Doublet Group distance statistics: 51642

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 1, 1, 2, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.005, 0.008, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.004, 0.008, 0.013, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.001, 0.009, 0.017, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.009 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C2	A	0, -0.001, 0.008, 0.017, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.008 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.001, 0.011, 0.021, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.011 std_dev=0.010
N7	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.016 std_dev=0.010
N6	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C8	A	0, 0.005, 0.020, 0.034, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.020 std_dev=0.015
C2'	A	0, -0.031, 0.166, 0.363, 0.702 max_d=0.702 avg_d=0.166 std_dev=0.197
O4'	A	0, -0.030, 0.173, 0.377, 0.738 max_d=0.738 avg_d=0.173 std_dev=0.204
O2'	B	0, 0.220, 0.424, 0.628, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.424 std_dev=0.204
C2'	B	0, 0.199, 0.432, 0.666, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.432 std_dev=0.233
N3	B	0, 0.132, 0.424, 0.715, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.424 std_dev=0.291
C1'	B	0, 0.210, 0.507, 0.804, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.507 std_dev=0.297
C4'	A	0, 0.079, 0.389, 0.700, 0.894 max_d=0.894 avg_d=0.389 std_dev=0.311
OP1	A	0, 0.197, 0.512, 0.826, 1.054 max_d=1.054 avg_d=0.512 std_dev=0.314
O3'	B	0, 0.264, 0.584, 0.904, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.584 std_dev=0.320
C4	B	0, 0.162, 0.486, 0.810, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.486 std_dev=0.324
C2	B	0, 0.143, 0.475, 0.807, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.475 std_dev=0.332
N9	B	0, 0.188, 0.520, 0.852, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.520 std_dev=0.332
C3'	B	0, 0.268, 0.606, 0.943, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.606 std_dev=0.337
N2	B	0, 0.143, 0.495, 0.848, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.495 std_dev=0.353
P	A	0, 0.178, 0.555, 0.931, 1.186 max_d=1.186 avg_d=0.555 std_dev=0.377
C5	B	0, 0.180, 0.578, 0.977, 1.323 max_d=1.323 avg_d=0.578 std_dev=0.399
N1	B	0, 0.165, 0.564, 0.963, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.564 std_dev=0.399
C8	B	0, 0.207, 0.622, 1.038, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.622 std_dev=0.416
O4'	B	0, 0.217, 0.639, 1.060, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.639 std_dev=0.421
C6	B	0, 0.180, 0.617, 1.055, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.617 std_dev=0.438
N7	B	0, 0.200, 0.652, 1.103, 1.483 max_d=1.483 avg_d=0.652 std_dev=0.452
OP2	A	0, 0.233, 0.705, 1.176, 1.401 max_d=1.401 avg_d=0.705 std_dev=0.471
C5'	A	0, 0.058, 0.540, 1.022, 1.589 max_d=1.589 avg_d=0.540 std_dev=0.482
C4'	B	0, 0.271, 0.758, 1.244, 1.576 max_d=1.576 avg_d=0.758 std_dev=0.487
O6	B	0, 0.193, 0.720, 1.247, 1.653 max_d=1.653 avg_d=0.720 std_dev=0.527
O5'	A	0, 0.222, 0.809, 1.396, 1.791 max_d=1.791 avg_d=0.809 std_dev=0.587
O2'	A	0, -0.012, 0.635, 1.283, 1.695 max_d=1.695 avg_d=0.635 std_dev=0.647
C3'	A	0, -0.038, 0.624, 1.286, 1.776 max_d=1.776 avg_d=0.624 std_dev=0.662
C5'	B	0, 0.300, 1.074, 1.848, 2.512 max_d=2.512 avg_d=1.074 std_dev=0.774
O5'	B	0, 0.294, 1.218, 2.142, 2.906 max_d=2.906 avg_d=1.218 std_dev=0.924
P	B	0, 0.248, 1.598, 2.949, 4.337 max_d=4.337 avg_d=1.598 std_dev=1.351
OP1	B	0, 0.291, 1.647, 3.004, 3.954 max_d=3.954 avg_d=1.647 std_dev=1.357
O3'	A	0, -0.291, 1.080, 2.452, 3.418 max_d=3.418 avg_d=1.080 std_dev=1.371
OP2	B	0, 0.156, 1.721, 3.285, 5.273 max_d=5.273 avg_d=1.721 std_dev=1.564

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.28	0.00	0.17	0.12	0.48	0.15
C2	0.02	0.00	0.13	0.17	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.42	0.21	0.12	0.27	0.08	0.34	0.06
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.03	0.25	0.05	0.08	0.10	0.13	0.03	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.37	0.33	0.56	0.35
C3'	0.02	0.17	0.00	0.00	0.26	0.00	0.38	0.02	0.36	0.46	0.27	0.13	0.42	0.48	0.28	0.02	0.00	0.01	0.40	0.35	0.16	0.31
C4	0.01	0.00	0.07	0.26	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	0.04	0.06	0.28	0.07	0.37	0.05
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.11	0.18	0.07	0.06	0.13	0.17	0.09	0.33	0.03	0.00	0.01	0.12	0.32	0.04
C5	0.01	0.00	0.03	0.38	0.00	0.12	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.35	0.18	0.02	0.36	0.09	0.31	0.10
C5'	0.11	0.12	0.25	0.02	0.12	0.01	0.15	0.00	0.15	0.17	0.13	0.12	0.17	0.18	0.12	0.09	0.19	0.01	0.01	0.14	0.36	0.02
C6	0.01	0.00	0.05	0.36	0.00	0.11	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.41	0.15	0.05	0.37	0.11	0.29	0.12
C8	0.00	0.01	0.08	0.46	0.01	0.18	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.23	0.35	0.08	0.37	0.08	0.38	0.07
N1	0.02	0.00	0.10	0.27	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.44	0.05	0.09	0.32	0.09	0.30	0.09
N3	0.02	0.00	0.13	0.13	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.37	0.26	0.12	0.24	0.09	0.38	0.06
N6	0.01	0.01	0.03	0.42	0.00	0.13	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.42	0.26	0.03	0.40	0.14	0.26	0.17
N7	0.00	0.00	0.05	0.48	0.00	0.17	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.30	0.38	0.05	0.41	0.12	0.30	0.13
N9	0.00	0.01	0.01	0.28	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.20	0.06	0.01	0.26	0.07	0.42	0.07
O2'	0.02	0.42	0.00	0.02	0.32	0.33	0.35	0.09	0.41	0.23	0.44	0.37	0.42	0.30	0.20	0.00	0.03	0.26	0.42	0.36	0.55	0.33
O3'	0.28	0.21	0.02	0.00	0.04	0.03	0.18	0.19	0.15	0.35	0.05	0.26	0.26	0.38	0.06	0.03	0.00	0.26	0.44	0.61	0.39	0.47
O4'	0.00	0.12	0.01	0.01	0.06	0.00	0.02	0.01	0.05	0.08	0.09	0.12	0.03	0.05	0.01	0.26	0.26	0.00	0.13	0.09	0.52	0.20
O5'	0.17	0.27	0.37	0.40	0.28	0.01	0.36	0.01	0.37	0.37	0.32	0.24	0.40	0.41	0.26	0.42	0.44	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.12	0.08	0.33	0.35	0.07	0.12	0.09	0.14	0.11	0.08	0.09	0.09	0.14	0.12	0.07	0.36	0.61	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.48	0.34	0.56	0.16	0.37	0.32	0.31	0.36	0.29	0.38	0.30	0.38	0.26	0.30	0.42	0.55	0.39	0.52	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.06	0.35	0.31	0.05	0.04	0.10	0.02	0.12	0.07	0.09	0.06	0.17	0.13	0.07	0.33	0.47	0.20	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.24	0.23	0.25	0.25	0.24	0.24	0.32	0.22	0.29	0.23	0.28	0.24	0.27	0.27	0.25	0.17	0.26	0.49	0.21	0.59	0.83	0.63
C2	0.24	0.08	0.18	0.26	0.25	0.29	0.34	0.46	0.30	0.38	0.16	0.21	0.11	0.41	0.29	0.15	0.18	0.29	0.64	0.34	0.66	0.94	0.81
C2'	0.26	0.25	0.24	0.36	0.25	0.34	0.24	0.47	0.21	0.29	0.22	0.28	0.25	0.27	0.27	0.16	0.31	0.30	0.65	0.19	0.85	1.08	0.84
C3'	0.39	0.28	0.39	0.48	0.36	0.42	0.40	0.51	0.34	0.53	0.28	0.34	0.29	0.51	0.43	0.25	0.40	0.42	0.65	0.35	0.68	0.99	0.76
C4	0.22	0.18	0.17	0.26	0.21	0.28	0.25	0.43	0.20	0.33	0.18	0.27	0.14	0.32	0.26	0.16	0.17	0.26	0.60	0.20	0.62	0.90	0.75
C4'	0.21	0.36	0.20	0.22	0.24	0.18	0.23	0.20	0.25	0.25	0.31	0.45	0.32	0.24	0.23	0.15	0.16	0.20	0.33	0.23	0.42	0.63	0.43
C5	0.19	0.22	0.15	0.26	0.13	0.31	0.17	0.49	0.12	0.31	0.20	0.32	0.13	0.29	0.22	0.13	0.19	0.27	0.65	0.12	0.65	0.92	0.80
C5'	0.33	0.38	0.33	0.31	0.29	0.32	0.23	0.29	0.24	0.26	0.32	0.46	0.38	0.22	0.29	0.38	0.29	0.33	0.33	0.22	0.41	0.56	0.40
C6	0.20	0.21	0.15	0.26	0.13	0.33	0.20	0.53	0.10	0.35	0.20	0.33	0.09	0.34	0.23	0.13	0.20	0.29	0.69	0.11	0.70	0.95	0.85
C8	0.19	0.24	0.15	0.26	0.18	0.29	0.16	0.43	0.16	0.25	0.21	0.30	0.21	0.20	0.20	0.15	0.18	0.25	0.59	0.14	0.64	0.88	0.72
N1	0.22	0.12	0.17	0.26	0.20	0.32	0.29	0.51	0.22	0.38	0.10	0.28	0.06	0.40	0.27	0.14	0.19	0.29	0.68	0.26	0.70	0.96	0.85
N3	0.25	0.15	0.19	0.26	0.26	0.27	0.32	0.42	0.28	0.36	0.21	0.21	0.16	0.37	0.30	0.17	0.17	0.27	0.60	0.30	0.63	0.91	0.75
N6	0.19	0.26	0.15	0.26	0.10	0.36	0.12	0.58	0.14	0.32	0.28	0.35	0.14	0.30	0.20	0.13	0.22	0.31	0.72	0.14	0.73	0.96	0.89
N7	0.16	0.26	0.12	0.26	0.13	0.32	0.12	0.50	0.16	0.24	0.24	0.32	0.20	0.19	0.17	0.12	0.19	0.27	0.65	0.15	0.65	0.92	0.78
N9	0.23	0.22	0.19	0.26	0.21	0.26	0.22	0.39	0.18	0.29	0.20	0.28	0.20	0.27	0.25	0.19	0.17	0.25	0.56	0.17	0.61	0.87	0.69
O2'	0.31	0.25	0.31	0.41	0.23	0.40	0.22	0.54	0.23	0.27	0.25	0.32	0.24	0.24	0.27	0.39	0.38	0.36	0.74	0.25	0.98	1.25	0.98
O3'	0.14	0.49	0.19	0.40	0.19	0.30	0.19	0.44	0.24	0.32	0.39	0.73	0.37	0.30	0.18	0.14	0.41	0.22	0.59	0.23	0.64	0.95	0.71
O4'	0.23	0.35	0.22	0.22	0.24	0.21	0.23	0.23	0.27	0.24	0.32	0.42	0.30	0.23	0.23	0.26	0.18	0.23	0.34	0.26	0.41	0.59	0.42
O5'	0.09	0.28	0.09	0.11	0.18	0.04	0.21	0.11	0.22	0.25	0.24	0.35	0.25	0.26	0.16	0.23	0.02	0.07	0.27	0.23	0.45	0.63	0.41
OP1	0.03	0.21	0.03	0.02	0.09	0.04	0.07	0.08	0.10	0.14	0.16	0.29	0.19	0.13	0.04	0.13	0.02	0.03	0.20	0.11	0.52	0.44	0.35
OP2	0.23	0.52	0.30	0.06	0.38	0.10	0.37	0.31	0.42	0.27	0.49	0.58	0.47	0.31	0.28	0.29	0.02	0.07	0.32	0.42	0.64	0.68	0.55
P	0.07	0.24	0.09	0.01	0.13	0.04	0.11	0.10	0.14	0.15	0.19	0.31	0.22	0.14	0.08	0.11	0.00	0.02	0.17	0.14	0.44	0.48	0.33

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.10	0.03	0.16	0.17	0.20
C2	0.02	0.00	0.10	0.10	0.01	0.03	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.13	0.05	0.24	0.02	0.30	0.39	0.39
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.02	0.05	0.06	0.07	0.12	0.10	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.05	0.12	0.12	0.11
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.11	0.07	0.13	0.10	0.09	0.04	0.02	0.01	0.02	0.08	0.06	0.19	0.17	0.11
C4	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.03	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.06	0.02	0.24	0.02	0.30	0.36	0.38
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.06	0.09	0.04	0.03	0.03	0.09	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.04	0.06
C5	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.06	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.05	0.02	0.29	0.02	0.38	0.47	0.45
C5'	0.04	0.11	0.02	0.01	0.12	0.01	0.17	0.00	0.18	0.20	0.14	0.09	0.09	0.22	0.12	0.03	0.04	0.02	0.00	0.19	0.11	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.06	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.07	0.06	0.03	0.30	0.01	0.40	0.50	0.48
C8	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.09	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.12	0.03	0.31	0.03	0.39	0.47	0.45
N1	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.09	0.04	0.28	0.01	0.35	0.46	0.44
N2	0.03	0.00	0.12	0.13	0.01	0.03	0.00	0.09	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.18	0.06	0.23	0.02	0.29	0.39	0.37
N3	0.02	0.00	0.10	0.10	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.13	0.04	0.21	0.02	0.27	0.33	0.34
N7	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.09	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.02	0.34	0.03	0.44	0.56	0.50
N9	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.12	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.01	0.22	0.03	0.27	0.31	0.34
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.07	0.03	0.05	0.03	0.07	0.03	0.09	0.12	0.11	0.03	0.03	0.00	0.05	0.03	0.05	0.08	0.13	0.10	0.08
O3'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.06	0.01	0.05	0.04	0.06	0.12	0.09	0.18	0.13	0.10	0.04	0.05	0.00	0.02	0.11	0.06	0.31	0.26	0.18
O4'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.06	0.04	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.06	0.04	0.17	0.18	0.19
O5'	0.10	0.24	0.07	0.08	0.24	0.01	0.29	0.00	0.30	0.31	0.28	0.23	0.21	0.34	0.22	0.05	0.11	0.06	0.00	0.32	0.01	0.01	0.00
O6	0.03	0.02	0.05	0.06	0.02	0.06	0.02	0.19	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.08	0.06	0.04	0.32	0.00	0.44	0.55	0.51
OP1	0.16	0.30	0.12	0.19	0.30	0.11	0.38	0.11	0.40	0.39	0.35	0.29	0.27	0.44	0.27	0.13	0.31	0.17	0.01	0.44	0.00	0.01	0.00
OP2	0.17	0.39	0.12	0.17	0.36	0.04	0.47	0.02	0.50	0.47	0.46	0.39	0.33	0.56	0.31	0.10	0.26	0.18	0.01	0.55	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.39	0.11	0.11	0.38	0.06	0.45	0.01	0.48	0.45	0.44	0.37	0.34	0.50	0.34	0.08	0.18	0.19	0.00	0.51	0.00	0.01	0.00