Doublet Group distance statistics: 51608

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.010, 0.016, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.016 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.008, 0.015, 0.022, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.010, 0.018, 0.026, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.018 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.011, 0.020, 0.029, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.020 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.010, 0.021, 0.031, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.021 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.013, 0.025, 0.037, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.025 std_dev=0.012
N6	A	0, 0.018, 0.039, 0.060, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.039 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.022, 0.044, 0.067, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.044 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.019, 0.042, 0.065, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.042 std_dev=0.023
C2'	A	0, 0.085, 0.183, 0.280, 0.272 max_d=0.272 avg_d=0.183 std_dev=0.097
O4'	A	0, 0.103, 0.238, 0.374, 0.382 max_d=0.382 avg_d=0.238 std_dev=0.135
N1	B	0, 0.085, 0.269, 0.454, 0.605 max_d=0.605 avg_d=0.269 std_dev=0.185
C4'	A	0, 0.173, 0.397, 0.620, 0.604 max_d=0.604 avg_d=0.397 std_dev=0.223
C6	B	0, 0.142, 0.373, 0.603, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.373 std_dev=0.231
C5	B	0, 0.187, 0.436, 0.685, 0.673 max_d=0.673 avg_d=0.436 std_dev=0.249
C4	B	0, 0.166, 0.431, 0.697, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.431 std_dev=0.265
C2	B	0, 0.211, 0.486, 0.762, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.486 std_dev=0.276
N3	B	0, 0.247, 0.581, 0.915, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.581 std_dev=0.334
C3'	A	0, 0.270, 0.617, 0.965, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.617 std_dev=0.347
N9	B	0, 0.260, 0.641, 1.022, 1.036 max_d=1.036 avg_d=0.641 std_dev=0.381
O2'	A	0, 0.355, 0.754, 1.154, 1.054 max_d=1.054 avg_d=0.754 std_dev=0.399
C4'	B	0, 0.264, 0.665, 1.065, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.665 std_dev=0.401
N6	B	0, 0.294, 0.710, 1.125, 1.273 max_d=1.273 avg_d=0.710 std_dev=0.416
N7	B	0, 0.342, 0.763, 1.185, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.763 std_dev=0.421
C8	B	0, 0.351, 0.778, 1.204, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.778 std_dev=0.427
C1'	B	0, 0.367, 0.884, 1.402, 1.479 max_d=1.479 avg_d=0.884 std_dev=0.517
O4'	B	0, 0.387, 0.976, 1.564, 1.705 max_d=1.705 avg_d=0.976 std_dev=0.588
C5'	A	0, 0.514, 1.202, 1.890, 1.743 max_d=1.743 avg_d=1.202 std_dev=0.688
O3'	A	0, 0.577, 1.340, 2.102, 1.921 max_d=1.921 avg_d=1.340 std_dev=0.762
C3'	B	0, 0.627, 1.494, 2.360, 2.369 max_d=2.369 avg_d=1.494 std_dev=0.867
C5'	B	0, 0.786, 1.869, 2.952, 2.937 max_d=2.937 avg_d=1.869 std_dev=1.083
C2'	B	0, 0.894, 2.101, 3.307, 3.173 max_d=3.173 avg_d=2.101 std_dev=1.206
O3'	B	0, 0.924, 2.164, 3.404, 3.317 max_d=3.317 avg_d=2.164 std_dev=1.240
O5'	B	0, 1.230, 2.873, 4.515, 4.181 max_d=4.181 avg_d=2.873 std_dev=1.642
O5'	A	0, 1.401, 3.294, 5.186, 4.501 max_d=4.501 avg_d=3.294 std_dev=1.893
O2'	B	0, 1.531, 3.558, 5.585, 5.165 max_d=5.165 avg_d=3.558 std_dev=2.027
OP2	A	0, 1.553, 3.682, 5.811, 5.353 max_d=5.353 avg_d=3.682 std_dev=2.129
P	B	0, 1.610, 3.779, 5.948, 5.571 max_d=5.571 avg_d=3.779 std_dev=2.169
OP2	B	0, 1.685, 3.948, 6.211, 5.703 max_d=5.703 avg_d=3.948 std_dev=2.263
OP1	B	0, 1.957, 4.611, 7.264, 6.732 max_d=6.732 avg_d=4.611 std_dev=2.654
P	A	0, 1.977, 4.672, 7.367, 6.479 max_d=6.479 avg_d=4.672 std_dev=2.695
OP1	A	0, 2.800, 6.597, 10.395, 9.027 max_d=9.027 avg_d=6.597 std_dev=3.797

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.15	0.00	0.28	0.25	0.10	0.03
C2	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.19	0.24	0.06	0.24	0.20	0.26	0.20
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.13	0.05	0.02	0.05	0.03	0.06	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.52	0.67	0.22	0.41
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.07	0.16	0.04	0.01	0.09	0.15	0.08	0.01	0.01	0.04	0.30	0.41	0.11	0.26
C4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.13	0.03	0.41	0.45	0.11	0.06
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.07	0.03	0.06	0.04	0.06	0.02	0.19	0.02	0.00	0.01	0.05	0.08	0.09
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.02	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.05	0.01	0.59	0.76	0.07	0.24
C5'	0.07	0.04	0.13	0.01	0.10	0.01	0.17	0.00	0.16	0.26	0.09	0.03	0.20	0.25	0.14	0.08	0.18	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.02	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.21	0.09	0.01	0.54	0.70	0.05	0.17
C8	0.01	0.01	0.02	0.16	0.00	0.07	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.10	0.10	0.06	0.80	1.02	0.26	0.50
N1	0.01	0.00	0.05	0.04	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.17	0.04	0.38	0.42	0.17	0.07
N3	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.06	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.17	0.25	0.06	0.21	0.16	0.25	0.21
N6	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.04	0.01	0.20	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.22	0.05	0.02	0.65	0.91	0.10	0.30
N7	0.01	0.01	0.03	0.15	0.00	0.06	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.14	0.08	0.04	0.79	1.11	0.26	0.50
N9	0.00	0.00	0.02	0.08	0.00	0.02	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.10	0.06	0.01	0.50	0.56	0.07	0.17
O2'	0.02	0.19	0.00	0.01	0.16	0.19	0.18	0.08	0.21	0.10	0.21	0.17	0.22	0.14	0.10	0.00	0.05	0.09	0.23	0.43	0.06	0.19
O3'	0.15	0.24	0.01	0.01	0.13	0.02	0.05	0.18	0.09	0.10	0.17	0.25	0.05	0.08	0.06	0.05	0.00	0.10	0.02	0.13	0.13	0.07
O4'	0.00	0.06	0.00	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.04	0.06	0.02	0.04	0.01	0.09	0.10	0.00	0.05	0.13	0.25	0.29
O5'	0.28	0.24	0.52	0.30	0.41	0.01	0.59	0.01	0.54	0.80	0.38	0.21	0.65	0.79	0.50	0.23	0.02	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.25	0.20	0.67	0.41	0.45	0.05	0.76	0.01	0.70	1.02	0.42	0.16	0.91	1.11	0.56	0.43	0.13	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.10	0.26	0.22	0.11	0.11	0.08	0.07	0.05	0.05	0.26	0.17	0.25	0.10	0.26	0.07	0.06	0.13	0.25	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.20	0.41	0.26	0.06	0.09	0.24	0.02	0.17	0.50	0.07	0.21	0.30	0.50	0.17	0.19	0.07	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.20	0.38	0.23	0.06	0.02	0.16	0.23	0.15	0.24	0.09	0.23	0.25	0.30	0.04	0.14	0.42	0.06	0.67	0.87	1.39	0.94
C2	0.18	0.18	0.37	0.17	0.10	0.19	0.11	0.20	0.12	0.14	0.07	0.21	0.22	0.18	0.11	0.45	0.19	0.27	0.10	0.39	1.01	0.44
C2'	0.18	0.18	0.35	0.21	0.06	0.03	0.17	0.26	0.18	0.23	0.09	0.21	0.30	0.30	0.03	0.10	0.46	0.06	0.75	0.98	1.43	1.02
C3'	0.24	0.19	0.22	0.15	0.09	0.03	0.09	0.32	0.11	0.12	0.10	0.23	0.20	0.19	0.07	0.19	0.53	0.07	0.81	0.98	1.31	1.00
C4	0.24	0.19	0.24	0.10	0.08	0.09	0.13	0.06	0.16	0.16	0.09	0.24	0.28	0.25	0.08	0.11	0.41	0.12	0.36	0.73	1.30	0.77
C4'	0.24	0.26	0.18	0.10	0.10	0.04	0.12	0.32	0.10	0.22	0.12	0.29	0.22	0.28	0.05	0.26	0.66	0.07	0.86	1.00	1.35	1.05
C5	0.31	0.18	0.08	0.08	0.14	0.10	0.12	0.09	0.17	0.11	0.10	0.24	0.31	0.23	0.16	0.35	0.51	0.09	0.35	0.86	1.37	0.85
C5'	0.40	0.29	0.21	0.30	0.15	0.23	0.11	0.18	0.12	0.19	0.11	0.35	0.27	0.29	0.13	0.70	1.10	0.11	0.76	1.02	1.25	1.00
C6	0.28	0.16	0.08	0.08	0.16	0.13	0.10	0.06	0.15	0.11	0.09	0.23	0.31	0.16	0.19	0.23	0.43	0.14	0.18	0.70	1.22	0.68
C8	0.32	0.19	0.11	0.11	0.12	0.09	0.15	0.30	0.18	0.16	0.11	0.25	0.32	0.28	0.13	0.64	0.68	0.11	0.67	1.18	1.60	1.15
N1	0.22	0.15	0.20	0.08	0.13	0.18	0.09	0.17	0.12	0.11	0.06	0.20	0.25	0.14	0.15	0.18	0.28	0.23	0.08	0.48	1.05	0.49
N3	0.18	0.19	0.44	0.21	0.07	0.16	0.14	0.12	0.14	0.18	0.08	0.22	0.23	0.24	0.08	0.47	0.22	0.23	0.22	0.48	1.11	0.55
N6	0.31	0.15	0.15	0.14	0.18	0.13	0.12	0.07	0.16	0.17	0.11	0.21	0.32	0.15	0.23	0.41	0.48	0.12	0.17	0.78	1.23	0.72
N7	0.35	0.18	0.19	0.15	0.15	0.10	0.14	0.24	0.19	0.13	0.12	0.25	0.34	0.25	0.18	0.70	0.66	0.10	0.54	1.13	1.56	1.08
N9	0.25	0.19	0.21	0.10	0.08	0.04	0.15	0.19	0.17	0.19	0.10	0.24	0.29	0.29	0.06	0.22	0.52	0.06	0.58	0.93	1.45	0.96
O2'	0.14	0.10	0.48	0.25	0.08	0.11	0.26	0.11	0.27	0.29	0.14	0.13	0.41	0.38	0.09	0.36	0.37	0.12	0.59	0.72	1.27	0.81
O3'	0.10	0.20	0.57	0.48	0.24	0.27	0.34	0.53	0.35	0.35	0.28	0.17	0.42	0.40	0.23	0.31	0.12	0.25	0.98	0.98	1.37	1.08
O4'	0.24	0.24	0.21	0.11	0.10	0.03	0.12	0.27	0.11	0.23	0.11	0.28	0.21	0.28	0.05	0.24	0.64	0.07	0.75	0.91	1.37	0.99
O5'	0.69	0.39	0.54	0.87	0.25	0.83	0.12	0.52	0.17	0.13	0.13	0.52	0.40	0.33	0.27	0.90	1.71	0.52	0.12	0.40	0.80	0.42
OP1	1.38	0.84	1.36	1.91	0.75	1.90	0.29	1.76	0.19	0.33	0.46	1.05	0.18	0.06	0.83	1.51	2.52	1.36	1.12	0.83	0.33	0.79
OP2	1.25	0.86	1.40	1.57	0.82	1.21	0.51	0.82	0.44	0.54	0.62	1.00	0.21	0.33	0.88	1.85	2.17	0.91	0.32	0.30	0.25	0.11
P	1.43	0.98	1.41	1.78	0.91	1.62	0.54	1.29	0.46	0.55	0.68	1.14	0.18	0.31	0.97	1.69	2.50	1.24	0.68	0.23	0.05	0.32

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.00	0.12	0.06	0.61	0.18
C2	0.01	0.00	0.28	0.05	0.00	0.29	0.01	0.51	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.65	0.06	0.42	0.51	0.33	0.37	0.21
C2'	0.00	0.28	0.00	0.01	0.15	0.00	0.07	0.11	0.13	0.16	0.22	0.28	0.10	0.08	0.01	0.00	0.03	0.01	0.24	0.25	0.25	0.11
C3'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.09	0.34	0.20	0.07
C4	0.00	0.00	0.15	0.03	0.00	0.13	0.00	0.27	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.30	0.04	0.22	0.31	0.07	0.59	0.09
C4'	0.02	0.29	0.00	0.01	0.13	0.00	0.05	0.01	0.12	0.16	0.23	0.27	0.07	0.09	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.21	0.44	0.10
C5	0.00	0.01	0.07	0.02	0.00	0.05	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.07	0.09	0.24	0.18	0.71	0.22
C5'	0.04	0.51	0.11	0.02	0.27	0.01	0.18	0.00	0.29	0.15	0.44	0.46	0.23	0.08	0.08	0.06	0.11	0.02	0.00	0.27	0.22	0.01
C6	0.00	0.00	0.13	0.03	0.00	0.12	0.01	0.29	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.27	0.04	0.18	0.33	0.10	0.63	0.13
C8	0.01	0.01	0.16	0.02	0.01	0.16	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.34	0.14	0.24	0.11	0.47	0.98	0.53
N1	0.01	0.00	0.22	0.04	0.00	0.23	0.01	0.44	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.50	0.04	0.32	0.45	0.17	0.47	0.11
N3	0.01	0.00	0.28	0.05	0.00	0.27	0.00	0.46	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.63	0.06	0.42	0.46	0.32	0.39	0.17
N6	0.01	0.01	0.10	0.04	0.01	0.07	0.01	0.23	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.18	0.06	0.11	0.28	0.23	0.70	0.22
N7	0.01	0.01	0.08	0.02	0.00	0.09	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.21	0.12	0.13	0.11	0.47	0.93	0.47
N9	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.09	0.01	0.16	0.13	0.72	0.26
O2'	0.01	0.65	0.00	0.02	0.30	0.03	0.13	0.06	0.27	0.34	0.50	0.63	0.18	0.21	0.03	0.00	0.04	0.01	0.23	0.33	0.19	0.15
O3'	0.09	0.06	0.03	0.00	0.04	0.03	0.07	0.11	0.04	0.14	0.04	0.06	0.06	0.12	0.09	0.04	0.00	0.06	0.04	0.37	0.21	0.02
O4'	0.00	0.42	0.01	0.01	0.22	0.01	0.09	0.02	0.18	0.24	0.32	0.42	0.11	0.13	0.01	0.01	0.06	0.00	0.01	0.08	0.77	0.31
O5'	0.12	0.51	0.24	0.09	0.31	0.01	0.24	0.00	0.33	0.11	0.45	0.46	0.28	0.11	0.16	0.23	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00
OP1	0.06	0.33	0.25	0.34	0.07	0.21	0.18	0.27	0.10	0.47	0.17	0.32	0.23	0.47	0.13	0.33	0.37	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.61	0.37	0.25	0.20	0.59	0.44	0.71	0.22	0.63	0.98	0.47	0.39	0.70	0.93	0.72	0.19	0.21	0.77	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.21	0.11	0.07	0.09	0.10	0.22	0.01	0.13	0.53	0.11	0.17	0.22	0.47	0.26	0.15	0.02	0.31	0.00	0.00	0.01	0.00