Doublet Group distance statistics: 51605

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 2, 3, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.006, 0.013, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.002, 0.015, 0.029, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.015 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.001, 0.015, 0.028, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.015 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.016, 0.030, 0.044, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.030 std_dev=0.014
C2	A	0, -0.001, 0.014, 0.029, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.014 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.010, 0.026, 0.043, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.026 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N6	A	0, 0.011, 0.030, 0.048, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.030 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.021, 0.043, 0.064, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.043 std_dev=0.022
O4'	A	0, 0.020, 0.111, 0.201, 0.319 max_d=0.319 avg_d=0.111 std_dev=0.091
C2'	A	0, 0.058, 0.162, 0.265, 0.426 max_d=0.426 avg_d=0.162 std_dev=0.103
C4'	A	0, 0.133, 0.273, 0.413, 0.536 max_d=0.536 avg_d=0.273 std_dev=0.140
O2'	A	0, 0.116, 0.265, 0.415, 0.589 max_d=0.589 avg_d=0.265 std_dev=0.149
C3'	A	0, 0.130, 0.289, 0.449, 0.642 max_d=0.642 avg_d=0.289 std_dev=0.159
N3	B	0, 0.218, 0.459, 0.700, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.459 std_dev=0.241
O3'	A	0, 0.201, 0.447, 0.692, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.447 std_dev=0.246
C4	B	0, 0.138, 0.389, 0.641, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.389 std_dev=0.251
C5'	A	0, 0.198, 0.456, 0.715, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.456 std_dev=0.258
C2	B	0, 0.247, 0.522, 0.797, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.522 std_dev=0.275
O5'	A	0, 0.278, 0.555, 0.831, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.555 std_dev=0.277
N9	B	0, 0.179, 0.461, 0.743, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.461 std_dev=0.282
C5	B	0, 0.107, 0.393, 0.678, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.393 std_dev=0.286
C1'	B	0, 0.269, 0.559, 0.848, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.559 std_dev=0.289
C2'	B	0, 0.252, 0.546, 0.840, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.546 std_dev=0.294
C8	B	0, 0.246, 0.541, 0.836, 1.276 max_d=1.276 avg_d=0.541 std_dev=0.295
N7	B	0, 0.172, 0.485, 0.799, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.485 std_dev=0.313
C3'	B	0, 0.310, 0.638, 0.966, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.638 std_dev=0.328
N1	B	0, 0.186, 0.526, 0.866, 1.149 max_d=1.149 avg_d=0.526 std_dev=0.340
C6	B	0, 0.085, 0.440, 0.794, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.440 std_dev=0.355
O2'	B	0, 0.240, 0.597, 0.953, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.597 std_dev=0.356
P	A	0, 0.296, 0.656, 1.016, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.656 std_dev=0.360
O3'	B	0, 0.351, 0.712, 1.073, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.712 std_dev=0.361
O4'	B	0, 0.344, 0.710, 1.076, 1.406 max_d=1.406 avg_d=0.710 std_dev=0.366
C4'	B	0, 0.363, 0.735, 1.107, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.735 std_dev=0.372
OP2	A	0, 0.339, 0.744, 1.149, 1.497 max_d=1.497 avg_d=0.744 std_dev=0.405
OP1	A	0, 0.327, 0.742, 1.157, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.742 std_dev=0.415
N6	B	0, 0.037, 0.515, 0.992, 1.498 max_d=1.498 avg_d=0.515 std_dev=0.477
C5'	B	0, 0.425, 0.921, 1.416, 1.780 max_d=1.780 avg_d=0.921 std_dev=0.495
O5'	B	0, 0.222, 1.127, 2.031, 3.294 max_d=3.294 avg_d=1.127 std_dev=0.905
P	B	0, 0.134, 1.487, 2.840, 4.257 max_d=4.257 avg_d=1.487 std_dev=1.353
OP1	B	0, 0.403, 1.800, 3.196, 4.955 max_d=4.955 avg_d=1.800 std_dev=1.397
OP2	B	0, -0.002, 1.964, 3.929, 6.813 max_d=6.813 avg_d=1.964 std_dev=1.966

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.10	0.10	0.16	0.10
C2	0.04	0.00	0.10	0.14	0.01	0.07	0.02	0.14	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.10	0.16	0.04	0.26	0.29	0.39	0.30
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.07	0.03	0.09	0.10	0.07	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.07	0.13	0.12	0.07
C3'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.10	0.00	0.11	0.01	0.13	0.08	0.14	0.12	0.13	0.10	0.06	0.02	0.01	0.02	0.08	0.15	0.11	0.08
C4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.11	0.02	0.25	0.26	0.35	0.28
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.09	0.08	0.08	0.06	0.10	0.09	0.05	0.04	0.02	0.00	0.02	0.11	0.07	0.03
C5	0.02	0.02	0.05	0.11	0.01	0.08	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.13	0.02	0.30	0.35	0.44	0.35
C5'	0.03	0.14	0.02	0.01	0.14	0.01	0.18	0.00	0.19	0.17	0.17	0.12	0.21	0.20	0.12	0.04	0.03	0.02	0.01	0.11	0.03	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.09	0.01	0.19	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.15	0.02	0.32	0.38	0.48	0.38
C8	0.02	0.02	0.03	0.08	0.00	0.08	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.03	0.27	0.29	0.34	0.30
N1	0.04	0.01	0.09	0.14	0.02	0.08	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.09	0.16	0.03	0.30	0.36	0.46	0.35
N3	0.04	0.01	0.10	0.12	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.10	0.13	0.04	0.23	0.24	0.33	0.25
N6	0.02	0.02	0.07	0.13	0.01	0.10	0.01	0.21	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.17	0.02	0.34	0.44	0.53	0.42
N7	0.01	0.02	0.04	0.10	0.01	0.09	0.00	0.20	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.12	0.03	0.32	0.37	0.45	0.37
N9	0.01	0.02	0.02	0.06	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.21	0.21	0.28	0.22
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.06	0.04	0.05	0.04	0.07	0.03	0.09	0.10	0.07	0.03	0.03	0.00	0.04	0.04	0.06	0.12	0.12	0.06
O3'	0.02	0.16	0.02	0.01	0.11	0.02	0.13	0.03	0.15	0.09	0.16	0.13	0.17	0.12	0.06	0.04	0.00	0.02	0.12	0.19	0.12	0.10
O4'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.00	0.08	0.07	0.14	0.08
O5'	0.10	0.26	0.07	0.08	0.25	0.02	0.30	0.01	0.32	0.27	0.30	0.23	0.34	0.32	0.21	0.06	0.12	0.08	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.10	0.29	0.13	0.15	0.26	0.11	0.35	0.11	0.38	0.29	0.36	0.24	0.44	0.37	0.21	0.12	0.19	0.07	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.16	0.39	0.12	0.11	0.35	0.07	0.44	0.03	0.48	0.34	0.46	0.33	0.53	0.45	0.28	0.12	0.12	0.14	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.30	0.07	0.08	0.28	0.03	0.35	0.02	0.38	0.30	0.35	0.25	0.42	0.37	0.22	0.06	0.10	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.20	0.20	0.18	0.18	0.18	0.17	0.29	0.12	0.23	0.12	0.22	0.14	0.23	0.20	0.30	0.18	0.17	0.69	0.86	1.01	0.76
C2	0.26	0.33	0.24	0.27	0.27	0.30	0.32	0.42	0.31	0.37	0.34	0.27	0.36	0.40	0.29	0.27	0.28	0.29	0.96	1.27	1.66	1.21
C2'	0.20	0.22	0.21	0.15	0.18	0.16	0.18	0.29	0.15	0.22	0.15	0.22	0.18	0.23	0.19	0.33	0.15	0.15	0.71	0.92	1.02	0.78
C3'	0.20	0.19	0.23	0.14	0.14	0.15	0.13	0.27	0.11	0.20	0.12	0.20	0.14	0.20	0.17	0.36	0.13	0.13	0.68	0.92	0.88	0.72
C4	0.24	0.26	0.24	0.26	0.22	0.28	0.25	0.39	0.22	0.32	0.25	0.22	0.23	0.33	0.25	0.29	0.27	0.26	0.90	1.15	1.47	1.09
C4'	0.22	0.17	0.23	0.13	0.13	0.13	0.11	0.21	0.08	0.18	0.10	0.19	0.10	0.16	0.17	0.38	0.14	0.15	0.56	0.75	0.66	0.55
C5	0.27	0.25	0.29	0.31	0.20	0.35	0.23	0.45	0.23	0.35	0.27	0.20	0.27	0.33	0.27	0.31	0.33	0.32	0.99	1.30	1.66	1.23
C5'	0.22	0.19	0.26	0.11	0.13	0.12	0.09	0.15	0.09	0.15	0.13	0.19	0.09	0.12	0.16	0.39	0.11	0.16	0.50	0.72	0.50	0.46
C6	0.28	0.27	0.29	0.33	0.22	0.37	0.26	0.48	0.27	0.38	0.31	0.20	0.34	0.38	0.29	0.30	0.35	0.36	1.04	1.42	1.83	1.35
C8	0.25	0.23	0.31	0.28	0.16	0.30	0.12	0.39	0.14	0.24	0.20	0.21	0.16	0.20	0.21	0.34	0.30	0.27	0.87	1.07	1.30	1.00
N1	0.27	0.31	0.26	0.30	0.25	0.35	0.30	0.46	0.30	0.39	0.34	0.24	0.36	0.40	0.29	0.28	0.32	0.33	1.02	1.39	1.80	1.32
N3	0.24	0.31	0.22	0.24	0.26	0.27	0.30	0.38	0.28	0.34	0.30	0.27	0.32	0.37	0.27	0.27	0.25	0.26	0.89	1.15	1.49	1.09
N6	0.31	0.25	0.32	0.36	0.21	0.42	0.23	0.53	0.27	0.39	0.31	0.18	0.37	0.36	0.30	0.31	0.38	0.41	1.09	1.55	1.97	1.46
N7	0.29	0.23	0.33	0.34	0.18	0.37	0.16	0.46	0.21	0.31	0.25	0.20	0.25	0.25	0.26	0.34	0.36	0.35	1.00	1.28	1.58	1.21
N9	0.22	0.23	0.24	0.23	0.18	0.24	0.18	0.35	0.12	0.26	0.17	0.21	0.14	0.25	0.21	0.30	0.24	0.22	0.81	1.01	1.25	0.93
O2'	0.23	0.22	0.21	0.17	0.20	0.17	0.19	0.27	0.16	0.23	0.15	0.24	0.20	0.23	0.21	0.34	0.17	0.18	0.65	0.85	0.94	0.72
O3'	0.21	0.20	0.25	0.14	0.15	0.14	0.13	0.26	0.11	0.19	0.13	0.21	0.15	0.20	0.17	0.40	0.13	0.14	0.65	0.92	0.82	0.68
O4'	0.21	0.17	0.20	0.18	0.14	0.17	0.12	0.26	0.08	0.21	0.11	0.18	0.10	0.18	0.19	0.32	0.18	0.16	0.59	0.74	0.77	0.61
O5'	0.21	0.27	0.27	0.09	0.20	0.04	0.18	0.16	0.20	0.16	0.23	0.26	0.19	0.17	0.18	0.32	0.01	0.11	0.61	0.85	0.62	0.58
OP1	0.04	0.19	0.10	0.02	0.10	0.14	0.13	0.24	0.15	0.17	0.17	0.17	0.18	0.18	0.07	0.14	0.01	0.08	0.41	0.91	0.37	0.37
OP2	0.11	0.17	0.06	0.07	0.18	0.23	0.24	0.36	0.24	0.28	0.20	0.15	0.28	0.30	0.18	0.04	0.01	0.19	0.69	1.12	0.64	0.70
P	0.04	0.16	0.11	0.02	0.11	0.11	0.14	0.21	0.16	0.17	0.15	0.14	0.18	0.19	0.09	0.13	0.00	0.05	0.52	0.87	0.44	0.47

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.05	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.17	0.31	0.30	0.17
C2	0.05	0.00	0.12	0.12	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.19	0.15	0.04	0.44	0.58	0.87	0.53
C2'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.07	0.05	0.10	0.11	0.06	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.29	0.40	0.27	0.25
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.10	0.12	0.11	0.11	0.11	0.12	0.07	0.02	0.01	0.01	0.39	0.49	0.27	0.31
C4	0.03	0.02	0.06	0.08	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.09	0.02	0.45	0.57	0.83	0.53
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.07	0.11	0.06	0.07	0.09	0.11	0.05	0.06	0.01	0.00	0.02	0.33	0.22	0.11
C5	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.08	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.11	0.02	0.58	0.76	1.11	0.72
C5'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.11	0.01	0.17	0.00	0.17	0.19	0.14	0.08	0.21	0.21	0.10	0.06	0.01	0.01	0.01	0.24	0.34	0.01
C6	0.03	0.00	0.07	0.10	0.01	0.07	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.13	0.02	0.60	0.83	1.20	0.78
C8	0.01	0.02	0.05	0.12	0.01	0.11	0.01	0.19	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.13	0.03	0.55	0.68	0.96	0.65
N1	0.04	0.00	0.10	0.11	0.02	0.06	0.01	0.14	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.17	0.14	0.03	0.54	0.73	1.07	0.68
N3	0.05	0.00	0.11	0.11	0.00	0.07	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.18	0.13	0.04	0.38	0.48	0.71	0.43
N6	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.09	0.01	0.21	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.11	0.14	0.02	0.67	0.96	1.37	0.89
N7	0.01	0.01	0.04	0.12	0.01	0.11	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.14	0.03	0.64	0.85	1.22	0.81
N9	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.06	0.01	0.40	0.48	0.68	0.44
O2'	0.02	0.19	0.00	0.02	0.10	0.06	0.09	0.06	0.12	0.03	0.17	0.18	0.11	0.04	0.03	0.00	0.04	0.07	0.08	0.45	0.14	0.15
O3'	0.01	0.15	0.02	0.01	0.09	0.01	0.11	0.01	0.13	0.13	0.14	0.13	0.14	0.14	0.06	0.04	0.00	0.02	0.33	0.61	0.28	0.26
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.03	0.01	0.07	0.02	0.00	0.09	0.31	0.19	0.11
O5'	0.17	0.44	0.29	0.39	0.45	0.02	0.58	0.01	0.60	0.55	0.54	0.38	0.67	0.64	0.40	0.08	0.33	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.31	0.58	0.40	0.49	0.57	0.33	0.76	0.24	0.83	0.68	0.73	0.48	0.96	0.85	0.48	0.45	0.61	0.31	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.30	0.87	0.27	0.27	0.83	0.22	1.11	0.34	1.20	0.96	1.07	0.71	1.37	1.22	0.68	0.14	0.28	0.19	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.53	0.25	0.31	0.53	0.11	0.72	0.01	0.78	0.65	0.68	0.43	0.89	0.81	0.44	0.15	0.26	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00