Doublet Group distance statistics: 51637

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 6, 1, 0, 1, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.009, 0.017, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.002, 0.014, 0.026, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.014 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.003, 0.015, 0.027, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.002, 0.014, 0.026, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.014 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.003, 0.017, 0.031, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.017 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.007, 0.022, 0.038, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.022 std_dev=0.015
N6	A	0, 0.006, 0.028, 0.051, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.028 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.005, 0.029, 0.053, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.029 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.005, 0.032, 0.060, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.032 std_dev=0.027
C2	B	0, 0.243, 0.394, 0.545, 0.664 max_d=0.664 avg_d=0.394 std_dev=0.151
O4'	A	0, 0.110, 0.268, 0.425, 0.483 max_d=0.483 avg_d=0.268 std_dev=0.158
N1	B	0, 0.239, 0.417, 0.595, 0.696 max_d=0.696 avg_d=0.417 std_dev=0.178
N2	B	0, 0.310, 0.497, 0.683, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.497 std_dev=0.187
C2'	A	0, 0.100, 0.288, 0.476, 0.537 max_d=0.537 avg_d=0.288 std_dev=0.188
N3	B	0, 0.181, 0.375, 0.569, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.375 std_dev=0.194
C4'	A	0, 0.180, 0.404, 0.627, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.404 std_dev=0.223
O2'	A	0, 0.134, 0.357, 0.581, 0.634 max_d=0.634 avg_d=0.357 std_dev=0.224
C6	B	0, 0.196, 0.428, 0.660, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.428 std_dev=0.232
C4	B	0, 0.151, 0.407, 0.663, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.407 std_dev=0.256
C5	B	0, 0.184, 0.448, 0.712, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.448 std_dev=0.264
C3'	A	0, 0.168, 0.444, 0.720, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.444 std_dev=0.276
O6	B	0, 0.237, 0.521, 0.804, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.521 std_dev=0.284
N7	B	0, 0.268, 0.611, 0.955, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.611 std_dev=0.344
O3'	A	0, 0.257, 0.617, 0.976, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.617 std_dev=0.359
N9	B	0, 0.153, 0.518, 0.884, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.518 std_dev=0.366
C2'	B	0, 0.229, 0.603, 0.977, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.603 std_dev=0.374
O2'	B	0, 0.294, 0.679, 1.063, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.679 std_dev=0.384
C8	B	0, 0.253, 0.653, 1.053, 1.337 max_d=1.337 avg_d=0.653 std_dev=0.400
C1'	B	0, 0.152, 0.576, 0.999, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.576 std_dev=0.424
C5'	A	0, 0.284, 0.731, 1.178, 1.382 max_d=1.382 avg_d=0.731 std_dev=0.447
C3'	B	0, 0.252, 0.759, 1.267, 1.539 max_d=1.539 avg_d=0.759 std_dev=0.508
O4'	B	0, 0.170, 0.706, 1.243, 1.552 max_d=1.552 avg_d=0.706 std_dev=0.536
O3'	B	0, 0.286, 0.831, 1.375, 1.633 max_d=1.633 avg_d=0.831 std_dev=0.545
P	A	0, 0.251, 0.825, 1.400, 1.773 max_d=1.773 avg_d=0.825 std_dev=0.575
O5'	A	0, 0.212, 0.828, 1.443, 1.858 max_d=1.858 avg_d=0.828 std_dev=0.616
OP2	A	0, 0.292, 0.918, 1.545, 2.022 max_d=2.022 avg_d=0.918 std_dev=0.626
OP1	A	0, 0.242, 0.869, 1.495, 2.020 max_d=2.020 avg_d=0.869 std_dev=0.627
C4'	B	0, 0.231, 0.896, 1.561, 1.869 max_d=1.869 avg_d=0.896 std_dev=0.665
O5'	B	0, 1.090, 1.894, 2.698, 3.488 max_d=3.488 avg_d=1.894 std_dev=0.804
C5'	B	0, 0.327, 1.222, 2.117, 2.537 max_d=2.537 avg_d=1.222 std_dev=0.895
P	B	0, 1.124, 2.148, 3.171, 4.448 max_d=4.448 avg_d=2.148 std_dev=1.024
OP1	B	0, 1.410, 2.439, 3.467, 5.186 max_d=5.186 avg_d=2.439 std_dev=1.028
OP2	B	0, 0.861, 2.151, 3.440, 6.149 max_d=6.149 avg_d=2.151 std_dev=1.289

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.20	0.23	0.32	0.16
C2	0.03	0.00	0.15	0.21	0.02	0.10	0.02	0.16	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.13	0.25	0.04	0.42	0.37	0.39	0.33
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.08	0.02	0.04	0.02	0.07	0.08	0.12	0.16	0.06	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.27	0.35	0.28	0.22
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.11	0.00	0.07	0.02	0.11	0.11	0.17	0.20	0.08	0.07	0.03	0.02	0.01	0.01	0.37	0.45	0.26	0.30
C4	0.02	0.02	0.08	0.11	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.06	0.12	0.03	0.45	0.36	0.38	0.33
C4'	0.01	0.10	0.02	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.07	0.08	0.09	0.09	0.07	0.08	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.23	0.32	0.07
C5	0.01	0.02	0.04	0.07	0.00	0.06	0.00	0.16	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.03	0.56	0.45	0.46	0.43
C5'	0.03	0.16	0.02	0.02	0.13	0.00	0.16	0.00	0.17	0.15	0.17	0.14	0.18	0.17	0.10	0.05	0.04	0.01	0.01	0.22	0.40	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.07	0.01	0.17	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.08	0.12	0.03	0.57	0.47	0.49	0.46
C8	0.01	0.03	0.08	0.11	0.01	0.08	0.02	0.15	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.12	0.04	0.57	0.41	0.41	0.40
N1	0.02	0.00	0.12	0.17	0.02	0.09	0.02	0.17	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.11	0.21	0.03	0.51	0.43	0.45	0.41
N3	0.03	0.01	0.16	0.20	0.00	0.09	0.01	0.14	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.12	0.23	0.04	0.37	0.33	0.36	0.28
N6	0.02	0.01	0.06	0.08	0.02	0.07	0.01	0.18	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.07	0.10	0.03	0.63	0.54	0.56	0.53
N7	0.01	0.02	0.06	0.07	0.01	0.08	0.01	0.17	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.09	0.04	0.62	0.48	0.49	0.48
N9	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.10	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.42	0.33	0.35	0.29
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.06	0.05	0.05	0.05	0.08	0.04	0.11	0.12	0.07	0.04	0.02	0.00	0.04	0.04	0.08	0.27	0.27	0.08
O3'	0.02	0.25	0.02	0.01	0.12	0.02	0.07	0.04	0.12	0.12	0.21	0.23	0.10	0.09	0.03	0.04	0.00	0.01	0.30	0.50	0.24	0.30
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.02	0.04	0.01	0.00	0.10	0.18	0.41	0.18
O5'	0.20	0.42	0.27	0.37	0.45	0.01	0.56	0.01	0.57	0.57	0.51	0.37	0.63	0.62	0.42	0.08	0.30	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.23	0.37	0.35	0.45	0.36	0.23	0.45	0.22	0.47	0.41	0.43	0.33	0.54	0.48	0.33	0.27	0.50	0.18	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.32	0.39	0.28	0.26	0.38	0.32	0.46	0.40	0.49	0.41	0.45	0.36	0.56	0.49	0.35	0.27	0.24	0.41	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.16	0.33	0.22	0.30	0.33	0.07	0.43	0.02	0.46	0.40	0.41	0.28	0.53	0.48	0.29	0.08	0.30	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.21	0.21	0.26	0.22	0.23	0.20	0.27	0.18	0.24	0.18	0.25	0.23	0.22	0.25	0.34	0.32	0.24	0.21	0.18	0.29	0.23	0.23
C2	0.10	0.11	0.13	0.29	0.08	0.20	0.09	0.34	0.13	0.09	0.11	0.16	0.10	0.11	0.08	0.23	0.36	0.10	0.39	0.19	0.59	0.64	0.44
C2'	0.22	0.25	0.14	0.22	0.20	0.16	0.17	0.25	0.17	0.18	0.20	0.31	0.25	0.18	0.20	0.32	0.31	0.17	0.28	0.18	0.45	0.39	0.35
C3'	0.12	0.17	0.11	0.27	0.11	0.20	0.12	0.32	0.14	0.14	0.15	0.24	0.16	0.15	0.11	0.22	0.39	0.10	0.40	0.16	0.61	0.55	0.51
C4	0.13	0.11	0.14	0.29	0.10	0.21	0.10	0.34	0.11	0.11	0.08	0.16	0.12	0.12	0.11	0.23	0.36	0.13	0.35	0.15	0.53	0.52	0.39
C4'	0.13	0.19	0.09	0.15	0.14	0.11	0.16	0.19	0.16	0.18	0.17	0.25	0.17	0.19	0.14	0.22	0.26	0.08	0.27	0.18	0.33	0.37	0.33
C5	0.13	0.12	0.17	0.35	0.11	0.28	0.10	0.43	0.10	0.12	0.08	0.16	0.13	0.12	0.12	0.21	0.42	0.15	0.47	0.15	0.67	0.69	0.52
C5'	0.25	0.26	0.26	0.24	0.22	0.28	0.22	0.29	0.22	0.22	0.23	0.30	0.27	0.24	0.22	0.36	0.35	0.24	0.35	0.24	0.46	0.48	0.42
C6	0.13	0.14	0.18	0.36	0.12	0.30	0.13	0.47	0.15	0.14	0.14	0.17	0.14	0.15	0.13	0.19	0.43	0.16	0.55	0.20	0.75	0.83	0.61
C8	0.18	0.14	0.19	0.33	0.15	0.27	0.15	0.39	0.12	0.18	0.09	0.17	0.17	0.18	0.17	0.23	0.40	0.18	0.36	0.16	0.54	0.46	0.39
N1	0.10	0.13	0.15	0.33	0.10	0.25	0.12	0.42	0.15	0.12	0.14	0.18	0.12	0.14	0.10	0.20	0.40	0.12	0.49	0.21	0.70	0.78	0.56
N3	0.13	0.10	0.13	0.27	0.09	0.18	0.09	0.30	0.11	0.10	0.10	0.15	0.11	0.11	0.10	0.25	0.34	0.12	0.31	0.16	0.50	0.50	0.36
N6	0.17	0.17	0.22	0.41	0.16	0.37	0.18	0.56	0.19	0.19	0.17	0.18	0.16	0.20	0.17	0.20	0.48	0.22	0.66	0.23	0.88	1.00	0.74
N7	0.17	0.13	0.21	0.38	0.14	0.33	0.11	0.48	0.09	0.15	0.06	0.15	0.16	0.15	0.15	0.22	0.45	0.20	0.50	0.14	0.69	0.68	0.54
N9	0.17	0.15	0.15	0.28	0.15	0.21	0.15	0.31	0.14	0.17	0.12	0.19	0.17	0.17	0.17	0.26	0.35	0.16	0.28	0.16	0.44	0.38	0.31
O2'	0.35	0.32	0.25	0.21	0.30	0.26	0.25	0.25	0.23	0.28	0.26	0.38	0.34	0.25	0.31	0.44	0.25	0.31	0.22	0.21	0.27	0.28	0.25
O3'	0.14	0.20	0.12	0.24	0.13	0.18	0.13	0.30	0.14	0.16	0.16	0.28	0.18	0.17	0.13	0.25	0.35	0.10	0.43	0.16	0.66	0.66	0.58
O4'	0.19	0.20	0.17	0.26	0.15	0.22	0.16	0.27	0.16	0.22	0.18	0.27	0.17	0.20	0.18	0.28	0.33	0.18	0.25	0.18	0.24	0.24	0.26
O5'	0.31	0.36	0.35	0.15	0.35	0.11	0.42	0.09	0.46	0.37	0.43	0.34	0.31	0.43	0.32	0.48	0.02	0.21	0.29	0.51	0.41	0.53	0.41
OP1	0.07	0.24	0.15	0.04	0.16	0.17	0.24	0.33	0.30	0.19	0.28	0.27	0.18	0.26	0.10	0.27	0.02	0.11	0.66	0.35	0.55	1.00	0.78
OP2	0.18	0.33	0.23	0.11	0.28	0.19	0.35	0.38	0.40	0.29	0.37	0.33	0.28	0.36	0.23	0.26	0.02	0.18	0.42	0.44	0.71	0.55	0.59
P	0.08	0.21	0.16	0.02	0.16	0.09	0.25	0.22	0.30	0.19	0.27	0.23	0.15	0.26	0.10	0.25	0.01	0.04	0.39	0.35	0.46	0.57	0.49

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.05	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.22	0.03	0.06	0.37	0.22
C2	0.04	0.00	0.12	0.21	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.14	0.24	0.06	0.31	0.02	0.23	0.58	0.29
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.01	0.08	0.07	0.10	0.15	0.12	0.07	0.03	0.00	0.01	0.01	0.11	0.08	0.13	0.18	0.10
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.16	0.01	0.18	0.02	0.21	0.14	0.21	0.22	0.18	0.17	0.10	0.02	0.01	0.03	0.08	0.23	0.19	0.11	0.09
C4	0.02	0.01	0.07	0.16	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.17	0.03	0.35	0.01	0.21	0.62	0.32
C4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.07	0.00	0.12	0.01	0.12	0.13	0.09	0.07	0.05	0.15	0.07	0.06	0.02	0.00	0.02	0.15	0.05	0.06	0.04
C5	0.02	0.01	0.06	0.18	0.00	0.12	0.00	0.24	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.21	0.02	0.44	0.01	0.32	0.80	0.43
C5'	0.02	0.14	0.01	0.02	0.16	0.01	0.24	0.00	0.25	0.24	0.20	0.12	0.11	0.28	0.14	0.07	0.04	0.01	0.01	0.29	0.06	0.06	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.21	0.01	0.12	0.00	0.25	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.25	0.03	0.45	0.01	0.36	0.83	0.44
C8	0.01	0.01	0.07	0.14	0.01	0.13	0.01	0.24	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.16	0.03	0.48	0.03	0.27	0.78	0.45
N1	0.04	0.01	0.10	0.21	0.02	0.09	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.13	0.25	0.05	0.39	0.02	0.31	0.72	0.37
N2	0.05	0.01	0.15	0.22	0.02	0.07	0.02	0.12	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.17	0.26	0.07	0.26	0.03	0.20	0.51	0.24
N3	0.03	0.01	0.12	0.18	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.19	0.05	0.27	0.01	0.17	0.51	0.25
N7	0.01	0.02	0.07	0.17	0.01	0.15	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.20	0.03	0.52	0.03	0.36	0.91	0.51
N9	0.01	0.02	0.03	0.10	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.10	0.01	0.35	0.02	0.16	0.58	0.32
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.08	0.06	0.07	0.07	0.10	0.06	0.13	0.17	0.13	0.06	0.04	0.00	0.04	0.06	0.04	0.09	0.13	0.05	0.05
O3'	0.01	0.24	0.01	0.01	0.17	0.02	0.21	0.04	0.25	0.16	0.25	0.26	0.19	0.20	0.10	0.04	0.00	0.02	0.18	0.28	0.27	0.28	0.21
O4'	0.01	0.06	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.05	0.07	0.05	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.22	0.03	0.12	0.36	0.26
O5'	0.22	0.31	0.11	0.08	0.35	0.02	0.44	0.01	0.45	0.48	0.39	0.26	0.27	0.52	0.35	0.04	0.18	0.22	0.00	0.50	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.08	0.23	0.01	0.15	0.01	0.29	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.09	0.28	0.03	0.50	0.00	0.43	0.94	0.50
OP1	0.06	0.23	0.13	0.19	0.21	0.05	0.32	0.06	0.36	0.27	0.31	0.20	0.17	0.36	0.16	0.13	0.27	0.12	0.02	0.43	0.00	0.01	0.01
OP2	0.37	0.58	0.18	0.11	0.62	0.06	0.80	0.06	0.83	0.78	0.72	0.51	0.51	0.91	0.58	0.05	0.28	0.36	0.02	0.94	0.01	0.00	0.00
P	0.22	0.29	0.10	0.09	0.32	0.04	0.43	0.02	0.44	0.45	0.37	0.24	0.25	0.51	0.32	0.05	0.21	0.26	0.01	0.50	0.01	0.00	0.00