Doublet Group distance statistics: 51641

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 3, 0, 1, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.010, 0.018, 0.026, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.012, 0.023, 0.033, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.023 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.014, 0.028, 0.043, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.028 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.018, 0.034, 0.050, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.034 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.025, 0.045, 0.064, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.045 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.034, 0.054, 0.074, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.054 std_dev=0.020
C2	A	0, 0.022, 0.043, 0.063, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.043 std_dev=0.021
N3	A	0, 0.007, 0.031, 0.056, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.031 std_dev=0.024
C1'	A	0, 0.028, 0.053, 0.077, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.053 std_dev=0.024
N9	A	0, 0.018, 0.043, 0.068, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.043 std_dev=0.025
N6	A	0, 0.007, 0.040, 0.073, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.040 std_dev=0.033
O4'	A	0, 0.006, 0.115, 0.223, 0.400 max_d=0.400 avg_d=0.115 std_dev=0.109
C4'	A	0, 0.135, 0.341, 0.546, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.341 std_dev=0.206
N9	B	0, 0.265, 0.480, 0.695, 0.725 max_d=0.725 avg_d=0.480 std_dev=0.215
C8	B	0, 0.309, 0.529, 0.749, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.529 std_dev=0.220
C5	B	0, 0.180, 0.400, 0.621, 0.745 max_d=0.745 avg_d=0.400 std_dev=0.220
C2'	A	0, -0.059, 0.164, 0.386, 0.796 max_d=0.796 avg_d=0.164 std_dev=0.222
C4	B	0, 0.193, 0.423, 0.654, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.423 std_dev=0.231
N7	B	0, 0.283, 0.525, 0.767, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.525 std_dev=0.242
C6	B	0, 0.185, 0.434, 0.682, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.434 std_dev=0.249
N1	B	0, 0.256, 0.510, 0.763, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.510 std_dev=0.254
C1'	B	0, 0.327, 0.584, 0.842, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.584 std_dev=0.257
N3	B	0, 0.283, 0.554, 0.825, 0.881 max_d=0.881 avg_d=0.554 std_dev=0.271
C2	B	0, 0.304, 0.587, 0.871, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.587 std_dev=0.284
C3'	A	0, 0.090, 0.385, 0.679, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.385 std_dev=0.294
C4'	B	0, 0.314, 0.625, 0.936, 1.138 max_d=1.138 avg_d=0.625 std_dev=0.311
C5'	A	0, 0.195, 0.512, 0.830, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.512 std_dev=0.318
O6	B	0, 0.233, 0.554, 0.874, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.554 std_dev=0.320
O2'	A	0, 0.102, 0.442, 0.782, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.442 std_dev=0.340
O4'	B	0, 0.370, 0.712, 1.055, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.712 std_dev=0.343
C2'	B	0, 0.142, 0.497, 0.853, 1.255 max_d=1.255 avg_d=0.497 std_dev=0.355
C3'	B	0, 0.122, 0.484, 0.846, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.484 std_dev=0.362
O5'	A	0, 0.242, 0.608, 0.974, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.608 std_dev=0.366
N2	B	0, 0.421, 0.787, 1.153, 1.208 max_d=1.208 avg_d=0.787 std_dev=0.366
O2'	B	0, 0.393, 0.802, 1.212, 1.466 max_d=1.466 avg_d=0.802 std_dev=0.409
P	A	0, 0.198, 0.630, 1.061, 1.502 max_d=1.502 avg_d=0.630 std_dev=0.431
O3'	A	0, 0.209, 0.667, 1.125, 1.553 max_d=1.553 avg_d=0.667 std_dev=0.458
C5'	B	0, 0.502, 0.961, 1.420, 1.564 max_d=1.564 avg_d=0.961 std_dev=0.459
O3'	B	0, 0.156, 0.616, 1.076, 1.671 max_d=1.671 avg_d=0.616 std_dev=0.460
OP1	A	0, 0.196, 0.684, 1.172, 1.611 max_d=1.611 avg_d=0.684 std_dev=0.488
OP2	A	0, 0.228, 0.816, 1.405, 2.010 max_d=2.010 avg_d=0.816 std_dev=0.589
O5'	B	0, 0.599, 1.299, 1.998, 2.835 max_d=2.835 avg_d=1.299 std_dev=0.700
P	B	0, 0.479, 1.342, 2.205, 3.410 max_d=3.410 avg_d=1.342 std_dev=0.863
OP2	B	0, 0.550, 1.452, 2.355, 3.672 max_d=3.672 avg_d=1.452 std_dev=0.902
OP1	B	0, 0.855, 2.025, 3.195, 3.573 max_d=3.573 avg_d=2.025 std_dev=1.170

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.09	0.32	0.15
C2	0.03	0.00	0.07	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.17	0.07	0.03	0.13	0.16	0.32	0.20
C2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.08	0.01	0.11	0.01	0.10	0.12	0.08	0.07	0.12	0.14	0.07	0.01	0.02	0.01	0.07	0.07	0.25	0.06
C3'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.08	0.01	0.14	0.01	0.12	0.18	0.08	0.04	0.16	0.20	0.09	0.02	0.01	0.03	0.16	0.14	0.24	0.07
C4	0.02	0.01	0.08	0.08	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.08	0.01	0.14	0.16	0.31	0.20
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.06	0.11	0.04	0.04	0.09	0.12	0.05	0.06	0.02	0.01	0.05	0.06	0.27	0.07
C5	0.02	0.01	0.11	0.14	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.15	0.03	0.21	0.23	0.32	0.25
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.08	0.00	0.13	0.00	0.13	0.16	0.09	0.03	0.16	0.19	0.08	0.05	0.03	0.04	0.01	0.07	0.24	0.03
C6	0.02	0.01	0.10	0.12	0.01	0.06	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.14	0.13	0.03	0.22	0.25	0.34	0.27
C8	0.01	0.01	0.12	0.18	0.01	0.11	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.07	0.19	0.08	0.21	0.21	0.29	0.23
N1	0.02	0.00	0.08	0.08	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.09	0.02	0.18	0.21	0.33	0.24
N3	0.03	0.00	0.07	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.16	0.07	0.04	0.10	0.13	0.32	0.18
N6	0.03	0.01	0.12	0.16	0.01	0.09	0.01	0.16	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.15	0.18	0.03	0.26	0.29	0.35	0.30
N7	0.02	0.01	0.14	0.20	0.00	0.12	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.10	0.21	0.06	0.26	0.27	0.32	0.28
N9	0.01	0.02	0.07	0.09	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.06	0.09	0.02	0.12	0.13	0.30	0.17
O2'	0.02	0.17	0.01	0.02	0.12	0.06	0.12	0.05	0.14	0.07	0.16	0.16	0.15	0.10	0.06	0.00	0.07	0.06	0.07	0.09	0.27	0.09
O3'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.08	0.02	0.15	0.03	0.13	0.19	0.09	0.07	0.18	0.21	0.09	0.07	0.00	0.03	0.17	0.21	0.24	0.11
O4'	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.04	0.03	0.08	0.02	0.04	0.03	0.06	0.02	0.06	0.03	0.00	0.21	0.18	0.39	0.23
O5'	0.08	0.13	0.07	0.16	0.14	0.05	0.21	0.01	0.22	0.21	0.18	0.10	0.26	0.26	0.12	0.07	0.17	0.21	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.09	0.16	0.07	0.14	0.16	0.06	0.23	0.07	0.25	0.21	0.21	0.13	0.29	0.27	0.13	0.09	0.21	0.18	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.32	0.32	0.25	0.24	0.31	0.27	0.32	0.24	0.34	0.29	0.33	0.32	0.35	0.32	0.30	0.27	0.24	0.39	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.20	0.06	0.07	0.20	0.07	0.25	0.03	0.27	0.23	0.24	0.18	0.30	0.28	0.17	0.09	0.11	0.23	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.14	0.21	0.18	0.18	0.20	0.23	0.20	0.22	0.24	0.16	0.20	0.16	0.26	0.21	0.28	0.14	0.22	0.46	0.26	0.59	0.56	0.51
C2	0.25	0.20	0.23	0.28	0.21	0.26	0.20	0.32	0.18	0.24	0.19	0.25	0.20	0.24	0.23	0.25	0.26	0.24	0.74	0.20	1.20	0.68	0.87
C2'	0.22	0.16	0.18	0.12	0.18	0.13	0.21	0.13	0.21	0.23	0.15	0.23	0.18	0.25	0.19	0.28	0.10	0.19	0.43	0.25	0.55	0.65	0.50
C3'	0.15	0.12	0.14	0.10	0.16	0.08	0.22	0.11	0.21	0.23	0.14	0.17	0.12	0.26	0.16	0.26	0.15	0.11	0.38	0.25	0.58	0.63	0.46
C4	0.23	0.17	0.24	0.27	0.14	0.24	0.13	0.28	0.16	0.18	0.16	0.24	0.17	0.18	0.18	0.28	0.26	0.22	0.69	0.24	0.96	0.68	0.78
C4'	0.17	0.14	0.15	0.13	0.19	0.11	0.25	0.11	0.25	0.26	0.18	0.14	0.13	0.29	0.20	0.26	0.15	0.15	0.29	0.28	0.46	0.47	0.34
C5	0.26	0.18	0.30	0.34	0.14	0.30	0.06	0.35	0.16	0.18	0.18	0.23	0.18	0.13	0.20	0.32	0.36	0.25	0.80	0.29	1.09	0.76	0.90
C5'	0.15	0.18	0.16	0.19	0.22	0.12	0.27	0.15	0.26	0.28	0.21	0.18	0.17	0.30	0.21	0.26	0.23	0.11	0.27	0.30	0.61	0.42	0.35
C6	0.29	0.19	0.30	0.37	0.20	0.33	0.14	0.40	0.11	0.25	0.18	0.23	0.20	0.19	0.25	0.31	0.38	0.28	0.86	0.21	1.28	0.78	1.01
C8	0.21	0.14	0.28	0.29	0.04	0.24	0.18	0.26	0.25	0.16	0.18	0.20	0.13	0.24	0.10	0.33	0.32	0.19	0.67	0.34	0.76	0.72	0.72
N1	0.27	0.19	0.27	0.33	0.21	0.30	0.20	0.37	0.14	0.27	0.17	0.23	0.20	0.25	0.25	0.28	0.33	0.27	0.82	0.14	1.32	0.74	0.98
N3	0.24	0.21	0.22	0.25	0.19	0.23	0.19	0.28	0.18	0.22	0.18	0.26	0.20	0.21	0.21	0.25	0.23	0.23	0.66	0.21	1.03	0.65	0.77
N6	0.31	0.20	0.33	0.40	0.22	0.37	0.16	0.45	0.15	0.28	0.20	0.22	0.21	0.22	0.27	0.33	0.42	0.32	0.93	0.24	1.39	0.84	1.11
N7	0.26	0.18	0.32	0.37	0.11	0.32	0.12	0.35	0.24	0.13	0.20	0.22	0.18	0.16	0.16	0.35	0.41	0.25	0.81	0.36	0.96	0.80	0.89
N9	0.20	0.14	0.22	0.22	0.11	0.20	0.18	0.22	0.22	0.18	0.16	0.21	0.14	0.22	0.14	0.29	0.21	0.18	0.59	0.29	0.75	0.65	0.65
O2'	0.32	0.24	0.25	0.16	0.24	0.21	0.24	0.18	0.25	0.25	0.23	0.30	0.26	0.26	0.26	0.33	0.07	0.30	0.38	0.27	0.50	0.56	0.44
O3'	0.15	0.15	0.13	0.11	0.17	0.07	0.22	0.12	0.22	0.24	0.16	0.20	0.14	0.27	0.17	0.24	0.18	0.11	0.34	0.25	0.63	0.62	0.45
O4'	0.19	0.19	0.18	0.17	0.21	0.18	0.26	0.18	0.26	0.27	0.22	0.22	0.16	0.30	0.21	0.29	0.15	0.19	0.37	0.30	0.45	0.48	0.41
O5'	0.24	0.14	0.28	0.10	0.09	0.18	0.14	0.09	0.14	0.18	0.10	0.22	0.15	0.21	0.13	0.36	0.02	0.23	0.31	0.21	0.63	0.46	0.39
OP1	0.12	0.12	0.14	0.02	0.07	0.14	0.12	0.15	0.14	0.15	0.11	0.18	0.12	0.18	0.08	0.24	0.01	0.15	0.27	0.20	1.04	0.35	0.43
OP2	0.12	0.23	0.07	0.14	0.20	0.21	0.27	0.37	0.27	0.30	0.24	0.28	0.21	0.33	0.19	0.08	0.03	0.21	0.61	0.32	1.08	0.69	0.71
P	0.07	0.15	0.11	0.02	0.09	0.06	0.14	0.12	0.15	0.16	0.14	0.21	0.14	0.19	0.08	0.17	0.02	0.07	0.32	0.21	0.84	0.38	0.42

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.09	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.04	0.06	0.12	0.08	0.04	0.01	0.03	0.02	0.01	0.31	0.03	0.68	0.18	0.33
C2	0.09	0.00	0.09	0.14	0.03	0.08	0.01	0.12	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.11	0.15	0.09	0.56	0.02	1.08	0.55	0.64
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.07	0.03	0.07	0.03	0.07	0.08	0.07	0.13	0.09	0.09	0.04	0.01	0.03	0.06	0.25	0.10	0.39	0.21	0.26
C3'	0.04	0.14	0.00	0.00	0.08	0.01	0.07	0.03	0.08	0.10	0.11	0.17	0.13	0.09	0.08	0.01	0.01	0.04	0.25	0.07	0.34	0.20	0.24
C4	0.02	0.03	0.07	0.08	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.09	0.09	0.02	0.56	0.03	1.09	0.51	0.63
C4'	0.01	0.08	0.03	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.07	0.05	0.12	0.08	0.07	0.03	0.14	0.05	0.01	0.05	0.07	0.22	0.22	0.05
C5	0.01	0.01	0.07	0.07	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.08	0.09	0.04	0.64	0.03	1.26	0.67	0.74
C5'	0.04	0.12	0.03	0.03	0.09	0.01	0.09	0.00	0.08	0.12	0.10	0.14	0.11	0.11	0.10	0.13	0.09	0.02	0.01	0.07	0.27	0.41	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.08	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.10	0.10	0.03	0.65	0.02	1.29	0.74	0.76
C8	0.04	0.03	0.08	0.10	0.01	0.07	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.05	0.13	0.08	0.64	0.05	1.23	0.53	0.71
N1	0.06	0.00	0.07	0.11	0.02	0.05	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.13	0.04	0.62	0.02	1.21	0.67	0.71
N2	0.12	0.00	0.13	0.17	0.03	0.12	0.02	0.14	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.02	0.05	0.13	0.19	0.13	0.54	0.03	1.03	0.53	0.61
N3	0.08	0.01	0.09	0.13	0.01	0.08	0.01	0.11	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.11	0.13	0.08	0.52	0.03	0.99	0.46	0.58
N7	0.04	0.02	0.09	0.09	0.01	0.07	0.00	0.11	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.12	0.08	0.68	0.05	1.35	0.71	0.79
N9	0.01	0.04	0.04	0.08	0.01	0.03	0.02	0.10	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.02	0.00	0.03	0.08	0.02	0.53	0.05	1.01	0.40	0.57
O2'	0.03	0.11	0.01	0.01	0.09	0.14	0.08	0.13	0.10	0.05	0.10	0.13	0.11	0.07	0.03	0.00	0.09	0.17	0.17	0.12	0.23	0.21	0.17
O3'	0.02	0.15	0.03	0.01	0.09	0.05	0.09	0.09	0.10	0.13	0.13	0.19	0.13	0.12	0.08	0.09	0.00	0.05	0.18	0.11	0.49	0.28	0.21
O4'	0.01	0.09	0.06	0.04	0.02	0.01	0.04	0.02	0.03	0.08	0.04	0.13	0.08	0.08	0.02	0.17	0.05	0.00	0.20	0.07	0.61	0.11	0.21
O5'	0.31	0.56	0.25	0.25	0.56	0.05	0.64	0.01	0.65	0.64	0.62	0.54	0.52	0.68	0.53	0.17	0.18	0.20	0.00	0.67	0.02	0.04	0.01
O6	0.03	0.02	0.10	0.07	0.03	0.07	0.03	0.07	0.02	0.05	0.02	0.03	0.03	0.05	0.05	0.12	0.11	0.07	0.67	0.00	1.34	0.84	0.80
OP1	0.68	1.08	0.39	0.34	1.09	0.22	1.26	0.27	1.29	1.23	1.21	1.03	0.99	1.35	1.01	0.23	0.49	0.61	0.02	1.34	0.00	0.02	0.01
OP2	0.18	0.55	0.21	0.20	0.51	0.22	0.67	0.41	0.74	0.53	0.67	0.53	0.46	0.71	0.40	0.21	0.28	0.11	0.04	0.84	0.02	0.00	0.01
P	0.33	0.64	0.26	0.24	0.63	0.05	0.74	0.01	0.76	0.71	0.71	0.61	0.58	0.79	0.57	0.17	0.21	0.21	0.01	0.80	0.01	0.01	0.00