Doublet Group distance statistics: 51611

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.015 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.009, 0.021, 0.033, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.011, 0.025, 0.038, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.025 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.006, 0.020, 0.035, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.020 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.010, 0.025, 0.040, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.014, 0.030, 0.045, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.030 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.016, 0.034, 0.052, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.034 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.022, 0.052, 0.082, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.052 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.027, 0.061, 0.096, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.061 std_dev=0.034
N6	A	0, 0.023, 0.061, 0.098, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.061 std_dev=0.038
N9	B	0, 0.138, 0.335, 0.533, 0.544 max_d=0.544 avg_d=0.335 std_dev=0.198
C4	B	0, 0.159, 0.357, 0.555, 0.562 max_d=0.562 avg_d=0.357 std_dev=0.198
C5	B	0, 0.124, 0.328, 0.532, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.328 std_dev=0.204
C2'	A	0, -0.016, 0.200, 0.416, 0.668 max_d=0.668 avg_d=0.200 std_dev=0.216
C8	B	0, 0.099, 0.322, 0.545, 0.679 max_d=0.679 avg_d=0.322 std_dev=0.223
O4'	A	0, 0.004, 0.227, 0.450, 0.676 max_d=0.676 avg_d=0.227 std_dev=0.223
O5'	A	0, 0.149, 0.372, 0.596, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.372 std_dev=0.223
C1'	B	0, 0.153, 0.383, 0.612, 0.584 max_d=0.584 avg_d=0.383 std_dev=0.229
N7	B	0, 0.079, 0.314, 0.550, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.314 std_dev=0.235
N3	B	0, 0.211, 0.463, 0.716, 0.694 max_d=0.694 avg_d=0.463 std_dev=0.252
C4'	A	0, -0.021, 0.235, 0.491, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.235 std_dev=0.256
C6	B	0, 0.116, 0.384, 0.652, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.384 std_dev=0.268
C2'	B	0, 0.115, 0.404, 0.692, 0.894 max_d=0.894 avg_d=0.404 std_dev=0.289
C2	B	0, 0.219, 0.508, 0.798, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.508 std_dev=0.290
N1	B	0, 0.163, 0.469, 0.774, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.469 std_dev=0.305
O4'	B	0, 0.147, 0.468, 0.789, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.468 std_dev=0.321
O2'	A	0, -0.016, 0.315, 0.647, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.315 std_dev=0.331
N6	B	0, 0.080, 0.435, 0.790, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.435 std_dev=0.355
C4'	B	0, 0.110, 0.480, 0.849, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.480 std_dev=0.370
C3'	A	0, -0.110, 0.276, 0.663, 1.124 max_d=1.124 avg_d=0.276 std_dev=0.386
P	A	0, 0.162, 0.570, 0.978, 1.305 max_d=1.305 avg_d=0.570 std_dev=0.408
C3'	B	0, 0.073, 0.490, 0.907, 1.254 max_d=1.254 avg_d=0.490 std_dev=0.417
O2'	B	0, 0.090, 0.520, 0.951, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.520 std_dev=0.430
C5'	B	0, 0.027, 0.462, 0.897, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.462 std_dev=0.435
OP2	A	0, 0.240, 0.718, 1.197, 1.509 max_d=1.509 avg_d=0.718 std_dev=0.478
O3'	A	0, -0.129, 0.397, 0.924, 1.549 max_d=1.549 avg_d=0.397 std_dev=0.527
C5'	A	0, -0.073, 0.512, 1.097, 1.764 max_d=1.764 avg_d=0.512 std_dev=0.585
OP1	A	0, 0.102, 0.759, 1.415, 1.948 max_d=1.948 avg_d=0.759 std_dev=0.657
O3'	B	0, -0.154, 0.793, 1.740, 2.810 max_d=2.810 avg_d=0.793 std_dev=0.947
O5'	B	0, -0.401, 0.902, 2.205, 3.755 max_d=3.755 avg_d=0.902 std_dev=1.303
OP1	B	0, -0.511, 0.887, 2.286, 3.961 max_d=3.961 avg_d=0.887 std_dev=1.399
P	B	0, -0.769, 1.000, 2.770, 4.929 max_d=4.929 avg_d=1.000 std_dev=1.770
OP2	B	0, -1.123, 1.515, 4.154, 7.385 max_d=7.385 avg_d=1.515 std_dev=2.638

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.11	0.00	0.15	0.23	0.19	0.15
C2	0.02	0.00	0.09	0.09	0.01	0.08	0.01	0.28	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.23	0.33	0.13	0.23	0.21	0.27	0.17
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.03	0.02	0.07	0.06	0.09	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.02	0.12	0.09	0.16	0.10
C3'	0.02	0.09	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.11	0.05	0.09	0.04	0.10	0.03	0.01	0.01	0.01	0.30	0.08	0.26	0.23
C4	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.08	0.01	0.28	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.15	0.21	0.07	0.19	0.23	0.29	0.18
C4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.08	0.00	0.11	0.01	0.11	0.12	0.09	0.07	0.12	0.13	0.08	0.02	0.01	0.00	0.02	0.16	0.09	0.02
C5	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.11	0.00	0.34	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.13	0.17	0.04	0.17	0.26	0.35	0.22
C5'	0.08	0.28	0.03	0.01	0.28	0.01	0.34	0.00	0.35	0.30	0.33	0.24	0.38	0.35	0.23	0.03	0.01	0.01	0.01	0.31	0.17	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.11	0.01	0.35	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.22	0.06	0.19	0.24	0.35	0.21
C8	0.01	0.00	0.07	0.11	0.00	0.12	0.01	0.30	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.04	0.03	0.07	0.15	0.32	0.37	0.27
N1	0.02	0.01	0.06	0.05	0.01	0.09	0.00	0.33	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.21	0.29	0.10	0.21	0.21	0.31	0.18
N3	0.02	0.01	0.09	0.09	0.01	0.07	0.01	0.24	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.31	0.13	0.22	0.22	0.25	0.16
N6	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.12	0.02	0.38	0.00	0.04	0.02	0.01	0.00	0.04	0.03	0.15	0.19	0.05	0.17	0.26	0.36	0.22
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.13	0.00	0.35	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.07	0.07	0.04	0.16	0.33	0.41	0.28
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.08	0.01	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.11	0.01	0.16	0.25	0.28	0.19
O2'	0.01	0.23	0.00	0.01	0.15	0.02	0.13	0.03	0.17	0.04	0.21	0.21	0.15	0.07	0.07	0.00	0.04	0.02	0.18	0.07	0.18	0.14
O3'	0.11	0.33	0.04	0.01	0.21	0.01	0.17	0.01	0.22	0.03	0.29	0.31	0.19	0.07	0.11	0.04	0.00	0.03	0.31	0.19	0.26	0.27
O4'	0.00	0.13	0.02	0.01	0.07	0.00	0.04	0.01	0.06	0.07	0.10	0.13	0.05	0.04	0.01	0.02	0.03	0.00	0.33	0.37	0.27	0.27
O5'	0.15	0.23	0.12	0.30	0.19	0.02	0.17	0.01	0.19	0.15	0.21	0.22	0.17	0.16	0.16	0.18	0.31	0.33	0.00	0.02	0.00	0.00
OP1	0.23	0.21	0.09	0.08	0.23	0.16	0.26	0.31	0.24	0.32	0.21	0.22	0.26	0.33	0.25	0.07	0.19	0.37	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.27	0.16	0.26	0.29	0.09	0.35	0.17	0.35	0.37	0.31	0.25	0.36	0.41	0.28	0.18	0.26	0.27	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.17	0.10	0.23	0.18	0.02	0.22	0.01	0.21	0.27	0.18	0.16	0.22	0.28	0.19	0.14	0.27	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.05	0.30	0.23	0.07	0.18	0.10	0.40	0.15	0.12	0.11	0.09	0.25	0.13	0.14	0.39	0.49	0.27	0.61	0.49	1.04	0.90
C2	0.09	0.10	0.04	0.41	0.12	0.17	0.12	0.24	0.07	0.14	0.07	0.12	0.07	0.14	0.12	0.47	0.50	0.09	0.40	0.24	0.76	0.62
C2'	0.24	0.06	0.33	0.21	0.08	0.26	0.11	0.45	0.16	0.10	0.11	0.10	0.28	0.15	0.13	0.42	0.56	0.27	0.80	0.70	1.41	1.17
C3'	0.21	0.05	0.31	0.20	0.07	0.31	0.17	0.46	0.22	0.13	0.15	0.07	0.34	0.23	0.10	0.31	0.51	0.27	0.83	0.79	1.37	1.19
C4	0.17	0.12	0.18	0.35	0.11	0.11	0.07	0.30	0.12	0.15	0.13	0.11	0.17	0.09	0.14	0.47	0.51	0.18	0.43	0.27	0.84	0.70
C4'	0.11	0.21	0.24	0.19	0.18	0.12	0.29	0.28	0.34	0.21	0.29	0.15	0.43	0.33	0.13	0.19	0.39	0.14	0.41	0.42	0.70	0.66
C5	0.17	0.17	0.16	0.35	0.14	0.09	0.13	0.28	0.16	0.20	0.19	0.15	0.19	0.16	0.17	0.48	0.49	0.18	0.36	0.20	0.77	0.64
C5'	0.26	0.50	0.32	0.28	0.45	0.09	0.56	0.17	0.62	0.44	0.58	0.43	0.71	0.58	0.37	0.26	0.39	0.16	0.21	0.29	0.48	0.46
C6	0.14	0.19	0.09	0.38	0.15	0.09	0.16	0.25	0.14	0.20	0.19	0.16	0.11	0.20	0.16	0.47	0.48	0.14	0.32	0.17	0.72	0.59
C8	0.22	0.16	0.25	0.28	0.13	0.12	0.13	0.33	0.21	0.18	0.21	0.13	0.30	0.12	0.17	0.45	0.48	0.25	0.40	0.28	0.83	0.70
N1	0.09	0.15	0.04	0.40	0.13	0.13	0.14	0.23	0.11	0.16	0.12	0.14	0.10	0.18	0.13	0.46	0.48	0.09	0.34	0.19	0.71	0.59
N3	0.13	0.08	0.14	0.39	0.11	0.16	0.08	0.28	0.08	0.14	0.07	0.11	0.12	0.12	0.13	0.47	0.53	0.14	0.46	0.30	0.84	0.69
N6	0.15	0.21	0.09	0.37	0.17	0.08	0.19	0.24	0.19	0.22	0.22	0.18	0.19	0.24	0.17	0.48	0.45	0.15	0.28	0.12	0.67	0.56
N7	0.21	0.20	0.21	0.31	0.16	0.10	0.16	0.30	0.22	0.22	0.24	0.16	0.28	0.17	0.19	0.47	0.47	0.24	0.34	0.21	0.77	0.64
N9	0.20	0.11	0.25	0.29	0.09	0.13	0.09	0.34	0.16	0.13	0.15	0.10	0.25	0.08	0.14	0.44	0.50	0.23	0.47	0.34	0.90	0.76
O2'	0.32	0.17	0.41	0.27	0.19	0.33	0.10	0.48	0.08	0.15	0.08	0.23	0.17	0.11	0.23	0.53	0.67	0.33	0.98	0.80	1.73	1.34
O3'	0.42	0.28	0.48	0.39	0.29	0.51	0.24	0.59	0.24	0.26	0.24	0.33	0.29	0.25	0.32	0.48	0.62	0.46	1.12	0.86	1.64	1.43
O4'	0.21	0.21	0.34	0.37	0.18	0.13	0.23	0.22	0.27	0.16	0.25	0.19	0.34	0.24	0.17	0.35	0.50	0.20	0.23	0.22	0.52	0.48
O5'	0.26	0.25	0.25	0.14	0.25	0.25	0.29	0.28	0.33	0.25	0.30	0.24	0.40	0.30	0.24	0.23	0.19	0.32	0.16	0.13	0.08	0.15
OP1	0.16	0.18	0.17	0.20	0.16	0.21	0.21	0.24	0.25	0.17	0.23	0.16	0.32	0.22	0.15	0.16	0.29	0.21	0.10	0.12	0.11	0.08
OP2	0.24	0.19	0.33	0.14	0.18	0.20	0.18	0.22	0.22	0.18	0.21	0.18	0.28	0.17	0.19	0.35	0.18	0.27	0.19	0.27	0.14	0.08
P	0.10	0.17	0.18	0.15	0.13	0.12	0.20	0.15	0.25	0.11	0.23	0.12	0.33	0.19	0.09	0.15	0.21	0.16	0.16	0.29	0.23	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.28	0.01	0.18	0.20	0.20	0.11
C2	0.02	0.00	0.08	0.17	0.00	0.07	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.39	0.16	0.02	0.11	0.26	0.07	0.07
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.20	0.06	0.03	0.08	0.07	0.07	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.18	0.14	0.30	0.25
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.21	0.00	0.31	0.01	0.32	0.31	0.26	0.13	0.38	0.35	0.20	0.01	0.00	0.01	0.25	0.11	0.40	0.27
C4	0.01	0.00	0.04	0.21	0.00	0.08	0.00	0.07	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.30	0.08	0.01	0.16	0.30	0.13	0.09
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.08	0.00	0.12	0.00	0.13	0.12	0.11	0.05	0.16	0.14	0.08	0.25	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.31	0.00	0.12	0.00	0.11	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.30	0.08	0.01	0.21	0.37	0.19	0.18
C5'	0.07	0.08	0.20	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.12	0.11	0.10	0.07	0.16	0.13	0.05	0.04	0.18	0.01	0.01	0.09	0.01	0.01
C6	0.02	0.00	0.06	0.32	0.02	0.13	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.34	0.11	0.01	0.20	0.38	0.19	0.19
C8	0.01	0.01	0.03	0.31	0.01	0.12	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.15	0.11	0.02	0.27	0.40	0.27	0.21
N1	0.02	0.00	0.08	0.26	0.01	0.11	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.38	0.08	0.02	0.15	0.32	0.12	0.14
N3	0.02	0.00	0.07	0.13	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.36	0.21	0.02	0.12	0.24	0.09	0.04
N6	0.03	0.01	0.07	0.38	0.02	0.16	0.02	0.16	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.34	0.19	0.02	0.25	0.43	0.27	0.27
N7	0.01	0.01	0.03	0.35	0.01	0.14	0.00	0.13	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.23	0.16	0.02	0.27	0.44	0.27	0.24
N9	0.00	0.00	0.01	0.20	0.00	0.08	0.01	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.17	0.06	0.01	0.20	0.30	0.19	0.12
O2'	0.02	0.39	0.01	0.01	0.30	0.25	0.30	0.04	0.34	0.15	0.38	0.36	0.34	0.23	0.17	0.00	0.01	0.19	0.10	0.09	0.13	0.08
O3'	0.28	0.16	0.02	0.00	0.08	0.01	0.08	0.18	0.11	0.11	0.08	0.21	0.19	0.16	0.06	0.01	0.00	0.21	0.52	0.38	0.78	0.57
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.19	0.21	0.00	0.33	0.24	0.38	0.25
O5'	0.18	0.11	0.18	0.25	0.16	0.01	0.21	0.01	0.20	0.27	0.15	0.12	0.25	0.27	0.20	0.10	0.52	0.33	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.20	0.26	0.14	0.11	0.30	0.05	0.37	0.09	0.38	0.40	0.32	0.24	0.43	0.44	0.30	0.09	0.38	0.24	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.20	0.07	0.30	0.40	0.13	0.04	0.19	0.01	0.19	0.27	0.12	0.09	0.27	0.27	0.19	0.13	0.78	0.38	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.07	0.25	0.27	0.09	0.02	0.18	0.01	0.19	0.21	0.14	0.04	0.27	0.24	0.12	0.08	0.57	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00