Doublet Group distance statistics: 51621

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.006, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N7	A	0, 0.000, 0.011, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N3	A	0, 0.000, 0.024, 0.049, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C2	A	0, 0.000, 0.026, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.026 std_dev=0.026
C1'	A	0, 0.000, 0.034, 0.067, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.034 std_dev=0.034
C2	B	0, 0.000, 0.343, 0.685, 0.685 max_d=0.685 avg_d=0.343 std_dev=0.343
N1	B	0, 0.000, 0.362, 0.724, 0.724 max_d=0.724 avg_d=0.362 std_dev=0.362
N3	B	0, 0.000, 0.439, 0.878, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.439 std_dev=0.439
C6	B	0, 0.000, 0.489, 0.979, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.489 std_dev=0.489
N6	B	0, 0.000, 0.554, 1.107, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.554 std_dev=0.554
C4	B	0, 0.000, 0.556, 1.111, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.556 std_dev=0.556
C5	B	0, 0.000, 0.591, 1.182, 1.182 max_d=1.182 avg_d=0.591 std_dev=0.591
N9	B	0, 0.000, 0.715, 1.429, 1.429 max_d=1.429 avg_d=0.715 std_dev=0.715
N7	B	0, 0.000, 0.761, 1.522, 1.522 max_d=1.522 avg_d=0.761 std_dev=0.761
C1'	B	0, 0.000, 0.796, 1.591, 1.591 max_d=1.591 avg_d=0.796 std_dev=0.796
C8	B	0, 0.000, 0.822, 1.643, 1.643 max_d=1.643 avg_d=0.822 std_dev=0.822
C2'	A	0, 0.000, 1.084, 2.167, 2.167 max_d=2.167 avg_d=1.084 std_dev=1.084
O4'	A	0, 0.000, 1.085, 2.170, 2.170 max_d=2.170 avg_d=1.085 std_dev=1.085
OP2	A	0, 0.000, 1.195, 2.389, 2.389 max_d=2.389 avg_d=1.195 std_dev=1.195
C2'	B	0, 0.000, 1.219, 2.438, 2.438 max_d=2.438 avg_d=1.219 std_dev=1.219
O3'	A	0, 0.000, 1.329, 2.658, 2.658 max_d=2.658 avg_d=1.329 std_dev=1.329
C3'	B	0, 0.000, 1.334, 2.669, 2.669 max_d=2.669 avg_d=1.334 std_dev=1.334
C3'	A	0, 0.000, 1.371, 2.742, 2.742 max_d=2.742 avg_d=1.371 std_dev=1.371
O4'	B	0, 0.000, 1.455, 2.910, 2.910 max_d=2.910 avg_d=1.455 std_dev=1.455
C4'	B	0, 0.000, 1.521, 3.041, 3.041 max_d=3.041 avg_d=1.521 std_dev=1.521
C4'	A	0, 0.000, 1.538, 3.076, 3.076 max_d=3.076 avg_d=1.538 std_dev=1.538
O2'	A	0, 0.000, 1.610, 3.220, 3.220 max_d=3.220 avg_d=1.610 std_dev=1.610
O3'	B	0, 0.000, 1.686, 3.371, 3.371 max_d=3.371 avg_d=1.686 std_dev=1.686
P	A	0, 0.000, 1.775, 3.550, 3.550 max_d=3.550 avg_d=1.775 std_dev=1.775
OP1	A	0, 0.000, 1.937, 3.874, 3.874 max_d=3.874 avg_d=1.937 std_dev=1.937
O2'	B	0, 0.000, 2.104, 4.207, 4.207 max_d=4.207 avg_d=2.104 std_dev=2.104
O5'	A	0, 0.000, 2.317, 4.633, 4.633 max_d=4.633 avg_d=2.317 std_dev=2.317
C5'	A	0, 0.000, 2.498, 4.996, 4.996 max_d=4.996 avg_d=2.498 std_dev=2.498
C5'	B	0, 0.000, 2.973, 5.946, 5.946 max_d=5.946 avg_d=2.973 std_dev=2.973
O5'	B	0, 0.000, 3.678, 7.357, 7.357 max_d=7.357 avg_d=3.678 std_dev=3.678
P	B	0, 0.000, 5.174, 10.347, 10.347 max_d=10.347 avg_d=5.174 std_dev=5.174
OP1	B	0, 0.000, 5.578, 11.157, 11.157 max_d=11.157 avg_d=5.578 std_dev=5.578
OP2	B	0, 0.000, 5.671, 11.342, 11.342 max_d=11.342 avg_d=5.671 std_dev=5.671

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.03	0.00	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.29	0.01	0.39	0.42	0.12	0.11
C2	0.04	0.00	0.41	0.27	0.01	0.21	0.01	0.30	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.32	0.03	0.43	0.72	0.55	0.11	0.39
C2'	0.00	0.41	0.00	0.01	0.21	0.01	0.09	0.16	0.19	0.22	0.32	0.40	0.13	0.11	0.00	0.01	0.03	0.01	0.59	0.96	0.47	0.58
C3'	0.01	0.27	0.01	0.00	0.25	0.00	0.30	0.01	0.33	0.20	0.32	0.22	0.36	0.27	0.18	0.02	0.00	0.02	0.26	0.80	0.10	0.34
C4	0.02	0.01	0.21	0.25	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.05	0.23	0.62	0.46	0.05	0.29
C4'	0.01	0.21	0.01	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.02	0.22	0.13	0.22	0.04	0.18	0.06	0.23	0.01	0.00	0.02	0.30	0.36	0.08
C5	0.02	0.01	0.09	0.30	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.18	0.04	0.12	0.60	0.38	0.07	0.29
C5'	0.06	0.30	0.16	0.01	0.12	0.00	0.00	0.00	0.06	0.23	0.20	0.30	0.01	0.19	0.01	0.06	0.20	0.02	0.00	0.27	0.35	0.00
C6	0.03	0.01	0.19	0.33	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.07	0.20	0.66	0.41	0.11	0.34
C8	0.00	0.01	0.22	0.20	0.00	0.22	0.00	0.23	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.51	0.01	0.20	0.42	0.27	0.03	0.15
N1	0.03	0.00	0.32	0.32	0.01	0.13	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.03	0.34	0.71	0.49	0.13	0.38
N3	0.04	0.00	0.40	0.22	0.00	0.22	0.01	0.30	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.34	0.09	0.42	0.68	0.55	0.07	0.35
N6	0.02	0.01	0.13	0.36	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.17	0.12	0.14	0.63	0.34	0.12	0.33
N7	0.01	0.01	0.11	0.27	0.00	0.18	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.45	0.05	0.09	0.49	0.26	0.03	0.21
N9	0.01	0.02	0.00	0.18	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.19	0.10	0.02	0.50	0.40	0.03	0.20
O2'	0.01	0.32	0.01	0.02	0.03	0.23	0.18	0.06	0.07	0.51	0.15	0.34	0.17	0.45	0.19	0.00	0.06	0.16	0.26	0.76	0.39	0.34
O3'	0.29	0.03	0.03	0.00	0.05	0.01	0.04	0.20	0.07	0.01	0.03	0.09	0.12	0.05	0.10	0.06	0.00	0.18	0.08	0.52	0.06	0.07
O4'	0.01	0.43	0.01	0.02	0.23	0.00	0.12	0.02	0.20	0.20	0.34	0.42	0.14	0.09	0.02	0.16	0.18	0.00	0.16	0.09	0.53	0.21
O5'	0.39	0.72	0.59	0.26	0.62	0.02	0.60	0.00	0.66	0.42	0.71	0.68	0.63	0.49	0.50	0.26	0.08	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.42	0.55	0.96	0.80	0.46	0.30	0.38	0.27	0.41	0.27	0.49	0.55	0.34	0.26	0.40	0.76	0.52	0.09	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.12	0.11	0.47	0.10	0.05	0.36	0.07	0.35	0.11	0.03	0.13	0.07	0.12	0.03	0.03	0.39	0.06	0.53	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.39	0.58	0.34	0.29	0.08	0.29	0.00	0.34	0.15	0.38	0.35	0.33	0.21	0.20	0.34	0.07	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.50	0.05	0.10	0.36	0.28	0.31	0.21	0.25	0.01	0.47	0.05	0.20	0.10	0.34	0.43	0.10	0.50	0.76	0.17	0.45	0.22	0.16
C2	0.21	0.13	0.51	0.19	0.02	0.78	0.12	1.17	0.20	0.01	0.20	0.02	0.23	0.09	0.07	0.68	0.40	1.03	0.82	1.14	0.97	1.11
C2'	0.67	0.03	0.09	0.14	0.25	0.56	0.04	0.44	0.25	0.43	0.25	0.20	0.50	0.16	0.48	0.31	0.22	0.98	0.02	0.25	0.09	0.02
C3'	0.26	0.02	0.30	0.64	0.07	0.02	0.08	0.13	0.19	0.04	0.12	0.11	0.35	0.11	0.14	0.07	0.76	0.49	0.60	0.98	0.74	0.64
C4	0.37	0.02	0.23	0.17	0.18	0.64	0.08	0.88	0.08	0.26	0.12	0.13	0.16	0.14	0.30	0.25	0.34	0.96	0.54	0.57	0.63	0.74
C4'	0.22	0.25	0.73	1.17	0.28	0.61	0.34	0.82	0.33	0.33	0.28	0.24	0.35	0.39	0.28	0.44	1.27	0.12	1.26	1.71	1.44	1.34
C5	0.29	0.01	0.19	0.01	0.16	0.78	0.09	1.21	0.04	0.21	0.10	0.12	0.10	0.13	0.24	0.32	0.18	0.95	0.96	1.07	1.14	1.25
C5'	0.64	0.48	1.01	1.46	0.64	1.00	0.70	1.21	0.61	0.80	0.49	0.53	0.61	0.85	0.69	0.73	1.52	0.59	1.58	2.06	1.82	1.67
C6	0.16	0.09	0.29	0.11	0.04	0.92	0.02	1.54	0.10	0.08	0.15	0.02	0.13	0.02	0.11	0.56	0.11	0.97	1.34	1.63	1.61	1.74
C8	0.41	0.09	0.02	0.06	0.30	0.59	0.28	0.81	0.11	0.41	0.01	0.22	0.02	0.35	0.39	0.00	0.22	0.85	0.54	0.41	0.62	0.70
N1	0.11	0.14	0.45	0.02	0.05	0.94	0.11	1.56	0.17	0.01	0.19	0.05	0.19	0.08	0.03	0.76	0.20	1.00	1.31	1.72	1.55	1.71
N3	0.35	0.07	0.38	0.30	0.08	0.60	0.04	0.80	0.16	0.15	0.17	0.07	0.22	0.01	0.22	0.40	0.48	0.99	0.40	0.52	0.48	0.59
N6	0.08	0.10	0.25	0.25	0.01	0.98	0.02	1.74	0.07	0.05	0.12	0.02	0.08	0.01	0.05	0.62	0.03	0.90	1.67	2.05	2.08	2.18
N7	0.32	0.07	0.06	0.05	0.24	0.73	0.21	1.11	0.08	0.31	0.01	0.18	0.01	0.26	0.30	0.15	0.13	0.88	0.90	0.90	1.08	1.16
N9	0.45	0.05	0.10	0.20	0.28	0.51	0.21	0.63	0.01	0.41	0.05	0.20	0.10	0.30	0.40	0.03	0.36	0.87	0.28	0.15	0.31	0.40
O2'	1.01	0.04	0.39	0.16	0.43	0.86	0.24	0.69	0.16	0.83	0.27	0.29	0.41	0.50	0.79	0.65	0.10	1.30	0.24	0.04	0.12	0.21
O3'	0.05	0.17	0.61	0.97	0.13	0.25	0.24	0.42	0.31	0.13	0.27	0.10	0.41	0.25	0.06	0.37	1.14	0.29	0.96	1.33	1.08	1.01
O4'	0.16	0.22	0.67	1.05	0.20	0.47	0.19	0.58	0.19	0.14	0.21	0.21	0.14	0.15	0.17	0.41	1.15	0.01	0.98	1.33	1.07	1.00
O5'	0.82	1.00	1.13	1.53	0.98	1.12	1.05	1.30	1.10	0.89	1.05	0.97	1.14	1.01	0.90	0.80	1.53	0.78	1.60	2.04	1.85	1.68
OP1	0.48	0.51	0.71	1.20	0.52	0.90	0.54	1.16	0.55	0.51	0.53	0.51	0.56	0.54	0.51	0.35	1.25	0.55	1.47	2.17	1.81	1.66
OP2	0.02	0.25	0.16	0.49	0.10	0.16	0.13	0.25	0.26	0.05	0.32	0.16	0.36	0.01	0.01	0.11	0.52	0.08	0.47	0.96	0.68	0.53
P	0.37	0.56	0.57	1.00	0.49	0.69	0.53	0.90	0.61	0.39	0.61	0.50	0.68	0.46	0.41	0.24	1.01	0.39	1.16	1.73	1.47	1.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00	0.00	0.06	0.19	0.01
C2	0.02	0.00	0.08	0.33	0.01	0.62	0.01	1.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.22	0.44	1.16	1.09	1.29	1.37
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.04	0.03	0.00	0.06	0.03	0.07	0.06	0.09	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.03	0.04	0.05
C3'	0.03	0.33	0.01	0.00	0.03	0.00	0.18	0.01	0.06	0.52	0.16	0.35	0.16	0.45	0.20	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01
C4	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.24	0.00	0.42	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.23	0.39	0.25	0.30	0.44
C4'	0.01	0.62	0.03	0.00	0.24	0.00	0.02	0.00	0.17	0.45	0.43	0.61	0.06	0.32	0.08	0.19	0.00	0.00	0.01	0.19	0.22	0.01
C5	0.01	0.01	0.00	0.18	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.18	0.09	0.04	0.22	0.07	0.06
C5'	0.01	1.11	0.06	0.01	0.42	0.00	0.10	0.00	0.36	0.65	0.81	1.04	0.17	0.47	0.07	0.12	0.11	0.00	0.01	0.09	0.29	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.17	0.00	0.36	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.11	0.18	0.33	0.07	0.31	0.41
C8	0.00	0.01	0.07	0.52	0.00	0.45	0.00	0.65	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.39	0.25	0.72	0.95	0.95	0.78
N1	0.02	0.00	0.06	0.16	0.01	0.43	0.01	0.81	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.33	0.84	0.68	0.94	1.01
N3	0.02	0.00	0.09	0.35	0.00	0.61	0.00	1.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.24	0.45	1.05	0.98	1.06	1.18
N6	0.01	0.00	0.01	0.16	0.00	0.06	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.14	0.21	0.11	0.12	0.24	0.07	0.16
N7	0.00	0.01	0.05	0.45	0.00	0.32	0.00	0.47	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.39	0.14	0.57	0.92	0.79	0.64
N9	0.00	0.01	0.02	0.20	0.00	0.08	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.12	0.00	0.11	0.21	0.28	0.11
O2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.03	0.19	0.13	0.12	0.08	0.25	0.02	0.13	0.14	0.24	0.11	0.00	0.03	0.14	0.12	0.04	0.13	0.13
O3'	0.08	0.22	0.02	0.01	0.00	0.00	0.18	0.11	0.11	0.39	0.07	0.24	0.21	0.39	0.12	0.03	0.00	0.06	0.21	0.09	0.05	0.20
O4'	0.00	0.44	0.01	0.02	0.23	0.00	0.09	0.00	0.18	0.25	0.33	0.45	0.11	0.14	0.00	0.14	0.06	0.00	0.00	0.16	0.33	0.01
O5'	0.00	1.16	0.05	0.01	0.39	0.01	0.04	0.01	0.33	0.72	0.84	1.05	0.12	0.57	0.11	0.12	0.21	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.06	1.09	0.03	0.01	0.25	0.19	0.22	0.09	0.07	0.95	0.68	0.98	0.24	0.92	0.21	0.04	0.09	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	1.29	0.04	0.04	0.30	0.22	0.07	0.29	0.31	0.95	0.94	1.06	0.07	0.79	0.28	0.13	0.05	0.33	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.01	1.37	0.05	0.01	0.44	0.01	0.06	0.01	0.41	0.78	1.01	1.18	0.16	0.64	0.11	0.13	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00