Doublet Group distance statistics: 51620

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C2	A	0, 0.000, 0.023, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C5	A	0, 0.000, 0.024, 0.047, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.024 std_dev=0.024
N1	A	0, 0.000, 0.031, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.031
O2'	B	0, 0.000, 0.036, 0.072, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.036 std_dev=0.036
C4	A	0, 0.000, 0.036, 0.072, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.036 std_dev=0.036
N9	A	0, 0.000, 0.036, 0.072, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.036 std_dev=0.036
N3	A	0, 0.000, 0.039, 0.078, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.039 std_dev=0.039
C1'	A	0, 0.000, 0.042, 0.084, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.042 std_dev=0.042
N7	A	0, 0.000, 0.053, 0.105, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.053 std_dev=0.053
C8	A	0, 0.000, 0.062, 0.124, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.062 std_dev=0.062
N6	A	0, 0.000, 0.063, 0.126, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.063 std_dev=0.063
C2'	A	0, 0.000, 0.069, 0.139, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.069 std_dev=0.069
C3'	A	0, 0.000, 0.104, 0.209, 0.209 max_d=0.209 avg_d=0.104 std_dev=0.104
C1'	B	0, 0.000, 0.106, 0.213, 0.213 max_d=0.213 avg_d=0.106 std_dev=0.106
N3	B	0, 0.000, 0.108, 0.215, 0.215 max_d=0.215 avg_d=0.108 std_dev=0.108
O2'	A	0, 0.000, 0.113, 0.226, 0.226 max_d=0.226 avg_d=0.113 std_dev=0.113
O4'	B	0, 0.000, 0.120, 0.241, 0.241 max_d=0.241 avg_d=0.120 std_dev=0.120
C5'	A	0, 0.000, 0.122, 0.245, 0.245 max_d=0.245 avg_d=0.122 std_dev=0.122
C4	B	0, 0.000, 0.123, 0.245, 0.245 max_d=0.245 avg_d=0.123 std_dev=0.123
P	B	0, 0.000, 0.127, 0.254, 0.254 max_d=0.254 avg_d=0.127 std_dev=0.127
C4'	A	0, 0.000, 0.128, 0.255, 0.255 max_d=0.255 avg_d=0.128 std_dev=0.128
N9	B	0, 0.000, 0.132, 0.264, 0.264 max_d=0.264 avg_d=0.132 std_dev=0.132
C2'	B	0, 0.000, 0.133, 0.266, 0.266 max_d=0.266 avg_d=0.133 std_dev=0.133
C2	B	0, 0.000, 0.140, 0.279, 0.279 max_d=0.279 avg_d=0.140 std_dev=0.140
C5	B	0, 0.000, 0.162, 0.323, 0.323 max_d=0.323 avg_d=0.162 std_dev=0.162
O3'	A	0, 0.000, 0.173, 0.347, 0.347 max_d=0.347 avg_d=0.173 std_dev=0.173
O4'	A	0, 0.000, 0.174, 0.349, 0.349 max_d=0.349 avg_d=0.174 std_dev=0.174
C8	B	0, 0.000, 0.177, 0.354, 0.354 max_d=0.354 avg_d=0.177 std_dev=0.177
N7	B	0, 0.000, 0.187, 0.374, 0.374 max_d=0.374 avg_d=0.187 std_dev=0.187
N1	B	0, 0.000, 0.188, 0.377, 0.377 max_d=0.377 avg_d=0.188 std_dev=0.188
O5'	A	0, 0.000, 0.194, 0.387, 0.387 max_d=0.387 avg_d=0.194 std_dev=0.194
C6	B	0, 0.000, 0.196, 0.392, 0.392 max_d=0.392 avg_d=0.196 std_dev=0.196
O3'	B	0, 0.000, 0.207, 0.414, 0.414 max_d=0.414 avg_d=0.207 std_dev=0.207
C4'	B	0, 0.000, 0.221, 0.442, 0.442 max_d=0.442 avg_d=0.221 std_dev=0.221
C3'	B	0, 0.000, 0.223, 0.447, 0.447 max_d=0.447 avg_d=0.223 std_dev=0.223
P	A	0, 0.000, 0.230, 0.460, 0.460 max_d=0.460 avg_d=0.230 std_dev=0.230
OP2	A	0, 0.000, 0.254, 0.508, 0.508 max_d=0.508 avg_d=0.254 std_dev=0.254
N6	B	0, 0.000, 0.255, 0.509, 0.509 max_d=0.509 avg_d=0.255 std_dev=0.255
O5'	B	0, 0.000, 0.264, 0.528, 0.528 max_d=0.528 avg_d=0.264 std_dev=0.264
OP1	A	0, 0.000, 0.268, 0.536, 0.536 max_d=0.536 avg_d=0.268 std_dev=0.268
C5'	B	0, 0.000, 0.365, 0.729, 0.729 max_d=0.729 avg_d=0.365 std_dev=0.365
OP1	B	0, 0.000, 0.701, 1.403, 1.403 max_d=1.403 avg_d=0.701 std_dev=0.701
OP2	B	0, 0.000, 0.726, 1.453, 1.453 max_d=1.453 avg_d=0.726 std_dev=0.726

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.05	0.03	0.01	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.11	0.12	0.09	0.10
C2	0.04	0.00	0.04	0.06	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.07	0.11	0.09	0.13	0.12	0.12	0.11
C2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.03	0.02	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.09	0.13	0.08	0.09
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.04	0.01	0.06	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.10	0.02	0.05
C4	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.06	0.14	0.15	0.14	0.14
C4'	0.00	0.07	0.02	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.06	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.03	0.01
C5	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.13	0.14	0.15	0.14
C5'	0.05	0.10	0.04	0.02	0.10	0.00	0.08	0.00	0.08	0.08	0.09	0.11	0.05	0.08	0.08	0.03	0.00	0.00	0.01	0.04	0.02	0.00
C6	0.03	0.00	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.07	0.04	0.12	0.13	0.14	0.12
C8	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.14	0.18	0.19	0.18
N1	0.04	0.00	0.04	0.06	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.07	0.10	0.07	0.12	0.12	0.12	0.11
N3	0.04	0.00	0.04	0.06	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.06	0.10	0.11	0.14	0.14	0.13	0.13
N6	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.09	0.10	0.11	0.10
N7	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.17	0.18	0.17
N9	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.14	0.16	0.15	0.15
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.03	0.01	0.03	0.03	0.05	0.02	0.07	0.06	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.13	0.08	0.09
O3'	0.02	0.11	0.00	0.01	0.06	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.10	0.10	0.05	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.03	0.07	0.01	0.03
O4'	0.00	0.09	0.03	0.00	0.06	0.00	0.02	0.00	0.04	0.03	0.07	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.05	0.03
O5'	0.11	0.13	0.09	0.05	0.14	0.00	0.13	0.01	0.12	0.14	0.12	0.14	0.09	0.13	0.14	0.08	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.12	0.12	0.13	0.10	0.15	0.04	0.14	0.04	0.13	0.18	0.12	0.14	0.10	0.17	0.16	0.13	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.12	0.08	0.02	0.14	0.03	0.15	0.02	0.14	0.19	0.12	0.13	0.11	0.18	0.15	0.08	0.01	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.11	0.09	0.05	0.14	0.01	0.14	0.00	0.12	0.18	0.11	0.13	0.10	0.17	0.15	0.09	0.03	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.02	0.07	0.10	0.02	0.09	0.02	0.14	0.04	0.03	0.04	0.03	0.05	0.02	0.04	0.01	0.06	0.06	0.05	0.15	0.22	0.01
C2	0.07	0.01	0.09	0.11	0.06	0.08	0.04	0.12	0.01	0.08	0.03	0.04	0.01	0.06	0.08	0.02	0.07	0.06	0.04	0.02	0.38	0.04
C2'	0.03	0.04	0.05	0.08	0.01	0.08	0.05	0.13	0.07	0.01	0.07	0.01	0.09	0.06	0.01	0.01	0.06	0.04	0.05	0.23	0.18	0.03
C3'	0.03	0.01	0.04	0.06	0.01	0.06	0.04	0.09	0.06	0.02	0.04	0.03	0.07	0.06	0.02	0.00	0.03	0.04	0.07	0.22	0.14	0.01
C4	0.09	0.02	0.12	0.15	0.05	0.13	0.01	0.18	0.03	0.09	0.05	0.04	0.03	0.04	0.09	0.03	0.11	0.09	0.03	0.05	0.31	0.00
C4'	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.05	0.05	0.03	0.03	0.04	0.06	0.06	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.19	0.16	0.02
C5	0.09	0.04	0.11	0.15	0.05	0.13	0.01	0.19	0.04	0.11	0.07	0.02	0.04	0.06	0.10	0.03	0.12	0.09	0.00	0.06	0.36	0.02
C5'	0.05	0.04	0.05	0.03	0.04	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.06	0.02	0.02	0.03	0.03	0.00	0.05	0.10	0.17	0.04	0.03
C6	0.07	0.06	0.09	0.13	0.05	0.10	0.03	0.16	0.03	0.11	0.08	0.01	0.02	0.08	0.09	0.02	0.10	0.07	0.05	0.03	0.43	0.05
C8	0.09	0.04	0.11	0.19	0.03	0.17	0.02	0.24	0.06	0.09	0.07	0.01	0.08	0.01	0.08	0.03	0.16	0.11	0.08	0.13	0.23	0.02
N1	0.07	0.03	0.08	0.11	0.06	0.08	0.04	0.13	0.00	0.09	0.05	0.02	0.01	0.07	0.08	0.02	0.08	0.06	0.06	0.02	0.43	0.06
N3	0.09	0.01	0.11	0.13	0.06	0.10	0.02	0.15	0.01	0.08	0.03	0.05	0.01	0.04	0.08	0.03	0.09	0.08	0.01	0.00	0.32	0.01
N6	0.03	0.10	0.05	0.10	0.01	0.08	0.02	0.14	0.05	0.09	0.12	0.04	0.02	0.08	0.05	0.02	0.07	0.03	0.09	0.05	0.49	0.10
N7	0.09	0.05	0.11	0.18	0.03	0.17	0.01	0.24	0.06	0.12	0.08	0.01	0.08	0.04	0.10	0.03	0.15	0.11	0.05	0.10	0.30	0.00
N9	0.08	0.03	0.11	0.16	0.03	0.14	0.01	0.19	0.04	0.07	0.05	0.03	0.05	0.01	0.07	0.03	0.12	0.09	0.06	0.10	0.25	0.01
O2'	0.04	0.02	0.06	0.10	0.02	0.09	0.03	0.15	0.06	0.02	0.06	0.03	0.08	0.03	0.04	0.00	0.06	0.06	0.05	0.25	0.20	0.03
O3'	0.05	0.03	0.06	0.06	0.04	0.06	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.07	0.03	0.02	0.05	0.01	0.01	0.05	0.06	0.19	0.15	0.01
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.02	0.06	0.05	0.04	0.02	0.07	0.08	0.02	0.04	0.05	0.01	0.02	0.20	0.27	0.08
O5'	0.04	0.03	0.04	0.04	0.03	0.05	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02	0.03	0.02	0.00	0.04	0.08	0.26	0.06	0.01
OP1	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.11	0.30	0.13	0.02
OP2	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.03	0.10	0.38	0.06	0.01
P	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.11	0.29	0.06	0.02

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.09	0.04	0.34	0.07
C2	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.16	0.12	0.54	0.11
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.13	0.25	0.06
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.20	0.11	0.03
C4	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.16	0.02	0.54	0.14
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.04	0.02	0.03	0.04	0.00	0.03	0.07	0.04	0.03
C5	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.06	0.58	0.15
C5'	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.01	0.07	0.00	0.07	0.08	0.06	0.02	0.07	0.09	0.05	0.04	0.06	0.00	0.01	0.22	0.11	0.02
C6	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.00	0.60	0.14
C8	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.13	0.19	0.49	0.15
N1	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.16	0.09	0.57	0.12
N3	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01	0.16	0.08	0.51	0.12
N6	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.17	0.05	0.62	0.17
N7	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.13	0.16	0.55	0.15
N9	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.14	0.08	0.47	0.12
O2'	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.01	0.15	0.03
O3'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.12	0.16	0.06	0.06
O4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.08	0.03	0.23	0.02
O5'	0.09	0.16	0.04	0.01	0.16	0.03	0.16	0.01	0.16	0.13	0.16	0.16	0.17	0.13	0.14	0.04	0.12	0.08	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.04	0.12	0.13	0.20	0.02	0.07	0.06	0.22	0.00	0.19	0.09	0.08	0.05	0.16	0.08	0.01	0.16	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.34	0.54	0.25	0.11	0.54	0.04	0.58	0.11	0.60	0.49	0.57	0.51	0.62	0.55	0.47	0.15	0.06	0.23	0.02	0.00	0.00	0.01
P	0.07	0.11	0.06	0.03	0.14	0.03	0.15	0.02	0.14	0.15	0.12	0.12	0.17	0.15	0.12	0.03	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00