Doublet Group distance statistics: 51606

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 1, 2, 1, 1, 2, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.006, 0.009, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.005
N9	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.007 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.001, 0.008, 0.014, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.001, 0.008, 0.014, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.002, 0.009, 0.017, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N7	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C8	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N6	A	0, 0.006, 0.017, 0.028, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.017 std_dev=0.011
O4'	A	0, 0.107, 0.233, 0.358, 0.408 max_d=0.408 avg_d=0.233 std_dev=0.125
C4'	A	0, 0.263, 0.417, 0.570, 0.630 max_d=0.630 avg_d=0.417 std_dev=0.154
C2'	A	0, 0.066, 0.222, 0.377, 0.432 max_d=0.432 avg_d=0.222 std_dev=0.155
C4	B	0, 0.251, 0.458, 0.664, 0.795 max_d=0.795 avg_d=0.458 std_dev=0.207
N3	B	0, 0.322, 0.560, 0.799, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.560 std_dev=0.238
C5	B	0, 0.300, 0.548, 0.796, 0.902 max_d=0.902 avg_d=0.548 std_dev=0.248
C5'	A	0, 0.554, 0.847, 1.141, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.847 std_dev=0.294
C2'	B	0, 0.430, 0.736, 1.043, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.736 std_dev=0.307
C6	B	0, 0.179, 0.487, 0.796, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.487 std_dev=0.308
N1	B	0, 0.393, 0.707, 1.021, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.707 std_dev=0.314
C2	B	0, 0.429, 0.744, 1.059, 1.090 max_d=1.090 avg_d=0.744 std_dev=0.315
N9	B	0, 0.457, 0.855, 1.254, 1.337 max_d=1.337 avg_d=0.855 std_dev=0.398
O2'	B	0, 0.494, 0.929, 1.363, 1.483 max_d=1.483 avg_d=0.929 std_dev=0.434
N7	B	0, 0.605, 1.055, 1.505, 1.652 max_d=1.652 avg_d=1.055 std_dev=0.450
C3'	B	0, 0.544, 1.017, 1.490, 1.556 max_d=1.556 avg_d=1.017 std_dev=0.473
C3'	A	0, 0.386, 0.859, 1.333, 1.420 max_d=1.420 avg_d=0.859 std_dev=0.474
O2'	A	0, 0.237, 0.711, 1.185, 1.303 max_d=1.303 avg_d=0.711 std_dev=0.474
N6	B	0, 0.225, 0.731, 1.237, 1.526 max_d=1.526 avg_d=0.731 std_dev=0.506
C8	B	0, 0.679, 1.197, 1.715, 1.808 max_d=1.808 avg_d=1.197 std_dev=0.518
C1'	B	0, 0.488, 1.051, 1.615, 1.765 max_d=1.765 avg_d=1.051 std_dev=0.563
O3'	B	0, 0.621, 1.219, 1.817, 1.955 max_d=1.955 avg_d=1.219 std_dev=0.598
O5'	A	0, 0.444, 1.133, 1.822, 2.152 max_d=2.152 avg_d=1.133 std_dev=0.689
C4'	B	0, 0.701, 1.522, 2.342, 2.627 max_d=2.627 avg_d=1.522 std_dev=0.821
OP2	B	0, 1.196, 2.032, 2.868, 3.371 max_d=3.371 avg_d=2.032 std_dev=0.836
O4'	B	0, 0.606, 1.502, 2.398, 2.753 max_d=2.753 avg_d=1.502 std_dev=0.896
O3'	A	0, 0.474, 1.556, 2.637, 2.858 max_d=2.858 avg_d=1.556 std_dev=1.082
O5'	B	0, 0.762, 1.848, 2.934, 3.406 max_d=3.406 avg_d=1.848 std_dev=1.086
P	B	0, 1.189, 2.308, 3.426, 3.796 max_d=3.796 avg_d=2.308 std_dev=1.119
C5'	B	0, 0.834, 2.058, 3.282, 3.821 max_d=3.821 avg_d=2.058 std_dev=1.224
OP1	A	0, 0.557, 1.843, 3.129, 3.529 max_d=3.529 avg_d=1.843 std_dev=1.286
P	A	0, 0.395, 1.804, 3.212, 3.573 max_d=3.573 avg_d=1.804 std_dev=1.409
OP1	B	0, 1.381, 2.928, 4.476, 5.404 max_d=5.404 avg_d=2.928 std_dev=1.548
OP2	A	0, 0.185, 2.256, 4.327, 4.826 max_d=4.826 avg_d=2.256 std_dev=2.071

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.32	0.00	0.19	0.22	0.22	0.15
C2	0.02	0.00	0.10	0.13	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.34	0.32	0.03	0.13	0.13	0.15	0.12
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.24	0.04	0.05	0.07	0.10	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.54	0.64	0.87	0.64
C3'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.20	0.00	0.32	0.01	0.30	0.38	0.22	0.09	0.35	0.41	0.23	0.01	0.00	0.02	0.09	0.29	0.33	0.19
C4	0.01	0.00	0.05	0.20	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.30	0.15	0.02	0.11	0.11	0.13	0.10
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.08	0.12	0.05	0.02	0.09	0.12	0.07	0.32	0.02	0.00	0.01	0.14	0.07	0.01
C5	0.01	0.00	0.02	0.32	0.00	0.09	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.35	0.05	0.02	0.10	0.13	0.28	0.14
C5'	0.10	0.07	0.24	0.01	0.07	0.00	0.06	0.00	0.07	0.06	0.07	0.08	0.08	0.07	0.07	0.08	0.22	0.01	0.01	0.09	0.03	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.30	0.00	0.08	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.39	0.03	0.03	0.10	0.15	0.30	0.15
C8	0.01	0.00	0.05	0.38	0.00	0.12	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.22	0.21	0.01	0.11	0.13	0.30	0.14
N1	0.01	0.00	0.07	0.22	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.38	0.17	0.03	0.10	0.12	0.20	0.13
N3	0.01	0.00	0.10	0.09	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	0.36	0.03	0.15	0.16	0.16	0.12
N6	0.02	0.00	0.03	0.35	0.01	0.09	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.40	0.10	0.03	0.12	0.22	0.43	0.21
N7	0.01	0.00	0.03	0.41	0.00	0.12	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.30	0.23	0.01	0.13	0.20	0.44	0.20
N9	0.01	0.01	0.01	0.23	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.20	0.07	0.01	0.11	0.11	0.10	0.09
O2'	0.02	0.34	0.00	0.01	0.30	0.32	0.35	0.08	0.39	0.22	0.38	0.30	0.40	0.30	0.20	0.00	0.02	0.23	0.39	0.52	0.99	0.56
O3'	0.32	0.32	0.02	0.00	0.15	0.02	0.05	0.22	0.03	0.21	0.17	0.36	0.10	0.23	0.07	0.02	0.00	0.24	0.17	0.14	0.15	0.12
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.23	0.24	0.00	0.05	0.02	0.15	0.15
O5'	0.19	0.13	0.54	0.09	0.11	0.01	0.10	0.01	0.10	0.11	0.10	0.15	0.12	0.13	0.11	0.39	0.17	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.22	0.13	0.64	0.29	0.11	0.14	0.13	0.09	0.15	0.13	0.12	0.16	0.22	0.20	0.11	0.52	0.14	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.22	0.15	0.87	0.33	0.13	0.07	0.28	0.03	0.30	0.30	0.20	0.16	0.43	0.44	0.10	0.99	0.15	0.15	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.12	0.64	0.19	0.10	0.01	0.14	0.01	0.15	0.14	0.13	0.12	0.21	0.20	0.09	0.56	0.12	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.45	0.21	0.11	0.40	0.23	0.08	0.11	0.14	0.11	0.34	0.20	0.24	0.19	0.21	0.37	0.23	0.68	0.34	0.16	0.43	0.33	0.13
C2	0.25	0.40	0.19	0.40	0.24	0.15	0.15	0.21	0.13	0.20	0.28	0.37	0.27	0.23	0.21	0.14	0.59	0.23	0.30	0.76	0.51	0.36
C2'	0.51	0.23	0.11	0.37	0.23	0.07	0.10	0.19	0.14	0.37	0.24	0.24	0.24	0.22	0.39	0.36	0.69	0.37	0.22	0.49	0.27	0.20
C3'	0.57	0.22	0.12	0.48	0.26	0.13	0.09	0.35	0.10	0.30	0.14	0.34	0.23	0.17	0.39	0.49	0.87	0.39	0.41	0.67	0.37	0.43
C4	0.25	0.27	0.17	0.48	0.22	0.23	0.12	0.30	0.07	0.22	0.18	0.29	0.14	0.19	0.23	0.12	0.68	0.13	0.35	0.72	0.36	0.33
C4'	0.63	0.16	0.21	0.30	0.28	0.06	0.18	0.13	0.07	0.47	0.15	0.22	0.11	0.30	0.48	0.50	0.67	0.47	0.13	0.40	0.21	0.14
C5	0.13	0.26	0.20	0.56	0.16	0.41	0.14	0.52	0.15	0.22	0.23	0.22	0.13	0.22	0.15	0.09	0.72	0.18	0.57	0.95	0.31	0.54
C5'	0.31	0.20	0.07	0.54	0.12	0.38	0.13	0.56	0.09	0.38	0.17	0.12	0.11	0.28	0.28	0.27	0.96	0.08	0.45	0.76	0.34	0.48
C6	0.13	0.31	0.22	0.53	0.15	0.40	0.13	0.50	0.18	0.23	0.30	0.24	0.15	0.25	0.14	0.11	0.67	0.21	0.57	1.03	0.32	0.57
C8	0.16	0.17	0.15	0.64	0.15	0.49	0.16	0.64	0.13	0.29	0.16	0.14	0.14	0.26	0.20	0.07	0.84	0.20	0.63	0.90	0.33	0.58
N1	0.16	0.38	0.21	0.46	0.19	0.26	0.13	0.33	0.13	0.22	0.32	0.31	0.14	0.25	0.15	0.12	0.62	0.14	0.42	0.93	0.43	0.45
N3	0.32	0.36	0.17	0.40	0.27	0.12	0.14	0.17	0.12	0.21	0.21	0.38	0.26	0.19	0.26	0.16	0.61	0.29	0.24	0.64	0.48	0.29
N6	0.17	0.30	0.24	0.56	0.14	0.52	0.15	0.66	0.23	0.28	0.33	0.20	0.25	0.27	0.17	0.14	0.67	0.37	0.72	1.22	0.29	0.76
N7	0.12	0.20	0.19	0.65	0.14	0.58	0.18	0.75	0.19	0.26	0.21	0.15	0.20	0.26	0.15	0.09	0.81	0.34	0.77	1.07	0.37	0.74
N9	0.29	0.20	0.13	0.51	0.20	0.25	0.12	0.34	0.08	0.29	0.16	0.22	0.13	0.21	0.28	0.13	0.74	0.12	0.36	0.66	0.31	0.31
O2'	0.32	0.27	0.25	0.56	0.18	0.22	0.13	0.26	0.09	0.32	0.22	0.22	0.11	0.24	0.28	0.22	0.92	0.25	0.23	0.48	0.30	0.15
O3'	1.02	0.80	0.39	0.23	0.81	0.27	0.58	0.07	0.47	0.66	0.57	0.95	0.30	0.52	0.85	0.74	0.75	0.89	0.08	0.36	0.21	0.07
O4'	0.54	0.17	0.11	0.33	0.25	0.06	0.17	0.08	0.07	0.46	0.16	0.18	0.10	0.31	0.45	0.27	0.64	0.40	0.06	0.30	0.33	0.06
O5'	0.21	0.28	0.44	1.19	0.19	1.08	0.17	1.33	0.20	0.15	0.25	0.26	0.19	0.16	0.16	0.21	1.61	0.61	1.20	1.48	0.98	1.21
OP1	0.50	0.39	0.55	1.40	0.37	1.58	0.32	2.00	0.31	0.33	0.34	0.41	0.27	0.29	0.39	0.35	1.91	1.05	1.76	2.20	1.73	1.89
OP2	1.22	0.66	1.22	2.28	0.89	2.48	0.84	3.04	0.69	1.12	0.62	0.78	0.64	0.97	1.09	0.88	2.55	1.93	2.92	3.26	2.75	3.01
P	0.84	0.57	0.92	1.84	0.61	1.93	0.51	2.28	0.46	0.58	0.50	0.64	0.40	0.49	0.68	0.70	2.32	1.41	2.04	2.34	1.81	2.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.56	0.18	0.18
C2	0.01	0.00	0.43	0.26	0.00	0.17	0.00	0.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.45	0.41	0.35	0.47	0.77	0.92	0.74
C2'	0.00	0.43	0.00	0.00	0.24	0.01	0.15	0.02	0.24	0.17	0.36	0.41	0.19	0.06	0.04	0.00	0.02	0.01	0.10	0.23	0.22	0.10
C3'	0.01	0.26	0.00	0.00	0.14	0.00	0.09	0.01	0.14	0.17	0.22	0.24	0.12	0.11	0.04	0.01	0.00	0.02	0.08	0.12	0.14	0.08
C4	0.01	0.00	0.24	0.14	0.00	0.11	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.23	0.20	0.19	0.37	0.73	0.74	0.55
C4'	0.01	0.17	0.01	0.00	0.11	0.00	0.12	0.00	0.15	0.08	0.17	0.14	0.15	0.10	0.06	0.04	0.01	0.00	0.01	0.11	0.20	0.04
C5	0.01	0.00	0.15	0.09	0.00	0.12	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.14	0.11	0.42	0.84	0.94	0.65
C5'	0.05	0.43	0.02	0.01	0.30	0.00	0.33	0.00	0.40	0.15	0.45	0.36	0.41	0.24	0.17	0.04	0.03	0.01	0.01	0.19	0.38	0.01
C6	0.01	0.00	0.24	0.14	0.00	0.15	0.00	0.40	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.25	0.23	0.19	0.49	0.88	1.10	0.78
C8	0.01	0.00	0.17	0.17	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.19	0.18	0.26	0.88	0.56	0.38
N1	0.01	0.00	0.36	0.22	0.00	0.17	0.00	0.45	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.38	0.35	0.30	0.51	0.85	1.08	0.82
N3	0.01	0.00	0.41	0.24	0.00	0.14	0.00	0.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.42	0.36	0.33	0.40	0.68	0.74	0.60
N6	0.01	0.00	0.19	0.12	0.01	0.15	0.01	0.41	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.19	0.15	0.50	0.94	1.23	0.83
N7	0.01	0.00	0.06	0.11	0.00	0.10	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.12	0.07	0.35	0.91	0.87	0.54
N9	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.06	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.05	0.02	0.25	0.71	0.49	0.36
O2'	0.01	0.45	0.00	0.01	0.23	0.04	0.15	0.04	0.25	0.13	0.38	0.42	0.20	0.04	0.04	0.00	0.03	0.04	0.04	0.23	0.09	0.05
O3'	0.01	0.41	0.02	0.00	0.20	0.01	0.14	0.03	0.23	0.19	0.35	0.36	0.19	0.12	0.05	0.03	0.00	0.02	0.08	0.41	0.11	0.15
O4'	0.00	0.35	0.01	0.02	0.19	0.00	0.11	0.01	0.19	0.18	0.30	0.33	0.15	0.07	0.02	0.04	0.02	0.00	0.08	0.58	0.17	0.18
O5'	0.11	0.47	0.10	0.08	0.37	0.01	0.42	0.01	0.49	0.26	0.51	0.40	0.50	0.35	0.25	0.04	0.08	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.56	0.77	0.23	0.12	0.73	0.11	0.84	0.19	0.88	0.88	0.85	0.68	0.94	0.91	0.71	0.23	0.41	0.58	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.92	0.22	0.14	0.74	0.20	0.94	0.38	1.10	0.56	1.08	0.74	1.23	0.87	0.49	0.09	0.11	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.18	0.74	0.10	0.08	0.55	0.04	0.65	0.01	0.78	0.38	0.82	0.60	0.83	0.54	0.36	0.05	0.15	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00