Doublet Group distance statistics: 51614

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.004, 0.016, 0.027, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.009, 0.020, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.020 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.010, 0.024, 0.038, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.024 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.008, 0.024, 0.039, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.024 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.011, 0.027, 0.044, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.027 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.015, 0.035, 0.055, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.035 std_dev=0.020
N6	A	0, 0.014, 0.036, 0.059, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.036 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.016, 0.043, 0.070, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.043 std_dev=0.027
N1	B	0, 0.132, 0.519, 0.906, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.519 std_dev=0.387
C8	B	0, 0.162, 0.552, 0.942, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.552 std_dev=0.390
C5	B	0, 0.137, 0.533, 0.929, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.533 std_dev=0.396
C6	B	0, 0.163, 0.570, 0.977, 1.090 max_d=1.090 avg_d=0.570 std_dev=0.407
N9	B	0, 0.104, 0.518, 0.932, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.518 std_dev=0.414
C4	B	0, 0.064, 0.496, 0.928, 1.145 max_d=1.145 avg_d=0.496 std_dev=0.432
C2	B	0, 0.149, 0.604, 1.059, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.604 std_dev=0.455
N7	B	0, 0.173, 0.634, 1.096, 1.167 max_d=1.167 avg_d=0.634 std_dev=0.461
N3	B	0, 0.150, 0.647, 1.144, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.647 std_dev=0.497
N6	B	0, 0.223, 0.754, 1.286, 1.428 max_d=1.428 avg_d=0.754 std_dev=0.531
C2'	B	0, 0.190, 0.728, 1.265, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.728 std_dev=0.538
C1'	B	0, 0.127, 0.664, 1.202, 1.419 max_d=1.419 avg_d=0.664 std_dev=0.538
C2'	A	0, -0.030, 0.529, 1.087, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.529 std_dev=0.558
O4'	A	0, -0.021, 0.540, 1.102, 1.249 max_d=1.249 avg_d=0.540 std_dev=0.561
O3'	B	0, 0.234, 0.817, 1.401, 1.741 max_d=1.741 avg_d=0.817 std_dev=0.584
O2'	A	0, -0.013, 0.805, 1.623, 1.934 max_d=1.934 avg_d=0.805 std_dev=0.818
C4'	A	0, 0.010, 0.895, 1.779, 2.008 max_d=2.008 avg_d=0.895 std_dev=0.884
C3'	B	0, 0.135, 1.031, 1.927, 2.274 max_d=2.274 avg_d=1.031 std_dev=0.896
C3'	A	0, -0.075, 0.888, 1.851, 2.075 max_d=2.075 avg_d=0.888 std_dev=0.963
C5'	A	0, 0.093, 1.127, 2.160, 2.477 max_d=2.477 avg_d=1.127 std_dev=1.033
O2'	B	0, 0.103, 1.493, 2.883, 3.324 max_d=3.324 avg_d=1.493 std_dev=1.390
O3'	A	0, -0.119, 1.325, 2.769, 3.155 max_d=3.155 avg_d=1.325 std_dev=1.444
O4'	B	0, -0.049, 1.530, 3.109, 3.632 max_d=3.632 avg_d=1.530 std_dev=1.579
C4'	B	0, -0.019, 1.633, 3.285, 3.870 max_d=3.870 avg_d=1.633 std_dev=1.652
O5'	A	0, 0.030, 1.686, 3.341, 3.812 max_d=3.812 avg_d=1.686 std_dev=1.656
P	A	0, 0.049, 2.031, 4.013, 4.625 max_d=4.625 avg_d=2.031 std_dev=1.982
OP1	A	0, 0.151, 2.232, 4.312, 5.012 max_d=5.012 avg_d=2.232 std_dev=2.081
O5'	B	0, -0.145, 2.584, 5.313, 6.155 max_d=6.155 avg_d=2.584 std_dev=2.729
C5'	B	0, -0.244, 2.607, 5.457, 6.322 max_d=6.322 avg_d=2.607 std_dev=2.850
OP2	B	0, -0.053, 2.839, 5.731, 6.583 max_d=6.583 avg_d=2.839 std_dev=2.892
P	B	0, -0.293, 2.952, 6.197, 7.202 max_d=7.202 avg_d=2.952 std_dev=3.245
OP2	A	0, -0.218, 3.122, 6.461, 7.368 max_d=7.368 avg_d=3.122 std_dev=3.340
OP1	B	0, -0.330, 3.381, 7.093, 8.314 max_d=8.314 avg_d=3.381 std_dev=3.712

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.07	0.03	0.01	0.04	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.35	0.00	0.44	0.09	0.67	0.31
C2	0.04	0.00	0.34	0.53	0.01	0.20	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.24	0.16	0.10	1.14	0.87	2.05	1.20
C2'	0.00	0.34	0.00	0.00	0.17	0.01	0.07	0.24	0.15	0.17	0.26	0.35	0.10	0.09	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.10	0.14	0.16
C3'	0.00	0.53	0.00	0.00	0.42	0.00	0.44	0.02	0.51	0.20	0.55	0.46	0.51	0.33	0.25	0.02	0.00	0.01	0.05	0.29	0.10	0.02
C4	0.02	0.01	0.17	0.42	0.00	0.16	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.25	0.05	0.05	1.07	0.59	1.80	1.03
C4'	0.01	0.20	0.01	0.00	0.16	0.00	0.17	0.01	0.19	0.09	0.21	0.17	0.19	0.13	0.09	0.30	0.02	0.00	0.01	0.07	0.02	0.01
C5	0.01	0.00	0.07	0.44	0.00	0.17	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.32	0.13	0.04	1.26	0.67	2.24	1.28
C5'	0.07	0.24	0.24	0.02	0.16	0.01	0.19	0.00	0.24	0.09	0.26	0.19	0.25	0.14	0.06	0.04	0.22	0.02	0.00	0.03	0.02	0.00
C6	0.03	0.00	0.15	0.51	0.01	0.19	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.33	0.20	0.06	1.34	0.85	2.51	1.45
C8	0.01	0.01	0.17	0.20	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.27	0.05	0.06	1.02	0.24	1.63	0.90
N1	0.04	0.00	0.26	0.55	0.01	0.21	0.01	0.26	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.30	0.22	0.09	1.29	0.94	2.39	1.40
N3	0.04	0.01	0.35	0.46	0.00	0.17	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.20	0.08	0.09	1.00	0.70	1.70	0.98
N6	0.02	0.01	0.10	0.51	0.01	0.19	0.01	0.25	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.36	0.24	0.05	1.41	0.90	2.76	1.58
N7	0.01	0.00	0.09	0.33	0.00	0.13	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	0.10	0.03	1.23	0.47	2.18	1.23
N9	0.00	0.01	0.01	0.25	0.00	0.09	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.20	0.08	0.01	0.88	0.31	1.37	0.75
O2'	0.01	0.24	0.00	0.02	0.25	0.30	0.32	0.04	0.33	0.27	0.30	0.20	0.36	0.32	0.20	0.00	0.04	0.25	0.08	0.03	0.03	0.16
O3'	0.35	0.16	0.03	0.00	0.05	0.02	0.13	0.22	0.20	0.05	0.22	0.08	0.24	0.10	0.08	0.04	0.00	0.29	0.07	0.68	0.12	0.18
O4'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.05	0.00	0.04	0.02	0.06	0.06	0.09	0.09	0.05	0.03	0.01	0.25	0.29	0.00	0.42	0.08	0.52	0.32
O5'	0.44	1.14	0.03	0.05	1.07	0.01	1.26	0.00	1.34	1.02	1.29	1.00	1.41	1.23	0.88	0.08	0.07	0.42	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.09	0.87	0.10	0.29	0.59	0.07	0.67	0.03	0.85	0.24	0.94	0.70	0.90	0.47	0.31	0.03	0.68	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.67	2.05	0.14	0.10	1.80	0.02	2.24	0.02	2.51	1.63	2.39	1.70	2.76	2.18	1.37	0.03	0.12	0.52	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.31	1.20	0.16	0.02	1.03	0.01	1.28	0.00	1.45	0.90	1.40	0.98	1.58	1.23	0.75	0.16	0.18	0.32	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.60	0.22	0.36	0.22	0.32	0.63	0.14	0.48	0.14	0.28	0.11	0.41	0.28	0.17	0.41	0.26	0.20	1.08	0.65	0.69	0.46	0.59
C2	0.39	0.10	0.13	0.50	0.19	0.16	0.09	0.58	0.21	0.18	0.11	0.22	0.45	0.14	0.27	0.66	0.09	0.25	0.24	0.31	0.52	0.37
C2'	0.59	0.08	0.32	0.18	0.16	0.65	0.21	0.42	0.43	0.16	0.33	0.31	0.69	0.25	0.30	0.20	0.32	1.04	0.56	0.64	0.28	0.47
C3'	0.65	0.54	0.36	0.21	0.36	0.76	0.13	0.56	0.14	0.18	0.19	0.65	0.37	0.19	0.38	0.29	0.17	1.21	0.68	0.69	0.25	0.54
C4	0.47	0.06	0.25	0.48	0.15	0.07	0.15	0.31	0.31	0.19	0.23	0.20	0.47	0.19	0.29	0.36	0.06	0.52	0.08	0.03	0.20	0.05
C4'	0.97	0.74	0.13	0.20	0.67	1.22	0.38	1.10	0.26	0.47	0.40	0.91	0.16	0.31	0.70	0.21	0.45	1.65	1.19	1.24	0.84	1.11
C5	0.37	0.17	0.23	0.64	0.07	0.27	0.28	0.75	0.39	0.17	0.32	0.09	0.51	0.30	0.16	0.52	0.14	0.20	0.37	0.32	0.40	0.37
C5'	1.01	0.67	0.10	0.24	0.62	1.23	0.32	1.03	0.20	0.43	0.34	0.86	0.15	0.25	0.68	0.19	0.49	1.64	1.11	1.20	0.79	1.05
C6	0.26	0.15	0.10	0.71	0.07	0.55	0.28	1.13	0.38	0.14	0.29	0.08	0.51	0.34	0.07	0.83	0.22	0.14	0.71	0.70	0.78	0.75
C8	0.47	0.20	0.47	0.49	0.13	0.19	0.26	0.21	0.37	0.21	0.34	0.13	0.46	0.26	0.23	0.17	0.05	0.64	0.14	0.24	0.15	0.15
N1	0.29	0.07	0.11	0.61	0.06	0.44	0.17	0.98	0.29	0.09	0.19	0.11	0.48	0.23	0.15	0.85	0.17	0.08	0.60	0.65	0.80	0.70
N3	0.47	0.14	0.18	0.43	0.25	0.11	0.10	0.25	0.20	0.22	0.10	0.30	0.43	0.14	0.33	0.44	0.08	0.52	0.10	0.03	0.26	0.08
N6	0.14	0.22	0.07	0.83	0.18	0.90	0.34	1.62	0.39	0.23	0.32	0.15	0.49	0.41	0.08	1.03	0.35	0.50	1.16	1.13	1.16	1.17
N7	0.37	0.25	0.39	0.69	0.17	0.25	0.33	0.70	0.42	0.23	0.38	0.14	0.50	0.34	0.16	0.30	0.18	0.27	0.34	0.24	0.24	0.27
N9	0.54	0.10	0.36	0.38	0.18	0.33	0.15	0.09	0.28	0.22	0.24	0.24	0.41	0.18	0.32	0.17	0.10	0.79	0.30	0.34	0.21	0.26
O2'	0.53	0.09	0.35	0.20	0.19	0.59	0.13	0.42	0.30	0.27	0.33	0.18	0.48	0.16	0.34	0.22	0.28	0.97	0.58	0.65	0.38	0.52
O3'	1.07	1.23	0.11	0.17	0.94	1.18	0.66	1.03	0.63	0.61	0.90	1.24	0.38	0.49	0.87	0.19	0.40	1.67	1.18	1.08	0.63	0.98
O4'	0.95	0.67	0.16	0.17	0.70	1.12	0.48	1.03	0.34	0.58	0.39	0.87	0.20	0.44	0.75	0.24	0.41	1.59	1.17	1.19	0.93	1.11
O5'	0.08	0.08	1.03	0.80	0.28	0.22	0.60	0.02	0.59	0.66	0.30	0.10	0.81	0.80	0.33	1.02	0.54	0.62	0.05	0.16	0.38	0.04
OP1	0.83	0.45	0.12	0.12	0.30	0.98	0.13	0.61	0.24	0.09	0.09	0.63	0.54	0.30	0.36	0.15	0.40	1.31	0.66	0.83	0.28	0.61
OP2	0.95	0.49	1.94	1.88	1.11	0.94	1.47	1.31	1.32	1.75	0.84	0.57	1.55	1.85	1.30	1.84	1.64	0.50	1.29	1.23	1.87	1.45
P	0.12	0.08	1.12	0.97	0.37	0.05	0.70	0.38	0.67	0.81	0.35	0.07	0.90	0.95	0.45	1.07	0.74	0.39	0.33	0.24	0.75	0.42

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.33	0.00	0.21	0.46	0.66	0.40
C2	0.02	0.00	0.52	0.25	0.00	0.49	0.00	0.70	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.61	0.08	0.72	0.83	0.85	0.69	0.78
C2'	0.00	0.52	0.00	0.01	0.28	0.00	0.14	0.16	0.24	0.23	0.41	0.52	0.17	0.11	0.02	0.01	0.02	0.02	0.69	0.96	1.45	1.05
C3'	0.00	0.25	0.01	0.00	0.28	0.01	0.35	0.06	0.36	0.33	0.31	0.21	0.39	0.38	0.24	0.03	0.02	0.03	0.38	0.83	0.94	0.75
C4	0.01	0.00	0.28	0.28	0.00	0.16	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.05	0.37	0.48	0.51	0.52	0.47
C4'	0.00	0.49	0.00	0.01	0.16	0.00	0.03	0.01	0.13	0.42	0.34	0.47	0.06	0.31	0.10	0.31	0.03	0.00	0.02	0.32	0.22	0.16
C5	0.01	0.00	0.14	0.35	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.05	0.16	0.32	0.29	0.31	0.27
C5'	0.03	0.70	0.16	0.06	0.25	0.01	0.09	0.00	0.22	0.58	0.51	0.65	0.14	0.45	0.12	0.12	0.30	0.02	0.01	0.13	0.25	0.02
C6	0.01	0.00	0.24	0.36	0.00	0.13	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.07	0.32	0.48	0.42	0.34	0.39
C8	0.01	0.00	0.23	0.33	0.00	0.42	0.00	0.58	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.69	0.05	0.38	0.22	0.12	0.19	0.12
N1	0.02	0.00	0.41	0.31	0.00	0.34	0.00	0.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.36	0.05	0.56	0.71	0.68	0.52	0.63
N3	0.02	0.00	0.52	0.21	0.00	0.47	0.00	0.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.61	0.12	0.73	0.76	0.81	0.73	0.75
N6	0.01	0.00	0.17	0.39	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.12	0.22	0.39	0.28	0.21	0.26
N7	0.01	0.00	0.11	0.38	0.00	0.31	0.00	0.45	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.56	0.09	0.20	0.13	0.08	0.19	0.08
N9	0.00	0.01	0.02	0.24	0.00	0.10	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.21	0.09	0.01	0.19	0.31	0.45	0.28
O2'	0.02	0.61	0.01	0.03	0.15	0.31	0.15	0.12	0.06	0.69	0.36	0.61	0.13	0.56	0.21	0.00	0.04	0.22	0.40	0.76	1.56	0.90
O3'	0.33	0.08	0.02	0.02	0.05	0.03	0.05	0.30	0.07	0.05	0.05	0.12	0.12	0.09	0.09	0.04	0.00	0.21	0.05	0.42	0.61	0.36
O4'	0.00	0.72	0.02	0.03	0.37	0.00	0.16	0.02	0.32	0.38	0.56	0.73	0.22	0.20	0.01	0.22	0.21	0.00	0.14	0.14	0.15	0.05
O5'	0.21	0.83	0.69	0.38	0.48	0.02	0.32	0.01	0.48	0.22	0.71	0.76	0.39	0.13	0.19	0.40	0.05	0.14	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.46	0.85	0.96	0.83	0.51	0.32	0.29	0.13	0.42	0.12	0.68	0.81	0.28	0.08	0.31	0.76	0.42	0.14	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.66	0.69	1.45	0.94	0.52	0.22	0.31	0.25	0.34	0.19	0.52	0.73	0.21	0.19	0.45	1.56	0.61	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.40	0.78	1.05	0.75	0.47	0.16	0.27	0.02	0.39	0.12	0.63	0.75	0.26	0.08	0.28	0.90	0.36	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00