Doublet Group distance statistics: 51639

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 2, 3, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.006, 0.014, 0.023, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.006, 0.019, 0.033, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.019 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.012, 0.029, 0.046, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.029 std_dev=0.017
N6	A	0, 0.012, 0.029, 0.046, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.029 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.012, 0.035, 0.059, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.035 std_dev=0.023
N9	A	0, 0.002, 0.027, 0.052, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.027 std_dev=0.025
N1	B	0, 0.189, 0.373, 0.557, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.373 std_dev=0.184
C2	B	0, 0.066, 0.311, 0.556, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.311 std_dev=0.245
C6	B	0, 0.215, 0.480, 0.745, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.480 std_dev=0.265
O4'	A	0, 0.018, 0.321, 0.623, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.321 std_dev=0.302
C2'	A	0, -0.002, 0.309, 0.619, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.309 std_dev=0.311
N3	B	0, 0.058, 0.370, 0.682, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.370 std_dev=0.312
C4	B	0, 0.146, 0.466, 0.787, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.466 std_dev=0.321
C5	B	0, 0.203, 0.525, 0.847, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.525 std_dev=0.322
N2	B	0, 0.028, 0.374, 0.720, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.374 std_dev=0.346
O6	B	0, 0.241, 0.605, 0.970, 1.584 max_d=1.584 avg_d=0.605 std_dev=0.365
N9	B	0, 0.127, 0.606, 1.085, 1.605 max_d=1.605 avg_d=0.606 std_dev=0.479
N7	B	0, 0.189, 0.684, 1.179, 1.939 max_d=1.939 avg_d=0.684 std_dev=0.495
C4'	A	0, 0.098, 0.622, 1.145, 1.983 max_d=1.983 avg_d=0.622 std_dev=0.524
C8	B	0, 0.145, 0.707, 1.269, 2.065 max_d=2.065 avg_d=0.707 std_dev=0.562
C2'	B	0, 0.066, 0.657, 1.247, 2.205 max_d=2.205 avg_d=0.657 std_dev=0.590
C1'	B	0, 0.094, 0.691, 1.289, 1.987 max_d=1.987 avg_d=0.691 std_dev=0.597
C3'	A	0, 0.153, 0.758, 1.363, 1.846 max_d=1.846 avg_d=0.758 std_dev=0.605
O2'	B	0, 0.124, 0.747, 1.370, 2.488 max_d=2.488 avg_d=0.747 std_dev=0.623
O2'	A	0, -0.102, 0.582, 1.266, 2.268 max_d=2.268 avg_d=0.582 std_dev=0.684
C5'	A	0, 0.037, 0.743, 1.449, 2.660 max_d=2.660 avg_d=0.743 std_dev=0.706
O5'	A	0, 0.105, 0.883, 1.660, 2.399 max_d=2.399 avg_d=0.883 std_dev=0.778
C3'	B	0, 0.011, 0.821, 1.631, 2.642 max_d=2.642 avg_d=0.821 std_dev=0.810
O4'	B	0, 0.051, 0.868, 1.685, 2.689 max_d=2.689 avg_d=0.868 std_dev=0.817
P	A	0, 0.019, 0.872, 1.726, 2.959 max_d=2.959 avg_d=0.872 std_dev=0.854
O3'	B	0, 0.030, 0.890, 1.750, 3.022 max_d=3.022 avg_d=0.890 std_dev=0.860
OP2	A	0, 0.063, 0.990, 1.916, 3.036 max_d=3.036 avg_d=0.990 std_dev=0.926
OP1	A	0, -0.034, 0.900, 1.834, 3.371 max_d=3.371 avg_d=0.900 std_dev=0.934
C4'	B	0, -0.014, 0.942, 1.899, 2.968 max_d=2.968 avg_d=0.942 std_dev=0.957
O5'	B	0, 0.510, 1.495, 2.481, 3.654 max_d=3.654 avg_d=1.495 std_dev=0.986
OP2	B	0, 0.581, 1.601, 2.620, 4.096 max_d=4.096 avg_d=1.601 std_dev=1.020
O3'	A	0, 0.192, 1.243, 2.293, 3.150 max_d=3.150 avg_d=1.243 std_dev=1.051
P	B	0, 0.494, 1.563, 2.632, 4.170 max_d=4.170 avg_d=1.563 std_dev=1.069
C5'	B	0, 0.067, 1.178, 2.290, 3.781 max_d=3.781 avg_d=1.178 std_dev=1.111
OP1	B	0, 0.460, 1.775, 3.091, 4.954 max_d=4.954 avg_d=1.775 std_dev=1.315

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.28	0.01	0.10	0.10	0.47	0.17
C2	0.01	0.00	0.17	0.19	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.33	0.32	0.10	0.24	0.19	0.43	0.21
C2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.08	0.01	0.05	0.21	0.07	0.14	0.13	0.17	0.06	0.10	0.03	0.01	0.02	0.02	0.30	0.29	0.58	0.33
C3'	0.02	0.19	0.01	0.00	0.23	0.01	0.32	0.03	0.32	0.36	0.26	0.15	0.36	0.39	0.23	0.03	0.01	0.02	0.33	0.27	0.08	0.22
C4	0.01	0.00	0.08	0.23	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.29	0.19	0.05	0.25	0.19	0.43	0.21
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.07	0.00	0.14	0.01	0.12	0.22	0.08	0.07	0.16	0.21	0.10	0.29	0.02	0.00	0.02	0.07	0.29	0.04
C5	0.01	0.00	0.05	0.32	0.00	0.14	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.37	0.17	0.04	0.36	0.30	0.45	0.31
C5'	0.08	0.08	0.21	0.03	0.11	0.01	0.20	0.00	0.19	0.26	0.13	0.08	0.24	0.29	0.12	0.09	0.20	0.01	0.01	0.07	0.28	0.02
C6	0.01	0.00	0.07	0.32	0.00	0.12	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.40	0.19	0.04	0.38	0.33	0.47	0.34
C8	0.02	0.00	0.14	0.36	0.00	0.22	0.00	0.26	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.34	0.23	0.13	0.37	0.27	0.44	0.29
N1	0.01	0.00	0.13	0.26	0.01	0.08	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.37	0.24	0.06	0.32	0.27	0.46	0.28
N3	0.01	0.00	0.17	0.15	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.29	0.35	0.11	0.19	0.14	0.43	0.17
N6	0.01	0.01	0.06	0.36	0.01	0.16	0.00	0.24	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.44	0.23	0.04	0.44	0.42	0.52	0.42
N7	0.02	0.00	0.10	0.39	0.00	0.21	0.00	0.29	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.40	0.26	0.10	0.44	0.37	0.47	0.38
N9	0.01	0.00	0.03	0.23	0.00	0.10	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.22	0.11	0.03	0.21	0.15	0.44	0.17
O2'	0.02	0.33	0.01	0.03	0.29	0.29	0.37	0.09	0.40	0.34	0.37	0.29	0.44	0.40	0.22	0.00	0.07	0.22	0.32	0.24	0.59	0.27
O3'	0.28	0.32	0.02	0.01	0.19	0.02	0.17	0.20	0.19	0.23	0.24	0.35	0.23	0.26	0.11	0.07	0.00	0.19	0.39	0.59	0.25	0.41
O4'	0.01	0.10	0.02	0.02	0.05	0.00	0.04	0.01	0.04	0.13	0.06	0.11	0.04	0.10	0.03	0.22	0.19	0.00	0.11	0.09	0.46	0.19
O5'	0.10	0.24	0.30	0.33	0.25	0.02	0.36	0.01	0.38	0.37	0.32	0.19	0.44	0.44	0.21	0.32	0.39	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.10	0.19	0.29	0.27	0.19	0.07	0.30	0.07	0.33	0.27	0.27	0.14	0.42	0.37	0.15	0.24	0.59	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.47	0.43	0.58	0.08	0.43	0.29	0.45	0.28	0.47	0.44	0.46	0.43	0.52	0.47	0.44	0.59	0.25	0.46	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.21	0.33	0.22	0.21	0.04	0.31	0.02	0.34	0.29	0.28	0.17	0.42	0.38	0.17	0.27	0.41	0.19	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.23	0.17	0.23	0.13	0.19	0.19	0.25	0.18	0.26	0.17	0.36	0.19	0.27	0.17	0.24	0.22	0.17	0.51	0.22	0.65	0.47	0.45
C2	0.13	0.10	0.12	0.24	0.17	0.19	0.26	0.30	0.29	0.26	0.19	0.22	0.10	0.31	0.18	0.15	0.22	0.16	0.53	0.35	0.49	0.54	0.42
C2'	0.22	0.24	0.21	0.31	0.17	0.27	0.26	0.36	0.22	0.38	0.19	0.40	0.18	0.38	0.25	0.28	0.31	0.24	0.66	0.27	0.86	0.59	0.64
C3'	0.25	0.25	0.26	0.35	0.23	0.31	0.27	0.40	0.25	0.33	0.24	0.32	0.22	0.33	0.26	0.34	0.37	0.27	0.55	0.27	0.77	0.61	0.57
C4	0.13	0.18	0.14	0.26	0.15	0.21	0.23	0.31	0.22	0.26	0.16	0.30	0.15	0.30	0.18	0.17	0.24	0.16	0.54	0.27	0.54	0.51	0.44
C4'	0.20	0.16	0.19	0.22	0.15	0.20	0.18	0.23	0.17	0.24	0.15	0.23	0.14	0.23	0.19	0.31	0.24	0.20	0.44	0.19	0.69	0.44	0.45
C5	0.20	0.19	0.21	0.35	0.19	0.32	0.24	0.43	0.20	0.29	0.12	0.30	0.20	0.32	0.22	0.20	0.33	0.26	0.57	0.26	0.55	0.56	0.48
C5'	0.30	0.21	0.28	0.30	0.21	0.32	0.22	0.33	0.19	0.28	0.19	0.24	0.21	0.26	0.26	0.40	0.33	0.32	0.44	0.20	0.74	0.45	0.48
C6	0.20	0.16	0.20	0.36	0.20	0.33	0.28	0.47	0.24	0.33	0.10	0.29	0.16	0.36	0.24	0.16	0.34	0.27	0.57	0.31	0.54	0.61	0.50
C8	0.24	0.25	0.29	0.36	0.18	0.34	0.18	0.41	0.15	0.26	0.15	0.34	0.27	0.28	0.21	0.33	0.36	0.27	0.56	0.21	0.61	0.51	0.48
N1	0.15	0.11	0.14	0.30	0.18	0.25	0.28	0.39	0.29	0.30	0.14	0.26	0.11	0.35	0.21	0.11	0.27	0.20	0.55	0.36	0.50	0.59	0.46
N3	0.14	0.13	0.13	0.23	0.16	0.17	0.25	0.26	0.26	0.25	0.19	0.25	0.10	0.29	0.18	0.18	0.21	0.15	0.53	0.31	0.52	0.50	0.41
N6	0.28	0.18	0.27	0.43	0.24	0.43	0.30	0.58	0.21	0.39	0.11	0.29	0.19	0.41	0.31	0.20	0.41	0.37	0.61	0.28	0.59	0.69	0.58
N7	0.29	0.24	0.32	0.44	0.22	0.42	0.20	0.52	0.14	0.30	0.13	0.32	0.27	0.31	0.27	0.32	0.42	0.35	0.60	0.22	0.59	0.57	0.52
N9	0.15	0.22	0.16	0.26	0.15	0.21	0.21	0.30	0.19	0.26	0.16	0.33	0.20	0.29	0.18	0.22	0.24	0.17	0.54	0.24	0.60	0.49	0.45
O2'	0.19	0.26	0.20	0.30	0.19	0.26	0.35	0.35	0.36	0.42	0.27	0.45	0.19	0.49	0.24	0.34	0.31	0.22	0.64	0.47	0.88	0.66	0.66
O3'	0.17	0.36	0.17	0.31	0.21	0.25	0.25	0.38	0.30	0.25	0.34	0.49	0.29	0.28	0.18	0.32	0.42	0.16	0.51	0.33	0.80	0.61	0.58
O4'	0.18	0.15	0.18	0.23	0.13	0.19	0.18	0.22	0.17	0.25	0.14	0.24	0.12	0.25	0.18	0.26	0.23	0.18	0.45	0.20	0.63	0.44	0.41
O5'	0.17	0.25	0.19	0.05	0.17	0.04	0.20	0.11	0.22	0.19	0.23	0.31	0.24	0.22	0.15	0.40	0.02	0.09	0.42	0.24	0.73	0.43	0.46
OP1	0.03	0.17	0.08	0.02	0.08	0.11	0.09	0.19	0.12	0.12	0.14	0.24	0.15	0.13	0.04	0.15	0.02	0.06	0.31	0.14	0.84	0.42	0.52
OP2	0.14	0.34	0.25	0.05	0.21	0.17	0.19	0.40	0.23	0.16	0.29	0.41	0.31	0.18	0.14	0.32	0.02	0.08	0.57	0.23	0.87	0.63	0.68
P	0.08	0.19	0.15	0.01	0.10	0.08	0.10	0.20	0.12	0.12	0.15	0.25	0.17	0.13	0.06	0.23	0.01	0.02	0.40	0.13	0.77	0.42	0.50

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.14	0.01	0.07	0.48	0.15
C2	0.02	0.00	0.08	0.12	0.01	0.05	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.12	0.03	0.31	0.01	0.16	0.42	0.16
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.04	0.06	0.06	0.11	0.09	0.06	0.03	0.01	0.01	0.01	0.27	0.05	0.32	0.29	0.10
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.08	0.01	0.08	0.03	0.09	0.09	0.11	0.15	0.12	0.09	0.05	0.02	0.01	0.01	0.35	0.09	0.45	0.22	0.22
C4	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.07	0.03	0.33	0.01	0.14	0.43	0.16
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.09	0.06	0.06	0.05	0.10	0.05	0.06	0.02	0.00	0.02	0.09	0.14	0.43	0.08
C5	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.08	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.08	0.05	0.40	0.01	0.18	0.40	0.19
C5'	0.03	0.13	0.03	0.03	0.13	0.01	0.17	0.00	0.18	0.17	0.16	0.12	0.11	0.19	0.11	0.05	0.03	0.01	0.01	0.20	0.17	0.41	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.09	0.00	0.08	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.09	0.05	0.42	0.00	0.20	0.38	0.22
C8	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.07	0.38	0.01	0.16	0.45	0.18
N1	0.02	0.00	0.06	0.11	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.10	0.03	0.38	0.01	0.19	0.40	0.19
N2	0.02	0.00	0.11	0.15	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.16	0.03	0.28	0.01	0.17	0.42	0.15
N3	0.02	0.00	0.09	0.12	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.12	0.03	0.27	0.01	0.14	0.43	0.14
N7	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.10	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.10	0.07	0.44	0.01	0.20	0.39	0.21
N9	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.05	0.04	0.29	0.01	0.11	0.45	0.15
O2'	0.02	0.13	0.01	0.02	0.08	0.06	0.08	0.05	0.10	0.04	0.12	0.15	0.12	0.06	0.04	0.00	0.04	0.06	0.09	0.11	0.26	0.37	0.09
O3'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.07	0.02	0.08	0.03	0.09	0.09	0.10	0.16	0.12	0.10	0.05	0.04	0.00	0.02	0.27	0.09	0.59	0.22	0.29
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.03	0.03	0.03	0.07	0.04	0.06	0.02	0.00	0.07	0.05	0.09	0.59	0.27
O5'	0.14	0.31	0.27	0.35	0.33	0.02	0.40	0.01	0.42	0.38	0.38	0.28	0.27	0.44	0.29	0.09	0.27	0.07	0.00	0.46	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.09	0.01	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.09	0.05	0.46	0.00	0.23	0.37	0.24
OP1	0.07	0.16	0.32	0.45	0.14	0.14	0.18	0.17	0.20	0.16	0.19	0.17	0.14	0.20	0.11	0.26	0.59	0.09	0.02	0.23	0.00	0.01	0.00
OP2	0.48	0.42	0.29	0.22	0.43	0.43	0.40	0.41	0.38	0.45	0.40	0.42	0.43	0.39	0.45	0.37	0.22	0.59	0.02	0.37	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.16	0.10	0.22	0.16	0.08	0.19	0.01	0.22	0.18	0.19	0.15	0.14	0.21	0.15	0.09	0.29	0.27	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00