Doublet Group distance statistics: 51640

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 1, 3, 0, 0, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.006, 0.011, 0.015, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.011 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.012, 0.019, 0.027, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.019 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.013, 0.022, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.022 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.018, 0.030, 0.041, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.030 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.017, 0.030, 0.042, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.030 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.018, 0.032, 0.045, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.032 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.026, 0.044, 0.061, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.044 std_dev=0.018
N6	A	0, 0.033, 0.054, 0.075, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.054 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.026, 0.050, 0.074, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.050 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.038, 0.067, 0.096, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.067 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.048, 0.086, 0.125, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.086 std_dev=0.039
C2'	A	0, 0.078, 0.184, 0.290, 0.372 max_d=0.372 avg_d=0.184 std_dev=0.106
O4'	A	0, 0.035, 0.146, 0.257, 0.337 max_d=0.337 avg_d=0.146 std_dev=0.111
O2'	A	0, 0.115, 0.246, 0.377, 0.449 max_d=0.449 avg_d=0.246 std_dev=0.131
O5'	A	0, 0.215, 0.351, 0.487, 0.496 max_d=0.496 avg_d=0.351 std_dev=0.136
C3'	A	0, 0.118, 0.291, 0.463, 0.566 max_d=0.566 avg_d=0.291 std_dev=0.173
C4'	A	0, 0.090, 0.272, 0.454, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.272 std_dev=0.182
C3'	B	0, 0.202, 0.385, 0.567, 0.593 max_d=0.593 avg_d=0.385 std_dev=0.183
O3'	B	0, 0.296, 0.487, 0.678, 0.714 max_d=0.714 avg_d=0.487 std_dev=0.191
P	A	0, 0.151, 0.387, 0.623, 0.822 max_d=0.822 avg_d=0.387 std_dev=0.236
C2'	B	0, 0.155, 0.397, 0.639, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.397 std_dev=0.242
C4'	B	0, 0.221, 0.481, 0.741, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.481 std_dev=0.260
C5'	A	0, 0.118, 0.389, 0.660, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.389 std_dev=0.271
C8	B	0, 0.320, 0.609, 0.898, 1.040 max_d=1.040 avg_d=0.609 std_dev=0.289
N9	B	0, 0.250, 0.541, 0.833, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.541 std_dev=0.292
OP2	A	0, 0.144, 0.452, 0.760, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.452 std_dev=0.308
O3'	A	0, 0.148, 0.458, 0.769, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.458 std_dev=0.311
O2'	B	0, 0.288, 0.607, 0.926, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.607 std_dev=0.319
C1'	B	0, 0.152, 0.472, 0.793, 1.054 max_d=1.054 avg_d=0.472 std_dev=0.321
N7	B	0, 0.372, 0.708, 1.044, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.708 std_dev=0.336
C4	B	0, 0.274, 0.610, 0.946, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.610 std_dev=0.336
C5'	B	0, 0.234, 0.574, 0.913, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.574 std_dev=0.339
C5	B	0, 0.355, 0.705, 1.055, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.705 std_dev=0.350
O5'	B	0, 0.248, 0.608, 0.968, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.608 std_dev=0.360
O4'	B	0, 0.143, 0.508, 0.874, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.508 std_dev=0.366
N3	B	0, 0.248, 0.635, 1.022, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.635 std_dev=0.387
OP1	A	0, 0.182, 0.572, 0.962, 1.244 max_d=1.244 avg_d=0.572 std_dev=0.390
C6	B	0, 0.404, 0.818, 1.232, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.818 std_dev=0.414
C2	B	0, 0.330, 0.751, 1.171, 1.349 max_d=1.349 avg_d=0.751 std_dev=0.421
N1	B	0, 0.393, 0.829, 1.266, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.829 std_dev=0.437
N2	B	0, 0.360, 0.830, 1.301, 1.575 max_d=1.575 avg_d=0.830 std_dev=0.471
O6	B	0, 0.454, 0.926, 1.397, 1.677 max_d=1.677 avg_d=0.926 std_dev=0.472
P	B	0, 0.249, 0.987, 1.725, 2.771 max_d=2.771 avg_d=0.987 std_dev=0.738
OP1	B	0, 0.334, 1.108, 1.882, 2.812 max_d=2.812 avg_d=1.108 std_dev=0.774
OP2	B	0, 0.037, 1.432, 2.827, 5.304 max_d=5.304 avg_d=1.432 std_dev=1.395

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.09	0.07	0.19	0.11
C2	0.02	0.00	0.08	0.06	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.08	0.07	0.20	0.17	0.30	0.18
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.06	0.05	0.07	0.08	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.06	0.10	0.13	0.07
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.09	0.06	0.05	0.08	0.09	0.05	0.02	0.01	0.01	0.04	0.13	0.08	0.05
C4	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.06	0.05	0.19	0.16	0.28	0.17
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.06	0.04	0.08	0.08	0.04	0.05	0.03	0.00	0.01	0.06	0.07	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.08	0.04	0.24	0.23	0.33	0.22
C5'	0.03	0.12	0.02	0.01	0.11	0.01	0.15	0.00	0.16	0.14	0.15	0.10	0.19	0.17	0.09	0.05	0.02	0.02	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.07	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.09	0.06	0.25	0.25	0.35	0.24
C8	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.08	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.09	0.03	0.21	0.20	0.27	0.19
N1	0.01	0.00	0.07	0.06	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.08	0.07	0.23	0.22	0.33	0.22
N3	0.01	0.00	0.08	0.05	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.10	0.06	0.07	0.17	0.14	0.27	0.16
N6	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.10	0.06	0.27	0.29	0.38	0.28
N7	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.08	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.10	0.03	0.24	0.26	0.33	0.24
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.16	0.13	0.24	0.15
O2'	0.02	0.11	0.01	0.02	0.06	0.05	0.05	0.05	0.07	0.04	0.09	0.10	0.06	0.04	0.02	0.00	0.04	0.03	0.04	0.10	0.11	0.05
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.06	0.03	0.08	0.02	0.09	0.09	0.08	0.06	0.10	0.10	0.04	0.04	0.00	0.02	0.05	0.19	0.08	0.07
O4'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.05	0.00	0.04	0.02	0.06	0.03	0.07	0.07	0.06	0.03	0.02	0.03	0.02	0.00	0.08	0.07	0.20	0.14
O5'	0.09	0.20	0.06	0.04	0.19	0.01	0.24	0.01	0.25	0.21	0.23	0.17	0.27	0.24	0.16	0.04	0.05	0.08	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.07	0.17	0.10	0.13	0.16	0.06	0.23	0.06	0.25	0.20	0.22	0.14	0.29	0.26	0.13	0.10	0.19	0.07	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.30	0.13	0.08	0.28	0.07	0.33	0.02	0.35	0.27	0.33	0.27	0.38	0.33	0.24	0.11	0.08	0.20	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.18	0.07	0.05	0.17	0.04	0.22	0.02	0.24	0.19	0.22	0.16	0.28	0.24	0.15	0.05	0.07	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.26	0.17	0.18	0.22	0.16	0.22	0.18	0.24	0.21	0.26	0.27	0.24	0.21	0.22	0.30	0.25	0.18	0.24	0.24	0.30	0.28	0.19
C2	0.18	0.10	0.22	0.20	0.13	0.19	0.19	0.16	0.20	0.22	0.15	0.20	0.09	0.24	0.17	0.40	0.24	0.18	0.17	0.25	0.19	0.16	0.12
C2'	0.19	0.26	0.15	0.14	0.20	0.13	0.20	0.15	0.23	0.18	0.25	0.28	0.23	0.19	0.20	0.26	0.19	0.16	0.27	0.23	0.39	0.25	0.22
C3'	0.19	0.25	0.16	0.09	0.21	0.09	0.22	0.11	0.24	0.19	0.26	0.27	0.23	0.21	0.21	0.21	0.13	0.13	0.31	0.25	0.46	0.33	0.28
C4	0.14	0.18	0.18	0.19	0.09	0.17	0.14	0.16	0.18	0.17	0.19	0.22	0.12	0.18	0.13	0.37	0.22	0.15	0.22	0.21	0.28	0.13	0.18
C4'	0.22	0.25	0.20	0.11	0.23	0.12	0.23	0.11	0.24	0.23	0.25	0.26	0.23	0.23	0.23	0.21	0.17	0.18	0.26	0.24	0.35	0.41	0.21
C5	0.20	0.16	0.24	0.23	0.08	0.22	0.09	0.21	0.12	0.21	0.16	0.21	0.12	0.18	0.17	0.38	0.23	0.22	0.27	0.17	0.37	0.34	0.29
C5'	0.24	0.26	0.25	0.10	0.25	0.11	0.26	0.07	0.26	0.26	0.26	0.27	0.25	0.26	0.26	0.26	0.09	0.18	0.30	0.26	0.40	0.44	0.25
C6	0.27	0.18	0.28	0.26	0.19	0.27	0.18	0.23	0.09	0.30	0.14	0.24	0.19	0.28	0.26	0.41	0.25	0.29	0.27	0.14	0.37	0.44	0.32
C8	0.13	0.19	0.15	0.18	0.13	0.17	0.16	0.20	0.20	0.16	0.21	0.21	0.15	0.16	0.13	0.30	0.20	0.15	0.29	0.22	0.44	0.34	0.32
N1	0.25	0.15	0.27	0.24	0.20	0.25	0.22	0.20	0.17	0.29	0.09	0.24	0.18	0.29	0.25	0.42	0.25	0.26	0.22	0.22	0.27	0.31	0.22
N3	0.13	0.17	0.18	0.18	0.12	0.15	0.17	0.14	0.21	0.18	0.20	0.23	0.11	0.20	0.14	0.38	0.23	0.13	0.17	0.24	0.20	0.11	0.11
N6	0.34	0.25	0.32	0.30	0.29	0.33	0.27	0.29	0.17	0.39	0.22	0.28	0.26	0.37	0.34	0.42	0.27	0.38	0.34	0.13	0.47	0.68	0.45
N7	0.18	0.18	0.21	0.22	0.08	0.22	0.10	0.23	0.16	0.18	0.19	0.21	0.13	0.14	0.14	0.33	0.21	0.22	0.32	0.20	0.48	0.48	0.39
N9	0.14	0.22	0.15	0.17	0.16	0.15	0.18	0.18	0.21	0.17	0.23	0.24	0.18	0.18	0.16	0.33	0.22	0.14	0.24	0.22	0.33	0.18	0.21
O2'	0.22	0.28	0.18	0.15	0.23	0.15	0.22	0.15	0.23	0.20	0.26	0.31	0.26	0.20	0.22	0.26	0.20	0.20	0.25	0.23	0.34	0.30	0.19
O3'	0.19	0.25	0.17	0.08	0.21	0.08	0.22	0.09	0.25	0.20	0.26	0.27	0.23	0.21	0.21	0.19	0.09	0.14	0.33	0.26	0.51	0.39	0.31
O4'	0.22	0.25	0.19	0.19	0.23	0.17	0.24	0.19	0.25	0.23	0.25	0.26	0.24	0.24	0.24	0.24	0.28	0.20	0.24	0.25	0.29	0.42	0.22
O5'	0.23	0.31	0.25	0.09	0.29	0.07	0.30	0.05	0.31	0.28	0.32	0.32	0.30	0.29	0.28	0.21	0.01	0.14	0.36	0.32	0.51	0.43	0.35
OP1	0.04	0.13	0.07	0.08	0.12	0.17	0.19	0.26	0.20	0.19	0.16	0.14	0.10	0.23	0.10	0.11	0.02	0.12	0.33	0.25	0.62	0.67	0.45
OP2	0.13	0.25	0.15	0.14	0.23	0.19	0.29	0.25	0.32	0.24	0.29	0.24	0.21	0.30	0.18	0.16	0.02	0.17	0.43	0.36	0.65	0.72	0.56
P	0.05	0.16	0.08	0.06	0.15	0.10	0.20	0.16	0.22	0.19	0.19	0.16	0.13	0.23	0.13	0.09	0.01	0.07	0.35	0.26	0.54	0.54	0.40

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.03	0.12	0.54	0.22
C2	0.03	0.00	0.10	0.05	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.23	0.09	0.05	0.16	0.01	0.21	0.40	0.24
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.07	0.03	0.09	0.02	0.09	0.07	0.09	0.11	0.09	0.09	0.05	0.01	0.01	0.01	0.18	0.10	0.15	0.37	0.08
C3'	0.02	0.05	0.00	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.09	0.13	0.06	0.07	0.05	0.13	0.07	0.02	0.01	0.01	0.25	0.11	0.25	0.27	0.15
C4	0.02	0.01	0.07	0.06	0.00	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.06	0.03	0.19	0.02	0.21	0.31	0.21
C4'	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.05	0.08	0.03	0.04	0.03	0.08	0.04	0.13	0.03	0.00	0.01	0.07	0.11	0.56	0.20
C5	0.02	0.01	0.09	0.09	0.01	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.11	0.04	0.26	0.02	0.35	0.42	0.33
C5'	0.03	0.08	0.02	0.01	0.09	0.00	0.14	0.00	0.14	0.15	0.11	0.06	0.06	0.17	0.09	0.11	0.07	0.01	0.01	0.17	0.11	0.22	0.03
C6	0.02	0.01	0.09	0.09	0.01	0.05	0.01	0.14	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.19	0.10	0.04	0.26	0.00	0.37	0.47	0.35
C8	0.01	0.01	0.07	0.13	0.01	0.08	0.01	0.15	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.07	0.15	0.03	0.30	0.03	0.37	0.43	0.36
N1	0.03	0.00	0.09	0.06	0.01	0.03	0.01	0.11	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.22	0.08	0.05	0.21	0.01	0.28	0.36	0.27
N2	0.04	0.00	0.11	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.26	0.13	0.05	0.14	0.02	0.21	0.50	0.27
N3	0.03	0.00	0.09	0.05	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.09	0.04	0.14	0.01	0.17	0.45	0.23
N7	0.02	0.01	0.09	0.13	0.01	0.08	0.00	0.17	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.16	0.03	0.32	0.03	0.46	0.64	0.46
N9	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.07	0.02	0.19	0.02	0.18	0.27	0.17
O2'	0.01	0.23	0.01	0.02	0.16	0.13	0.15	0.11	0.19	0.07	0.22	0.26	0.21	0.11	0.07	0.00	0.02	0.10	0.10	0.19	0.18	0.68	0.23
O3'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.06	0.03	0.11	0.07	0.10	0.15	0.08	0.13	0.09	0.16	0.07	0.02	0.00	0.03	0.29	0.14	0.35	0.46	0.25
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.03	0.05	0.05	0.04	0.03	0.02	0.10	0.03	0.00	0.15	0.05	0.22	0.72	0.36
O5'	0.08	0.16	0.18	0.25	0.19	0.01	0.26	0.01	0.26	0.30	0.21	0.14	0.14	0.32	0.19	0.10	0.29	0.15	0.00	0.30	0.02	0.02	0.00
O6	0.03	0.01	0.10	0.11	0.02	0.07	0.02	0.17	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.19	0.14	0.05	0.30	0.00	0.46	0.63	0.44
OP1	0.12	0.21	0.15	0.25	0.21	0.11	0.35	0.11	0.37	0.37	0.28	0.21	0.17	0.46	0.18	0.18	0.35	0.22	0.02	0.46	0.00	0.01	0.00
OP2	0.54	0.40	0.37	0.27	0.31	0.56	0.42	0.22	0.47	0.43	0.36	0.50	0.45	0.64	0.27	0.68	0.46	0.72	0.02	0.63	0.01	0.00	0.01
P	0.22	0.24	0.08	0.15	0.21	0.20	0.33	0.03	0.35	0.36	0.27	0.27	0.23	0.46	0.17	0.23	0.25	0.36	0.00	0.44	0.00	0.01	0.00