Doublet Group distance statistics: 51628

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 6, 16, 18, 18, 9, 10, 10, 4, 8, 6, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.012, 0.019, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.020 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.019 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.010, 0.025, 0.041, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.025 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.006, 0.026, 0.045, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.026 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.008, 0.027, 0.047, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.027 std_dev=0.020
N6	A	0, 0.008, 0.035, 0.061, 0.156 max_d=0.156 avg_d=0.035 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.007, 0.037, 0.067, 0.205 max_d=0.205 avg_d=0.037 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.008, 0.043, 0.078, 0.225 max_d=0.225 avg_d=0.043 std_dev=0.035
O4'	A	0, -0.053, 0.165, 0.383, 1.271 max_d=1.271 avg_d=0.165 std_dev=0.218
C2'	A	0, -0.032, 0.199, 0.431, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.199 std_dev=0.231
C2'	B	0, 0.228, 0.493, 0.757, 1.311 max_d=1.311 avg_d=0.493 std_dev=0.264
N9	B	0, 0.222, 0.489, 0.755, 1.210 max_d=1.210 avg_d=0.489 std_dev=0.267
C4	B	0, 0.210, 0.482, 0.754, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.482 std_dev=0.272
C5	B	0, 0.220, 0.504, 0.787, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.504 std_dev=0.284
C1'	B	0, 0.246, 0.530, 0.814, 1.380 max_d=1.380 avg_d=0.530 std_dev=0.284
C8	B	0, 0.243, 0.535, 0.827, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.535 std_dev=0.292
N7	B	0, 0.271, 0.568, 0.866, 1.263 max_d=1.263 avg_d=0.568 std_dev=0.298
C3'	B	0, 0.222, 0.523, 0.824, 1.594 max_d=1.594 avg_d=0.523 std_dev=0.301
N3	B	0, 0.235, 0.542, 0.848, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.542 std_dev=0.307
C3'	A	0, -0.005, 0.309, 0.623, 1.810 max_d=1.810 avg_d=0.309 std_dev=0.314
C6	B	0, 0.213, 0.533, 0.852, 1.366 max_d=1.366 avg_d=0.533 std_dev=0.319
C4'	A	0, -0.051, 0.280, 0.610, 1.920 max_d=1.920 avg_d=0.280 std_dev=0.330
O4'	B	0, 0.251, 0.589, 0.927, 1.555 max_d=1.555 avg_d=0.589 std_dev=0.338
N1	B	0, 0.202, 0.545, 0.889, 1.430 max_d=1.430 avg_d=0.545 std_dev=0.344
C2	B	0, 0.225, 0.570, 0.916, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.570 std_dev=0.345
O2'	B	0, 0.256, 0.604, 0.952, 1.722 max_d=1.722 avg_d=0.604 std_dev=0.348
O6	B	0, 0.247, 0.608, 0.969, 1.489 max_d=1.489 avg_d=0.608 std_dev=0.361
C4'	B	0, 0.257, 0.632, 1.007, 1.979 max_d=1.979 avg_d=0.632 std_dev=0.375
O3'	B	0, 0.174, 0.556, 0.938, 1.958 max_d=1.958 avg_d=0.556 std_dev=0.382
O5'	A	0, 0.059, 0.445, 0.832, 2.034 max_d=2.034 avg_d=0.445 std_dev=0.386
N2	B	0, 0.266, 0.688, 1.109, 1.808 max_d=1.808 avg_d=0.688 std_dev=0.421
O3'	A	0, 0.047, 0.478, 0.909, 2.387 max_d=2.387 avg_d=0.478 std_dev=0.431
O2'	A	0, -0.107, 0.332, 0.770, 2.558 max_d=2.558 avg_d=0.332 std_dev=0.438
C5'	A	0, 0.000, 0.444, 0.887, 2.490 max_d=2.490 avg_d=0.444 std_dev=0.444
P	A	0, 0.064, 0.513, 0.962, 2.161 max_d=2.161 avg_d=0.513 std_dev=0.449
C5'	B	0, 0.260, 0.776, 1.292, 2.778 max_d=2.778 avg_d=0.776 std_dev=0.516
OP2	A	0, 0.048, 0.572, 1.095, 2.873 max_d=2.873 avg_d=0.572 std_dev=0.523
O5'	B	0, 0.251, 0.832, 1.413, 2.854 max_d=2.854 avg_d=0.832 std_dev=0.581
OP1	A	0, 0.050, 0.650, 1.251, 2.863 max_d=2.863 avg_d=0.650 std_dev=0.600
P	B	0, 0.288, 1.055, 1.822, 3.756 max_d=3.756 avg_d=1.055 std_dev=0.767
OP2	B	0, 0.224, 1.225, 2.227, 6.355 max_d=6.355 avg_d=1.225 std_dev=1.002
OP1	B	0, 0.290, 1.301, 2.313, 4.494 max_d=4.494 avg_d=1.301 std_dev=1.011

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.13	0.01	0.11	0.14	0.20	0.12
C2	0.03	0.00	0.17	0.15	0.02	0.05	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.18	0.09	0.15	0.21	0.34	0.20
C2'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.09	0.01	0.06	0.11	0.09	0.09	0.14	0.18	0.07	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.25	0.33	0.36	0.29
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.14	0.00	0.17	0.03	0.18	0.18	0.17	0.13	0.20	0.20	0.12	0.02	0.01	0.02	0.10	0.21	0.15	0.13
C4	0.02	0.02	0.09	0.14	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.10	0.05	0.16	0.21	0.31	0.19
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.07	0.13	0.05	0.05	0.10	0.12	0.05	0.14	0.02	0.01	0.02	0.11	0.07	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.17	0.00	0.08	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.16	0.11	0.03	0.21	0.29	0.39	0.26
C5'	0.05	0.08	0.11	0.03	0.08	0.01	0.13	0.00	0.13	0.16	0.10	0.07	0.16	0.17	0.08	0.06	0.10	0.01	0.01	0.12	0.08	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.18	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.17	0.13	0.04	0.22	0.32	0.43	0.29
C8	0.01	0.02	0.09	0.18	0.01	0.13	0.01	0.16	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.19	0.14	0.07	0.21	0.26	0.32	0.23
N1	0.03	0.01	0.14	0.17	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.15	0.15	0.07	0.19	0.28	0.40	0.25
N3	0.03	0.00	0.18	0.13	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.16	0.17	0.09	0.13	0.18	0.29	0.17
N6	0.02	0.01	0.07	0.20	0.01	0.10	0.02	0.16	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.20	0.16	0.04	0.26	0.39	0.49	0.34
N7	0.02	0.01	0.06	0.20	0.01	0.12	0.01	0.17	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.21	0.16	0.06	0.25	0.34	0.42	0.30
N9	0.01	0.02	0.02	0.12	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.10	0.06	0.02	0.14	0.17	0.26	0.16
O2'	0.03	0.16	0.01	0.02	0.11	0.14	0.16	0.06	0.17	0.19	0.15	0.16	0.20	0.21	0.10	0.00	0.05	0.11	0.22	0.34	0.43	0.29
O3'	0.13	0.18	0.02	0.01	0.10	0.02	0.11	0.10	0.13	0.14	0.15	0.17	0.16	0.16	0.06	0.05	0.00	0.08	0.14	0.26	0.22	0.18
O4'	0.01	0.09	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.04	0.07	0.07	0.09	0.04	0.06	0.02	0.11	0.08	0.00	0.07	0.08	0.15	0.11
O5'	0.11	0.15	0.25	0.10	0.16	0.02	0.21	0.01	0.22	0.21	0.19	0.13	0.26	0.25	0.14	0.22	0.14	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.14	0.21	0.33	0.21	0.21	0.11	0.29	0.12	0.32	0.26	0.28	0.18	0.39	0.34	0.17	0.34	0.26	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.20	0.34	0.36	0.15	0.31	0.07	0.39	0.08	0.43	0.32	0.40	0.29	0.49	0.42	0.26	0.43	0.22	0.15	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.12	0.20	0.29	0.13	0.19	0.03	0.26	0.02	0.29	0.23	0.25	0.17	0.34	0.30	0.16	0.29	0.18	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.33	0.21	0.19	0.24	0.19	0.27	0.22	0.31	0.24	0.33	0.41	0.28	0.27	0.22	0.31	0.19	0.20	0.35	0.34	0.47	0.49	0.38
C2	0.22	0.22	0.22	0.22	0.20	0.22	0.23	0.33	0.25	0.23	0.21	0.32	0.22	0.26	0.20	0.30	0.21	0.20	0.52	0.33	0.82	0.68	0.60
C2'	0.19	0.32	0.19	0.22	0.20	0.20	0.25	0.25	0.29	0.27	0.32	0.44	0.24	0.29	0.20	0.28	0.24	0.19	0.40	0.33	0.53	0.56	0.45
C3'	0.15	0.28	0.14	0.11	0.17	0.11	0.21	0.16	0.25	0.21	0.28	0.37	0.21	0.23	0.15	0.25	0.12	0.11	0.35	0.29	0.48	0.54	0.41
C4	0.21	0.21	0.22	0.22	0.17	0.21	0.21	0.31	0.24	0.22	0.21	0.30	0.20	0.25	0.19	0.30	0.21	0.19	0.49	0.31	0.71	0.63	0.55
C4'	0.17	0.30	0.16	0.13	0.21	0.13	0.24	0.14	0.28	0.22	0.30	0.37	0.25	0.24	0.18	0.26	0.14	0.15	0.27	0.30	0.38	0.44	0.31
C5	0.24	0.22	0.26	0.27	0.19	0.27	0.19	0.39	0.18	0.24	0.14	0.31	0.23	0.26	0.22	0.31	0.26	0.24	0.56	0.27	0.83	0.71	0.64
C5'	0.21	0.31	0.20	0.12	0.23	0.13	0.25	0.12	0.27	0.24	0.30	0.37	0.28	0.25	0.21	0.28	0.11	0.16	0.25	0.28	0.39	0.42	0.28
C6	0.26	0.27	0.27	0.29	0.23	0.30	0.22	0.43	0.18	0.27	0.18	0.35	0.27	0.28	0.25	0.31	0.27	0.26	0.61	0.25	0.95	0.78	0.71
C8	0.22	0.21	0.25	0.26	0.16	0.25	0.21	0.34	0.23	0.24	0.20	0.28	0.20	0.27	0.20	0.31	0.25	0.22	0.48	0.29	0.64	0.60	0.52
N1	0.24	0.26	0.24	0.26	0.22	0.26	0.23	0.39	0.22	0.25	0.19	0.35	0.26	0.28	0.23	0.30	0.24	0.24	0.58	0.29	0.93	0.75	0.68
N3	0.20	0.22	0.21	0.20	0.18	0.19	0.23	0.28	0.27	0.22	0.24	0.31	0.21	0.25	0.19	0.30	0.19	0.19	0.47	0.34	0.71	0.62	0.53
N6	0.29	0.31	0.30	0.33	0.27	0.35	0.26	0.51	0.21	0.31	0.26	0.37	0.30	0.31	0.29	0.32	0.32	0.31	0.67	0.22	1.07	0.86	0.80
N7	0.26	0.21	0.28	0.30	0.18	0.31	0.18	0.42	0.18	0.25	0.16	0.28	0.23	0.26	0.23	0.31	0.29	0.26	0.58	0.27	0.80	0.70	0.64
N9	0.20	0.24	0.22	0.21	0.18	0.20	0.23	0.28	0.27	0.23	0.26	0.32	0.21	0.26	0.19	0.30	0.20	0.19	0.43	0.31	0.60	0.56	0.47
O2'	0.22	0.40	0.19	0.21	0.25	0.19	0.30	0.23	0.35	0.29	0.38	0.55	0.33	0.33	0.23	0.31	0.22	0.21	0.37	0.39	0.50	0.54	0.42
O3'	0.16	0.28	0.15	0.13	0.16	0.13	0.21	0.17	0.25	0.21	0.28	0.39	0.22	0.23	0.15	0.26	0.14	0.13	0.36	0.29	0.52	0.57	0.43
O4'	0.22	0.31	0.22	0.22	0.24	0.21	0.27	0.22	0.31	0.25	0.32	0.37	0.25	0.27	0.22	0.31	0.22	0.21	0.31	0.33	0.40	0.45	0.34
O5'	0.18	0.28	0.20	0.08	0.21	0.08	0.23	0.11	0.25	0.24	0.27	0.33	0.25	0.25	0.20	0.26	0.03	0.13	0.31	0.26	0.43	0.49	0.35
OP1	0.11	0.24	0.12	0.09	0.18	0.10	0.22	0.18	0.24	0.25	0.24	0.30	0.21	0.27	0.17	0.15	0.02	0.11	0.31	0.27	0.60	0.56	0.39
OP2	0.15	0.32	0.14	0.10	0.27	0.15	0.32	0.27	0.35	0.30	0.34	0.34	0.28	0.35	0.23	0.13	0.02	0.13	0.42	0.38	0.57	0.68	0.51
P	0.06	0.22	0.10	0.02	0.13	0.06	0.16	0.14	0.19	0.18	0.20	0.27	0.18	0.20	0.10	0.13	0.01	0.03	0.29	0.21	0.48	0.50	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.17	0.02	0.25	0.29	0.18
C2	0.04	0.00	0.12	0.16	0.01	0.08	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.19	0.04	0.32	0.01	0.57	0.47	0.34
C2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.06	0.02	0.05	0.03	0.06	0.07	0.09	0.15	0.12	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.17	0.06	0.21	0.22	0.14
C3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.09	0.01	0.09	0.03	0.11	0.12	0.14	0.19	0.15	0.11	0.06	0.02	0.01	0.02	0.20	0.11	0.26	0.23	0.17
C4	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.10	0.02	0.34	0.01	0.55	0.45	0.34
C4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.10	0.08	0.10	0.08	0.10	0.05	0.06	0.03	0.01	0.03	0.09	0.14	0.25	0.06
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.08	0.00	0.20	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.10	0.03	0.42	0.02	0.71	0.57	0.44
C5'	0.04	0.16	0.03	0.03	0.15	0.01	0.20	0.00	0.21	0.21	0.19	0.15	0.13	0.23	0.13	0.06	0.04	0.02	0.01	0.24	0.24	0.29	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.08	0.01	0.21	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.13	0.03	0.43	0.00	0.77	0.62	0.47
C8	0.01	0.02	0.07	0.12	0.01	0.10	0.02	0.21	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.13	0.04	0.44	0.02	0.63	0.53	0.42
N1	0.03	0.01	0.09	0.14	0.02	0.08	0.01	0.19	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.16	0.03	0.39	0.01	0.69	0.56	0.42
N2	0.05	0.01	0.15	0.19	0.01	0.10	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.18	0.24	0.05	0.30	0.02	0.54	0.45	0.33
N3	0.04	0.01	0.12	0.15	0.01	0.08	0.01	0.13	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.17	0.04	0.28	0.02	0.48	0.40	0.29
N7	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.10	0.00	0.23	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.13	0.04	0.48	0.03	0.78	0.64	0.50
N9	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.32	0.02	0.47	0.39	0.30
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.08	0.06	0.07	0.06	0.09	0.04	0.13	0.18	0.13	0.05	0.03	0.00	0.05	0.05	0.07	0.09	0.14	0.22	0.08
O3'	0.02	0.19	0.02	0.01	0.10	0.03	0.10	0.04	0.13	0.13	0.16	0.24	0.17	0.13	0.06	0.05	0.00	0.03	0.19	0.14	0.38	0.31	0.20
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.05	0.04	0.04	0.02	0.05	0.03	0.00	0.12	0.03	0.19	0.34	0.19
O5'	0.17	0.32	0.17	0.20	0.34	0.03	0.42	0.01	0.43	0.44	0.39	0.30	0.28	0.48	0.32	0.07	0.19	0.12	0.00	0.47	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.09	0.02	0.24	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.09	0.14	0.03	0.47	0.00	0.86	0.70	0.53
OP1	0.25	0.57	0.21	0.26	0.55	0.14	0.71	0.24	0.77	0.63	0.69	0.54	0.48	0.78	0.47	0.14	0.38	0.19	0.02	0.86	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.47	0.22	0.23	0.45	0.25	0.57	0.29	0.62	0.53	0.56	0.45	0.40	0.64	0.39	0.22	0.31	0.34	0.02	0.70	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.34	0.14	0.17	0.34	0.06	0.44	0.02	0.47	0.42	0.42	0.33	0.29	0.50	0.30	0.08	0.20	0.19	0.01	0.53	0.01	0.01	0.00