Doublet Group distance statistics: 51630

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 4, 3, 3, 12, 10, 7, 7, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.005, 0.013, 0.020, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.009, 0.021, 0.033, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.021 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.012, 0.027, 0.042, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.027 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.009, 0.025, 0.041, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.025 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.010, 0.027, 0.044, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.027 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.010, 0.032, 0.055, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.032 std_dev=0.022
N9	A	0, 0.008, 0.033, 0.057, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.033 std_dev=0.024
N6	A	0, 0.024, 0.052, 0.081, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.052 std_dev=0.028
N7	A	0, 0.014, 0.047, 0.079, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.047 std_dev=0.032
C8	A	0, 0.013, 0.053, 0.094, 0.151 max_d=0.151 avg_d=0.053 std_dev=0.041
O4'	A	0, 0.013, 0.146, 0.278, 0.712 max_d=0.712 avg_d=0.146 std_dev=0.133
C2'	A	0, 0.049, 0.184, 0.319, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.184 std_dev=0.135
O2'	A	0, 0.094, 0.255, 0.417, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.255 std_dev=0.162
N3	B	0, 0.364, 0.529, 0.695, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.529 std_dev=0.165
C4	B	0, 0.212, 0.388, 0.563, 0.688 max_d=0.688 avg_d=0.388 std_dev=0.176
C2	B	0, 0.437, 0.650, 0.863, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.650 std_dev=0.213
C4'	A	0, 0.036, 0.258, 0.479, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.258 std_dev=0.222
C3'	A	0, 0.057, 0.282, 0.507, 1.258 max_d=1.258 avg_d=0.282 std_dev=0.225
N9	B	0, 0.291, 0.535, 0.779, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.535 std_dev=0.244
C5	B	0, 0.247, 0.500, 0.752, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.500 std_dev=0.253
O5'	A	0, 0.138, 0.392, 0.646, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.392 std_dev=0.254
C2'	B	0, 0.265, 0.524, 0.783, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.524 std_dev=0.259
N1	B	0, 0.328, 0.592, 0.855, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.592 std_dev=0.264
C1'	B	0, 0.372, 0.668, 0.965, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.668 std_dev=0.296
N2	B	0, 0.700, 1.013, 1.326, 1.620 max_d=1.620 avg_d=1.013 std_dev=0.313
O2'	B	0, 0.471, 0.791, 1.111, 1.801 max_d=1.801 avg_d=0.791 std_dev=0.320
C8	B	0, 0.448, 0.769, 1.091, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.769 std_dev=0.322
N7	B	0, 0.462, 0.784, 1.105, 1.366 max_d=1.366 avg_d=0.784 std_dev=0.322
O3'	A	0, 0.119, 0.442, 0.764, 1.697 max_d=1.697 avg_d=0.442 std_dev=0.322
C6	B	0, 0.222, 0.549, 0.876, 1.146 max_d=1.146 avg_d=0.549 std_dev=0.327
C3'	B	0, 0.263, 0.609, 0.954, 1.699 max_d=1.699 avg_d=0.609 std_dev=0.345
P	A	0, 0.171, 0.529, 0.888, 1.696 max_d=1.696 avg_d=0.529 std_dev=0.358
C5'	A	0, 0.052, 0.413, 0.774, 2.057 max_d=2.057 avg_d=0.413 std_dev=0.361
O3'	B	0, 0.223, 0.597, 0.971, 2.026 max_d=2.026 avg_d=0.597 std_dev=0.374
O6	B	0, 0.416, 0.814, 1.211, 1.668 max_d=1.668 avg_d=0.814 std_dev=0.397
O4'	B	0, 0.519, 0.943, 1.366, 1.846 max_d=1.846 avg_d=0.943 std_dev=0.423
C4'	B	0, 0.477, 0.953, 1.429, 1.990 max_d=1.990 avg_d=0.953 std_dev=0.476
OP1	A	0, 0.165, 0.649, 1.133, 2.475 max_d=2.475 avg_d=0.649 std_dev=0.484
OP2	A	0, 0.143, 0.631, 1.118, 2.457 max_d=2.457 avg_d=0.631 std_dev=0.488
C5'	B	0, 0.643, 1.267, 1.890, 2.534 max_d=2.534 avg_d=1.267 std_dev=0.623
O5'	B	0, 0.656, 1.372, 2.088, 3.779 max_d=3.779 avg_d=1.372 std_dev=0.716
P	B	0, 0.914, 1.798, 2.683, 4.360 max_d=4.360 avg_d=1.798 std_dev=0.885
OP2	B	0, 0.967, 1.963, 2.959, 4.475 max_d=4.475 avg_d=1.963 std_dev=0.996
OP1	B	0, 1.056, 2.108, 3.159, 4.915 max_d=4.915 avg_d=2.108 std_dev=1.052

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.17	0.21	0.11
C2	0.03	0.00	0.12	0.16	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.20	0.03	0.19	0.22	0.41	0.24
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.02	0.08	0.06	0.10	0.12	0.08	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.12	0.16	0.22	0.10
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.10	0.01	0.11	0.02	0.13	0.11	0.15	0.15	0.13	0.11	0.06	0.02	0.01	0.02	0.20	0.18	0.23	0.16
C4	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.11	0.03	0.19	0.21	0.38	0.23
C4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.09	0.08	0.06	0.09	0.10	0.05	0.05	0.03	0.00	0.01	0.18	0.13	0.07
C5	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.04	0.24	0.28	0.47	0.30
C5'	0.03	0.13	0.02	0.02	0.12	0.01	0.16	0.00	0.17	0.16	0.15	0.11	0.19	0.18	0.10	0.05	0.04	0.01	0.01	0.11	0.15	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.13	0.01	0.08	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.15	0.04	0.25	0.31	0.51	0.33
C8	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.09	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.12	0.05	0.23	0.25	0.39	0.27
N1	0.02	0.00	0.10	0.15	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.18	0.03	0.23	0.27	0.48	0.29
N3	0.03	0.00	0.12	0.15	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.17	0.03	0.16	0.19	0.36	0.20
N6	0.02	0.01	0.08	0.13	0.01	0.09	0.01	0.19	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.09	0.16	0.05	0.27	0.38	0.56	0.37
N7	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.10	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.13	0.05	0.26	0.33	0.50	0.34
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.03	0.17	0.17	0.31	0.19
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.07	0.05	0.06	0.05	0.09	0.04	0.11	0.12	0.09	0.04	0.02	0.00	0.04	0.05	0.06	0.23	0.16	0.12
O3'	0.01	0.20	0.02	0.01	0.11	0.03	0.12	0.04	0.15	0.12	0.18	0.17	0.16	0.13	0.06	0.04	0.00	0.02	0.23	0.25	0.25	0.20
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.03	0.03	0.05	0.05	0.03	0.05	0.02	0.00	0.11	0.22	0.18	0.15
O5'	0.09	0.19	0.12	0.20	0.19	0.01	0.24	0.01	0.25	0.23	0.23	0.16	0.27	0.26	0.17	0.06	0.23	0.11	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.17	0.22	0.16	0.18	0.21	0.18	0.28	0.11	0.31	0.25	0.27	0.19	0.38	0.33	0.17	0.23	0.25	0.22	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.21	0.41	0.22	0.23	0.38	0.13	0.47	0.15	0.51	0.39	0.48	0.36	0.56	0.50	0.31	0.16	0.25	0.18	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.24	0.10	0.16	0.23	0.07	0.30	0.02	0.33	0.27	0.29	0.20	0.37	0.34	0.19	0.12	0.20	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.28	0.21	0.21	0.14	0.20	0.14	0.21	0.17	0.21	0.24	0.39	0.20	0.19	0.18	0.27	0.21	0.20	0.34	0.18	0.40	0.40	0.36
C2	0.20	0.24	0.19	0.23	0.19	0.23	0.25	0.30	0.25	0.30	0.23	0.36	0.18	0.33	0.23	0.23	0.23	0.22	0.49	0.31	0.58	0.65	0.56
C2'	0.16	0.28	0.16	0.16	0.14	0.15	0.15	0.17	0.18	0.20	0.24	0.40	0.21	0.19	0.15	0.25	0.17	0.16	0.32	0.19	0.41	0.42	0.36
C3'	0.13	0.28	0.13	0.14	0.12	0.14	0.12	0.17	0.17	0.16	0.24	0.39	0.22	0.15	0.10	0.23	0.18	0.12	0.29	0.18	0.42	0.41	0.34
C4	0.19	0.26	0.19	0.22	0.16	0.22	0.18	0.29	0.17	0.27	0.23	0.37	0.18	0.26	0.20	0.22	0.23	0.22	0.46	0.19	0.53	0.55	0.50
C4'	0.13	0.31	0.12	0.12	0.14	0.12	0.12	0.14	0.17	0.13	0.26	0.42	0.26	0.12	0.10	0.25	0.15	0.11	0.26	0.17	0.38	0.37	0.30
C5	0.21	0.26	0.21	0.27	0.14	0.28	0.16	0.36	0.14	0.29	0.25	0.35	0.17	0.28	0.21	0.22	0.28	0.25	0.54	0.16	0.62	0.64	0.59
C5'	0.22	0.34	0.23	0.15	0.20	0.18	0.16	0.15	0.20	0.14	0.28	0.42	0.31	0.14	0.16	0.38	0.19	0.18	0.24	0.19	0.39	0.39	0.28
C6	0.21	0.24	0.20	0.28	0.15	0.30	0.19	0.40	0.14	0.32	0.25	0.34	0.16	0.32	0.22	0.21	0.29	0.27	0.58	0.16	0.69	0.75	0.66
C8	0.21	0.27	0.22	0.26	0.14	0.26	0.14	0.31	0.17	0.25	0.25	0.34	0.21	0.21	0.19	0.24	0.27	0.24	0.46	0.18	0.52	0.48	0.48
N1	0.21	0.23	0.19	0.25	0.18	0.26	0.23	0.36	0.19	0.32	0.21	0.35	0.17	0.34	0.23	0.21	0.26	0.25	0.55	0.25	0.66	0.74	0.63
N3	0.20	0.25	0.19	0.21	0.19	0.21	0.23	0.27	0.24	0.28	0.25	0.38	0.19	0.29	0.21	0.24	0.22	0.21	0.44	0.28	0.51	0.56	0.49
N6	0.23	0.24	0.22	0.31	0.15	0.34	0.16	0.46	0.16	0.33	0.27	0.33	0.16	0.31	0.23	0.22	0.33	0.31	0.65	0.19	0.78	0.85	0.74
N7	0.23	0.27	0.23	0.30	0.15	0.31	0.14	0.39	0.20	0.29	0.28	0.33	0.20	0.24	0.21	0.23	0.31	0.28	0.55	0.22	0.62	0.60	0.58
N9	0.20	0.27	0.20	0.22	0.14	0.21	0.14	0.26	0.15	0.24	0.24	0.37	0.20	0.21	0.19	0.24	0.22	0.21	0.41	0.16	0.47	0.47	0.44
O2'	0.22	0.29	0.22	0.22	0.18	0.22	0.18	0.22	0.20	0.22	0.25	0.40	0.24	0.20	0.19	0.30	0.24	0.22	0.32	0.22	0.40	0.40	0.35
O3'	0.13	0.28	0.14	0.16	0.12	0.16	0.12	0.19	0.17	0.16	0.24	0.40	0.22	0.16	0.10	0.24	0.21	0.13	0.29	0.18	0.44	0.43	0.34
O4'	0.14	0.32	0.15	0.19	0.13	0.17	0.12	0.19	0.18	0.15	0.27	0.42	0.25	0.13	0.10	0.24	0.22	0.15	0.29	0.18	0.37	0.35	0.32
O5'	0.16	0.30	0.18	0.09	0.17	0.09	0.15	0.13	0.20	0.16	0.26	0.36	0.26	0.15	0.13	0.27	0.02	0.13	0.29	0.19	0.43	0.42	0.34
OP1	0.05	0.24	0.08	0.03	0.14	0.08	0.18	0.16	0.21	0.18	0.23	0.30	0.20	0.21	0.09	0.17	0.02	0.06	0.29	0.25	0.49	0.49	0.34
OP2	0.13	0.39	0.12	0.08	0.32	0.13	0.38	0.23	0.43	0.31	0.43	0.40	0.32	0.38	0.24	0.12	0.02	0.12	0.37	0.47	0.57	0.50	0.44
P	0.04	0.25	0.08	0.02	0.16	0.05	0.20	0.12	0.24	0.17	0.26	0.29	0.21	0.20	0.10	0.15	0.01	0.03	0.27	0.26	0.44	0.43	0.31

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.11	0.02	0.13	0.18	0.10
C2	0.04	0.00	0.12	0.15	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.18	0.05	0.22	0.02	0.22	0.35	0.24
C2'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.07	0.02	0.05	0.02	0.07	0.06	0.10	0.15	0.12	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.10	0.06	0.17	0.18	0.10
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.11	0.00	0.12	0.02	0.14	0.11	0.14	0.16	0.13	0.12	0.07	0.02	0.01	0.01	0.14	0.14	0.22	0.24	0.15
C4	0.02	0.01	0.07	0.11	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.12	0.03	0.23	0.01	0.21	0.33	0.23
C4'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.09	0.06	0.07	0.05	0.10	0.05	0.06	0.02	0.00	0.02	0.10	0.15	0.19	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.12	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.14	0.03	0.29	0.01	0.28	0.44	0.30
C5'	0.03	0.09	0.02	0.02	0.10	0.01	0.14	0.00	0.15	0.15	0.12	0.08	0.07	0.17	0.09	0.06	0.03	0.02	0.01	0.18	0.18	0.20	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.14	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.16	0.03	0.30	0.01	0.31	0.49	0.33
C8	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.09	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.13	0.05	0.28	0.03	0.25	0.36	0.27
N1	0.03	0.01	0.10	0.14	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.18	0.04	0.27	0.02	0.27	0.43	0.29
N2	0.05	0.01	0.15	0.16	0.02	0.07	0.01	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.17	0.21	0.07	0.21	0.03	0.21	0.33	0.23
N3	0.04	0.01	0.12	0.13	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.12	0.16	0.05	0.19	0.01	0.19	0.29	0.20
N7	0.02	0.01	0.05	0.12	0.01	0.10	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.14	0.05	0.32	0.03	0.32	0.48	0.33
N9	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.02	0.21	0.02	0.19	0.26	0.19
O2'	0.02	0.14	0.01	0.02	0.07	0.06	0.05	0.06	0.08	0.04	0.11	0.17	0.12	0.03	0.02	0.00	0.04	0.05	0.05	0.07	0.17	0.22	0.08
O3'	0.02	0.18	0.02	0.01	0.12	0.02	0.14	0.03	0.16	0.13	0.18	0.21	0.16	0.14	0.07	0.04	0.00	0.02	0.16	0.18	0.30	0.37	0.20
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.04	0.07	0.05	0.05	0.02	0.05	0.02	0.00	0.10	0.04	0.14	0.21	0.12
O5'	0.11	0.22	0.10	0.14	0.23	0.02	0.29	0.01	0.30	0.28	0.27	0.21	0.19	0.32	0.21	0.05	0.16	0.10	0.00	0.33	0.03	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.06	0.14	0.01	0.10	0.01	0.18	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.07	0.18	0.04	0.33	0.00	0.37	0.56	0.38
OP1	0.13	0.22	0.17	0.22	0.21	0.15	0.28	0.18	0.31	0.25	0.27	0.21	0.19	0.32	0.19	0.17	0.30	0.14	0.03	0.37	0.00	0.02	0.01
OP2	0.18	0.35	0.18	0.24	0.33	0.19	0.44	0.20	0.49	0.36	0.43	0.33	0.29	0.48	0.26	0.22	0.37	0.21	0.02	0.56	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.24	0.10	0.15	0.23	0.04	0.30	0.02	0.33	0.27	0.29	0.23	0.20	0.33	0.19	0.08	0.20	0.12	0.01	0.38	0.01	0.01	0.00