Doublet Group distance statistics: 51634

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 5, 7, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.005, 0.023, 0.042, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.023 std_dev=0.018
C5	A	0, 0.009, 0.028, 0.046, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.028 std_dev=0.019
C2	A	0, -0.005, 0.017, 0.039, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.017 std_dev=0.022
C4	A	0, 0.007, 0.030, 0.052, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.030 std_dev=0.022
N9	A	0, 0.011, 0.038, 0.065, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.038 std_dev=0.027
N3	A	0, -0.003, 0.024, 0.052, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.024 std_dev=0.028
N6	A	0, 0.017, 0.048, 0.079, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.048 std_dev=0.031
C1'	A	0, -0.008, 0.024, 0.056, 0.149 max_d=0.149 avg_d=0.024 std_dev=0.032
N7	A	0, 0.020, 0.057, 0.094, 0.157 max_d=0.157 avg_d=0.057 std_dev=0.037
C8	A	0, 0.018, 0.059, 0.100, 0.163 max_d=0.163 avg_d=0.059 std_dev=0.041
C6	B	0, 0.238, 0.384, 0.531, 0.627 max_d=0.627 avg_d=0.384 std_dev=0.147
O6	B	0, 0.294, 0.459, 0.625, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.459 std_dev=0.166
N1	B	0, 0.236, 0.406, 0.576, 0.696 max_d=0.696 avg_d=0.406 std_dev=0.170
O4'	A	0, 0.009, 0.196, 0.383, 0.708 max_d=0.708 avg_d=0.196 std_dev=0.187
C5	B	0, 0.178, 0.377, 0.575, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.377 std_dev=0.199
C2'	A	0, 0.009, 0.214, 0.418, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.214 std_dev=0.205
C2	B	0, 0.216, 0.453, 0.689, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.453 std_dev=0.236
N7	B	0, 0.205, 0.444, 0.683, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.444 std_dev=0.239
C4	B	0, 0.136, 0.400, 0.664, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.400 std_dev=0.264
N3	B	0, 0.168, 0.458, 0.747, 1.286 max_d=1.286 avg_d=0.458 std_dev=0.290
C8	B	0, 0.184, 0.478, 0.772, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.478 std_dev=0.294
C3'	A	0, 0.030, 0.327, 0.625, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.327 std_dev=0.298
C4'	A	0, -0.005, 0.296, 0.597, 1.089 max_d=1.089 avg_d=0.296 std_dev=0.301
N2	B	0, 0.246, 0.556, 0.867, 1.424 max_d=1.424 avg_d=0.556 std_dev=0.311
N9	B	0, 0.135, 0.449, 0.762, 1.183 max_d=1.183 avg_d=0.449 std_dev=0.314
C1'	B	0, 0.167, 0.536, 0.906, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.536 std_dev=0.369
O4'	B	0, 0.198, 0.578, 0.957, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.578 std_dev=0.379
C5'	A	0, 0.032, 0.478, 0.923, 1.904 max_d=1.904 avg_d=0.478 std_dev=0.446
C2'	B	0, 0.091, 0.538, 0.986, 1.860 max_d=1.860 avg_d=0.538 std_dev=0.447
O2'	A	0, -0.102, 0.362, 0.826, 2.049 max_d=2.049 avg_d=0.362 std_dev=0.464
O5'	A	0, 0.031, 0.502, 0.973, 1.936 max_d=1.936 avg_d=0.502 std_dev=0.471
O3'	A	0, 0.043, 0.528, 1.013, 2.029 max_d=2.029 avg_d=0.528 std_dev=0.485
C3'	B	0, 0.032, 0.530, 1.029, 2.027 max_d=2.027 avg_d=0.530 std_dev=0.499
O2'	B	0, 0.179, 0.678, 1.177, 2.129 max_d=2.129 avg_d=0.678 std_dev=0.499
C4'	B	0, 0.099, 0.599, 1.099, 1.847 max_d=1.847 avg_d=0.599 std_dev=0.500
O3'	B	0, 0.030, 0.599, 1.167, 2.453 max_d=2.453 avg_d=0.599 std_dev=0.568
C5'	B	0, 0.101, 0.689, 1.276, 2.335 max_d=2.335 avg_d=0.689 std_dev=0.587
P	A	0, -0.021, 0.583, 1.187, 2.632 max_d=2.632 avg_d=0.583 std_dev=0.604
OP2	A	0, -0.011, 0.652, 1.315, 2.907 max_d=2.907 avg_d=0.652 std_dev=0.663
OP1	A	0, -0.013, 0.694, 1.401, 3.107 max_d=3.107 avg_d=0.694 std_dev=0.707
O5'	B	0, 0.842, 1.819, 2.795, 2.946 max_d=2.946 avg_d=1.819 std_dev=0.977
P	B	0, 1.033, 2.273, 3.513, 3.745 max_d=3.745 avg_d=2.273 std_dev=1.240
OP2	B	0, 1.691, 3.339, 4.986, 5.265 max_d=5.265 avg_d=3.339 std_dev=1.648
OP1	B	0, 1.761, 3.511, 5.260, 5.482 max_d=5.482 avg_d=3.511 std_dev=1.750

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.06	0.04	0.01	0.05	0.06	0.04	0.01	0.01	0.04	0.13	0.01	0.15	0.15	0.21	0.16
C2	0.06	0.00	0.14	0.18	0.01	0.08	0.01	0.11	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.15	0.21	0.08	0.24	0.26	0.40	0.28
C2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.06	0.03	0.05	0.12	0.05	0.12	0.09	0.14	0.05	0.10	0.03	0.00	0.03	0.03	0.26	0.28	0.34	0.28
C3'	0.03	0.18	0.01	0.00	0.16	0.01	0.19	0.02	0.20	0.19	0.19	0.17	0.22	0.21	0.14	0.02	0.01	0.02	0.11	0.16	0.13	0.11
C4	0.03	0.01	0.06	0.16	0.00	0.07	0.01	0.12	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.16	0.14	0.05	0.24	0.26	0.37	0.28
C4'	0.02	0.08	0.03	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.09	0.13	0.08	0.08	0.11	0.13	0.07	0.19	0.04	0.01	0.02	0.08	0.04	0.02
C5	0.02	0.01	0.05	0.19	0.01	0.10	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.23	0.15	0.04	0.29	0.35	0.47	0.37
C5'	0.06	0.11	0.12	0.02	0.12	0.00	0.16	0.00	0.16	0.19	0.13	0.11	0.19	0.21	0.11	0.11	0.11	0.02	0.01	0.08	0.04	0.02
C6	0.04	0.01	0.05	0.20	0.02	0.09	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.24	0.17	0.05	0.30	0.37	0.51	0.39
C8	0.01	0.02	0.12	0.19	0.01	0.13	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.20	0.16	0.08	0.29	0.33	0.39	0.34
N1	0.05	0.00	0.09	0.19	0.01	0.08	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.20	0.19	0.06	0.27	0.32	0.47	0.34
N3	0.06	0.00	0.14	0.17	0.01	0.08	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.11	0.21	0.09	0.21	0.22	0.35	0.24
N6	0.04	0.01	0.05	0.22	0.02	0.11	0.01	0.19	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.27	0.18	0.06	0.33	0.43	0.56	0.44
N7	0.01	0.01	0.10	0.21	0.00	0.13	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.25	0.19	0.07	0.33	0.40	0.49	0.41
N9	0.01	0.03	0.03	0.14	0.01	0.07	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.12	0.09	0.03	0.22	0.23	0.31	0.25
O2'	0.04	0.15	0.00	0.02	0.16	0.19	0.23	0.11	0.24	0.20	0.20	0.11	0.27	0.25	0.12	0.00	0.06	0.17	0.19	0.24	0.36	0.24
O3'	0.13	0.21	0.03	0.01	0.14	0.04	0.15	0.11	0.17	0.16	0.19	0.21	0.18	0.19	0.09	0.06	0.00	0.09	0.19	0.28	0.24	0.21
O4'	0.01	0.08	0.03	0.02	0.05	0.01	0.04	0.02	0.05	0.08	0.06	0.09	0.06	0.07	0.03	0.17	0.09	0.00	0.09	0.09	0.10	0.08
O5'	0.15	0.24	0.26	0.11	0.24	0.02	0.29	0.01	0.30	0.29	0.27	0.21	0.33	0.33	0.22	0.19	0.19	0.09	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.15	0.26	0.28	0.16	0.26	0.08	0.35	0.08	0.37	0.33	0.32	0.22	0.43	0.40	0.23	0.24	0.28	0.09	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.40	0.34	0.13	0.37	0.04	0.47	0.04	0.51	0.39	0.47	0.35	0.56	0.49	0.31	0.36	0.24	0.10	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.28	0.28	0.11	0.28	0.02	0.37	0.02	0.39	0.34	0.34	0.24	0.44	0.41	0.25	0.24	0.21	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.33	0.25	0.18	0.23	0.19	0.20	0.18	0.19	0.25	0.23	0.44	0.33	0.25	0.24	0.32	0.17	0.23	0.57	0.22	0.71	0.77	0.60
C2	0.25	0.28	0.22	0.22	0.25	0.22	0.21	0.27	0.19	0.23	0.22	0.33	0.29	0.22	0.24	0.25	0.22	0.23	0.68	0.21	0.92	1.15	0.78
C2'	0.24	0.36	0.23	0.22	0.21	0.21	0.19	0.24	0.20	0.25	0.27	0.51	0.33	0.25	0.21	0.29	0.24	0.21	0.65	0.23	0.87	0.85	0.70
C3'	0.17	0.28	0.16	0.11	0.15	0.11	0.17	0.14	0.19	0.23	0.22	0.41	0.25	0.25	0.15	0.24	0.11	0.13	0.59	0.23	0.88	0.72	0.64
C4	0.27	0.29	0.26	0.23	0.25	0.23	0.20	0.26	0.18	0.24	0.21	0.35	0.31	0.23	0.25	0.29	0.23	0.24	0.69	0.22	0.86	1.04	0.75
C4'	0.20	0.23	0.19	0.14	0.15	0.15	0.18	0.14	0.19	0.23	0.19	0.34	0.21	0.24	0.17	0.26	0.12	0.18	0.47	0.23	0.69	0.53	0.48
C5	0.31	0.27	0.31	0.32	0.27	0.30	0.21	0.35	0.18	0.26	0.20	0.31	0.31	0.24	0.28	0.32	0.32	0.29	0.77	0.24	0.96	1.17	0.84
C5'	0.19	0.25	0.18	0.15	0.17	0.15	0.18	0.13	0.20	0.21	0.22	0.33	0.23	0.21	0.17	0.23	0.12	0.17	0.41	0.22	0.69	0.39	0.41
C6	0.31	0.27	0.31	0.33	0.28	0.32	0.23	0.39	0.20	0.28	0.22	0.29	0.30	0.26	0.29	0.30	0.34	0.30	0.78	0.23	1.04	1.29	0.89
C8	0.33	0.28	0.36	0.32	0.25	0.30	0.20	0.30	0.19	0.27	0.19	0.34	0.32	0.27	0.27	0.38	0.33	0.29	0.72	0.24	0.87	0.95	0.75
N1	0.27	0.28	0.26	0.28	0.26	0.27	0.23	0.34	0.19	0.26	0.23	0.30	0.29	0.24	0.27	0.26	0.28	0.26	0.74	0.20	1.01	1.26	0.85
N3	0.25	0.30	0.22	0.19	0.24	0.20	0.20	0.23	0.19	0.23	0.22	0.36	0.30	0.22	0.24	0.26	0.19	0.22	0.66	0.22	0.84	1.04	0.73
N6	0.34	0.27	0.35	0.39	0.30	0.39	0.26	0.48	0.23	0.33	0.23	0.27	0.30	0.30	0.33	0.34	0.40	0.35	0.83	0.26	1.14	1.40	0.97
N7	0.35	0.27	0.38	0.38	0.27	0.36	0.21	0.39	0.19	0.28	0.20	0.30	0.31	0.27	0.30	0.38	0.39	0.33	0.81	0.26	0.98	1.13	0.85
N9	0.28	0.30	0.28	0.22	0.24	0.22	0.19	0.23	0.18	0.25	0.21	0.38	0.32	0.25	0.25	0.32	0.22	0.24	0.66	0.23	0.80	0.91	0.69
O2'	0.29	0.44	0.26	0.18	0.27	0.19	0.22	0.21	0.23	0.26	0.31	0.62	0.41	0.26	0.25	0.39	0.16	0.25	0.60	0.24	0.81	0.81	0.65
O3'	0.17	0.29	0.17	0.14	0.13	0.14	0.14	0.19	0.16	0.21	0.21	0.43	0.26	0.21	0.14	0.25	0.17	0.14	0.58	0.20	0.93	0.69	0.64
O4'	0.24	0.24	0.23	0.17	0.17	0.19	0.20	0.18	0.20	0.26	0.19	0.35	0.23	0.26	0.21	0.31	0.16	0.22	0.47	0.24	0.60	0.59	0.49
O5'	0.17	0.31	0.19	0.10	0.17	0.11	0.14	0.09	0.19	0.12	0.25	0.39	0.29	0.13	0.12	0.23	0.04	0.15	0.51	0.19	0.82	0.46	0.51
OP1	0.06	0.23	0.08	0.02	0.11	0.04	0.12	0.11	0.16	0.13	0.20	0.30	0.19	0.14	0.06	0.11	0.03	0.05	0.30	0.18	0.89	0.48	0.35
OP2	0.08	0.30	0.09	0.05	0.21	0.10	0.24	0.19	0.27	0.22	0.29	0.34	0.25	0.25	0.15	0.07	0.03	0.08	0.60	0.29	1.15	0.58	0.64
P	0.05	0.23	0.08	0.02	0.13	0.04	0.14	0.09	0.17	0.13	0.21	0.29	0.20	0.15	0.07	0.09	0.01	0.04	0.42	0.19	0.88	0.40	0.43

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.25	0.02	0.39	0.33	0.26
C2	0.03	0.00	0.09	0.11	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.12	0.13	0.03	0.43	0.01	0.64	0.77	0.47
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.06	0.05	0.08	0.11	0.08	0.05	0.02	0.00	0.02	0.03	0.28	0.07	0.36	0.19	0.25
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.07	0.01	0.09	0.02	0.10	0.09	0.10	0.12	0.09	0.09	0.05	0.02	0.01	0.02	0.33	0.10	0.46	0.16	0.27
C4	0.02	0.00	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.44	0.01	0.64	0.75	0.48
C4'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.05	0.06	0.04	0.08	0.03	0.04	0.03	0.01	0.06	0.07	0.19	0.28	0.07
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.10	0.03	0.52	0.02	0.76	0.99	0.58
C5'	0.04	0.06	0.03	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.10	0.12	0.08	0.07	0.05	0.13	0.07	0.04	0.03	0.04	0.02	0.13	0.30	0.41	0.05
C6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.08	0.12	0.03	0.53	0.01	0.80	1.08	0.62
C8	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.09	0.05	0.52	0.02	0.72	0.87	0.55
N1	0.03	0.01	0.08	0.10	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.10	0.13	0.03	0.49	0.01	0.73	0.95	0.55
N2	0.04	0.01	0.11	0.12	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.15	0.16	0.04	0.40	0.02	0.60	0.70	0.44
N3	0.03	0.01	0.08	0.09	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.10	0.11	0.03	0.39	0.01	0.57	0.64	0.42
N7	0.02	0.02	0.05	0.09	0.01	0.08	0.01	0.13	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.10	0.05	0.56	0.03	0.81	1.09	0.64
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.42	0.02	0.58	0.63	0.43
O2'	0.03	0.12	0.00	0.02	0.06	0.04	0.06	0.04	0.08	0.03	0.10	0.15	0.10	0.04	0.03	0.00	0.05	0.07	0.13	0.08	0.23	0.13	0.12
O3'	0.01	0.13	0.02	0.01	0.08	0.03	0.10	0.03	0.12	0.09	0.13	0.16	0.11	0.10	0.05	0.05	0.00	0.04	0.24	0.13	0.56	0.31	0.22
O4'	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.05	0.03	0.04	0.03	0.05	0.01	0.07	0.04	0.00	0.17	0.04	0.32	0.33	0.19
O5'	0.25	0.43	0.28	0.33	0.44	0.06	0.52	0.02	0.53	0.52	0.49	0.40	0.39	0.56	0.42	0.13	0.24	0.17	0.00	0.57	0.03	0.03	0.01
O6	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.07	0.02	0.13	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.08	0.13	0.04	0.57	0.00	0.86	1.22	0.67
OP1	0.39	0.64	0.36	0.46	0.64	0.19	0.76	0.30	0.80	0.72	0.73	0.60	0.57	0.81	0.58	0.23	0.56	0.32	0.03	0.86	0.00	0.02	0.01
OP2	0.33	0.77	0.19	0.16	0.75	0.28	0.99	0.41	1.08	0.87	0.95	0.70	0.64	1.09	0.63	0.13	0.31	0.33	0.03	1.22	0.02	0.00	0.01
P	0.26	0.47	0.25	0.27	0.48	0.07	0.58	0.05	0.62	0.55	0.55	0.44	0.42	0.64	0.43	0.12	0.22	0.19	0.01	0.67	0.01	0.01	0.00