Doublet Group distance statistics: 51636

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 5, 3, 2, 1, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.002, 0.011, 0.021, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.016 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.005, 0.016, 0.028, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.003, 0.015, 0.027, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.007, 0.023, 0.038, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.023 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.008, 0.030, 0.052, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.030 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.016, 0.042, 0.068, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.042 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.018, 0.045, 0.073, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.045 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.060, 0.212, 0.364, 0.543 max_d=0.543 avg_d=0.212 std_dev=0.152
P	A	0, 0.175, 0.338, 0.500, 0.560 max_d=0.560 avg_d=0.338 std_dev=0.163
C2'	A	0, 0.047, 0.219, 0.391, 0.640 max_d=0.640 avg_d=0.219 std_dev=0.172
OP1	A	0, 0.270, 0.452, 0.634, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.452 std_dev=0.182
O3'	B	0, 0.197, 0.384, 0.570, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.384 std_dev=0.186
C2'	B	0, 0.151, 0.342, 0.533, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.342 std_dev=0.191
C3'	B	0, 0.157, 0.351, 0.545, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.351 std_dev=0.194
N7	B	0, 0.132, 0.334, 0.535, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.334 std_dev=0.201
N2	B	0, 0.117, 0.325, 0.534, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.325 std_dev=0.209
O5'	A	0, 0.196, 0.409, 0.621, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.409 std_dev=0.213
O2'	B	0, 0.179, 0.392, 0.605, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.392 std_dev=0.213
C8	B	0, 0.140, 0.353, 0.566, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.353 std_dev=0.213
C5	B	0, 0.073, 0.286, 0.500, 0.742 max_d=0.742 avg_d=0.286 std_dev=0.214
C6	B	0, 0.067, 0.282, 0.497, 0.845 max_d=0.845 avg_d=0.282 std_dev=0.215
O6	B	0, 0.102, 0.317, 0.532, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.317 std_dev=0.215
C2	B	0, 0.063, 0.280, 0.496, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.280 std_dev=0.217
N3	B	0, 0.067, 0.286, 0.506, 0.747 max_d=0.747 avg_d=0.286 std_dev=0.219
N9	B	0, 0.105, 0.327, 0.548, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.327 std_dev=0.222
C4	B	0, 0.062, 0.283, 0.505, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.283 std_dev=0.222
C4'	B	0, 0.186, 0.411, 0.635, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.411 std_dev=0.224
N1	B	0, 0.045, 0.269, 0.493, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.269 std_dev=0.224
C1'	B	0, 0.142, 0.368, 0.594, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.368 std_dev=0.226
OP2	A	0, 0.162, 0.394, 0.626, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.394 std_dev=0.232
C5'	B	0, 0.220, 0.457, 0.695, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.457 std_dev=0.238
O4'	B	0, 0.163, 0.413, 0.663, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.413 std_dev=0.250
O5'	B	0, 0.206, 0.460, 0.714, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.460 std_dev=0.254
C4'	A	0, 0.078, 0.338, 0.597, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.338 std_dev=0.259
P	B	0, 0.274, 0.546, 0.819, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.546 std_dev=0.272
OP2	B	0, 0.345, 0.646, 0.948, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.646 std_dev=0.302
C5'	A	0, 0.189, 0.499, 0.809, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.499 std_dev=0.310
OP1	B	0, 0.326, 0.641, 0.956, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.641 std_dev=0.315
C3'	A	0, 0.034, 0.381, 0.727, 1.440 max_d=1.440 avg_d=0.381 std_dev=0.347
O2'	A	0, -0.054, 0.312, 0.679, 1.571 max_d=1.571 avg_d=0.312 std_dev=0.367
O3'	A	0, -0.030, 0.602, 1.234, 2.686 max_d=2.686 avg_d=0.602 std_dev=0.632

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.19	0.00	0.11	0.09	0.23	0.15
C2	0.03	0.00	0.10	0.07	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.11	0.25	0.07	0.06	0.07	0.23	0.11
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.13	0.05	0.08	0.08	0.09	0.04	0.06	0.02	0.00	0.03	0.01	0.25	0.23	0.34	0.27
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.10	0.00	0.16	0.02	0.15	0.20	0.10	0.05	0.18	0.21	0.11	0.02	0.01	0.01	0.07	0.12	0.09	0.07
C4	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.14	0.04	0.06	0.09	0.25	0.13
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.05	0.09	0.04	0.04	0.07	0.08	0.04	0.18	0.02	0.00	0.01	0.09	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.16	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.06	0.03	0.06	0.11	0.25	0.13
C5'	0.05	0.08	0.13	0.02	0.06	0.00	0.07	0.00	0.08	0.05	0.08	0.07	0.09	0.07	0.04	0.08	0.12	0.02	0.01	0.10	0.03	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.15	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.18	0.09	0.04	0.06	0.10	0.23	0.12
C8	0.01	0.01	0.08	0.20	0.00	0.09	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.19	0.11	0.04	0.06	0.13	0.27	0.16
N1	0.02	0.01	0.08	0.10	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.15	0.18	0.06	0.06	0.08	0.23	0.11
N3	0.03	0.00	0.09	0.05	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.26	0.07	0.07	0.07	0.24	0.12
N6	0.02	0.02	0.04	0.18	0.01	0.07	0.01	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.21	0.07	0.04	0.08	0.11	0.21	0.12
N7	0.01	0.01	0.06	0.21	0.01	0.08	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.21	0.11	0.03	0.06	0.14	0.26	0.15
N9	0.00	0.01	0.02	0.11	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.07	0.01	0.07	0.09	0.25	0.14
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.12	0.18	0.18	0.08	0.18	0.19	0.15	0.09	0.21	0.21	0.12	0.00	0.03	0.13	0.18	0.15	0.35	0.21
O3'	0.19	0.25	0.03	0.01	0.14	0.02	0.06	0.12	0.09	0.11	0.18	0.26	0.07	0.11	0.07	0.03	0.00	0.14	0.15	0.32	0.18	0.19
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.04	0.06	0.07	0.04	0.03	0.01	0.13	0.14	0.00	0.08	0.09	0.16	0.10
O5'	0.11	0.06	0.25	0.07	0.06	0.01	0.06	0.01	0.06	0.06	0.06	0.07	0.08	0.06	0.07	0.18	0.15	0.08	0.00	0.03	0.02	0.00
OP1	0.09	0.07	0.23	0.12	0.09	0.09	0.11	0.10	0.10	0.13	0.08	0.07	0.11	0.14	0.09	0.15	0.32	0.09	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.23	0.34	0.09	0.25	0.05	0.25	0.03	0.23	0.27	0.23	0.24	0.21	0.26	0.25	0.35	0.18	0.16	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.11	0.27	0.07	0.13	0.02	0.13	0.02	0.12	0.16	0.11	0.12	0.12	0.15	0.14	0.21	0.19	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.14	0.13	0.12	0.15	0.12	0.15	0.13	0.15	0.15	0.14	0.14	0.15	0.15	0.15	0.17	0.14	0.13	0.14	0.15	0.20	0.21	0.16
C2	0.12	0.14	0.08	0.09	0.14	0.09	0.16	0.13	0.18	0.15	0.17	0.14	0.13	0.16	0.13	0.12	0.10	0.12	0.20	0.19	0.22	0.30	0.23
C2'	0.13	0.14	0.13	0.17	0.14	0.16	0.14	0.17	0.15	0.14	0.14	0.15	0.14	0.15	0.13	0.16	0.23	0.13	0.16	0.16	0.23	0.20	0.17
C3'	0.09	0.09	0.07	0.05	0.08	0.05	0.09	0.05	0.09	0.14	0.08	0.14	0.09	0.13	0.10	0.13	0.08	0.07	0.12	0.10	0.22	0.22	0.16
C4	0.10	0.11	0.08	0.09	0.12	0.08	0.14	0.11	0.15	0.13	0.13	0.11	0.10	0.15	0.12	0.13	0.11	0.09	0.17	0.16	0.21	0.27	0.20
C4'	0.10	0.14	0.09	0.07	0.11	0.09	0.10	0.08	0.11	0.10	0.12	0.17	0.13	0.10	0.10	0.14	0.09	0.10	0.08	0.11	0.18	0.13	0.10
C5	0.08	0.09	0.09	0.09	0.07	0.08	0.10	0.11	0.12	0.10	0.11	0.10	0.06	0.12	0.08	0.14	0.12	0.07	0.17	0.15	0.22	0.28	0.21
C5'	0.12	0.14	0.12	0.09	0.12	0.11	0.12	0.10	0.12	0.11	0.13	0.16	0.13	0.11	0.11	0.14	0.10	0.12	0.10	0.13	0.19	0.12	0.11
C6	0.09	0.10	0.10	0.09	0.07	0.09	0.09	0.13	0.11	0.10	0.11	0.13	0.09	0.11	0.09	0.14	0.11	0.09	0.19	0.15	0.24	0.32	0.24
C8	0.11	0.10	0.13	0.13	0.10	0.12	0.12	0.14	0.12	0.12	0.11	0.11	0.09	0.13	0.11	0.17	0.15	0.11	0.16	0.14	0.22	0.24	0.19
N1	0.11	0.11	0.09	0.09	0.11	0.09	0.13	0.13	0.15	0.13	0.13	0.14	0.11	0.14	0.11	0.13	0.10	0.11	0.20	0.17	0.24	0.32	0.25
N3	0.12	0.15	0.09	0.09	0.15	0.09	0.17	0.12	0.18	0.15	0.17	0.15	0.15	0.16	0.14	0.12	0.10	0.12	0.18	0.18	0.21	0.28	0.21
N6	0.12	0.15	0.12	0.11	0.10	0.11	0.08	0.15	0.12	0.10	0.15	0.17	0.13	0.10	0.10	0.15	0.11	0.10	0.21	0.15	0.27	0.35	0.27
N7	0.10	0.10	0.12	0.12	0.08	0.11	0.10	0.13	0.12	0.10	0.11	0.11	0.08	0.11	0.08	0.16	0.14	0.09	0.17	0.14	0.22	0.27	0.21
N9	0.12	0.12	0.11	0.11	0.12	0.10	0.14	0.12	0.14	0.14	0.13	0.12	0.11	0.14	0.13	0.15	0.13	0.11	0.16	0.15	0.21	0.24	0.18
O2'	0.15	0.20	0.13	0.12	0.18	0.11	0.21	0.12	0.24	0.17	0.22	0.21	0.19	0.21	0.16	0.20	0.14	0.14	0.14	0.27	0.21	0.21	0.16
O3'	0.13	0.33	0.10	0.07	0.19	0.09	0.16	0.08	0.21	0.09	0.29	0.43	0.29	0.10	0.12	0.20	0.11	0.11	0.13	0.19	0.27	0.22	0.18
O4'	0.13	0.15	0.13	0.13	0.14	0.12	0.14	0.13	0.14	0.15	0.14	0.16	0.14	0.15	0.14	0.16	0.13	0.12	0.14	0.14	0.21	0.19	0.15
O5'	0.12	0.09	0.11	0.07	0.09	0.06	0.09	0.04	0.09	0.13	0.09	0.11	0.09	0.11	0.11	0.12	0.02	0.09	0.09	0.10	0.21	0.15	0.13
OP1	0.03	0.08	0.05	0.03	0.06	0.05	0.09	0.11	0.11	0.06	0.10	0.09	0.06	0.09	0.03	0.10	0.02	0.03	0.14	0.13	0.20	0.16	0.15
OP2	0.09	0.22	0.10	0.07	0.16	0.07	0.17	0.10	0.20	0.10	0.22	0.24	0.19	0.14	0.11	0.10	0.03	0.09	0.12	0.21	0.29	0.17	0.18
P	0.03	0.11	0.04	0.02	0.07	0.02	0.08	0.04	0.11	0.05	0.11	0.13	0.08	0.07	0.03	0.07	0.01	0.02	0.08	0.12	0.20	0.10	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.07	0.02	0.08	0.13	0.09
C2	0.02	0.00	0.07	0.05	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.08	0.05	0.12	0.01	0.14	0.24	0.17
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.06	0.03	0.06	0.09	0.06	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.06	0.11	0.09	0.06
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.04	0.05	0.07	0.05	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.05	0.13	0.06	0.05
C4	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.05	0.03	0.13	0.01	0.15	0.23	0.16
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.03	0.04	0.02	0.05	0.02	0.05	0.02	0.00	0.02	0.05	0.08	0.04	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.03	0.16	0.01	0.20	0.27	0.21
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.11	0.10	0.09	0.05	0.05	0.12	0.07	0.05	0.02	0.01	0.01	0.12	0.07	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.04	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.04	0.17	0.01	0.21	0.29	0.22
C8	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.03	0.15	0.02	0.18	0.23	0.18
N1	0.03	0.01	0.06	0.05	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.07	0.05	0.15	0.01	0.19	0.28	0.20
N2	0.03	0.01	0.09	0.07	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.10	0.06	0.11	0.01	0.13	0.23	0.16
N3	0.02	0.01	0.06	0.05	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.07	0.04	0.11	0.01	0.12	0.21	0.15
N7	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.05	0.03	0.17	0.02	0.22	0.28	0.22
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.12	0.02	0.13	0.19	0.14
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.05	0.05	0.05	0.05	0.07	0.03	0.08	0.12	0.08	0.04	0.02	0.00	0.03	0.05	0.05	0.07	0.11	0.08	0.05
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.07	0.04	0.07	0.10	0.07	0.05	0.02	0.03	0.00	0.02	0.05	0.07	0.17	0.06	0.06
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.05	0.06	0.04	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.05	0.05	0.08	0.10	0.09
O5'	0.07	0.12	0.05	0.04	0.13	0.02	0.16	0.01	0.17	0.15	0.15	0.11	0.11	0.17	0.12	0.05	0.05	0.05	0.00	0.19	0.03	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.06	0.05	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.07	0.07	0.05	0.19	0.00	0.25	0.32	0.25
OP1	0.08	0.14	0.11	0.13	0.15	0.08	0.20	0.07	0.21	0.18	0.19	0.13	0.12	0.22	0.13	0.11	0.17	0.08	0.03	0.25	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.24	0.09	0.06	0.23	0.04	0.27	0.02	0.29	0.23	0.28	0.23	0.21	0.28	0.19	0.08	0.06	0.10	0.02	0.32	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.17	0.06	0.05	0.16	0.03	0.21	0.02	0.22	0.18	0.20	0.16	0.15	0.22	0.14	0.05	0.06	0.09	0.01	0.25	0.01	0.01	0.00