=0.221
C3'	A	0, 0.053, 0.274, 0.496, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.274 std_dev=0.221
C5	B	0, 0.124, 0.351, 0.579, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.351 std_dev=0.227
C6	B	0, 0.157, 0.385, 0.613, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.385 std_dev=0.228
C4'	A	0, 0.045, 0.274, 0.503, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.274 std_dev=0.229
C4	B	0, 0.067, 0.309, 0.552, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.309 std_dev=0.243
N7	B	0, 0.206, 0.463, 0.721, 0.967 max_d=0.967 avg_d=0.463 std_dev=0.257
N9	B	0, 0.144, 0.406, 0.667, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.406 std_dev=0.262
C2'	B	0, 0.218, 0.487, 0.757, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.487 std_dev=0.269
C8	B	0, 0.203, 0.476, 0.749, 1.050 max_d=1.050 avg_d=0.476 std_dev=0.273
N6	B	0, 0.202, 0.501, 0.801, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.501 std_dev=0.299
C1'	B	0, 0.204, 0.510, 0.817, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.510 std_dev=0.307
O3'	A	0, 0.072, 0.442, 0.813, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.442 std_dev=0.370
C5'	A	0, 0.076, 0.451, 0.827, 1.401 max_d=1.401 avg_d=0.451 std_dev=0.375
O2'	B	0, 0.157, 0.665, 1.172, 2.174 max_d=2.174 avg_d=0.665 std_dev=0.508
C3'	B	0, 0.062, 0.594, 1.126, 2.208 max_d=2.208 avg_d=0.594 std_dev=0.532
O4'	B	0, 0.183, 0.733, 1.284, 1.987 max_d=1.987 avg_d=0.733 std_dev=0.550
O3'	B	0, -0.013, 0.646, 1.305, 2.772 max_d=2.772 avg_d=0.646 std_dev=0.659
C4'	B	0, 0.067, 0.763, 1.459, 2.831 max_d=2.831 avg_d=0.763 std_dev=0.696
O5'	A	0, -0.166, 0.603, 1.371, 3.135 max_d=3.135 avg_d=0.603 std_dev=0.769
P	A	0, -0.305, 0.638, 1.581, 3.804 max_d=3.804 avg_d=0.638 std_dev=0.943
C5'	B	0, -0.062, 0.945, 1.952, 4.082 max_d=4.082 avg_d=0.945 std_dev=1.007
OP2	A	0, -0.316, 0.738, 1.793, 4.312 max_d=4.312 avg_d=0.738 std_dev=1.054
O5'	B	0, 0.234, 1.330, 2.427, 3.943 max_d=3.943 avg_d=1.330 std_dev=1.097
OP1	A	0, -0.416, 0.846, 2.107, 5.140 max_d=5.140 avg_d=0.846 std_dev=1.262
OP1	B	0, 1.212, 2.609, 4.006, 5.630 max_d=5.630 avg_d=2.609 std_dev=1.397
P	B	0, 0.310, 1.750, 3.191, 5.102 max_d=5.102 avg_d=1.750 std_dev=1.440
OP2	B	0, 0.547, 2.060, 3.573, 4.775 max_d=4.775 avg_d=2.060 std_dev=1.513

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01	0.20	0.12	0.15	0.10
C2	0.03	0.00	0.11	0.14	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.15	0.06	0.38	0.19	0.44	0.25
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.09	0.06	0.10	0.10	0.09	0.07	0.03	0.00	0.05	0.01	0.23	0.26	0.15	0.15
C3'	0.02	0.14	0.01	0.00	0.12	0.01	0.15	0.03	0.17	0.13	0.16	0.12	0.18	0.15	0.09	0.02	0.01	0.02	0.28	0.38	0.16	0.20
C4	0.01	0.01	0.06	0.12	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.12	0.03	0.44	0.27	0.44	0.30
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.09	0.12	0.06	0.03	0.11	0.12	0.06	0.08	0.03	0.00	0.02	0.13	0.22	0.05
C5	0.02	0.01	0.07	0.15	0.01	0.09	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.17	0.03	0.58	0.43	0.63	0.46
C5'	0.02	0.09	0.02	0.03	0.12	0.01	0.18	0.00	0.18	0.21	0.14	0.07	0.23	0.23	0.12	0.08	0.07	0.01	0.02	0.25	0.34	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.17	0.01	0.09	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.20	0.03	0.58	0.42	0.68	0.47
C8	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.12	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.16	0.06	0.64	0.50	0.57	0.50
N1	0.04	0.01	0.10	0.16	0.02	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.11	0.18	0.05	0.49	0.30	0.58	0.36
N3	0.03	0.01	0.10	0.12	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.10	0.13	0.06	0.33	0.16	0.35	0.19
N6	0.02	0.01	0.09	0.18	0.01	0.11	0.01	0.23	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.09	0.24	0.03	0.65	0.53	0.81	0.58
N7	0.02	0.01	0.07	0.15	0.01	0.12	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.20	0.05	0.69	0.58	0.74	0.60
N9	0.00	0.01	0.03	0.09	0.00	0.06	0.01	0.12	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.08	0.01	0.43	0.28	0.36	0.28
O2'	0.03	0.11	0.00	0.02	0.07	0.08	0.07	0.08	0.09	0.05	0.11	0.10	0.09	0.06	0.04	0.00	0.10	0.07	0.07	0.16	0.10	0.07
O3'	0.03	0.15	0.05	0.01	0.12	0.03	0.17	0.07	0.20	0.16	0.18	0.13	0.24	0.20	0.08	0.10	0.00	0.03	0.21	0.46	0.28	0.25
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.06	0.05	0.06	0.03	0.05	0.01	0.07	0.03	0.00	0.10	0.09	0.21	0.14
O5'	0.20	0.38	0.23	0.28	0.44	0.02	0.58	0.02	0.58	0.64	0.49	0.33	0.65	0.69	0.43	0.07	0.21	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.12	0.19	0.26	0.38	0.27	0.13	0.43	0.25	0.42	0.50	0.30	0.16	0.53	0.58	0.28	0.16	0.46	0.09	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.15	0.44	0.15	0.16	0.44	0.22	0.63	0.34	0.68	0.57	0.58	0.35	0.81	0.74	0.36	0.10	0.28	0.21	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.25	0.15	0.20	0.30	0.05	0.46	0.02	0.47	0.50	0.36	0.19	0.58	0.60	0.28	0.07	0.25	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.29	0.27	0.30	0.23	0.16	0.23	0.17	0.22	0.18	0.27	0.25	0.18	0.18	0.23	0.23	0.27	0.28	0.30	0.39	0.78	0.50	0.44
C2	0.20	0.14	0.29	0.29	0.17	0.21	0.22	0.27	0.25	0.21	0.21	0.14	0.30	0.24	0.19	0.23	0.24	0.26	0.74	1.21	1.16	0.92
C2'	0.26	0.27	0.23	0.19	0.15	0.16	0.18	0.19	0.20	0.26	0.26	0.18	0.22	0.23	0.21	0.26	0.22	0.24	0.35	0.73	0.48	0.40
C3'	0.26	0.28	0.17	0.15	0.16	0.12	0.19	0.18	0.20	0.29	0.25	0.21	0.23	0.27	0.21	0.29	0.19	0.19	0.27	0.67	0.47	0.33
C4	0.21	0.18	0.28	0.32	0.14	0.21	0.17	0.28	0.17	0.21	0.19	0.13	0.18	0.21	0.18	0.24	0.22	0.23	0.67	1.05	0.95	0.78
C4'	0.24	0.30	0.20	0.10	0.13	0.13	0.13	0.11	0.15	0.26	0.24	0.24	0.15	0.22	0.18	0.20	0.20	0.21	0.18	0.65	0.37	0.25
C5	0.17	0.15	0.27	0.43	0.12	0.30	0.14	0.42	0.14	0.19	0.14	0.13	0.16	0.19	0.15	0.29	0.25	0.22	0.83	1.19	1.15	0.96
C5'	0.24	0.34	0.23	0.11	0.20	0.15	0.19	0.14	0.20	0.28	0.27	0.32	0.21	0.27	0.20	0.29	0.16	0.18	0.22	0.66	0.48	0.30
C6	0.18	0.14	0.28	0.44	0.15	0.32	0.18	0.45	0.16	0.22	0.14	0.13	0.19	0.22	0.18	0.28	0.25	0.25	0.92	1.37	1.37	1.12
C8	0.17	0.21	0.24	0.43	0.11	0.30	0.15	0.42	0.13	0.25	0.16	0.19	0.16	0.24	0.16	0.36	0.28	0.18	0.66	0.90	0.80	0.70
N1	0.18	0.14	0.28	0.36	0.17	0.25	0.22	0.34	0.21	0.23	0.16	0.14	0.26	0.26	0.19	0.24	0.22	0.23	0.85	1.35	1.34	1.07
N3	0.23	0.17	0.29	0.26	0.17	0.22	0.20	0.25	0.23	0.21	0.24	0.13	0.26	0.22	0.20	0.23	0.26	0.29	0.64	1.07	0.97	0.77
N6	0.23	0.17	0.28	0.51	0.17	0.43	0.19	0.58	0.20	0.27	0.20	0.16	0.26	0.25	0.22	0.32	0.32	0.33	1.06	1.54	1.58	1.30
N7	0.16	0.17	0.25	0.51	0.10	0.40	0.13	0.54	0.14	0.19	0.14	0.17	0.19	0.21	0.13	0.37	0.34	0.26	0.86	1.12	1.09	0.94
N9	0.23	0.23	0.28	0.31	0.14	0.21	0.16	0.27	0.15	0.25	0.20	0.16	0.16	0.22	0.20	0.27	0.22	0.22	0.55	0.88	0.73	0.61
O2'	0.30	0.31	0.29	0.18	0.19	0.22	0.19	0.18	0.23	0.26	0.30	0.22	0.24	0.22	0.23	0.30	0.27	0.31	0.30	0.76	0.40	0.35
O3'	0.26	0.27	0.17	0.16	0.16	0.15	0.20	0.20	0.21	0.31	0.25	0.21	0.24	0.29	0.22	0.28	0.20	0.20	0.30	0.76	0.58	0.40
O4'	0.28	0.30	0.27	0.21	0.11	0.24	0.12	0.22	0.13	0.27	0.24	0.22	0.12	0.21	0.21	0.24	0.33	0.30	0.29	0.70	0.37	0.33
O5'	0.17	0.41	0.31	0.16	0.34	0.07	0.40	0.18	0.43	0.38	0.43	0.37	0.47	0.43	0.28	0.20	0.02	0.10	0.34	0.65	0.49	0.34
OP1	0.19	0.27	0.08	0.11	0.12	0.19	0.15	0.16	0.14	0.26	0.18	0.27	0.21	0.28	0.10	0.10	0.03	0.21	0.44	0.92	0.85	0.57
OP2	0.10	0.28	0.14	0.08	0.26	0.18	0.41	0.36	0.44	0.43	0.36	0.21	0.53	0.51	0.22	0.39	0.03	0.14	0.46	0.82	0.61	0.48
P	0.12	0.22	0.09	0.01	0.14	0.07	0.23	0.17	0.24	0.31	0.21	0.21	0.31	0.34	0.13	0.13	0.01	0.07	0.34	0.74	0.58	0.40

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.20	0.01	0.34	0.80	0.56	0.44
C2	0.04	0.00	0.29	0.17	0.01	0.17	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.31	0.27	0.25	0.55	1.01	1.00	0.68
C2'	0.00	0.29	0.00	0.01	0.15	0.02	0.07	0.11	0.13	0.14	0.22	0.29	0.10	0.08	0.02	0.00	0.03	0.02	0.31	0.71	0.54	0.42
C3'	0.01	0.17	0.01	0.00	0.13	0.01	0.18	0.02	0.18	0.24	0.17	0.16	0.21	0.24	0.13	0.02	0.01	0.02	0.13	0.52	0.25	0.21
C4	0.02	0.01	0.15	0.13	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.13	0.14	0.13	0.58	1.03	1.02	0.70
C4'	0.01	0.17	0.02	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.04	0.20	0.11	0.17	0.07	0.17	0.06	0.18	0.02	0.00	0.02	0.34	0.20	0.13
C5	0.01	0.01	0.07	0.18	0.01	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.15	0.08	0.06	0.71	1.14	1.32	0.88
C5'	0.04	0.20	0.11	0.02	0.11	0.01	0.15	0.00	0.14	0.27	0.16	0.19	0.17	0.26	0.10	0.09	0.13	0.02	0.01	0.12	0.29	0.02
C6	0.02	0.01	0.13	0.18	0.01	0.04	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.15	0.09	0.11	0.72	1.15	1.39	0.90
C8	0.01	0.01	0.14	0.24	0.01	0.20	0.01	0.27	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.00	0.31	0.18	0.14	0.77	1.16	1.26	0.89
N1	0.04	0.01	0.22	0.17	0.01	0.11	0.01	0.16	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.22	0.18	0.19	0.64	1.09	1.23	0.81
N3	0.05	0.00	0.29	0.16	0.00	0.17	0.02	0.19	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.31	0.28	0.25	0.49	0.96	0.86	0.61
N6	0.02	0.01	0.10	0.21	0.02	0.07	0.02	0.17	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.18	0.08	0.08	0.78	1.22	1.58	1.01
N7	0.00	0.01	0.08	0.24	0.01	0.17	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.28	0.17	0.08	0.83	1.23	1.50	1.01
N9	0.01	0.01	0.02	0.13	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.12	0.10	0.01	0.56	1.00	0.92	0.66
O2'	0.01	0.31	0.00	0.02	0.13	0.18	0.15	0.09	0.15	0.31	0.22	0.31	0.18	0.28	0.12	0.00	0.04	0.13	0.19	0.63	0.51	0.35
O3'	0.20	0.27	0.03	0.01	0.14	0.02	0.08	0.13	0.09	0.18	0.18	0.28	0.08	0.17	0.10	0.04	0.00	0.12	0.33	0.51	0.45	0.32
O4'	0.01	0.25	0.02	0.02	0.13	0.00	0.06	0.02	0.11	0.14	0.19	0.25	0.08	0.08	0.01	0.13	0.12	0.00	0.29	0.75	0.52	0.43
O5'	0.34	0.55	0.31	0.13	0.58	0.02	0.71	0.01	0.72	0.77	0.64	0.49	0.78	0.83	0.56	0.19	0.33	0.29	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.80	1.01	0.71	0.52	1.03	0.34	1.14	0.12	1.15	1.16	1.09	0.96	1.22	1.23	1.00	0.63	0.51	0.75	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.56	1.00	0.54	0.25	1.02	0.20	1.32	0.29	1.39	1.26	1.23	0.86	1.58	1.50	0.92	0.51	0.45	0.52	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.44	0.68	0.42	0.21	0.70	0.13	0.88	0.02	0.90	0.89	0.81	0.61	1.01	1.01	0.66	0.35	0.32	0.43	0.01	0.01	0.01	0.00