Doublet Group distance statistics: 51609

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.010 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.011, 0.021, 0.031, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.021 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.010, 0.021, 0.032, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.021 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.015, 0.028, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.028 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.019, 0.033, 0.046, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.033 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.020, 0.036, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.036 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.021, 0.037, 0.053, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.037 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.015, 0.032, 0.049, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.032 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.016, 0.038, 0.061, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.038 std_dev=0.022
N6	A	0, 0.021, 0.044, 0.068, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.044 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.018, 0.042, 0.066, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.042 std_dev=0.024
N1	B	0, 0.404, 0.708, 1.013, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.708 std_dev=0.304
C6	B	0, 0.257, 0.567, 0.877, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.567 std_dev=0.310
C4	B	0, 0.356, 0.680, 1.004, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.680 std_dev=0.324
C5	B	0, 0.220, 0.550, 0.880, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.550 std_dev=0.330
N7	B	0, 0.231, 0.564, 0.897, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.564 std_dev=0.333
C8	B	0, 0.309, 0.647, 0.985, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.647 std_dev=0.338
N6	B	0, 0.211, 0.552, 0.893, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.552 std_dev=0.341
N9	B	0, 0.371, 0.713, 1.055, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.713 std_dev=0.342
C2	B	0, 0.449, 0.815, 1.181, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.815 std_dev=0.366
N3	B	0, 0.442, 0.813, 1.185, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.813 std_dev=0.372
C1'	B	0, 0.481, 0.881, 1.280, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.881 std_dev=0.399
O4'	B	0, 0.623, 1.094, 1.565, 1.604 max_d=1.604 avg_d=1.094 std_dev=0.471
C2'	B	0, 0.316, 0.853, 1.391, 2.038 max_d=2.038 avg_d=0.853 std_dev=0.538
O2'	B	0, 0.434, 1.013, 1.593, 2.159 max_d=2.159 avg_d=1.013 std_dev=0.579
C4'	B	0, 0.619, 1.208, 1.798, 2.203 max_d=2.203 avg_d=1.208 std_dev=0.590
C2'	A	0, 0.980, 1.590, 2.199, 1.920 max_d=1.920 avg_d=1.590 std_dev=0.609
O4'	A	0, 0.997, 1.613, 2.229, 1.963 max_d=1.963 avg_d=1.613 std_dev=0.616
C3'	B	0, 0.338, 1.009, 1.680, 2.461 max_d=2.461 avg_d=1.009 std_dev=0.671
C5'	B	0, 0.729, 1.410, 2.091, 2.580 max_d=2.580 avg_d=1.410 std_dev=0.681
O5'	B	0, 0.546, 1.336, 2.126, 3.049 max_d=3.049 avg_d=1.336 std_dev=0.790
C3'	A	0, 1.335, 2.155, 2.975, 2.633 max_d=2.633 avg_d=2.155 std_dev=0.820
OP1	B	0, 0.697, 1.536, 2.375, 3.116 max_d=3.116 avg_d=1.536 std_dev=0.839
O3'	B	0, 0.349, 1.190, 2.030, 2.985 max_d=2.985 avg_d=1.190 std_dev=0.841
O3'	A	0, 1.436, 2.314, 3.192, 2.786 max_d=2.786 avg_d=2.314 std_dev=0.878
P	B	0, 0.460, 1.382, 2.304, 3.463 max_d=3.463 avg_d=1.382 std_dev=0.922
O2'	A	0, 1.505, 2.431, 3.358, 2.872 max_d=2.872 avg_d=2.431 std_dev=0.926
C4'	A	0, 1.533, 2.475, 3.418, 3.031 max_d=3.031 avg_d=2.475 std_dev=0.943
OP2	B	0, 0.189, 1.354, 2.519, 4.227 max_d=4.227 avg_d=1.354 std_dev=1.165
C5'	A	0, 2.331, 3.766, 5.201, 4.610 max_d=4.610 avg_d=3.766 std_dev=1.435
O5'	A	0, 2.148, 3.914, 5.679, 5.511 max_d=5.511 avg_d=3.914 std_dev=1.766
P	A	0, 3.320, 5.899, 8.477, 8.072 max_d=8.072 avg_d=5.899 std_dev=2.578
OP1	A	0, 3.927, 6.606, 9.285, 9.094 max_d=9.094 avg_d=6.606 std_dev=2.679
OP2	A	0, 3.800, 7.088, 10.376, 10.419 max_d=10.419 avg_d=7.088 std_dev=3.288

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.00	0.35	0.53	0.64	0.40
C2	0.02	0.00	0.15	0.12	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.15	0.13	0.11	0.57	0.73	1.29	0.73
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.08	0.01	0.05	0.05	0.08	0.07	0.12	0.14	0.07	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.28	0.70	0.63	0.44
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.13	0.12	0.13	0.10	0.14	0.13	0.07	0.02	0.01	0.02	0.37	0.77	0.69	0.51
C4	0.01	0.00	0.08	0.09	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.06	0.06	0.62	0.67	1.25	0.72
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.07	0.14	0.05	0.07	0.09	0.13	0.06	0.08	0.01	0.00	0.01	0.33	0.15	0.12
C5	0.00	0.00	0.05	0.12	0.00	0.08	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.04	0.02	0.77	0.68	1.57	0.89
C5'	0.03	0.11	0.05	0.01	0.12	0.00	0.18	0.00	0.18	0.23	0.14	0.10	0.22	0.25	0.12	0.03	0.07	0.01	0.01	0.10	0.05	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.13	0.00	0.07	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.08	0.05	0.78	0.71	1.67	0.94
C8	0.01	0.00	0.07	0.12	0.00	0.14	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.08	0.07	0.81	0.62	1.39	0.83
N1	0.01	0.00	0.12	0.13	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.11	0.11	0.09	0.68	0.74	1.52	0.86
N3	0.02	0.00	0.14	0.10	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.12	0.11	0.50	0.70	1.11	0.64
N6	0.00	0.00	0.07	0.14	0.00	0.09	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.10	0.08	0.03	0.85	0.70	1.85	1.04
N7	0.01	0.01	0.03	0.13	0.00	0.13	0.00	0.25	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.14	0.06	0.04	0.88	0.66	1.69	0.97
N9	0.00	0.00	0.01	0.07	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.03	0.01	0.59	0.61	1.08	0.64
O2'	0.01	0.15	0.00	0.02	0.07	0.08	0.09	0.03	0.09	0.16	0.11	0.14	0.10	0.14	0.07	0.00	0.06	0.07	0.08	0.62	0.33	0.26
O3'	0.10	0.13	0.02	0.01	0.06	0.01	0.04	0.07	0.08	0.08	0.11	0.12	0.08	0.06	0.03	0.06	0.00	0.06	0.49	0.90	0.86	0.59
O4'	0.00	0.11	0.01	0.02	0.06	0.00	0.02	0.01	0.05	0.07	0.09	0.11	0.03	0.04	0.01	0.07	0.06	0.00	0.37	0.41	0.52	0.35
O5'	0.35	0.57	0.28	0.37	0.62	0.01	0.77	0.01	0.78	0.81	0.68	0.50	0.85	0.88	0.59	0.08	0.49	0.37	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.53	0.73	0.70	0.77	0.67	0.33	0.68	0.10	0.71	0.62	0.74	0.70	0.70	0.66	0.61	0.62	0.90	0.41	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.64	1.29	0.63	0.69	1.25	0.15	1.57	0.05	1.67	1.39	1.52	1.11	1.85	1.69	1.08	0.33	0.86	0.52	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.40	0.73	0.44	0.51	0.72	0.12	0.89	0.01	0.94	0.83	0.86	0.64	1.04	0.97	0.64	0.26	0.59	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.34	0.49	0.47	0.66	0.34	0.55	0.26	0.63	0.28	0.21	0.39	0.47	0.22	0.19	0.29	0.39	0.76	0.40	0.71	0.90	0.37	0.78
C2	0.22	0.27	0.31	0.46	0.23	0.39	0.22	0.49	0.25	0.19	0.27	0.24	0.25	0.20	0.21	0.26	0.51	0.26	0.55	0.98	0.08	0.70
C2'	0.37	0.47	0.52	0.75	0.33	0.65	0.23	0.75	0.25	0.19	0.36	0.46	0.21	0.16	0.29	0.47	0.90	0.45	0.84	0.96	0.53	0.91
C3'	0.44	0.50	0.58	0.86	0.36	0.78	0.24	0.89	0.24	0.23	0.36	0.51	0.18	0.19	0.34	0.55	1.03	0.57	0.99	1.01	0.75	1.04
C4	0.26	0.33	0.35	0.52	0.26	0.46	0.22	0.56	0.23	0.19	0.28	0.31	0.18	0.18	0.24	0.28	0.57	0.32	0.64	0.96	0.21	0.76
C4'	0.49	0.57	0.65	0.89	0.41	0.79	0.29	0.87	0.30	0.28	0.44	0.57	0.22	0.23	0.39	0.61	1.06	0.60	0.94	0.98	0.71	0.97
C5	0.22	0.21	0.29	0.46	0.20	0.44	0.17	0.56	0.16	0.17	0.17	0.22	0.16	0.16	0.20	0.25	0.48	0.30	0.63	0.99	0.19	0.78
C5'	0.58	0.58	0.72	1.02	0.45	0.94	0.34	1.02	0.33	0.38	0.45	0.60	0.26	0.32	0.46	0.68	1.21	0.74	1.08	1.04	0.91	1.08
C6	0.18	0.17	0.25	0.38	0.16	0.37	0.18	0.49	0.20	0.16	0.18	0.16	0.25	0.17	0.16	0.23	0.42	0.25	0.54	1.00	0.08	0.73
C8	0.30	0.31	0.37	0.59	0.25	0.54	0.16	0.65	0.14	0.16	0.21	0.34	0.09	0.13	0.23	0.31	0.61	0.39	0.73	0.91	0.38	0.81
N1	0.19	0.21	0.27	0.40	0.19	0.36	0.20	0.47	0.23	0.17	0.23	0.19	0.27	0.18	0.18	0.23	0.44	0.24	0.51	0.99	0.06	0.68
N3	0.25	0.34	0.36	0.52	0.26	0.44	0.24	0.53	0.27	0.20	0.32	0.31	0.24	0.21	0.24	0.29	0.58	0.29	0.60	0.97	0.15	0.73
N6	0.14	0.14	0.22	0.32	0.12	0.33	0.18	0.46	0.23	0.13	0.19	0.12	0.32	0.18	0.12	0.23	0.38	0.22	0.48	1.00	0.05	0.71
N7	0.24	0.20	0.30	0.48	0.18	0.49	0.11	0.62	0.09	0.14	0.13	0.23	0.10	0.13	0.19	0.28	0.48	0.35	0.71	0.96	0.32	0.83
N9	0.30	0.40	0.40	0.60	0.30	0.52	0.22	0.61	0.22	0.19	0.31	0.40	0.17	0.17	0.26	0.32	0.66	0.37	0.69	0.93	0.32	0.78
O2'	0.36	0.47	0.54	0.77	0.33	0.64	0.25	0.73	0.28	0.21	0.39	0.45	0.25	0.19	0.29	0.50	0.94	0.44	0.81	0.94	0.50	0.87
O3'	0.47	0.53	0.61	0.90	0.37	0.83	0.24	0.95	0.26	0.21	0.40	0.54	0.21	0.17	0.34	0.61	1.10	0.60	1.03	1.01	0.84	1.08
O4'	0.41	0.57	0.55	0.72	0.39	0.61	0.29	0.66	0.32	0.24	0.45	0.55	0.25	0.20	0.34	0.49	0.83	0.48	0.72	0.87	0.42	0.76
O5'	1.22	1.16	1.23	1.49	1.11	1.47	0.97	1.57	0.92	0.99	1.01	1.23	0.82	0.92	1.11	1.20	1.57	1.34	1.65	1.59	1.51	1.67
OP1	1.18	1.10	1.18	1.30	1.01	1.40	0.85	1.47	0.85	0.84	0.97	1.14	0.75	0.75	1.01	1.34	1.48	1.29	1.42	1.29	1.34	1.39
OP2	1.88	1.68	1.80	2.07	1.71	2.19	1.62	2.39	1.53	1.71	1.54	1.78	1.47	1.65	1.77	1.86	2.06	2.07	2.53	2.39	2.59	2.59
P	1.30	1.17	1.28	1.60	1.12	1.67	0.98	1.79	0.93	1.03	1.01	1.24	0.84	0.95	1.15	1.35	1.77	1.50	1.84	1.68	1.78	1.83

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.07	0.37	0.26	0.05
C2	0.02	0.00	0.24	0.26	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.19	0.33	0.08	0.11	0.62	0.36	0.22
C2'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.12	0.01	0.07	0.01	0.12	0.11	0.19	0.24	0.09	0.06	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.18	0.17	0.04
C3'	0.01	0.26	0.00	0.00	0.13	0.00	0.08	0.02	0.14	0.15	0.22	0.24	0.11	0.09	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.08	0.04
C4	0.01	0.00	0.12	0.13	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.15	0.05	0.04	0.59	0.41	0.15
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.03	0.07	0.07	0.05	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.11	0.05	0.01
C5	0.01	0.00	0.07	0.08	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.09	0.03	0.05	0.66	0.53	0.16
C5'	0.01	0.09	0.01	0.02	0.06	0.01	0.06	0.00	0.08	0.03	0.09	0.08	0.08	0.03	0.02	0.04	0.04	0.01	0.01	0.04	0.19	0.01
C6	0.01	0.00	0.12	0.14	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.17	0.05	0.06	0.70	0.52	0.20
C8	0.01	0.01	0.11	0.15	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.17	0.05	0.18	0.58	0.59	0.08
N1	0.01	0.00	0.19	0.22	0.01	0.07	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.27	0.07	0.10	0.68	0.44	0.23
N3	0.01	0.00	0.24	0.24	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.18	0.29	0.08	0.09	0.57	0.32	0.18
N6	0.01	0.00	0.09	0.11	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.14	0.04	0.06	0.73	0.59	0.21
N7	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.12	0.03	0.13	0.66	0.65	0.11
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.07	0.52	0.41	0.08
O2'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.08	0.04	0.04	0.04	0.08	0.07	0.14	0.18	0.07	0.04	0.01	0.00	0.03	0.02	0.02	0.14	0.10	0.02
O3'	0.02	0.33	0.01	0.00	0.15	0.02	0.09	0.04	0.17	0.17	0.27	0.29	0.14	0.12	0.03	0.03	0.00	0.02	0.07	0.23	0.15	0.08
O4'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.05	0.07	0.08	0.04	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.11	0.33	0.17	0.06
O5'	0.07	0.11	0.02	0.04	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.18	0.10	0.09	0.06	0.13	0.07	0.02	0.07	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.37	0.62	0.18	0.07	0.59	0.11	0.66	0.04	0.70	0.58	0.68	0.57	0.73	0.66	0.52	0.14	0.23	0.33	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.26	0.36	0.17	0.08	0.41	0.05	0.53	0.19	0.52	0.59	0.44	0.32	0.59	0.65	0.41	0.10	0.15	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.22	0.04	0.04	0.15	0.01	0.16	0.01	0.20	0.08	0.23	0.18	0.21	0.11	0.08	0.02	0.08	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00